RedOxiBase: View Perox 10044

Entry information : CclPrx124

Entry ID	10044
Creation	2011-11-25 (Qiang LI)
Last sequence changes	2012-01-04 (Qiang LI)
Sequence status	partial
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2012-01-03 (Qiang Li)

Peroxidase information: CclPrx124

Name

CclPrx124

Class

Class III peroxidase [Orthogroup: Prx040]*

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus

Organism

Citrus clementina [TaxId: 85681 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	CclPrx124 start..stop	S start..stop
CclPrx68	479	5.29e-173	1..242	109..349
CsPrx54	470	1.8e-169	1..242	109..349
CclPrx05	467	3.04e-168	1..242	109..350
CsPrx52	466	3.55e-168	1..242	109..350

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	1142589..1142675	87	N° 2	1141828..1141996	169	N° 3	1140931..1141299	369	N° 4	1132928..1133031	104
complement(join(1132928..1133031,1140931..1141299,1141828..1141996,1142589..1142 675))

Literature and cross-references CclPrx124

DNA ref.	Phytozome 12: scaffold_31 (1142675..1132928)

Protein sequence: CclPrx124

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	242
PWM (Da):	26092.11
PI (pH):	8.21

Sequence 338
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MKAAVERACPGVVSCADILTIAAEESVALSGGPAWTNLLGRRDSRTANRTLANENLPGPNNSLERLKDRFRNVGLNDNFDLVALSGAHTFGRAQCRTFSDRLFNFNNTGNPDPTLNTTLLQQLRQLCPQGGNGSVLTNLDVTTPDLFDNKYFFNLQISKGLLQSDQELFSTPGADTTAIVNVFSSNQAAFFKSFVISMIRMGNLKPLTGNQGEIRLNCRRVNGNSNIATRSSSSEGDLVSSF

Retrieve as FASTA

Remarks

Partial sequence from genomic (5' end is missing). No prediction from phytozome.

