Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
319 (294) |
PWM (Da): |
33420.41 (30768.0) |
Transmb domain: |
i12-34o |
PI (pH): |
7.7 (7.70) |
Peptide Signal: |
cut: 26 range:26-319 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MAWESSSVRTAFLLLLSFLLGTASAQLSSTFYSTSCPSALSTIKS GVSSAVKSEARMGASLLRLHFHDCFVNGCDASVLLDDTANFTGEKNATPNANSLRGFDVIDTIKSQLESACPGVVSCADLLTVAARDSVVALGGPSWTVPLGRRDSTTASQSAANSNIPAPTLNLSGLITAFSNKGFTTKEMVALSG SHTIGQARCTTFRARLYNENNINTTFSTSLKANCPSSGGDNNLSPLDTTSPTSFDNAYFKNLQIQEGLLHSDQQLFSGGSTDAQVNAYSSNSATFMTDFANAMVKMGNLSPLTGSSGQIR KNCRKVN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic. Correct prediction from kazusa. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTGGGAGAGCTCTTCGGTCAGAACCGCCTTTTTATTGTTGCTGTCTTTCCTACTGGGAACAGCCTCAGCTCAGCTGTCCAGTACTTTCTACTCCACCTCCTGTCCCAGCGCCCTC TCCACCATTAAATCCGGCGTGAGCTCTGCGGTCAAAAGTGAGGCCCGCATGGGCGCATCGCTGCTCCGCCTTCACTTCCACGATTGCTTCGTTAATATGCAAGTCCCTCTGCCCGGAGTC TCTCCTCTCTTTCCGATTGATTGCTACCTTTGTTTCTCTTCTGTCATTCAAGCTGCATGCAAGCGTACATGCATGATGCATCTTTGTGCTTTTGTGCATGTGAAACGTTCCAACCGACCT CATAGTAAAAAAGAATGATTAGATTTCGCTTCTACGCAAGTTACTTACTCTCTTTTTCACTAACCAAACAATAGGTAGGAAGTACACATATTGCATTAGTCGAGTCTGACCGACCCTTTT TGTGCCATGCATTTTTGTGAGTTTATTATTATTATAATAATAGGCTGTGTTTATTGAAGTCGTTTAAAATTAGAGCTATGTTTTCATTCAAACAGCAATAAAAAGCATGGCCCTTAGAAT AAAAGCACTTCTTTTTGGTGATTCAAAGAAAAAATTTTCATGAGTAATTCTAGTATACACCGCTAGTGTAAAAATCTCATTCCATAAGTGGTCTTATCCACTAAATATTTTGGTGGCCGG GGAGAGATTTGGTAATTAGAATCCTCAAATCAAGATGGACAAGACTGTTTTTGTGCGTGCTCTAATTTTTTTTTTCATTTATTAAATTGATAATGTATTCTATAACTTCATTACAAAAGC CATGCAGGCGAGCGTATTTTATGGCGAGTATGTTGTGGTTGTGGATAAGACGTGTGTATGTATCATTAGCTACATGATTTTAATTCGATGAATTAGATCACGCAAAAGTCCCAAACGTTG GAGATGGCCAAAAGAGAGAGCGACAGCCTTGCTTTTATGACGGTGGTTGACTTTACGCGTTTATCATGTTTGGCAAATCAATCAGTCGTTTTCAATAGGTTTTGGTCATATTTTGATCAC CGTCACTTTGGTTGCCATACTTTTCTACATTAAAAATGATATTTTGCCATAAAATATCTTTTTTTAATGAAATTTGTTAGTCCAATGGTGTTCTAAAAATTGTATTAGATCTTTTGAACA AAACAAAAAGTGCCTTGTGCATGGCCTCACTACTTTGCTTCCAACACAAATTTAGAGTGTCAATCTAAATTAGCTAATCAATTTGAAGTACCTTCATTATTATCCACTTCGTGTTCTTTG TGCATAATTCAAGAGTTGTCCATATCCTAACGGGCCTTTCTCCATCGAACATGTCGTCTCTATTTTGAGCTTGATATTTAAAGCCTGATCCTTTTTTTACTAACAAATGTGACATGTTTA TAACTTTCTCGATTAGATGCATTTCTCTTTTTCCTGTATGGATTGGAGATTGTCTAGATCTTCGAGGTCATTCAAGTAGACATAATTCAGGTTAATTTTAGTAAATCAAAAAGTCGGTGA CTCCCCTCCGTTAAATATTAAAGGACACGGCATGGTGCTGACCAAAAGCCTTGATTTAGAGAACACTTGAGAGCACAATCATTTTGTTTCTAGTCCGACAATTATTGGATGCATTGTTCC