Entry information : EglKat[P]04
Entry ID 11019
Creation 2012-05-16 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglKat[P]04
Name EglKat[P]04
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglKat[P]04
start..stop
S start..stop
EcamKat[P]04 862 0 1..435 1..435
EgrKat[P]04 753 0 1..435 9..434
EguKat[P]04 735 0 1..435 8..433
EguKat03 700 0 1..435 38..471
Literature and cross-references EglKat[P]04
Protein sequence: EglKat[P]04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   435
PWM (Da):   %s   48815.05  
PI (pH):   %s   6.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GPILLDDYHL VEKLANFDRx xxxxxxVHAR GASAKGFFEV THDISHLTRA DFLQAPGVQT PVNVRFSILI HERGGPETLR DPRGSDVKFY TREVRETSRG KQFPVFFIND GMKFPDIFRA  LEPDPKSHVQ ENWRILDFFS HHPESFRMFT FLFDDIGIAQ DCRHTEGSGV TxYTFINEAR KAHHVKFHWK PTCGVKSLLE EEAIRVGGFN HSHTTRDLYD SIAAGNYPEW ELFIQIVDPD  HEDKFDFDPL DMTxxxPEDI LPLMPVRRLV LNRNIDNFFA ENEHLAFCPS IVVPGVYCLD DWLLQTRMFS YSDTHRHRLG PNYLQxPPNA LKCAYHNNHH EGFMNFMHRD EEVNYFLSRY 
DPVRHAGRYx IPPAMLTGKR EKQTITEKEN NFKQPGERYR PWTPDRYPSV SCKRSSSADG SMMRSAASGF HTGLR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from NGS. Short 5' end is missing. No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTCCAATTC TTCTTGACGA TTATCACCTT GTGGAGAAAC TTGCCAACTT TGATAGGGAn nnnnnnnnnn nnnnnTnnGT CCATGCCAGG GGAGCCAGTG CAAAGGGATT CTTTGAGGTC  ACTCATGACA TTTCTCACCT TACTCGTGCC GATTTCCTTC AGGCACCAGG AGTTCAAACA CCTGTGAATG TCCGTTTCTC CATCCTCATC CACGAAAGGG GTGGCCCTGA AACCCTGAGG  GACCCTCGGG GTTCTGATGT GAAGTTCTAT ACAAGAGAGG TAAGGGAGAC ATGAATGTGC AGCATGGACG AGCACGAGTA TGATGCTCCC TGTGATGAAT CCTTTCACAG GTGGCCTAAA  CTCAACCGAT GCATATCGCA GTTCTCTTGT CCACATTGCA TACATTTGTT TTGCTGCACT TTGCTGTGTG ATCTTACCTT TTCCGTTACT ACAGGGTACC TTTGATCTCG TGGGAAACAA  TTCCCCGTCT TCTTTATCAA CGATGGGATG AAATTTCCAG ATATTTTTCG TGCACTTGAA CCAGACCCCA AATCCCACGT CCAGGAGAAC TGGAGGATCC TTGACTTTTT CTCCCACCAT  CCCGAGAGCT TTCGCATGTT CACCTTCCTC TTTGATGACA TTGGTATTGC ACAAGATTGC AGGCACACGG AGGGCTCTGG AGTTACACCn TACACTTTTA TCAACGAGGC TAGAAAAGCG  CATCATGTGA AGTTCCACTG GAAACCAACT TGCGGGGTCA AGAGCTTGCT GGAGGAAGAG GCAATTAGAG TTGGTGGATT CAATCACAGC CATACAACTC GGGATCTTTA TGATTCCATT  GCTGCCGGAA ACTATCCTGA GTGGGAACTT TTCATTCAGA TTGTCGATCC TGATCATGAA GACAAATTCG ACTTTGACCC ACTTGATATG ACTAAnnnnn GGCCCGAAGA CATATTGCCC  CTAATGCCAG TTCGCCGCTT GGTCTTGAAT AGGAACATTG ATAACTTCTT TGCTGAGAAT GAACATCTTG CATTTTGCCC TTCAATTGTG GTTCCCGGCG TCTACTGCTT AGATGATTGG  CTGCTTCAAA CTCGTATGTT CTCATATTCT GATACTCACA