Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
|
Length (aa): |
261 |
PWM (Da): |
29444.68 |
|
PI (pH):
| 5.21 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MKCPDFDDGSYAPNLLRLAWHSSATYDKYTKTGGSNGATMRFPPELTDSANTGLNTARDLLEPVKSKFPWISYADLWILAGLVAIEEMDGPKIPFKPGRTDCGPNDLALIPPNGRLPLGFKDSQHIREIFSRLEMNDQEIVALLGAHGLGRTHAKYSGWDGKWTSNPIKFDNEFYKILLNDNWVFGKVESTGKKQYFNEKNPELMMLPTDLELVKDSSFKKWVEVYANDQDKFFEDFSNAFFKLTELGVERNECGFAPKIR |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic (1 intron). Incorrect prediction from JGI (large 5'end is missing). |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAATGTCCAGACTTTGATGATGGTTCTTATGCTCCAAACTTACTAAGATTAGCCTGGCACTCTTCCGCTACCTATGATAAATATACTAAAACTGGAGGCTCTAATGGTGCAACTATG AGGTAATATTTCACTTTTACTTGTTTCTTAACTTTTCTTATTTATCACAATTTTTTTTTATATTTTTCTTGTCTTTGTTGTAATATTTTTGTTCTATGTTTTGCTTATCCCAATTATTTG CTATATTATTTTTTTTATTTTTGCTTTGATAATTTTTTTCAGCTTTTTTTCACTTTTTTTCACTTTTTAACAATTTCTAACATTTTTAATTACTCGAATTTTATTTTCAATTTAATATTG TTAATTTTATTTGGTTTAGATTTCCACCTGAATTAACAGATTCTGCAAACACTGGTTTAAATACTGCAAGAGACCTTTTAGAACCCGTTAAATCGAAATTTCCTTGGATTTCTTATGCAG ATTTATGGATATTGGCAGGTTTAGTCGCAATAGAAGAGATGGATGGTCCAAAAATTCCTTTTAAACCTGGCAGAACTGACTGTGGTCCGAATGATTTAGCTTTAATACCTCCAAATGGCA GATTACCACTAGGGTTTAAAGATTCACAGCACATCAGAGAAATATTTTCAAGATTAGAAATGAATGATCAAGAGATTGTTGCTTTATTAGGTGCTCATGGTTTAGGCAGAACTCATGCCA AATATTCTGGTTGGGATGGGAAATGGACTTCAAATCCTATCAAATTTGATAATGAGTTTTATAAAATTTTGTTGAATGATAATTGGGTTTTTGGAAAAGTTGAGTCGACTGGTAAAAAGC AATATTTCAATGAAAAGAACCCAGAATTGATGATGTTGCCAACGGATTTAGAGCTTGTTAAAGATTCAAGCTTTAAAAAATGGGTTGAAGTTTATGCTAATGATCAAGATAAGTTTTTTG AAGATTTTTCAAATGCATTTTTCAAGTTAACTGAGTTAGGAGTTGAAAGGAATGAGTGCGGTTTTGCTCCCAAAATTAGATAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAATGTCCAGACTTTGATGATGGTTCTTATGCTCCAAACTTACTAAGATTAGCCTGGCACTCTTCCGCTACCTATGATAAATATACTAAAACTGGAGGCTCTAATGGTGCAACTATG AGATTTCCACCTGAATTAACAGATTCTGCAAACACTGGTTTAAATACTGCAAGAGACCTTTTAGAACCCGTTAAATCGAAATTTCCTTGGATTTCTTATGCAGATTTATGGATATTGGCA GGTTTAGTCGCAATAGAAGAGATGGATGGTCCAAAAATTCCTTTTAAACCTGGCAGAACTGACTGTGGTCCGAATGATTTAGCTTTAATACCTCCAAATGGCAGATTACCACTAGGGTTT AAAGATTCACAGCACATCAGAGAAATATTTTCAAGATTAGAAATGAATGATCAAGAGATTGTTGCTTTATTAGGTGCTCATGGTTTAGGCAGAACTCATGCCAAATATTCTGGTTGGGAT GGGAAATGGACTTCAAATCCTATCAAATTTGATAATGAGTTTTATAAAATTTTGTTGAATGATAATTGGGTTTTTGGAAAAGTTGAGTCGACTGGTAAAAAGCAATATTTCAATGAAAAG AACCCAGAATTGATGATGTTGCCAACGGATTTAGAGCTTGTTAAAGATTCAAGCTTTAAAAAATGGGTTGAAGTTTATGCTAATGATCAAGATAAGTTTTTTGAAGATTTTTCAAATGCA TTTTTCAAGTTAACTGAGTTAGGAGTTGAAAGGAATGAGTGCGGTTTTGCTCCCAAAATTAGATAA |
Retrieve as FASTA
|
|