Entry information : EgrKat[P]05 ( Eucgr.F03561 / Egrandis_v1_0.049938m)
Entry ID 10162
Creation 2012-01-25 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EgrKat[P]05 ( Eucgr.F03561 / Egrandis_v1_0.049938m)
Name (synonym) EgrKat[P]05 ( Eucgr.F03561 / Egrandis_v1_0.049938m)
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus grandis    [TaxId: 71139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EgrKat[P]05
start..stop
S start..stop
EglKat[P]05 622 0 1..321 1..310
EguKat[P]05 619 0 1..321 1..321
EcamKat03 545 0 1..321 137..466
EgrKat03 545 0 1..321 141..470
Literature and cross-references EgrKat[P]05 ( Eucgr.F03561 / Egrandis_v1_0.049938m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_6 (44118029..44119555)
Protein sequence: EgrKat[P]05 ( Eucgr.F03561 / Egrandis_v1_0.049938m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319
PWM (Da):   %s   36730.5  
PI (pH):   %s   7.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
PVFFIRDGKP NPKSHVQENW RILDVLAHHP ESLGMFTLLF DDTGIPQDER NMTGSGVNTY ALINKARKAH YVKFHWKQTC GVKSLLEEEA IRVGGSNHSL ATRDLYDSIA AGNYLEWKLF  VQIMDTDYKD KFDFDPLDVA KTWPKDILxP LMLVGRLVLN KNIDNFFAEN *QLAFCPSIV VPGVYYSDDK LLQVRIFSYS DAQTDRFAPN YLQLPSNAPK CAHHYSHHEG FMNCLISLLQ 
INYFPSRYDP VRHAERYPIP TAMLTGKREK GMIEKENNFK QPGERYRSRA PDRQEQFIC* WIDALSEPRM THKIHSIWIS Y 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from Phytozome (Both 5' end and 3' end are missing, PS is missing, Stops in frames). scaffold_6. No EST. join(44118029..44118726,44119035..44119150,44119326..44119387,44119471..44119555).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCGTCTTCT TTATCCGTGA TGGGAAACCA AACCCCAAAT CCCACGTCCA GGAGAACTGG AGGATCCTAG ACGTTCTCGC CCACCATCCG GAGAGCTTGG GCATGTTCAC CCTCCTCTTT  GATGATACTG GTATTCCACA AGATGAGAGG AACATGACGG GCTCTGGAGT TAACACCTAC GCTTTGATCA ACAAGGCCAG AAAAGCACAT TATGTGAAGT TTCACTGGAA ACAAACTTGC  GGGGTCAAGA GCTTACTGGA GGAAGAGGCG ATTAGAGTCG GGGGATCCAA TCACAGCCTT GCGACTCGGG ATCTTTATGA TTCCATTGCT GCTGGAAACT ATCTTGAATG GAAACTTTTC  GTTCAGATCA TGGATACTGA TTATAAAGAC AAATTTGACT TTGACCCGCT TGATGTGGCT AAGACCTGGC CCAAAGACAT ATTGCnnCCC CTAATGCTAG TTGGCCGCTT GGTCTTGAAT  AAGAACATTG ATAACTTCTT TGCTGAGAAT TAACAGCTTG CATTTTGCCC TTCAATTGTG GTTCCTGGCG