Entry information : SiAPx08 ( Si017077m)
Entry ID 9560
Creation 2011-07-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2011-12-12 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SiAPx08 ( Si017077m)
Name (synonym) SiAPx08 ( Si017077m)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Setaria
Organism Setaria italica    [TaxId: 4555 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SiAPx08
start..stop
S start..stop
SbAPx08 765 0 1..478 1..454
ZmAPx08 763 0 1..478 1..451
HvAPx07 696 0 1..478 1..446
BdiAPx04 695 0 1..478 1..440
Literature and cross-references SiAPx08 ( Si017077m)
DNA ref. Phytozome 11:   scaffold_1 (27412457..27417543)
Protein sequence: SiAPx08 ( Si017077m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   478
PWM (Da):   %s   51052.49 Transmb domain:   %s   o458-477i
PI (pH):   %s   4.95
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERLAASLL PAASPSPSAR RATVAASGSA AASFPSSCSA RAGLRLRSSR SGSARFSKAA GRGGGGGALR VVRCMAASDA AQLKSAREDI RELLKTTYCH PIMVRLGWHD SGTYDKNIEE  WPQRGGADGS LRFEPELNHG ANAGLINALK LIQPMKDKYP GITYADLFQL ASATAIEEAG GPKIPMKYGR VDVTEPEQCP PEGRLPDAGP RDPAEHLREV FYRMGLDDKE IVALSGAHTL  GRARPDRSGW GKPETKYTKD GPGEPGGQSW TVEWLKFDNS YFKDMKFLSQ LPSKEQKDQD LLVLPTDAAL FEDPSFKVYA EKYAEDQEAF FKDYAEAHAK LSDLGAKFDP PEGFSLDDDT 
SDEPAAEKKE EAAPTPEPAA AAAPPPEPAA APALEPVAAA VATATADDNN GVAPQPEPFV AAKYSYGKTE LSDSMKQKIR AEYEGFGGSP DKPLQSNYFL NIMLLIAGLA FLTSLVGN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGAGC GCCTCGCCGC CTCCCTCCTC CCCGCCGCCT CCCCCTCCCC GTCCGCCCGC CGCGCCACGG TCGCGGCCTC GGGGTCCGCC GCCGCGTCCT TCCCTTCCTC GTGCTCCGCC  CGAGCGGGGC TGCGCCTCCG CTCCTCCCGC TCGGGGTCGG CCCGCTTCTC CAAGGCGGCT GGGCGCGGCG GGGGAGGCGG CGCGCTGCGG GTGGTCCGGT GCATGGCGGC GTCGGACGCG  GCGCAGCTCA AGAGCGCGCG GGAGGACATC AGGGAGCTTC TCAAGACCAC GTACTGCCAC CCCATCATGG TAAGTGGTAG TAGCGCGTTC CCCCCCTTGC TTGCGCACTG TCAGAAACTC  TTCGGTCTTG AGCCTAAACT AGTTTTTCTT TGATTCCACA TTACTACAGC GTCGTGGTCA AACTCAAACA CATCAGACGA TGTAGTTTCG TATCTTCGAA GCTGTTGGTT TATAGTTTAT  TCCTTGAATT TGTTTCCTAC AATGTCCTGA ATGTAGATTC ACGGACCCAA CAGCGTTCTC CATGTTTCAA TCGAGCCGTT GTCGCTGCTG