Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
160 |
PWM (Da): |
17764.08 |
Transmb domain: |
i7-29o |
PI (pH): |
9.53 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGASQSVPEKSIHEFTVKDSRGKDFDLSAYKGKVLLVVNVASKCGFTNSNYTQLTELYNKYKDGLEILAFPCNQFLKQEPGTSQDAQEFACTRFKAEYPIFHVRVNGPDTAPVYKFLKAS KSGFLGSGIKWNFTKFLVDKEGHVLSRYSPTTSPLAIE |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from kazusa. No prediction. Short 3' end is missing. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGCGCTTCGCAGTCGGTCCCCGAGAAATCAATCCACGAGTTCACCGTCAAGAGGTAAAATACCAGAAACTAACCTTTCTCTGCACTTGCGGTGATGGTGAAGATGACAGACTAATGA GGTTTATGGGTTATGGTGGGAGCAGGACAGTAGAGGGAAGGACTTTGACTTGAGTGCGTACAAAGGGAAGGTCCTCCTCGTTGTTAACGTTGCCTCCAAATGTGGTATGTCTCTTGCCAA TCCCCTATTTCAGATGGGTTTTTCCTTCGGATTTATTTTTTTTTTTTTTTGCTTGTTCTTCTGGAATGAATTTGTTTTTGTTGTTTTTGATTGGTTTGGAAACAGTGGATTCACGAACTC CAACTATACACAGCTCACTGAACTTTACAACAAATACAAAGACCAAGAGGTTGGTTGTTTTTTTTCCCCCCTTATTTTCCTGTTCTGTTCCTTTTAAGCTTTTGGGTCTACTCCGTTTCG CAAATTTCTATAGGTTCGATGATAATTTTTTTGGTGATGTGCTGATGTCTGGGATTTTGCGTGCAAATGGTTACTTTGCTGATGAATTGAGGTGTATCGGATGGAGGAAGTTTTAGAAAC TGGCATCAATTGGTTAATTCTATGCTTTTTGTTTGTTAATGCTGAGGATTTTATCTAAATTTTTTTGAAACTTCATGGATTCTTCAATTTCTTGAGTTCCTTAATGAATTTCGAGGGAGC CATCGTGTATTTTTTCTTTTAGGGGACTAAGTTGTTGCGTTGTGGATTTGCTGCAAATGAAACGTTGAGTTGTTGTTATATCCCTTGCTTATCATAGAATTCCTTAGAGTACTTGGGTGT TGTTGGGTGCCTCAGGTCTTGAGATCTTGGCTTTTCCGTGCAACCAATTTTTGAAACAAGAGCCTGGAACAAGTCAGGATGCACAAGAATTTGCATGTACAAGATTCAAAGCTGAATACC CGATCTTCCACAAGAGGTAAGAATTGCTGCTCTGCAATCTTACATTTTTAGTAGCTTCGAGTTGTGAGTGATGTGGACAACTGTTTCTATATTGTGTCACAGTATGACTTTGGCAAAAAA TAGTTAACCTTGCAAACTTATGATTGTCTGCCACTTCATCCTGTACAGATGCATGAGTAAAATCTTATGTGCTGCTGCCACTACGATGTGGATTTTCTTGTTTGTATATGTTTGCCAAAG TTTACCGTTGGCCTGAGGAAAATTGATTTTTATTTAACTTGGTCTCCTTTGCGTTTAAATGCAACTAACTGTTATCTTTTTATAGGTATGCTCTTAGCTAAATCTTTGTAGTAAATACTA TGACAACCCTGAACCATAAGCATTCAAATCATGGTCCCTGACTTGGGTAACTTTTTCAGGAGTTTGTTGGCTGGTCCTTGACTCAAATTAATTAAAAGCTAGACGAATGTAATGACACTT GCTTAACACAGCAAACATTGCTTCTTTGAATGTGAGCTGATGGTAGAGACAACATTTATTGTATTGATGATACTTGCTCTTTTGAAATCTAGGCTATGTTTGGTCGTCCGGATAATAATC AGATATGATAGGATAAAGTAGGATATTAAATCCTTTGGATAATAAAAGCGGACATATCTAATCCTATCAAGTGTTTGGTGCACTTCAGGATAAGATTAAAAAATAAATATGATATTCATT TAAATTATAAAATTAAAAAATAGAAAATTAAATTAATTAAAGGCCATGGAAAAACCCTAGATCTAGGAATTGTGGCCACCTCTGCAGTAGCCACCATTGAAAACGGCAAGTGATATCTTC TCTTTTTGTTAAGTTATTTCTTTTCTTAAAAAAAAAAAATCTTATCCAATCCAGGCTTATCCCACCCCCTCCCCCGGATTTTGTATCCGGAGTTTTATCCGGATATATCCAGGTTTGTCT GATCCGGTGGACATTCCCAAACATCGGATAGGATTATAAATTATCCTATCCGGGGACTCTAATCCGGACTACCAAACGCAGCCTAATGGTAGGTAAACACCTCAGGTTTGGGTTGGAATA TTTATTGGTGATAGGTTAGGGCAAAAGTTCAAAGGAGTTGCAAACTTCGATCCATCAAATGTAAGGTATCAATAGTTTGGTGTCCTACTCAAATGTGACCCCGAAATATTGTCTCTGGGG TAACATGTCCGTCCTATGACATGTTAGCTTTGTTGGGAAAAACCTCAATTGATAGCTATTGTTATGTCCAACAATTCTAGATTTGCCTTTTTTTTTTTCATTCTGGTTTTCAGATTGGCA TCGCTTGACTGCTATAGAATTTTCCTTCTTATTTTGCTCTATTTGTGATTATACTTGTTGACGATCTCTCTCATGTGCACCTATTATATATGTGATCTGTTAATAGGTATGTAGCTTTGA TAGTGCTGAATCATCTAGTTGCCTGACAACAGTTACTGCATCCAATTAGCAAATGTGTTAAGTTGTTGCTTGATTCTAGGTACGAGTCAATGGACCAGACACAGCACCAGTCTATAAGTT CCTCAAAGCTAGTAAATCAGGATTTTTGGGTTCAGGAATAAAATGGAACTTCACGAAGTTCCTCGTTGATAAGGAGGGGCATGTCCTCAGTCGATATAGCCCAACCACCTCTCCTTTAGC CATTGAG |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGCGCTTCGCAGTCGGTCCCCGAGAAATCAATCCACGAGTTCACCGTCAAGGACAGTAGAGGGAAGGACTTTGACTTGAGTGCGTACAAAGGGAAGGTCCTCCTCGTTGTTAACGTT GCCTCCAAATGTGGATTCACGAACTCCAACTATACACAGCTCACTGAACTTTACAACAAATACAAAGACCAAGGTCTTGAGATCTTGGCTTTTCCGTGCAACCAATTTTTGAAACAAGAG CCTGGAACAAGTCAGGATGCACAAGAATTTGCATGTACAAGATTCAAAGCTGAATACCCGATCTTCCACAAGGTACGAGTCAATGGACCAGACACAGCACCAGTCTATAAGTTCCTCAAA GCTAGTAAATCAGGATTTTTGGGTTCAGGAATAAAATGGAACTTCACGAAGTTCCTCGTTGATAAGGAGGGGCATGTCCTCAGTCGATATAGCCCAACCACCTCTCCTTTAGCCATTGAG
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Retrieve as FASTA
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