Entry information : MtPrx[P]116 (Medtr7g086790.1)
Entry ID 10056
Creation 2011-11-25 (Qiang LI)
Last sequence changes 2014-07-16 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-06-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MtPrx[P]116 (Medtr7g086790.1)
Name (synonym) MtPrx[P]116 (Medtr7g086790.1)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx025]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtPrx[P]116
start..stop
S start..stop
MtPrx89 487 1e-175 9..310 13..315
GmPrx125 408 2e-144 2..308 5..311
PvPrx13 385 2e-135 4..310 9..314
MePrx102 361 5e-126 1..307 6..316
Literature and cross-references MtPrx[P]116 (Medtr7g086790.1)
DNA ref. Phytozome 12:   MtChr7 (33762588..33755691)
Protein sequence: MtPrx[P]116 (Medtr7g086790.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   310 (296)
PWM (Da):   %s   33526.37 (31963.5) Transmb domain:   %s   i2-24o
PI (pH):   %s   7.87 (7.87) Peptide Signal:   %s   cut: 15 range:15-310
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
SIILFLFVLP MAFAYLQLGL YAFSCQKAEL IVPQVVQKRF NRDKSVIAAL ICMHFHDCFV RGCDASLLID STNNTTAEKD SGTNECVRGY DLIDNVKEAI KVVCPLTVSC ADIVALATRD  VVPLSGGPTY GVPTGRLDGL VSNNEVNIPP PTFPVKVLSQ FFMTKGITTE EMVALLGAxT IGVAHCGFFS NRLSSSGGKP DPTMDPTLDA KLVKLCKSNV DGATFLDQNT SFVIDQEIYK 
QILLKRGILQ IDQKLTLDKS TSLFVSNFAS NGEKFVNNFA TAMIKMGKIG LLIGNEGEVR KNCRVFNKLN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from genomic (5'end is missing, introns 1, 3 and extra 3'). No prediction from phytozome. no EST found
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCAATCATCC TCTTTTTGTT TGTACTTCCA ATGGCATTTG CTTATCTACA ATTAGGATTA TATGCCTTTT CCTGTCAAAA AGCCGAGTTG ATTGTGCCGC AAGTTGTGCA GAAGCGGTTC  AATCGCGACA AATCCGTAAT TGCAGCTTTG ATTTGCATGC ATTTCCACGA CTGTTTTGTC AAAGTAAGAA CTAACTTGTT AAATATATTC TAAATTCTAG CTTGTGAATT TGTATAATTA  GTTTCTGCTA AGAATATGAT TCTTATCTAA CAAAAAAGAA ATCATTTTAA GTTTCAACAG TCATACAAAA GTTACATGAG AAAACTTGGT GAAAATGGTA ATTGTTACTT GTACAAAAAG  TTTTAGTTTA AAAATCAAAG CTTTGATCAT GTATTACTTA ATTGGTTTGT CAAACGATCA ACCTACCAAA TAGGCATAAG AAGATTGGGA TCTATTAAAA AATTGTTTTG ATTTAATTTT  CGATAGTTTT TATTCAAAAG TTTATTTGTA TCGATAACAT ACATTTCCAT CAATGTGTAG GGGTTGTGAT GCATCTCTTC TCATAGCTCA ACAAATAGCA CGAAATCAGA GAAATAAAAT  GACGCAAACG AAACTGTTAG AGGCTATGAT CTAATAGACG AGCCGAAGGA AACAATCGAA GTTATTTGTC CTTCAACAAT ATCATGTGCA GACATCTTAA CACTTTCTAG AAGAGATGTT  TTGGCCTTAT CCGGAGGACC AAAATACAAT GTTCCGACTA AGCTTGTGAA ATTGTTTGAA TCAGGCAATG ATGCTGCAAT TTTGTATTAG AAGACTTCTT TTATTCTTGA TAATGAATTT  TACCAACAAT TTCTTCTCAA GAGAGGTATA TTGCAGATCG ATCAGAAACT TACTTTGGTT AAATCAACAA GTCCTTTTGT GTCTAATTTT GCTTCAAATG GTGATAAGTT TGTTAAGAGT  TTTGCAACTG CTATGATAAA GATGGAAAAA AAATGGATTT TTGTTAGGAA ATGAAGGAGA AATTCGGAAG AATATTGTAG GGTCTTCAAT AAAATTCAAT TAGCTAGAGT GGATTGAAGA  