Entry information : SiAPx05 ( Si010520m)
Entry ID 9434
Creation 2011-07-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2011-12-12 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SiAPx05 ( Si010520m)
Name (synonym) SiAPx05 ( Si010520m)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Setaria
Organism Setaria italica    [TaxId: 4555 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SiAPx05
start..stop
S start..stop
SbAPx07 560 0 32..342 34..344
ZmAPx07 552 0 37..342 34..339
TaAPx02 551 0 45..342 47..348
HvAPx06 551 0 45..342 47..348
Literature and cross-references SiAPx05 ( Si010520m)
DNA ref. Phytozome 11:   scaffold_7 (20464190..20468704)
Protein sequence: SiAPx05 ( Si010520m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   343
PWM (Da):   %s   36958.9  
PI (pH):   %s   9.21
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MADRLAAAAA TFRASAVAAP SARRGARASR AFLPNSSASP AGARVGLRAA PSRLPQKARA VRCAAVAAAS DAAQLKAARE DIRELLRTTH CHPILVRLGW HDAGTYDKNI EDWPQRGGAN  GSLRFDVELK HGANAGLINA LKLIQPIKDK YPGITYADLF QLASATAIEE AGGPKIPMTY GRVDVTGPEQ CPPEGKLPDA GPTSPADHLR EVFYRMGLDD KDIVVLSGAH TLGRSRPERS 
GWGKPETKYT KNGPGAPGGQ SWTPEWLKFD NSYFKEIKEK RDQDLLVLPT DAALFEDPAF KVYAEKYAAD QDAFFKDYTE SHAKLSNLGA KFNPPQGFSL DD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGACC GCCTCGCCGC CGCCGCCGCC ACCTTCCGCG CCTCGGCCGT CGCCGCCCCG TCCGCCCGCC GTGGCGCGCG GGCCAGCCGC GCCTTCTTAC CCAACTCGTC GGCCTCGCCA  GCTGGCGCGC GCGTCGGCCT CCGCGCCGCG CCATCTCGGC TCCCGCAGGT CCGTACCCTT TCGCCTCTGT TGGGTCTCAG CTCTCGAGGG CGGCTTCAAA CGCAGATCGA AATGGTGCGG  CAGACCCGGC TGTTGTTGAC ACGTGTGTAC TTTACGTGTG TGATCGCAGA AGGCGAGGGC GGTGAGGTGC GCGGCTGTGG CGGCGGCGTC CGACGCGGCG CAGCTGAAGG CCGCCCGCGA  GGACATCAGG GAGCTTCTCA GGACGACACA TTGCCACCCC ATCCTGGTGC GTACCGTGGC CCTTGTCGAT GCTTAATTGC TCAGAAACTG CTTCGGATCA TCACCGTTAT CTATTGTGGA  AGATTTGGGA TGTGACTAGA CCATTCGCGA CCTTGCCATT GCATTTTAAC AATAGAAGAC GTGAGACATT GAATTGCGAT CCTATGCAGC TGTGATCTCT TACTAACTTT GTTAGTGGTG  TCCATTCTTA TACGCCTCTG CAGCACATTG TGCGTGAGCA CTGAGCAGGT ACCCAGAAGT GGCCATTATA TTTGTGTCTT TTGTGCCTGT TAACCAGTAA TCCAGTATTC ACTGTTGAGC  AGGGGCAGAT CCAGAAAATC AAATGTTATT GGTTACTCCA AGAGCTTGGG TTTATTTCTC GCTTATAGGT GTTATTTCCT AGTTATGCTT AGAGATTTAC TTAGTGTTTG CTAAAAGTCA  TTGGTGCCAC ACTGCCACTT GAGGCCAATG AGTATGTGCT GGAGTTGGCC CTGTTGCTCA