Entry information : CroPrx06(CRO_T026371 / cra_locus_11876_iso_6_len_1414_ver_3)
Entry ID 11168
Creation 2012-06-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-07-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx06(CRO_T026371 / cra_locus_11876_iso_6_len_1414_ver_3)
Name CroPrx06(CRO_T026371 / cra_locus_11876_iso_6_len_1414_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx06
start..stop
S start..stop
RcPrx17 600 0 1..331 1..331
MePrx01 600 0 1..331 1..331
NnPrx50 591 0 1..331 1..331
LcPrx03 590 0 1..331 1..332
Literature and cross-references CroPrx06(CRO_T026371 / cra_locus_11876_iso_6_len_1414_ver_3)
EST ref. GenBank:   FD421360.1 [3' end]
Protein sequence: CroPrx06(CRO_T026371 / cra_locus_11876_iso_6_len_1414_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (309)
PWM (Da):   %s   36164.48 (33803.2) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   9.69 (9.81) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKSMNILLL ATLLAFAPLC LCSKSHGGYL YPQFYDRSCP KAGQIVKSIV AKAVAKEARM AASLVRLHFH DCFVKGCDAS ILLDSTGSII SEKRSNPNRN SARGFEVIDE IKSALEKECP  QTVSCADILA LSARDSSVLA GGPSWEVPLG RKDSRGASLS GSNNNIPAPN NTFQTILTKF KLQGLNIVDM VALSGSHTIG NARCTSFRQR LYNQTGNGLA DFTLDKTYAA KLRNRCPRSG 
GDQNLFFMDF VSPTRFDNSY FKNLLASKGL LNSDEVLVTK NAESLELVKQ YAENNELFFQ QFAKSMIKMG NISPLTGSRG EIRKNCRKIN S 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 4 ESTs (5'end is missing). Incorrect prediction from MPGR (splicing error).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCAAGT CTATGAACAT TTTATTGCTG GCAACTCTCC TTGCCTTTGC ACCACTTTGT TTGTGTTCTA AGTCCCACGG TGGCTACCTT TACCCTCAGT TCTATGACAG ATCTTGCCCG  AAAGCAGGAC AAATTGTTAA GTCCATTGTT GCAAAAGCTG TTGCTAAAGA AGCCAGAATG GCTGCCTCTT TGGTCAGGCT CCATTTCCAT GACTGCTTTG TCAAGGTAAG GACTAAACCA  AGGAGTTATA AAGATTCATC TTTTAACTTT CTGACTTTTG TCTTGATGAT GATTTTTCTT AAGGGGTGCG ATGCCTCCAT ACTTCTAGAC AGCACTGGGA GTATAATCAG TGAGAAAAGA  TCAAATCCTA ACAGGAATTC AGCTCGTGGA TTCGAAGTGA TAGATGAAAT TAAATCTGCA TTAGAGAAAG AATGTCCTCA AACTGTGTCT TGTGCTGATA TCTTAGCCCT TTCTGCTAGA  GATTCTTCTG TTCTGGTAAC TAACAAGTTC TATAATATGT TTATCAAATG CAAAATGAAG ATGCTGCTAA GCAAAACTAA GAATAATTTC TTTATTATAT TATGCAGGCT GGTGGACCTA  GTTGGGAAGT TCCACTAGGA AGAAAAGACT CCAGAGGAGC TAGTTTAAGT GGCTCTAACA ACAACATTCC TGCTCCAAAT AACACTTTCC AAACCATCCT CACTAAGTTC AAGCTTCAAG  GCCTCAACAT TGTTGATATG GTTGCATTAT CTGGTAATAT CGGCTTTTTT TCTGGAAACC ATAAGTTTCT TCACATAATA ACAATGCATA ATGCATACAA GGACGGTACT AAAGGGGGCA  GAGGTGGGGT AAAGTTAAAT ATCATTTTTT GAAACAATAA TGATTTGAAA TTTACCTGCA GGAAGTCATA CAATAGGAAA TGCAAGATGC ACCAGCTTTA GGCAAAGGCT ATACAACCAA  ACTGGAAATG GATTAGCTGA CTTTACCTTG GACAAAACAT ATGCAGCAAA ATTAAGGAAC AGGTGCCCAA GATCCGGTGG AGATCAAAAC CTTTTCTTCA TGGACTTTGT TTCCCCAACA  AGATTTGATA ACAGCTACTT CAAGAACTTG CTGGCTTCAA AGGGACTATT AAACTCTGAT GAGGTTCTGG TGACCAAGAA TGCCGAGTCT TTGGAGCTGG TGAAACAATA CGCTGAGAAC 