GACTCTATTT TCTATTTGGG TTTTATGCGT ATTCCTACCA AAAGTCGAGT TCATTGTTAA GCAAGTTGTG CAGAAGCGAT TCAATTGCGA CAAATCCATT ACCGCAGCCT TGCTTCGCAT  GCATTTTCAT GACCATTTTG TAAGATTAAG AACTATCTAG CTAAATATAT TCTAAATTCT AGTTTGTGAG TTTGTATAAT CAGTTTCTAC TTAGAATATG ATTCTTATCT AACAAAAAAA  AATATTCATT TTAAGTTACA TCAACTTTTG AACTACCTTT TTTGCGTACA CTTCATTTTG GAAGGAGTAT CTCTTTATGT TTGTGTACAA TTATCATATA TATATATATA TATATTTGTA  AATGACTTAT TGAAAAAACA TGTAAATGAC TCACACACGC ACATATGCAC GCACACATGC GCACACACTC AAGAATGCAA ATAGTTTTCA AACATTGAAT TTTCTCAATT TCAATGTCAA  TAAAAATATC ATTCTCAATA GATGTAATCA AACAATTATT TAATCATTTA TCTTTTTTTT ATAATTTCTT TTGCTTTTGC TGATCTAAAA TTAGGATTAT ACTCCTCCTC TTGCCAAAAA  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CAATGCCCTC ATTGTGCTCC ACACTGTGGA CCTCAGGTCC TATTAGGCTA ACTTAATGAG CACGTTTAAG AGGAAGTCAA AACATTGTTA AAATTAGGCC AACATATTAT ACAGAAGGAC  AACTACATGA AAAAACCTGT TTGTTTGCTT TGATAACTCA TAGAGAGATT AAAGGAGTGG TTTGTTAGCA TAGAACCAGT CAAAAGAAAT AAGGAATATA AATATTTGAA GAACTTTTGA  AATATAAGCA ATATTTACAA CAAACTCATC TTCAATGAAA GTGTTTTAGA TCTATATTCA TCATCCATTA TCAGTTAGAC CATCAAGTCA CAATCATCAC CCTCACCTCG CATATCCTCC  ACAAAAGCTT TGACTTATTT CATTTTCCTT GTTACTTACT TACTTACTCT CTTTCATCAC GAAAATTACA GCAAGGAAAA GGAGAAAATT GAAGGTACTC TTCTTACAAA TAAGTAGTAC  ACAGCCAGAG AAAATAGGAG GGAGAGAGAG ACTTGTATTC ACCAAATTCT TGCCTAACTA ATCCAAAGCA CAACTCTCCC TTATATGCTA ATCAGGTGCT GTATTTTTTG TTAGCCCATC  TAATCTCCAC AATAGTTGGA TCACAAGCCA CCTGTTCATT TTCTCTAACA GAATTTGATA CTGTCGGCAG TTGGAATATT CTCATTCATA ACAAAATGCT TATTGTAACT TGTACAAAAA  GTTATAGGCT TAAAAAATCA GAGCTTCGAT CCTCTCTTGG TTTTATTTTT ATATCTTGTT AATTGAATCC ATATACAACG CGCATTTTCA TTCATCTTTA GAGTTGTGAT GCATTCATCC  TCATTGATTC AACCAATAAC ACCACAGCAG AGAAAGACAG TGGCACAAAT GAATGCGTTA GAGGATATGA TCTAATCGAC AATGTAAAGG AAGCAATCAA AGTTGTATGT CCTTTAACGG  TTTCATGTGC AGACATTGTA GCGCTTGCTA CAAGGGATGT CGTGCCATTG TCAGGAGGAC CAACATATGG TGTTCCGACT GGAAGACTTG ACGGACTTGT CTCCAACAAT GAAGTTAATA  TACCACCACC TACCTTTCCT GTGAAAGTAC TGTCACAATT TTTTATGACA AAAGGCATTA CAACCGAAGA AATGGTGGCC CTTCTGGGAG CCGTnACCAT CGGTGTTGCG CATTGCGGGT  TTTTCTCTAA TAGGCTTTCT AGCTCTGGAG GTAAACCGGA TCCTACCATG GACCCTACGT TGGATGCTAA ACTTGTGAAG TTGTGTAAAT CAAATGTTGA TGGTGCTACA TTTTTGGATC  AAAATACCTC TTTTGTTATT GATCAAGAAA TTTACAAACA AATTCTTCTG AAGAGAGGTA TTTTTGCGTA CATTTCATCT GGAAGGAGTA TCTCTTTATG TTTGCTTACA ATTATCATAT  ATATATATAT ATAAACTTGT AGATGACTTG TTCAAAAAAC ATGTAATTGA CTCACACACG CACATATGCA TGCACGCGTG CGCACACACT CAAGAATGCA AATAGTTTTT AAACATTGAA  TAATTTTCTC ATTTTCAATG TCAATAAAAA TATCATTCTC AATATAAGTA ATCAAACAAT TATTTAATCA TTTATCCTTC ATCCAATTTC ACATCCGATT CTTGATAATA CTCATTACAA  AAAAACTATT TCATTAGTTA CAGTTACCAC ATGTAATATT AATGACAACT TTAAAATCCA ATATACTGAT TGATACACAC AATATGTTTT TTTTTTTTTT TTCCAGTGGT TTGGGATTTA  CAATTTGAAA ATTGAGATAT ATTTAATTTT GGGTTAATAG