Entry information : AcoPrx117
Entry ID 9999
Creation 2011-12-14 (Qiang Li)
Last sequence changes 2011-12-14 (Qiang Li)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-12-14 (Qiang Li)
Peroxidase information: AcoPrx117
Name AcoPrx117
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx030]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ranunculaceae Aquilegia
Organism Aquilegia coerulea     [TaxId: 218851 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AcoPrx117
start..stop
S start..stop
AcoPrx110 654 0 1..314 1..314
AcoPrx61 632 0 8..314 26..330
VvPrx38 508 0 11..312 29..327
PtPrx08 495 2e-178 11..312 31..329
Literature and cross-references AcoPrx117
Protein sequence: AcoPrx117
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   314
PWM (Da):   %s   34882.19  
PI (pH):   %s   5.1
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TKIGGVQGKG SELQLNYYSE SCPRAEEIVK EEVTQLYHKH GNTYxAVSWV RNLFHDCMVK SCDASLLLET SNGIISEKTA KRNFGMRNFK YVDVIKEALE RECPMTVSCA DIIALSARDG  VSLLGGPSID GMKTGRRDSK ESYSSVIDDF IPNHNDTMTL VLAQFQNVGI DAEGTVALLG AHSVGRVHCV NIVNRLYPDT DPTLDPDYAT YLKGRCPNPQ PDQKEVEYAR NDRETPMVID 
NMYYKNLLSH KGLLLIDQQL TSDTSTYPFV EKMASDNGYF HDAISKALLL LSENNPLTGD EGEIRRDCRY INQE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (5' end is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAAAAATTG GGGGTGTTCA AGGTAAGGGC AGTGAGCTTC AGCTAAACTA CTACTCGGAG AGCTGTCCAC GAGCCGAAGA GATTGTCAAG GAAGAAGTAA CTCAATTGTA CCATAAGCAT  GGCAACACAT ACAnnGCAGT ATCATGGGTT AGAAACCTTT TCCATGACTG CATGGTTAAG GTACTGGCAC ATCACAAATG ACACATGCAT ATAAATAAAT AAGTTGGCCG ATAACCACAT  GATATATGGC ATATATACTA ATTTTCTTCA GATTTTTCAA CAATTATATT GCAGTCCTGT GATGCCTCTC TTCTGTTGGA GACGTCGAAT GGCATAATCT CGGAGAAGAC AGCAAAGAGA  AACTTTGGTA TGAGGAATTT TAAATATGTA GATGTAATCA AGGAAGCTCT CGAGCGTGAA TGCCCCATGA CAGTTTCATG TGCTGATATC ATAGCTTTGT CTGCAAGAGA TGGTGTTTCA  CTGGTATACA TGCATGAATA CACCTAACTA ATATGCATGC ATGTTTGATA ATTAATATAG CCAGATAGGA CTATTTTCAA TCATAATACA AAACATTATA TGTTGCAGTT AGGAGGACCT  TCCATAGATG GTATGAAGAC TGGGAGAAGG GACAGTAAGG AAAGTTATAG TTCAGTGATC GATGACTTTA TCCCTAATCA TAACGACACA ATGACTTTAG TGCTTGCTCA ATTTCAAAAT  GTTGGAATTG ATGCTGAAGG AACAGTAGCT CTACTTGGTA TGTACCCTTA ATTTTTATTC AATGTAATCC ATATACTGTA TAAATTTGCA GGTGTTAATG TTAGAATCCA AATTTCCTCA  ACAAATGTTC AACCCCGTTA TATATATATC TGTTCAGGAG CTCACTCGGT TGGACGGGTA CATTGTGTGA ATATTGTGAA CAGACTGTAT CCAGACACTG ATCCAACATT AGATCCTGAT  TATGCAACGT ACCTTAAAGG CCGATGCCCA AATCCTCAAC CTGATCAAAA GGAGGTAGAA TACGCAAGAA ATGATCGTGA AACGCCCATG GTGATTGATA ACATGTATTA CAAGAACCTG  TTGAGCCACA AAGGACTCTT GCTAATAGAC CAGCAGTTGA CTTCTGATAC TTCTACATAT CCTTTTGTAG AGAAAATGGC TTCTGATAAT GGCTACTTCC ATGATGCAAT CTCAAAGGCC 
CTCCTGTTAT TATCAGAGAA TAATCCACTT ACAGGTGATG AAGGAGAGAT AAGACGAGAT TGTCGATATA TCAATCAAGA ATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAAAAATTG GGGGTGTTCA AGGTAAGGGC AGTGAGCTTC AGCTAAACTA CTACTCGGAG AGCTGTCCAC GAGCCGAAGA GATTGTCAAG GAAGAAGTAA CTCAATTGTA CCATAAGCAT  GGCAACACAT ACAnnGCAGT ATCATGGGTT AGAAACCTTT TCCATGACTG CATGGTTAAG TCCTGTGATG CCTCTCTTCT GTTGGAGACG TCGAATGGCA TAATCTCGGA GAAGACAGCA  AAGAGAAACT TTGGTATGAG GAATTTTAAA TATGTAGATG TAATCAAGGA AGCTCTCGAG CGTGAATGCC CCATGACAGT TTCATGTGCT GATATCATAG CTTTGTCTGC AAGAGATGGT  GTTTCACTGT TAGGAGGACC TTCCATAGAT GGTATGAAGA CTGGGAGAAG GGACAGTAAG GAAAGTTATA GTTCAGTGAT CGATGACTTT ATCCCTAATC ATAACGACAC AATGACTTTA  GTGCTTGCTC AATTTCAAAA TGTTGGAATT GATGCTGAAG GAACAGTAGC TCTACTTGGA GCTCACTCGG TTGGACGGGT ACATTGTGTG AATATTGTGA ACAGACTGTA TCCAGACACT  GATCCAACAT TAGATCCTGA TTATGCAACG TACCTTAAAG GCCGATGCCC AAATCCTCAA CCTGATCAAA AGGAGGTAGA ATACGCAAGA AATGATCGTG AAACGCCCAT GGTGATTGAT  AACATGTATT ACAAGAACCT GTTGAGCCAC AAAGGACTCT TGCTAATAGA CCAGCAGTTG ACTTCTGATA CTTCTACATA TCCTTTTGTA GAGAAAATGG CTTCTGATAA TGGCTACTTC 
CATGATGCAA TCTCAAAGGC CCTCCTGTTA TTATCAGAGA ATAATCCACT TACAGGTGAT GAAGGAGAGA TAAGACGAGA TTGTCGATAT ATCAATCAAG AATAA 

Retrieve as FASTA