CTTGTGGTGT GCAGTGTGGC TGTTGTCCTT  GCACAGTGTG GTTATGGTAC TTGATCGGAA ATGGACATAT GCCTATAGGC TATAGTAGAG GATATGTTGA TCTCAAATAG AAAACTGAGC CTATGTTTCT TCCGTTGTGA CAGTGGCGGA  GCTAGGATTT TGAAGTTGGG TACGTATTCC CAACATAAAA TGTGTAAACA CAAAAATATA CACAACATAA ATTTCAGTGC AAATGATTTA CATACGCATA GACATCATAT TAATTTAGAA  AAATAGTTCA ATAATACTAC AAATTTTGGA CTTGAAATAT GTAAATAAAA GAATTCAGCA CAGCAGGTCT GGGTCCTTGG GCCTGAGCTC CTAGCTACCC ACCTAGCTTG ATCTGTTCCT  GACATACCTC CTCTTGGCCA TCTCTGCGGT GCCACACCGG CTACCGGCCT AGCCCAAGTT TTGGATTTGA GAAGTTAAGG AGATAAAGCC TGAGCGTGAC ACAGGTAACA TGTGAGACTT  GAGCGATGTA GAGAGACTGA GACACTGAGG GTGTGTTTGG TTGCATGCAA CACATGATGC ATGTATGGAT GATCTTGGAT GGTGTGGTTT AACCAATTTG TTTGTACCAT ATAGTTCACT  CCTATTAGTA AAATAATATA TTAAGTAGGA TGACTCCATC CTATTAGTAC AAAAGGATCA CTATTATTTT GAACCATTAC ATACATGAAC CAAATGATAC GAGCAACCAA ATATACTCTA  AGACAGAGGC GATGGGCTAG ATAGTCTGCT GAGGTACTTA CAAACAATGG AATTAAGCCT ATAACAAACT ATTTATGTAT CCATACTTTA TATATACTTG CTCTTTGACA AAATAAGTTG  GGTATTCCTA GGAATACCAG GAATACCCAA TGGAATTAAG CCTATAACAA ACTATTTATG TATCCATACT TTATATATAC TTGCTCTTTG ACAAAATAAG TTGGGTATTC CTAGGAATAC  CAGGAATACC CCCTAGCTCC GCGCCATGCG TTGTGACCTT CGATGATCAG GGAGCACAGA GAAAAGTAGA GCATTCGTGC CAAACAATGC AGTAACTGGA GAAGAATGGG CAAGTCACGT  GGGATTTGTA CCGAAAAATT GGATGGAGCA ACTATGAAAT GTGTCGAGGG ATGACACTGG CCGATGCTCC CGAATGCTAT CTTGCACGAT ATAAAAATGT CTCTGCTTAA GGAAAATGTG  AAACATCTGC AACTAACGCA TGCATGCTGT TGGCACAAGT TTTACTTGCT TTGGTTGCTC TATTGATAGT AAAACAGCAA TACAAATGCA GTAACTACAA TTTGTTTAGT ACATTGGAGG  GGCTACACTA TTTTTCAATC AATGTGCCTT TGTTCTATGC AGTGACTAGC TTTTCATGGT ACTTTGCAAA TCAGTGTTAC TCTGTGACAT TGTGCTTATT TTAAATCGCA ATTTACCGAG  TTGATTAATG AAAGATGTTA CTTATAGTCA AGTGCCAAGT TGTTTAGTCA ATACATGGCC ATGATTGTAC AAGCAAGTTT ACCATGGACA AGTAATCATC TTAGGTTGTA ATGCTTTGTA  ATCTGTTCAG GTCCGTCTGG GGTGGCATGA TTCTGGTACC TATGACAAGA ATATTGAGGA GTGGCCCCAG CGAGGTGGAG CTGATGGAAG CTTGAGATTT GAACCTGAGT TGAATCATGG  AGCCAACGCT GGTATTTTCT CTCATCTTCG GAGTCTATGT TTCTTATACT TTCTAGGTGA GTAGTAGCTT ACTGATTTGA CTTGATTTTT CACAGGTCTG ATTAATGCCT TGAAGCTTAT  CCAACCTATG AAGGACAAAT ACCCAGGTAT CACTTATGCA GATTTGTTCC AGTTGGCGAG