Entry information : EglKat03
Entry ID 11018
Creation 2012-05-16 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-25 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EglKat03
Name EglKat03
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglKat03
start..stop
S start..stop
EgrKat03 948 0 1..462 1..492
EguKat03 924 0 1..443 1..443
VvKat02 902 0 1..462 1..492
EcamKat03 898 0 5..462 1..488
Literature and cross-references EglKat03
EST ref. GenBank:   ES595669.1 [5' end]  ES590482.1 [Fragment]  ES596210.1 [Fragment]
Protein sequence: EglKat03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   462 (288)
PWM (Da):   %s   53188.58 (31442.8)  
PI (pH):   %s   7.28 (6.66) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-308
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDPHKYRPSS AFNTSFWTTN SGAPVWNNNS SLTVGSRGPI LLEDYHLVEK LANFDRERIP ERVVHARGAS AKGFFEVTHD ISQLTCADFL RAPGVQTPVI VRFSTVIHER GSPETLRDPR  GFAVKFYTRE GNFDLVGNNF PVFFVRDGMK FPDMVHALKP NPKSHIQENW RIVDFFSHHP ESLHMFTFLF DDIGIPQDYR HMEGSGVNTY TLINKAGKVH YVKFHWKPTC GVKNLLEEEA  IRVGGSNHSH ATQDLYDSIA AGNYPEWKLF IQIIDPDHED KFDFDPLDVT KTWPEDILPL MPVGRLVLNR NIDNFFAENE QLAFCPSIVV PGVFYSDDKL LQTRIFSYSD TQRHRLGPNY 
LQLPPNAPKC AHHNNHHEGF MNFMHRDEEI NYFPSRYDPV RHAERYPIPT AMLTGKREKT IIEKENNFKQ PGERYRSWTP DRQADKSLGQ KLASRLNVRP SI 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from NGS and several ESTS. Short 3' is missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGGTCACTC ATGACATTTC CCAGCTTACC TGTGCTGATT TCCTTCGGGC ACCAGGAGTT CAAACACCCG TGATTGTCCG TTTCTCCACT GTCATCCACG AAAGGGGCAG CCCTGAAACC  CTGAGGGACC CTCGAGGTTT TGCTGTGAAG TTCTACACAA GAGAGGTAAG GGAATTTTGG CAACAGATAG AAGTCTGCAG TTTGGAAGAG TACAAGTTTG ATGCTCACTG TGATAGACCC  TTTCACGGGG AGCCTAGGCT CAATCAATGC ATGTGCTATA GATGTGTGGT CAGTAAGAGC TAACTGCTTT TCATATCCCA TTCTGCTGAA GCATGGTTGC ATCTATAAAT TTCAATAGAA  TATACTTGGC TCATTTTTTG ATTAGTACCT ATCTACTAAG AGACATCATA TTAATAATTG CTGCTATGGT ATTGAATCCA CTTTGACACT TGAATTGGGG AGATGGCAGG TCTCTTGTAC  ACATTGCATA TATTTGTTTT GTGATCTTGC CTTTTCTGTT ACTGCAGGGT AACTTTGATC TGGTGGGAAA CAATTTCCCT GTCTTCTTTG TCCGTGATGG GATGAAATTC CCGGATATGG  TTCATGCACT TAAACCAAAC CCCAAATCCC ACATCCAGGA GAACTGGAGG ATCGTTGACT TTTTCTCCCA CCATCCCGAG AGCTTGCACA TGTTCACCTT CCTCTTTGAT GATATTGGTA  TTCCCCAAGA TTACAGGCAC ATGGAGGGCT CTGGAGTTAA CACCTACACC TTGATCAACA AGGCCGGAAA AGTGCATTAT GTGAAGTTTC ACTGGAAACC AACTTGCGGG GTCAAGAACT  TGCTGGAGGA AGAGGCAATT AGAGTTGGGG GATCCAATCA CAGCCATGCG ACTCAGGATC TTTATGATTC CATTGCTGCT GGAAACTATC CTGAATGGAA ACTTTTCATT CAGATCATCG  ATCCTGATCA TGAAGACAAA TTTGACTTTG ACCCACTTGA TGTGACTAAG ACCTGGCCCG AAGATATATT GCCCCTAATG CCAGTTGGCC GCTTGGTCTT GAATAGGAAC ATTGATAACT  TCTTTGCTGA GAATGAACAG CTTGCATTTT GCCCTTCAAT TGTGGTTCCT GGGGTCTTCT ACTCAGATGA TAAGCTGCTC CAAACTCGTA TCTTCTCGTA TTCTGATACT