Entry information : EgrRboh02 ( Eucgr.E00785 / Egrandis_v1_0.001715m)
Entry ID | 10177 |
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Creation | 2012-01-25 (Qiang Li) |
Last sequence changes | 2012-01-25 (Qiang Li) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2016-02-19 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: EgrRboh02 ( Eucgr.E00785 / Egrandis_v1_0.001715m)
Name (synonym) | EgrRboh02 ( Eucgr.E00785 / Egrandis_v1_0.001715m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Eucalyptus grandis [TaxId: 71139 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10177' 'join(8180372..8181080,8181194..8181353,8181740..8181788,8182540..8182653,8184220..8184642,8186183..8186569,8186747..8186842,8186955..8187070,8187212..8187379,8187496..8187655,8187799..8187996,8188097..8188225,8188340..8188418,8188513..8188622)' |
Exons►
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Literature and cross-references EgrRboh02 ( Eucgr.E00785 / Egrandis_v1_0.001715m)
DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_5 (8180372..8188622) |
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Protein sequence: EgrRboh02 ( Eucgr.E00785 / Egrandis_v1_0.001715m)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (scaffold_5, 13 introns). Correct prediction from phytozome. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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