TCTACTACTC AGATGATAAG CTGCTCCAAG TTCGTATTTT CTCATATTCT  GATGCTCAGA CGGACCGTTT TGCACCAAAT TATCTTCAAC TCCCTTCTAA TGCTCCTAAA TGCGCTCATC ACTACAGTCA CCACGAAGGT TTCATGAATT GCCATGCATA GGATGAAGAG  GTAAGAATTT TCTTTGAATC CTTCCTTAGC AATACTCTGG CAGCATCTGT TGTGGATTTT TTGTTGATGT AACCAAGTTA GACATCACGC TCTCCTATAA GTATGAAGGC CTAGTGATGC  ATTCTGACAT GTCAATTGTG GATCCCAAAG TGGCGGTGCA AACCCTCCTT TTGTTAGAGG ATTACCTTCT TGATTTTTCT ACTGCCCTTT GTGCCTGAAA CATGCATGTT TACATATGTA  GGAAATACCT TTCTGCTATC ACGTAAAATG ATTATCTGTT GAGCAAATGT TTAATTTCCC TTTTGCAGAT AAACTATTTT CCTTCAAGGT ATGATCCCGT TCGTCATGCG GAGAGATATC  CCATTCCAAC TGCTATGCTG ACTGGAAAGC GTGAAAAAGG TATGTTTTGT AGGATCTCTT TTACTTGGAT AGAGATTGAT TGTCCTGAGG TGCTTTCATG GTGATATCCA TGGGATATAC  TCAACTTGTC CTAGATGATC AATTGAATTG CAGTGAGTGG TATGACTGAT GTATGTGTGT TTGGATCTTG TTATCTTTTG TTTCTCCTGG CAGACCAACA TTGAGAAAGA GAACAACTTC  AAGCAGCCTG GAGAGAGATA CCGATCAAGG GCGCCTGACA GGTATTCTTC AGTTGTGCAT CTCCTGAAAA TGGTTTGATT GTCTCATGTT TCTCAATAAT CTGTCTCTAT CTTTCTTTTC 
TCAGGCAAGA GCAGTTCATC TGCTGATGGA TCGATGCTTT GTCTGAACCA CGTATGACTC ATAAGATCCA CAGCATCTGG ATTTCATAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCGTCTTCT TTATCCGTGA TGGGAAACCA AACCCCAAAT CCCACGTCCA GGAGAACTGG AGGATCCTAG ACGTTCTCGC CCACCATCCG GAGAGCTTGG GCATGTTCAC CCTCCTCTTT  GATGATACTG GTATTCCACA AGATGAGAGG AACATGACGG GCTCTGGAGT TAACACCTAC GCTTTGATCA ACAAGGCCAG AAAAGCACAT TATGTGAAGT TTCACTGGAA ACAAACTTGC  GGGGTCAAGA GCTTACTGGA GGAAGAGGCG ATTAGAGTCG GGGGATCCAA TCACAGCCTT GCGACTCGGG ATCTTTATGA TTCCATTGCT GCTGGAAACT ATCTTGAATG GAAACTTTTC  GTTCAGATCA TGGATACTGA TTATAAAGAC AAATTTGACT TTGACCCGCT TGATGTGGCT AAGACCTGGC CCAAAGACAT ATTGCnnCCC CTAATGCTAG TTGGCCGCTT GGTCTTGAAT  AAGAACATTG ATAACTTCTT TGCTGAGAAT TAACAGCTTG CATTTTGCCC TTCAATTGTG GTTCCTGGCG TCTACTACTC AGATGATAAG CTGCTCCAAG TTCGTATTTT CTCATATTCT  GATGCTCAGA CGGACCGTTT TGCACCAAAT TATCTTCAAC TCCCTTCTAA TGCTCCTAAA TGCGCTCATC ACTACAGTCA CCACGAAGGT TTCATGAATT GTTTAATTTC CCTTTTGCAG  ATAAACTATT TTCCTTCAAG GTATGATCCC GTTCGTCATG CGGAGAGATA TCCCATTCCA ACTGCTATGC TGACTGGAAA GCGTGAAAAA GGTATGATTG AGAAAGAGAA CAACTTCAAG  CAGCCTGGAG AGAGATACCG ATCAAGGGCG CCTGACAGGC AAGAGCAGTT CATCTGCTGA TGGATCGATG CTTTGTCTGA ACCACGTATG ACTCATAAGA TCCACAGCAT CTGGATTTCA 
TAT 

Retrieve as FASTA