CAGAGGCACC  GTCTTGGACC AAATTATCTT CAACTCCCCC CCAATGCTCC TAAATGTGCT CATCACAACA ATCACCATGA AGGTTTCATG AATTTCATGC ATAGGGATGA AGAGGTAAGA ATCTTCTTTG  AATCCTGCCG CAGCAATACT CTGGGCAGCA ACTCTGGTGG ATTTTTGGTT GGTGTAACTA AGTTAACATC ACGCTTTCCT TGACATATGA AGGCGTTGTG ATGCAATCTG ACATGTCAAT  TATTGATCCC AAAGTGGCAG TGCAAATGTC CTCTCTCCTT TTGTTGTGTG ACTAGATGTA TGTGTGTTTA CATATGTAGG AAATACCTGT CTGCTATTAT GTAAGAAGAT TATCTGTTGA  GCAAATGCTT ATTTTCCCTT TTGCAGATAA ACTATTTTCC ATCAAGGTAC GATCCTGTTC GTCATGCAGA GAGATATCCC ATTCCAACTG CTATGCTGAC TGGAAAGCGT GAAAAGGTTT  GTTTCCTAGG ATCTCTTTTA CTTGAACAGA AATTGGTTGT CTTGAGGTGC TTTCATGGTG ATATTGATGG GATAGACTCA GCTTGTCCAG TAGATAATCA ATTGAATTGC AGTnnnnnnT  GTGACTAGAT GTATGTGTGT TTGGATTTTG TTAACTTTTG TTGCTCCAAA CAGACCATCA TTGAGAAAGA GAACAACTTC AAGCAGCCTG GAGAGAGATA CCGATCATGG ACACCTGACA  GGTATCCTTC AGTTGTGCAT ATCCTGATAA TGGTTTGATG GTCTCATGTT TCTCAATCAT TTGTCTCTAT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnGCGGGTT AAAGTGAAAA ATGTAATATT  TAACATGCAG AAATGGGGGA TTCGGTTGTT GCTTGCTTTG TGAGATACAC ACACACACAC ACATGCAGAT GTGATAATGA ACTCATTTGA GATTACTTGC AATTGCAACA GGCCGACAAA 
TCTCTGGGTC AGAAATTAGC ATCTCGGCTC AATGTGCGAC CAAGCATTTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCCGC ACAAGTACCG TCCATCCAGT GCTTTCAACA CTTCTTTCTG GACTACGAAC TCTGGTGCTC CTGTCTGGAA CAATAACTCT TCGTTGACTG TTGGAAGCAG AGGTCCAATT  CTTCTTGAGG ATTATCACCT TGTGGAGAAA CTTGCCAACT TTGATAGGGA GAGGATTCCA GAGCGTGTGG TGCATGCCAG AGGAGCCAGT GCAAAGGGAT TCTTTGAGGT CACTCATGAC  ATTTCCCAGC TTACCTGTGC TGATTTCCTT CGGGCACCAG GAGTTCAAAC ACCCGTGATT GTCCGTTTCT CCACTGTCAT CCACGAAAGG GGCAGCCCTG AAACCCTGAG GGACCCTCGA  GGTTTTGCTG TGAAGTTCTA CACAAGAGAG GGTAACTTTG ATCTGGTGGG AAACAATTTC CCTGTCTTCT TTGTCCGTGA TGGGATGAAA TTCCCGGATA TGGTTCATGC ACTTAAACCA  AACCCCAAAT CCCACATCCA GGAGAACTGG AGGATCGTTG ACTTTTTCTC CCACCATCCC GAGAGCTTGC ACATGTTCAC CTTCCTCTTT GATGATATTG GTATTCCCCA AGATTACAGG  CACATGGAGG GCTCTGGAGT TAACACCTAC ACCTTGATCA ACAAGGCCGG AAAAGTGCAT TATGTGAAGT TTCACTGGAA ACCAACTTGC GGGGTCAAGA ACTTGCTGGA GGAAGAGGCA  ATTAGAGTTG GGGGATCCAA TCACAGCCAT GCGACTCAGG ATCTTTATGA TTCCATTGCT GCTGGAAACT ATCCTGAATG GAAACTTTTC ATTCAGATCA TCGATCCTGA TCATGAAGAC  AAATTTGACT TTGACCCACT TGATGTGACT AAGACCTGGC CCGAAGATAT ATTGCCCCTA ATGCCAGTTG GCCGCTTGGT CTTGAATAGG AACATTGATA ACTTCTTTGC TGAGAATGAA  CAGCTTGCAT TTTGCCCTTC AATTGTGGTT CCTGGGGTCT TCTACTCAGA TGATAAGCTG CTCCAAACTC GTATCTTCTC GTATTCTGAT ACTCAGAGGC ACCGTCTTGG ACCAAATTAT  CTTCAACTCC CCCCCAATGC TCCTAAATGT GCTCATCACA ACAATCACCA TGAAGGTTTC ATGAATTTCA TGCATAGGGA TGAAGAGATA AACTATTTTC CATCAAGGTA CGATCCTGTT  CGTCATGCAG AGAGATATCC CATTCCAACT GCTATGCTGA CTGGAAAGCG TGAAAAGACC ATCATTGAGA AAGAGAACAA CTTCAAGCAG CCTGGAGAGA GATACCGATC ATGGACACCT 
GACAGGCAGG CCGACAAATC TCTGGGTCAG AAATTAGCAT CTCGGCTCAA TGTGCGACCA AGCATTTAA 

Retrieve as FASTA