Entry information : EgrKat[P]04
Entry ID 10186
Creation 2012-01-25 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EgrKat[P]04
Name EgrKat[P]04
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus grandis    [TaxId: 71139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EgrKat[P]04
start..stop
S start..stop
EguKat[P]04 854 0 2..434 1..433
EcamKat[P]04 762 0 9..434 1..435
EglKat[P]04 753 0 9..434 1..435
EguKat03 681 0 9..434 38..471
Literature and cross-references EgrKat[P]04
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_6 (44093734..44095779)
Protein sequence: EgrKat[P]04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   434
PWM (Da):   %s   49854.77  
PI (pH):   %s   6.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
RQTIIYVTGP ILLDDYHLVE KLANFDREKI PxSVVHARGA SAKGFFEVTH DISHLTRADF LQAPGVQTPV NVRFSILIHE RGGPETLRDP RGSDVKFYTR EVRETSRGKQ FPVFFINDGM  KFPDIFHALE PDPKSHVQEN WRILDFFSHH PESFRMFTFL FDDIGIAQDC RHTEGSGVTP TLLSxEARKA HHVKFHWKPI CGVKSLLEEE AIRVGGFNHS HTTRDLYDSI AAGNYPEWEL  FIQIVDPDHE DKFDFDPLDM TKTWPEDILP LMPVRRLVLN RNIDNFFAEN EHLAFCPSIV VPGVYCLDDW LLQTRMFSYS DTHRHRLGPN YLQxPPNALK CAYHNNHHEG FMNFMHRDEE 
VRIFFESYRS DTLGRVSCGQ TISEKENNFK QPGERYRPWT PDREKFICRW IDALSDPRVT xMRSAASGFH TGLR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from genomic (5' end is missing). No prediction from phytozome. No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGGCAAACTA TCATCTACGT CACAGGTCCA ATTCTTCTTG ACGATTATCA CCTTGTGGAG AAACTTGCCA ACTTTGATAG GGAGAAAATT CCGGnnAGTG TTGTCCATGC CAGGGGAGCC  AGTGCAAAGG GATTCTTTGA GGTCACTCAT GACATTTCTC ACCTTACTCG TGCCGATTTC CTTCAGGCAC CAGGAGTTCA AACACCTGTG AATGTCCGTT TCTCCATCCT CATCCACGAA  AGGGGTGGCC CTGAAACCCT GAGGGACCCT CGGGGTTCTG ATGTGAAGTT CTATACAAGA GAGGTAAGGG AGACATGAAT GTGCAGCATG GACGAGCACG AGTATGATGC TCCCTGTGAT  GAATCCTTTC ACAGGTGGCC TAAACTCAAC CGATGCATAT CGCAGTTCTC TTGTCCACAT TGCATACATT TGTTTTGCTG CACTTTGCTG TGTGATCTTA CCTTTTCCGT TACTACAGGG  TACCTTTGAT CTCGTGGGAA ACAATTCCCC GTCTTCTTTA TCAACGATGG GATGAAATTT CCAGATATTT TTCATGCACT TGAACCAGAC CCCAAATCCC ACGTCCAGGA GAACTGGAGG  ATCCTTGACT TTTTCTCCCA CCATCCCGAG AGCTTTCGCA TGTTCACCTT CCTCTTTGAT GACATTGGTA TTGCACAAGA TTGCAGGCAC ACGGAGGGCT CTGGAGTTAC ACCTACACTT  TTATCAACnG AGGCTAGAAA AGCGCATCAT GTGAAGTTCC ACTGGAAACC AATTTGCGGG GTCAAGAGCT TGCTGGAGGA AGAGGCAATT AGAGTTGGTG GATTCAATCA CAGCCATACA  ACTCGGGATC TTTATGATTC CATTGCTGCC GGAAACTATC CTGAGTGGGA ACTTTTCATT CAGATTGTCG ATCCTGATCA TGAAGACAAA TTCGACTTTG ACCCACTTGA TATGACTAAG  ACCTGGCCCG AAGACATATT GCCCCTAATG CCAGTTCGCC GCTTGGTCTT GAATAGGAAC ATTGATAACT TCTTTGCTGA GAATGAACAT CTTGCATTTT GCCCTTCAAT TGTGGTTCCC  GGCGTCTACT GCTTAGATGA TTGGCTGCTT CAAACTCGTA TGTTCTCATA TTCTGATACT CACAGGCACC GCCTTGGACC AAATTATCTT CAACTnCCCC CTAATGCTCT TAAATGTGCT  TATCACAATA ATCACCACGA AGGTTTCATG AATTTCATGC ATAGGGATGA AGAGGTAAGA ATTTTCTTTG AATCCTACCG CAGCGATACT CTGGGTCGCG TCTCTTGTGG ATTTTTTGTC  GACGTAACTA AGGCATCACG CTTTCCTTGA AGTATGAAGG CGTAGTGATG CAATCTGACG TGTCCATTAC AGATCCCAAA GTGGCAGTGC GAATGTCCTC TCTCCTTGTT AGCGGAGGAT  TACTTTTTTT ATCTTGCAAA TGCCCTTTGT GTCTGAAACA TGCACACTTG TTTACACATG TGGGAAATTC CTGTCTGTTA TTATGTAAAA TGATGGATTA TCTGTTGAGC AAATGCTTAA  TTTCCCTTTT GCAGATAAAA CTATTTTCTT TCAAGGTATG ATCCCGTTCG TCATGCAGGG AGATATCCAT TCCACCTGCT ATGCTGACTG GAAAGCGTGA AAAGGTATGT TTCATAATCC  TATTTTACTT GAATAGAGAT TGATTGCTTG AGGTGCTTTC ATGTTGGTAT CGATGGGATG GACTCAGCTT GTCCTGTAAA TAATCAATTG AATTGCAGTG AGTGGTATGA CCGATGTATG  TGTGTTTGGA TTTTGTTAAT TTTTGTTGGT CCACACAGAC TATCTCTGAG AAAGAGAACA ACTTCAAGCA GCCCGGAGAG AGATACCGAC CATGGACGCC TGACAGGTAT CCTTCAGTCG  TGCATTTCCT GATAATGGTG TGATGGTCTC ATGTAAGAGA AGTTCATCTG CCGATGGATC GATGCTTTGT CTGACCCACG TGTGACTCnn ATGAGATCCG CAGCATCTGG ATTTCATACT 
GGTCTCAGGT GA 

Retrieve as FASTA