TGCTACAGCA ATTGAGGTCA TAGTTCTTTC TCTGCTTAAG TTATCTCACT TGGCCACTTT  GATCAGTCGA GTTTATGTGG TTACATGCAT TGTCAATCTC ATTATACAGG AAGCTGGTGG CCCAAAAATT CCAATGAAAT ACGGACGGGT GGATGTCACA GAACCTGAGC AATGTCCACC  TGAGGGGAGG CTTCCTGGTC AGTGTTTCCA ATGCGTTCTT CATTCTATGC TCTATTGCAA TGTCTACTTT TGTGTTTTGT TCAATGCTTG AAATTTTGGT GAGCAGTATT TATCAAGGTT  TGACTAACTT GTTCCTGATG CCCATGATCT GCAGATGCTG GCCCACGTGA TCCTGCTGAA CACCTTAGGG AGGTATTCTA TAGAATGGGT CTTGATGACA AGGTGTGGCA TGGTTTTGAA  ACTTCACTAA ACTTTCTGCC TGTATTTTCC TAAAAATGGG ACATGCTGTT GAACTTCCAG AGCATGTGTG CAGGAAATCG TTGCACTGTC TGGAGCACAT ACACTTGGAA GAGCAAGGCC  TGACCGGAGT GGCTGGGGAA AGCCAGAAAC AAAATATACT GTATGTTTTG TGGTCTATTT GCTTCAGTTT ATATCAGAAC ACTAGGTTAC TTTCCAGTTT ATATCAGAAC ACTAGGTTAC  TTTCTCAGTT CTGGGCATTC TCAGTTCGTT ACAATTCCTG CAGTTTTTTG TCCTTAAGAC AAAATAACTG GCTAGGACTT GACAATTTGT CTACTATTTG TGTCCCCTTT ATACTAGGCT  TAGTGTTGAA ACATTATCGA GATGCAAAAC GTTACTTGAT AGCTAATTTT CTCCATCTCC TGATGCCTCT TTATTGAGAA ATGAGAATTC TATTCTCCTT GTATCCAAAC TATCTTTTTG  CAACCTTACT TTTAACTGGG ACGAGTTCTG AATCTGATTA GTTTCAATTA ACCAGTACTG AGCTTCTCCT ACACTGTGTT TTACAGAAGG ATGGCCCTGG TGAACCCGGA GGGCAATCAT  GGACAGTTGA ATGGTTGAAA TTTGATAACA GTTACTTCAA GGTGTGCCCC CTTTTTGTCA TGTTTACAGA TCAAATAATT CACTAGAATC TCTGATGATT TACTTTAAGC TGTTAACAAC  ACTTCAGGAC ATGAAGTTTC TGAGCCAGCT TCCATCGAAA GAGCAGAAGG ATCAGGATCT TCTAGTTTTG CCCACTGATG CCGCATTATT TGAGGATCCA TCTTTCAAGG TAACCACCTG  GGCTCAGTTT GTGACCTGCA GAAATCCTAC GTGCATTCCC TGACAATCAA CGACACATTC AGGTGTACGC AGAAAAGTAC GCAGAGGACC AGGAAGCCTT CTTTAAAGAC TATGCTGAGG  CTCATGCTAA ACTGAGCGAC CTTGGTGCAA AGTTTGATCC TCCTGAGGTT AATGTCACCA TCCTGCCACT TCATTCTTCT CCAACCAGTT GCAACTTTAG TAAACAACAA GCAAATGCAG  TAGCACACTT TCTATTCTGT AGGCTTGCAA TCTGAATGAC AGATTTACCA GTATATCATG TTGAGTCATA TGAAAGACAT AGATGCATCG CTAACGTAAG ATCAGAACTA GTCTGGTGAT  GGGAGTTTGA GAGACGGGCC AAGTGGCAAG TAAATTGGTC TATCTGGTAC CATTTTGATG GAACATGAGT GATTATGGAT GCTTAGGGTC AACTTTTCCT TGTTGCTCCA GTTCCTGTAG  AAGCTGATAA GTATGTTGGA CTGTTGGTTT GTGTCCGACT TCATGTATGT GATGTGATTA TCCTGCAGGG ATTCTCACTG GACGATGACA CAAGCGATGA GCCAGCAGCT GAAAAGAAGG  AAGAAGCTGC ACCAACACCG GAACCGGCAG