GGTTAATATA CGTCTTTTAG TGATGTACAA AGACCCATTT AGGCAGGTAA AAGTAAGTTC  TACATGGATG GTTTGTTTGT TACGAAGTGG TATGAAGTAT ATAAGATAAA GACATGAAGT CAACCAGTAT GAATGTAAAA TGAGTGAGTG ACACGCCAGT GAAGTTTGAT TAGTCATGGT  AATTCAAAAA GAACTTTCCA TTCAAATTTT ACAATATAGT AATGACTAAT GATAATATGT AGATGAAGAG CATTATCCAA TATACGCTTC ATGGTCATAT CAGAGTCTGT TCATTAGTTA  TGCTGTATTT TCATGTATTT TACCTTTGCA TGGTCATGTG AGTTTGTCTT ATGTTTTAGA GGTTGAAGGT ATCACGGGAC CGTTTTTCCA GTTAAATGCT GTTGCTTGTA ATTGTGCATA  ATTCTATTTG CCTACCACAT GAAACGCAAT TTTCTGTGGT CCTGTATCTT CCTAAGACAA ATGTGTATGG AGTCAGGTTA CCTTTGGGCT TCTTCTATTT ATGCAAGATG ATTGATTGCT  ATTTGTTTGA TTGGATGAAG GTCCGTCTGG GATGGCATGA TGCTGGTACG TATGACAAGA ATATTGAGGA CTGGCCACAA CGAGGAGGAG CTAATGGAAG CTTAAGATTT GATGTTGAGC  TGAAACATGG AGCCAATGCT GGTACTTTTA CTAGACTTTC TCTCAGTAGC ATTACTTTAT TCTTCTAAAG TGTACTTGGT GACTAAAGGT TTTGGTTGAA ATTCTCAAAG GCCTGATAAA  TGCTCTAAAG CTTATCCAAC CAATTAAGGA CAAGTACCCG GGTATCACTT ATGCGGATTT ATTTCAGTTG GCAAGTGCTA CAGCAATTGA GGTCTGACCT TTCCCTCATT GAAGTATCTA  CGTATTTTAT TTTTAATATA TTACTTCCAT GTTAATCCTA GTTAATCTCA CTCCAGGAAG CTGGTGGCCC AAAGATTCCA ATGACATATG GACGGGTTGA TGTTACAGGA CCTGAGCAGT  GCCCGCCAGA GGGGAAGCTT CCTGGTTAGT ACATCTCTTC ATTGGACTTG CAGTGTTCCG CGTCTAGTAC CGATGGCCTT TCTCAATTTG TTGGGAAGAG TTAAGATACA AAGGATATGT  ATTAAGATTT CTCTTATCTG CTTGGAATAT CGAATAAGTG TATTTCTCAT GTCCAGAAAT CAAGAGAATA CCTCCATGGC TACATTGCCA CATTGATATC AAAACTGTTC TTATGTAGGA  ATAGATGCAC TGGCATGTTA CCCAATTCCA TTAATCTGAT CCCTATCAAC TCTTCTGTTC TCCTTTATCT TGTGCTTTAT AGATGCTGGC CCAACTTCAC CTGCTGATCA CTTGAGGGAG  GTATTCTACA GAATGGGCCT TGATGACAAG GTGTGCAGAT GACAGCACGT AGCCAATTTC AGTCTGTGCT ACTAGTTGCC TTTGTTGAGC TGTTTGGAAT TTGAATCCTG TGTAGGACAT  TGTTGTCTTG TCTGGAGCAC ATACACTTGG AAGGTCCAGG CCTGAACGGA GTGGCTGGGG AAAACCAGAG ACAAAATATA CCGTATGTTC TTATCTTCTT TATGTGAGGT GCAATGCCGG  AACATCAGTT ATTCTTTTCT GCTGGAATTC TGTTTTAGGC ATGATTTGTT CCATCCACTA TGTTCTGATT AATGATTGCA TTGCTTTTTT ATAATTTTGC AATAAGAGAA ACATTGTGTA  TATTGTGCCT GCACAGCTCT TAGAATTGTC CTTAACCTCT CTGGCAGGGG CGGATCTGCA CCCCGTGCTG GGGGTGCTGC AGAGCACCCC CTTGGCCCAA AAATCCATGT GTCACATCTC  AATTAGCTAG TCTAGTGTGC ATAAATATAA AATTTATGAT CAAATCTTCC ATCCTTGTTA CTTCTTCACG TGCAATACCA TATATCATTT CTTGTATCAG ATACCACATC TATGATATAA  TTTAGCTTGA CCCATCGAAG CTAAATAGAT TTAAACTGTC AATATATAGC ACCCCCTTAG CTCCATTCCT GGATCCGCCA