Entry information : ScomLDS02
Entry ID | 10728 |
---|---|
Creation | 2012-03-08 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2012-03-08 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Catherine Mathe |
Last annotation changes | 2016-01-04 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: ScomLDS02
Name | ScomLDS02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Schizophyllaceae Schizophyllum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Schizophyllum commune [TaxId: 5334 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10728' 'join(2082384..2082422,2082473..2082652,2082709..2082847,2082897..2083089,2083139..2083157,2083210..2083274,2083335..2083554,2083608..2083752,2083804..2083880,2083932..2083994,2084045..2084292,2084340..2084463,2084512..2084527,2084578..2085148,2085205..2085424,2085480..2085565,2085615..2085735,2085804..2086122,2086198..2086366,2086419..2086446,2086498..2086680)' |
Exons►
|
Literature and cross-references ScomLDS02
DNA ref. | JGI genome: scaffold_3 (2082384..2086680) |
---|---|
EST ref. | GenBank: GW370191.1 [Fragment] |
Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 1037963 |
Protein sequence: ScomLDS02
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Complete sequence from genomic (20 introns) and 1 EST. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|