CTGCAGCAGC ACCTCCGCCA GAGCCAGCAG CAGCACCGGC ACTGGAACCA GTAGCAGCAG CAGTAGCAAC AGCGACAGCG GACGACAACA  ATGGCGTGGC GCCACAGCCG GAGCCCTTCG TCGCTGCCAA ATATTCTTAT GGAAAGGTAA GAAAGCACTT GTCCCCCATC TTTTGCAATC TAGAGGGCAG CTTAACGATA ACTTGATGGA  GCATGAGTGC ATGACATTGG TGAACTCGCA GACGGAGCTG TCGGATTCGA TGAAGCAGAA GATCCGGGCG GAGTACGAGG GGTTCGGAGG CAGCCCGGAC AAGCCTCTGC AGTCCAACTA 
CTTCCTCAAC ATCATGCTCC TCATCGCGGG GCTGGCGTTC CTGACGTCTC TGGTCGGCAA CTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGAGC GCCTCGCCGC CTCCCTCCTC CCCGCCGCCT CCCCCTCCCC GTCCGCCCGC CGCGCCACGG TCGCGGCCTC GGGGTCCGCC GCCGCGTCCT TCCCTTCCTC GTGCTCCGCC  CGAGCGGGGC TGCGCCTCCG CTCCTCCCGC TCGGGGTCGG CCCGCTTCTC CAAGGCGGCT GGGCGCGGCG GGGGAGGCGG CGCGCTGCGG GTGGTCCGGT GCATGGCGGC GTCGGACGCG  GCGCAGCTCA AGAGCGCGCG GGAGGACATC AGGGAGCTTC TCAAGACCAC GTACTGCCAC CCCATCATGG TCCGTCTGGG GTGGCATGAT TCTGGTACCT ATGACAAGAA TATTGAGGAG  TGGCCCCAGC GAGGTGGAGC TGATGGAAGC TTGAGATTTG AACCTGAGTT GAATCATGGA GCCAACGCTG GTCTGATTAA TGCCTTGAAG CTTATCCAAC CTATGAAGGA CAAATACCCA  GGTATCACTT ATGCAGATTT GTTCCAGTTG GCGAGTGCTA CAGCAATTGA GGAAGCTGGT GGCCCAAAAA TTCCAATGAA ATACGGACGG GTGGATGTCA CAGAACCTGA GCAATGTCCA  CCTGAGGGGA GGCTTCCTGA TGCTGGCCCA CGTGATCCTG CTGAACACCT TAGGGAGGTA TTCTATAGAA TGGGTCTTGA TGACAAGGAA ATCGTTGCAC TGTCTGGAGC ACATACACTT  GGAAGAGCAA GGCCTGACCG GAGTGGCTGG GGAAAGCCAG AAACAAAATA TACTAAGGAT GGCCCTGGTG AACCCGGAGG GCAATCATGG ACAGTTGAAT GGTTGAAATT TGATAACAGT  TACTTCAAGG ACATGAAGTT TCTGAGCCAG CTTCCATCGA AAGAGCAGAA GGATCAGGAT CTTCTAGTTT TGCCCACTGA TGCCGCATTA TTTGAGGATC CATCTTTCAA GGTGTACGCA  GAAAAGTACG CAGAGGACCA GGAAGCCTTC TTTAAAGACT ATGCTGAGGC TCATGCTAAA CTGAGCGACC TTGGTGCAAA GTTTGATCCT CCTGAGGGAT TCTCACTGGA CGATGACACA  AGCGATGAGC CAGCAGCTGA AAAGAAGGAA GAAGCTGCAC CAACACCGGA ACCGGCAGCT GCAGCAGCAC CTCCGCCAGA GCCAGCAGCA GCACCGGCAC TGGAACCAGT AGCAGCAGCA  GTAGCAACAG CGACAGCGGA CGACAACAAT GGCGTGGCGC CACAGCCGGA GCCCTTCGTC GCTGCCAAAT ATTCTTATGG AAAGACGGAG CTGTCGGATT CGATGAAGCA GAAGATCCGG 
GCGGAGTACG AGGGGTTCGG AGGCAGCCCG GACAAGCCTC TGCAGTCCAA CTACTTCCTC AACATCATGC TCCTCATCGC GGGGCTGGCG TTCCTGACGT CTCTGGTCGG CAACTGA 

Retrieve as FASTA