GCTTTTAATT ATAGGTCATT TTTTGTTTTC CTCCCTGTAA ACTTTTGTTT GTTTTGGAAT ACCCCCTAGA CCAGCTGACT  GTGTATTTTC GCTGATGTGG CACGCTGAGT CATCGTTTTC TGATGACGTG ACGCGCTGAC TGTATAATTA TTTTATTTTT ATTTTTTAGT GTACACGTGA CATTTGTGAT TTTTTTTATA  AAAACGAAAA AAATTAAAAA TAATTCTAGA AAAATTAATA AAAATGAAAA CAAATGCTGA AAAAATAAAA AAATTGATAA AAATCAGGTA AAATAAAAAA TATTGAAAAA ATTCTAGAAA  AATTAATGAA AAAAAATCTG TGAAAATTTT TAAAAAATCT GAATTAAGTT GCTGAATTTT TCCCTTTTTT ATAAAAATTC TAATAAAAAA TAACACTTCT TATAAAAATT TCAGGAACTT  AAACTATTTG GAATTTTTTA AAAATAATAA GAAAATATAT TTCAATTTTT TTTTTAGGAA CTTAATTAAG ATTTTTTTTT TAATAATTTT TTCAAAGATT TCGATACATA TTAACTTTCC  AGATTTTTTT TTATTTTTCA TTTTATGAGA TTTTTTTTTA TTTTTTCAGA TTTTTATAAA TTTTTTTATT TTTTTCAGAA TTTTTTAAAA AAAAATCACA AATGTCACGC GTGCACAATA  AAAAAATTAT ACAGTCAGCG CGCCACGTCA TCAGAAAAAG GTGATTCAGC GTGCCACATC AACGAAAATA CACAGTCAAC TGACCTAGGG GGGAAAATCA AAAGTGACCT ATATTACAGG  GGGTAAAGAT CTATTAACCC TTTAATTTTT AGGTTATTAA TTGTGGACCT TTTACCATTC CTCTATTTGT TCGGTAGTGG AGTAATGTAT TTAGAAGTTA TAACAAACGG GCCCATAGTG  GTAAAGGATG GGTCGTCCCT ATACCTACTG TATATAAAGG AAATATTAAG TTTTAATCAA ATTTTTCCGC TTCCAATTTT AACCTTATTT ACAATTTTAT CATTCTTTAT CTAATTAGAC  ATTGAATTTC ATCGTAATTT AAAATTGGAT CAAATCAAAA AATAGAAATT AGGATTAGAT ATAAAAACAA TAGAATTACA TAAAAATAAA ACTGGTAATT ACGAAAGTCT GATAAAGAAT  TGTTTTACAC GTGAATCAAA TAAGGTTCTA CTCTGTTTTT AGGTGGTTTA AGTTTCACAA ATGTACATAC CTCTGATCCA GAATTTATGT CAATGTATTA TATATTTAGA TTAGTCCATA  TTTGAGTATA CGCAATAGAA TTCAAAAAAA TTTCAAAGTC TAAATCGAAG TTTAGTTTGA CTGTACTATG TAGCTGCATA CAACTTGAAA CACATGTAGC AATTCAGTGT GAAAGGCTAC  AATTTCAAAT ACGTGAAAGC CAATTTTCAT TTTGAAAACA CAATATCAGA GAGTATTAAT AATTAGGAAA CTATGCAAAA TTTCCCCATA GTCAGATTAA ATGGAAGTGA AATAAATGCG  AAATAATAAC ACACAAAATT CTTAACGAAG TTCGGCCAAT AATACCTACT CTCTGGACTG CTGCAGATCT CTTTAATAAA AAGGGAAATA TACGTGTTTA CAATCACTCA CAATCTCTTT  AATAAAAAGG GAAATATATG CAATAAGGAT TATATGCCTC TTTTTGTCAA AAAGTCGAGT TGATTGTGGA GCAAGTTGTG CAGAAGCGGT TCAATCGCGA CAAATCCATA ATTGCAGCTT  TGATTTGCAT GCATATTCAA CGACTGTGTT GTCGGAGTAA GAACTAATTT GTTAAATTTA TTCTAAATTC TAGCTTGTGA GTTTGTATAA TTAGTTTCTG CTAAGAATAT GATTCTTATC  TAACAAAAAA AAAATCATTT TAAGTTTCAA CAGTTATACA AAAGTTACAT GAGAAAAGTT GGTGAAAATG CTAATTGTTA CTTGTACAAA AAGTAATAGT TTAAAAAATC AAAGCTTTGA  TCATGTATTA CTTAATTGGT TTGTCAAATG ATCAACCTGA CCACAGAGGC ATAAGAAGAT TAGGATCTAT TAAAAAATTG TTTTGATTTA ATTTTTCGAT AGTTTTTATT CAAAAGTTTA  TTTGTATCGA TGACATACAT TTCCATCAAT GTGTAGAGGC TGTGATGCAT CTATCCACAT AGACTCAAAA AATAGGACTA ATTCAGAGAA AGAAAATGAC GCAAACGAAA CTGTTAGAGG  CTATGATCCA ATGGACGAGC GGAAGGAAAC AATAGAAGTT ATTTGTCCTT TAACAGTATC ATGTGCAGAC ATTATAACAC TGGCTAGAAC AGATGTTCTG GCCTTATCCG GAGGACCAAA  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GTCTTTTGAT TGGAAATGAA GGAGAAGTTC GGAAGAACTG TAGGGTCTTC AATAAACTCA ATTAG 

Retrieve as FASTA