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGAAAGCTGCCGTTGAAAGGGCCTGTCCAGGCGTTGTTTCCTGTGCTGATATTCTTACTATTGCAGCTGAAGAATCTGTTGCTCTGGTATGTGTGAATTTCTATTAACAACTCCTCATC
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TTAATTTGTATGAATTTGAGTAAAAATAACAAAGATCGGCTATGCATGTTTTTCAGGAGCTCACACGTTTGGAAGGGCTCAGTGCCGAACTTTTAGCGATAGATTATTCAATTTCAACAA
CACTGGCAATCCAGACCCAACACTTAACACAACCCTCTTACAGCAACTTAGGCAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCAGCGTTCTAACTAATCTTGATGTCACAACACCTGATTTGTT
TGACAACAAATACTTCTTCAATCTTCAAATCAGCAAGGGCCTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCCGGTGCCGATACCACTGCCATTGTCAATGTCTTTAGTAGCAACCA
GGCTGCTTTCTTTAAAAGCTTTGTGATTTCAATGATAAGAATGGGGAATTTGAAACCATTGACAGGCAATCAAGGGGAGATTAGATCGAACTGCAGGAGGGTCAACGGAAACAGTAATAT
AGAAACCAGATCATCGTCAGAGGGTGATTTGATCAGCTCTTTCTAAATAAGCTAGTTTGCAGCACATGTGAGAGATAGAGTTTGTGGGTAACAAACTCGTGAATTTACTCCTATGTTTTG
CCTGAAACATGCTTTTTATTTTCAATAAACTAAGGTTGTGTTTGTGTATTCACATCCTTGCTTTCTATGTATCAGAAATCCTTGTCATACAGTATGTGTGTATTTTTTTTCCTATGTCAT
CGGTACGCATTGTCATCTGAGTCACTTTCCAGTTTTTAGTGATCCATTTTATCCCCCAGCTTTAAAATATTAACCGGAAAAAAACCTTATTCTTACATATTTCTTTCTATTTCTACTTTT
TGTCAAATATCCGTAGTTTGACAAAATAGTAGGGAAGAATCTTTTATTTTCAGAAATAATCATACATAGCTTTTTTTATGGGATAACAAAACTTATTTTTAGACAAATTTTAAAAATCCA
TTTGACAATTTTTGGGGTCTGTGTGTACCAAAAAAGAGCCTATATAATTTCTAAAACCAATTGAATCTCCGTACTATTTCACTAAACCATTTCGCAAGGCAAACACTAACTTACAACTGC
TGTAAGTTACAGCACTCACAAAAATATGCATGAACAGTAATAAATGGTGGGTCCCATGTAATTTTTGTGTGTGCTGTAACTTACAGCTGGCTGTAAGTTAGGGGCTCCCATTTCGCAATT
ATTATGATCCTTTTTCCCCATAAAAGAAAACATTAGTAGCAACAGTTATCTTTTTCATGATCATTAATAAAATCATTTTTTACCCATTTCAAAAGTCATCCAGCCATTTCTTAATTATTT
AACTCCCACTTGAGGTTTCAATTAATCAAGACCTCATTTGAAATTAAAGTAAGACCGATTTACCTTTTAAAAACAACATTAAATTATTTAGAAAATATTTACTGCTATTTTTAAAACCTC
ATTTGAAATTAAACTTCGAGGTTGCTGCAAAGTTCTAATCCTAATCTGGTTTGTTTGGTTATAAATAAAGAGGCATTTCTCTTTGTTTTCCAAGTCCTAAGACTAATTATTCTCTTAATA
GAGAAGTAGTAACTCTTAGACAAAATGGCTTCACTTCGTTATCTTCTTGCAGCAGCTCTTGTTGTTGCTTTTGTGCTTGAGGGATCACCATCTCAAGCTCAACTTTCTCCCTCTTTTTAT
TCTTCCACATGCCCTAATTTATTGAACATTATCGAGGATGTGCTTAAGAAAGCTTTCTCGTCCGATATCCGCATCGGTGCCAGCCTCATCAGGCTTCATTTCCATGACTGTTTTGTTGAT
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ATTTTCATATATCTTTTTTTTTTCTCTTTTTCTTTTCTCTTTACGACAAATTTTTCCTCTCTAATTCGATGTACCGAGGACCATGTAATTCTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGG
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GCATTATTTATTTAATTTTTTTGAATTCATGTCCATAAGATAAGAAGGAATCTATCTACTTGTTAAAATAACAATATAATGGACTGTTAACATAGCAAGTTGTTAACTAATACTATTTTT
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ACCGTGCTACAGTTACATTCAGCCGTTGGATCCACTTAGATGAGTGGAGTCTATTAGAATTTAATGGCTGGATGCAACAGTAGCACGGTACCATATTTGCACCACAATTTTTCCCTTATT
TAAAAGGGGTGACTTATTGACTATGGTGCATCAGCTACACTGTGTGGTACCAAAATTGCTACACATATGTCAATATAGTGATTATTAAGGGATAAATTGTTACTGACAGTGAGACACTTT
TTACTGCGCTGGTGCATCGTAGCAAGTCCTTAGTTTTAAACTTAAAAGTTTTCTTCTTTTGTTATACGACAAAGTTTTGATTCAACGGCTAGCAAATTAAATAGTCCGCCCCAAACGCAC
ATCTCTTAAGATTATTGTTGATTTTGAGTGAATGGCTTTTGGTTACAGTCAGGGGGTCCGTCATGGGCAGTTCCATTGGGAAGAAGGGACAGCAGAACAGCAAACAGAGCTCTTGCAAAT
CAGAAACTTCCAGGACCATCTGATACTCTTGATGTGCTCAAATCTAGTTTTAGAAATGTTGGCCGCAATGACAATTTTGATCTTGTTGCACTCTCCGGTAATTATTAATTGCTTCTGCAT
CCTTTTAATTACTTGAGTAAAGTTATGGGAGTAGACTTTTAAAAGTCAAAAGAGCATGGTACTAGCAAACCACGCTCAAAAATTAATTTAAGAAATGAGTGTTATGCCTTAAATTTATGT
ATACTTAACTCAAAATTGGGCATGCATGTTTTTCAGGAGCTCACAGGTTTGGTAGGGCTCAGTGCCGATTTTTCAGGGGCAGATTATACGATTTCAACAACACTGGCAAGCCAGACCCGA
CACTGGACAGAACCCTGTTAAAGCAACTGAGGGAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCGGCGTTCTTGCTAATTTTGATGTCAAAACACCTGATGTTTTCGACAACAAATACTTCTCCA
ATCTTAGACTCCGCAAAGGCCTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCTGGTGCCGATACCGCTGCCATTGTCGAGGACTTTGGGAGGAACCAGAATGCTTTCTTTAAAAACT
TTGTGACCTCAATGATAAGAATGGGCAATTTGAAACCACTGCAGGAAATCAAGGGGAGATTAGATTGAACTGCAGGAGGGTCAATGGAAACAGTAATATTGCAACAAGATCATCATCATC
GGAGGGTGATTTGGTCAGCTCTTTCTAA

Retrieve as FASTA

CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGAAAGCTGCCGTTGAAAGGGCCTGTCCAGGCGTTGTTTCCTGTGCTGATATTCTTACTATTGCAGCTGAAGAATCTGTTGCTCTGTCAGGGGGTCCTGCATGGACAAATCTATTGGGA
AGAAGAGACAGCAGAACAGCAAACAGGACTCTTGCAAATGAAAATCTTCCAGGACCGAACAATAGTCTTGAGAGGCTCAAAGATAGATTCAGAAATGTTGGCCTCAACGACAATTTTGAT
CTTGTTGCACTCTCCGGAGCTCACACGTTTGGAAGGGCTCAGTGCCGAACTTTTAGCGATAGATTATTCAATTTCAACAACACTGGCAATCCAGACCCAACACTTAACACAACCCTCTTA
CAGCAACTTAGGCAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCAGCGTTCTAACTAATCTTGATGTCACAACACCTGATTTGTTTGACAACAAATACTTCTTCAATCTTCAAATCAGCAAGGGC
CTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCCGGTGCCGATACCACTGCCATTGTCAATGTCTTTAGTAGCAACCAGGCTGCTTTCTTTAAAAGCTTTGTGATTTCAATGATAAGA
ATGGGGAATTTGAAACCATTGACAGGAAATCAAGGGGAGATTAGATTGAACTGCAGGAGGGTCAATGGAAACAGTAATATTGCAACAAGATCATCATCATCGGAGGGTGATTTGGTCAGC
TCTTTCTAA

Retrieve as FASTA