Entry information : HcyCIIBC03
| Entry ID | 10531 |
|---|---|
| Creation | 2012-02-27 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2016-02-01 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Achraf Jemmat |
| Last annotation changes | 2016-02-01 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: HcyCIIBC03
| Name | HcyCIIBC03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Other class II peroxidase type C [Orthogroup: CIIBC001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Cortinariaceae Hebeloma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Hebeloma cylindrosporum [TaxId: 76867 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10531' 'join(1..127,177..241,293..351,467..522,576..588,641..706,764..885,936..1030,1081..1095,1154..1179,1230..1244,1298..1354,1408..1487,1548..1583,1639..1727,1789..1866,1926..1994)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references HcyCIIBC03
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_26 (417868..415875) |
|---|---|
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 82176 |
Protein sequence: HcyCIIBC03
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (14 introns). Incorrect prediction from JGI: two short exons are missing. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