TAGATAGACAACACAAATTAAAGTCAAAAGGCATGAGAAAGAGTGTCATTTCCGTCCAAACTGGTGTCTGTGGGCGTTCATAACGGGGGACAAAAAGGGGGAATATGATAAGGGAAATTA ATCAGTGTTCATACTTTATGTTGAGGAAAAAGTTACAGCACTTGTTCTGTTTATATTTTGACCGTCGAATCTAATGAAGGCAGTAAGATTGATTTGACTGATTAACGATGTGTGGCAAAA AACATAATATAGGGATGCGACGCATCTGTTTTGTTGGACGACACCGCGAACTTCACTGGGGAGAAGAATGCTACCCCAAATGCCAATTCCTTACGGGGATTTGATGTGATTGACACGATC AAGTCCCAATTGGAGAGCGCATGCCCCGGTGTTGTGTCCTGCGCTGATCTCTTGACTGTGGCTGCCCGAGATTCCGTTGTCGCTCTGTAAGCGCACACTTTCTTCTTAATTCTAGTGATC AATTGTGATGAGAAAAAATCACTCGTTATGATCTCGATGCTGCATCAATACTAACACGTGTGGATTTGTTTAACTATTTAATTCTTAGTTAGGTGGCCCAAGTTGGACAGTCCCGCTAGG AAGAAGAGACTCAACTACTGCAAGCCAAAGTGCTGCTAATAGCAACATCCCTGCCCCGACTTTGAACCTTAGCGGCCTCATCACTGCCTTCTCTAACAAAGGTTTCACCACCAAAGAAAT GGTGGCACTCTCAGAGGTCATTGTTTTTCCTTTTTTGTGGCACCTGTTAATAACGAATTTACAATAATGCTTGATCGATATACTAAGATTAATATTAAGAAGTTGTTCGATTGTTGTTAA TAGGGTCGCACACGATAGGTCAAGCCCGATGCACAACTTTCCGGGCCCGTCTTTACAACGAGAACAACATCAACACCACGTTCTCAACCTCGCTCAAGGCGAACTGCCCAAGCTCCGGAG GTGACAACAATCTCTCTCCTCTAGACACCACGAGCCCGACGTCCTTTGACAATGCCTACTTTAAGAACTTGCAAATCCAAGAAGGTCTTCTTCACTCGGACCAGCAATTGTTTAGTGGTG GTTCCACGGACGCTCAGGTGAACGCTTATAGCAGCAATTCAGCTACTTTCATGACAGATTTTGCTAACGCCATGGTGAAGATGGGTAACCTCAGCCCGCTCACCGGCTCAAGTGGTCAGA TTAGGAAGAACTGCAGGAAAGTCAACTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTGGGAGAGCTCTTCGGTCAGAACCGCCTTTTTATTGTTGCTGTCTTTCCTACTGGGAACAGCCTCAGCTCAGCTGTCCAGTACTTTCTACTCCACCTCCTGTCCCAGCGCCCTC TCCACCATTAAATCCGGCGTGAGCTCTGCGGTCAAAAGTGAGGCCCGCATGGGCGCATCGCTGCTCCGCCTTCACTTCCACGATTGCTTCGTTAATGGATGCGACGCATCTGTTTTGTTG GACGACACCGCGAACTTCACTGGGGAGAAGAATGCTACCCCAAATGCCAATTCCTTACGGGGATTTGATGTGATTGACACGATCAAGTCCCAATTGGAGAGCGCATGCCCCGGTGTTGTG TCCTGCGCTGATCTCTTGACTGTGGCTGCCCGAGATTCCGTTGTCGCTTTAGGTGGCCCAAGTTGGACAGTCCCGCTAGGAAGAAGAGACTCAACTACTGCAAGCCAAAGTGCTGCTAAT AGCAACATCCCTGCCCCGACTTTGAACCTTAGCGGCCTCATCACTGCCTTCTCTAACAAAGGTTTCACCACCAAAGAAATGGTGGCACTCTCAGGGTCGCACACGATAGGTCAAGCCCGA TGCACAACTTTCCGGGCCCGTCTTTACAACGAGAACAACATCAACACCACGTTCTCAACCTCGCTCAAGGCGAACTGCCCAAGCTCCGGAGGTGACAACAATCTCTCTCCTCTAGACACC ACGAGCCCGACGTCCTTTGACAATGCCTACTTTAAGAACTTGCAAATCCAAGAAGGTCTTCTTCACTCGGACCAGCAATTGTTTAGTGGTGGTTCCACGGACGCTCAGGTGAACGCTTAT AGCAGCAATTCAGCTACTTTCATGACAGATTTTGCTAACGCCATGGTGAAGATGGGTAACCTCAGCCCGCTCACCGGCTCAAGTGGTCAGATTAGGAAGAACTGCAGGAAAGTCAACTAA
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Retrieve as FASTA
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