AATGAACTCT TCTTTCAGCA GTTTGCCAAG TCCATGATTA AGATGGGTAA CATTTCACCT TTGACGGGTT CCAGGGGAGA AATCAGGAAA AACTGCAGGA AGATCAACTC TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCAAGT CTATGAACAT TTTATTGCTG GCAACTCTCC TTGCCTTTGC ACCACTTTGT TTGTGTTCTA AGTCCCACGG TGGCTACCTT TACCCTCAGT TCTATGACAG ATCTTGCCCG  AAAGCAGGAC AAATTGTTAA GTCCATTGTT GCAAAAGCTG TTGCTAAAGA AGCCAGAATG GCTGCCTCTT TGGTCAGGCT CCATTTCCAT GACTGCTTTG TCAAGGGGTG CGATGCCTCC  ATACTTCTAG ACAGCACTGG GAGTATAATC AGTGAGAAAA GATCAAATCC TAACAGGAAT TCAGCTCGTG GATTCGAAGT GATAGATGAA ATTAAATCTG CATTAGAGAA AGAATGTCCT  CAAACTGTGT CTTGTGCTGA TATCTTAGCC CTTTCTGCTA GAGATTCTTC TGTTCTGGCT GGTGGACCTA GTTGGGAAGT TCCACTAGGA AGAAAAGACT CCAGAGGAGC TAGTTTAAGT  GGCTCTAACA ACAACATTCC TGCTCCAAAT AACACTTTCC AAACCATCCT CACTAAGTTC AAGCTTCAAG GCCTCAACAT TGTTGATATG GTTGCATTAT CTGGAAGTCA CACAATAGGA  AATGCAAGAT GCACCAGCTT TAGGCAAAGG CTATACAACC AAACTGGAAA TGGATTAGCT GACTTTACCT TGGACAAAAC ATATGCAGCA AAATTAAGGA ACAGGTGCCC AAGATCCGGT  GGAGATCAAA ACCTTTTCTT CATGGACTTT GTTTCCCCAA CAAGATTTGA TAACAGCTAC TTCAAGAACT TGCTGGCTTC AAAGGGACTA TTAAACTCTG ATGAGGTTCT GGTGACCAAG  AATGCCGAGT CTTTGGAGCT GGTGAAACAA TACGCTGAGA ACAATGAACT CTTCTTTCAG CAGTTTGCCA AGTCCATGAT TAAGATGGGT AACATTTCAC CTTTGACGGG TTCCAGGGGA 
GAAATCAGGA AAAACTGCAG GAAGATCAAC TCTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACTAAGCTTG TATGCATAAA TTAAAATTAC AAATCAAAGG GTAAACTAAT CATATACTAA CCATAACCTT TGCTTAACTA CTTTGATGAT AAGAAGATGA AGATATTGAT AACTCTTCAA  AAAGATTACC AACTCCACAT TACTTCCTTC CCTTGTCTAT AAATACCATA TTTCTTCTAC AACTTTAGCC ATAACAAATT CTTACCATTT CATCCAATCA AAAGTGCCAA CAAAAAATTG  TGAACAATGA CCAAGTCTAT GAACATTTTA TTGCTGGCAA CTCTCCTTGC CTTTGCACCA CTTTGTTTGT GTTCTAAGTC CCACGGTGGC TACCTTTACC CTCAGTTCTA TGACAGATCT  TGCCCGAAAG CAGGACAAAT TGTTAAGTCC ATTGTTGCAA AAGCTGTTGC TAAAGAAGCC AGAATGGCTG CCTCTTTGGT CAGGCTCCAT TTCCATGACT GCTTTGTCAA GGGGTGCGAT  GCCTCCATAC TTCTAGACAG CACTGGGAGT ATAATCAGTG AGAAAAGATC AAATCCTAAC AGGAATTCAG CTCGTGGATT CGAAGTGATA GATGAAATTA AATCTGCATT AGAGAAAGAA  TGTCCTCAAA CTGTGTCTTG TGCTGATATC TTAGCCCTTT CTGCTAGAGA TTCTTCTGTT CTGGCTGGTG GACCTAGTTG GGAAGTTCCA CTAGGAAGAA AAGACTCCAG AGGAGCTAGT  TTAAGTGGCT CTAACAACAA CATTCCTGCT CCAAATAACA CTTTCCAAAC CATCCTCACT AAGTTCAAGC TTCAAGGCCT CAACATTGTT GATATGGTTG CATTATCTGG AAGTCACACA  ATAGGAAATG CAAGATGCAC CAGCTTTAGG CAAAGGCTAT ACAACCAAAC TGGAAATGGA TTAGCTGACT TTACCTTGGA CAAAACATAT GCAGCAAAAT TAAGGAACAG GTGCCCAAGA  TCCGGTGGAG ATCAAAACCT TTTCTTCATG GACTTTGTTT CCCCAACAAG ATTTGATAAC AGCTACTTCA AGAACTTGCT GGCTTCAAAG GGACTATTAA ACTCTGATGA GGTTCTGGTG  ACCAAGAATG CCGAGTCTTT GGAGCTGGTG AAACAATACG CTGAGAACAA TGAACTCTTC TTTCAGCAGT TTGCCAAGTC CATGATTAAG ATGGGTAACA TTTCACCTTT GACGGGTTCC  AGGGGAGAAA TCAGGAAAAA CTGCAGGAAG ATCAACTCTT AAGAGTTATA AGACAACATG CTATAATGGC TGCTAAAATC AACCTATATA TTTATATTTC CCTACCATGA TTCCTTTTCT 
GTATTGATTT GTCGACAATT ATTTCAGCTT GTATCCTATT ATTAATGAAA TTTTCCCATG ATTTGTTCTT ATCAAAAAAA GAAAAAAAAA GGCC 

Retrieve as FASTA