Entry information : HsubGPx01
| Entry ID | 10029 |
|---|---|
| Creation | 2011-12-21 (Passaia Gisèle) |
| Last sequence changes | 2012-04-06 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-04-06 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: HsubGPx01
| Name | HsubGPx01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Fungi-Bacteria glutathione peroxidase [Orthogroup: Gpx3001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Strophariaceae Hypholoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Hypholoma sublateritium [TaxId: 71945 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10029' 'join(103627..103886,103937..103959,104015..104082,104151..104324,104378..104485)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references HsubGPx01
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_11 (103627..104485) |
|---|---|
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 52546 [Incorrect prediction] |
Protein sequence: HsubGPx01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (4 introns). Incorrect prediction from JGI (bad splicing of intron 3: concervation of the position between species) | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