CTGCTCTCTG GAATGCTTTT GTTCGATATT TATGCACTGA  CTAAGCTACA TGCGTCGTGT ATTGTCTCTT GTTCTCTTTT ATCTGACTGT TATTTAAAGG ATCTAAATTT TTTTGTTTCT TTTTTTCTGT ACTAAGTAAG CTACGTGTCA TTTATTATCT  CTTGGTACTT TATTCATCTT ACCGTTCTAT TCTATTTAAA GGAGTTAATT GCTTACTCTA GATTATATAT AAAATCCTCT CAAAACCATT GGTATTACCT GGACATATGA AGTCAAACGT  GTTGCACTGT GTATGTGGAT AAATTTTGCT GGACCAATCT TGAATTCATC TACCATGTGC AACTCTTACA GAAAAACGGT CCTGGTGCAC CTGGTGGGCA ATCATGGACA CCTGAGTGGC  TGAAATTTGA TAACAGTTAC TTCAAGGTAC ACTTCTTTTG CCACACAGTG CACACTGAGA AATAATCTGA GTTTATCATA TCTGATCTGG TAGCAATATT TCAGGAGATT AAAGAGAAAA  GAGATCAGGA TCTTCTGGTC CTACCTACAG ATGCTGCTTT ATTTGAGGAC CCAGCGTTCA AGGTGATCCC TGATACTCAA CTGTATGATG TCAGTATCCT ATGAAATAAT TGTTGAACTT  ACTGTCCGAG AATTCACAAA CACAACCAGG TCTATGCGGA GAAATATGCA GCGGACCAAG ACGCATTCTT TAAAGACTAC ACTGAGTCTC ATGCTAAACT GAGCAATCTG GGTGCAAAGT  TCAATCCTCC ACAGGTCAGT GTGAGCATTT CTGAGGTCGC CCTTTTCACT TGCAGTTTCT TTAAATACCA AATTTCAGAC AATGCTTCGT GTTTGGTAGG CGACTAGCTT CTTCCAACAA 
AACTGTTGCT GATTTGTTTT TCCTCCAGCA TGCTGACCAA CCTTATCGTC CTTTACTCAA ATTGATCCTG CAGGGATTCT CTCTGGATGA TTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGACC GCCTCGCCGC CGCCGCCGCC ACCTTCCGCG CCTCGGCCGT CGCCGCCCCG TCCGCCCGCC GTGGCGCGCG GGCCAGCCGC GCCTTCTTAC CCAACTCGTC GGCCTCGCCA  GCTGGCGCGC GCGTCGGCCT CCGCGCCGCG CCATCTCGGC TCCCGCAGAA GGCGAGGGCG GTGAGGTGCG CGGCTGTGGC GGCGGCGTCC GACGCGGCGC AGCTGAAGGC CGCCCGCGAG  GACATCAGGG AGCTTCTCAG GACGACACAT TGCCACCCCA TCCTGGTCCG TCTGGGATGG CATGATGCTG GTACGTATGA CAAGAATATT GAGGACTGGC CACAACGAGG AGGAGCTAAT  GGAAGCTTAA GATTTGATGT TGAGCTGAAA CATGGAGCCA ATGCTGGCCT GATAAATGCT CTAAAGCTTA TCCAACCAAT TAAGGACAAG TACCCGGGTA TCACTTATGC GGATTTATTT  CAGTTGGCAA GTGCTACAGC AATTGAGGAA GCTGGTGGCC CAAAGATTCC AATGACATAT GGACGGGTTG ATGTTACAGG ACCTGAGCAG TGCCCGCCAG AGGGGAAGCT TCCTGATGCT  GGCCCAACTT CACCTGCTGA TCACTTGAGG GAGGTATTCT ACAGAATGGG CCTTGATGAC AAGGACATTG TTGTCTTGTC TGGAGCACAT ACACTTGGAA GGTCCAGGCC TGAACGGAGT  GGCTGGGGAA AACCAGAGAC AAAATATACC AAAAACGGTC CTGGTGCACC TGGTGGGCAA TCATGGACAC CTGAGTGGCT GAAATTTGAT AACAGTTACT TCAAGGAGAT TAAAGAGAAA  AGAGATCAGG ATCTTCTGGT CCTACCTACA GATGCTGCTT TATTTGAGGA CCCAGCGTTC AAGGTCTATG CGGAGAAATA TGCAGCGGAC CAAGACGCAT TCTTTAAAGA CTACACTGAG 
TCTCATGCTA AACTGAGCAA TCTGGGTGCA AAGTTCAATC CTCCACAGGG ATTCTCTCTG GATGATTAG 

Retrieve as FASTA