GGCACCGCCT TGGACCAAAT TATCTTCAAC TnCCCCCTAA TGCTCTTAAA TGTGCTTATC ACAATAATCA CCACGAAGGT  TTCATGAATT TCATGCATAG GGATGAAGAG GTAAGAATTT TCTTTGAATC CTACCGCAGC GATACTCTGG GTCGCGTCTC TTGTGGATTT TTTGTCGACG TAACTAAGGC ATCACGCTTT  CCTTGAAGTA TGAAGGCGTA GTGATGCAAT CTGACGTGTC CATTACAGAT CCCAAAGTGG CAGTGCGAAT GTCCTCTCTC CTTGTTAGCG GAGATGTAGG AAATTCCTGT CTGTTATTAT  GTAAAATGAT GGATTATCTG TTGAGCAAAT GCTTAATTTC CCTTTTGCAG ATAAAACTAT TTTCTTTCAA GGTATGATCC CGTTCGTCAT GCAGGGAGAT ATCCnATTCC ACCTGCTATG  CTGACTGGAA AGCGTGAAAA GGTATGTTTC ATAATCCTAT TTTACTTGAA TAGAGATTGA TTGCTTGAGG TGCTTTCATG TTGGTATCGA TGGGATGGAC TCAGCTTGTC CTGTAAATAA  TCAATTGAAT TGCAGTGAGT GGTATGACCG ATGTATGTGT GTTTGGATTT TGTTAATTTT TGTTGGTCCA CACAGACTAT CACTGAGAAA GAGAACAACT TCAAGCAGCC CGGAGAGAGA  TACCGACCAT GGACGCCTGA CAGGTATCCT TCAGTCGTGC ATTTCCTGAT AATGGTGTGA TGGTCTCATG TAAGAGAAGT TCATCTGCCG ATGGATCGAT GCTTTGTCTG ACCCACGTGT 
GACTCATGAG ATCCGCAGCA TCTGGATTTC ATACTGGTCT CAGGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTCCAATTC TTCTTGACGA TTATCACCTT GTGGAGAAAC TTGCCAACTT TGATAGGGAn nnnnnnnnnn nnnnnTnnGT CCATGCCAGG GGAGCCAGTG CAAAGGGATT CTTTGAGGTC  ACTCATGACA TTTCTCACCT TACTCGTGCC GATTTCCTTC AGGCACCAGG AGTTCAAACA CCTGTGAATG TCCGTTTCTC CATCCTCATC CACGAAAGGG GTGGCCCTGA AACCCTGAGG  GACCCTCGGG GTTCTGATGT GAAGTTCTAT ACAAGAGAGG TAAGGGAGAC ATCTCGTGGG AAACAATTCC CCGTCTTCTT TATCAACGAT GGGATGAAAT TTCCAGATAT TTTTCGTGCA  CTTGAACCAG ACCCCAAATC CCACGTCCAG GAGAACTGGA GGATCCTTGA CTTTTTCTCC CACCATCCCG AGAGCTTTCG CATGTTCACC TTCCTCTTTG ATGACATTGG TATTGCACAA  GATTGCAGGC ACACGGAGGG CTCTGGAGTT ACACCnTACA CTTTTATCAA CGAGGCTAGA AAAGCGCATC ATGTGAAGTT CCACTGGAAA CCAACTTGCG GGGTCAAGAG CTTGCTGGAG  GAAGAGGCAA TTAGAGTTGG TGGATTCAAT CACAGCCATA CAACTCGGGA TCTTTATGAT TCCATTGCTG CCGGAAACTA TCCTGAGTGG GAACTTTTCA TTCAGATTGT CGATCCTGAT  CATGAAGACA AATTCGACTT TGACCCACTT GATATGACTA AnnnnnGGCC CGAAGACATA TTGCCCCTAA TGCCAGTTCG CCGCTTGGTC TTGAATAGGA ACATTGATAA CTTCTTTGCT  GAGAATGAAC ATCTTGCATT TTGCCCTTCA ATTGTGGTTC CCGGCGTCTA CTGCTTAGAT GATTGGCTGC TTCAAACTCG TATGTTCTCA TATTCTGATA CTCACAGGCA CCGCCTTGGA  CCAAATTATC TTCAACTnCC CCCTAATGCT CTTAAATGTG CTTATCACAA TAATCACCAC GAAGGTTTCA TGAATTTCAT GCATAGGGAT GAAGAGGTAA ACTATTTTCT TTCAAGGTAT  GATCCCGTTC GTCATGCAGG GAGATATCCn ATTCCACCTG CTATGCTGAC TGGAAAGCGT GAAAAGCAGA CTATCACTGA GAAAGAGAAC AACTTCAAGC AGCCCGGAGA GAGATACCGA 
CCATGGACGC CTGACAGGTA TCCTTCAGTC TCATGTAAGA GAAGTTCATC TGCCGATGGA TCGATGATGA GATCCGCAGC ATCTGGATTT CATACTGGTC TCAGGTGA 

Retrieve as FASTA