Entry information : CroPrx07(CRO_T015723 / cra_locus_2633_iso_3_len_1726_ver_3)
Entry ID 11192
Creation 2012-07-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-07-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx07(CRO_T015723 / cra_locus_2633_iso_3_len_1726_ver_3)
Name CroPrx07(CRO_T015723 / cra_locus_2633_iso_3_len_1726_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx07
start..stop
S start..stop
PtPrx67 528 0 6..342 11..345
PpePrx02 521 0 7..351 14..357
GrPrx33 520 0 17..343 34..362
GhPrx33 518 0 17..343 34..362
Literature and cross-references CroPrx07(CRO_T015723 / cra_locus_2633_iso_3_len_1726_ver_3)
EST ref. GenBank:   FD423754.1 [3' end]
Protein sequence: CroPrx07(CRO_T015723 / cra_locus_2633_iso_3_len_1726_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   351 (326)
PWM (Da):   %s   38640.34 (35898.0)  
PI (pH):   %s   7.06 (7.72) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-351
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVSSSVLLLI SLVFFSAHYF DVSEAQNLPP LARGLSMSFY EQSCPKLESI IRKQLQKEFK KDIGQAAGLL RIHFHDCFVQ GCDGSVLLNG SASGPSERDA PPNFSLRAKG FQIIDDLRRR  VHKECGRIVS CSDIVALAAR DSVYLSGGPD YQVPLGRRDG LNFATQEATL NNLVPPSANT TTLLSMLAAK NLDATDAVAL SGGHTIGISH CGSFTDRLYP NVDPTMDKTF ANNLKKTCPT 
ENSNNTVFQD IRSPNKFDNK YFVDLMNRQG LFTSDQDMYT DRRTRGIVTN FAVNETLFFE KFVIGMIKMG QMNVLTGTQG EIRAKCSVRN RDNSMISTVV DEIEDIGLSM F 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCTT CTTCTTCTGT GCTTCTTCTA ATCTCTTTGG TTTTTTTTAG TGCGCATTAT TTTGATGTAA GTGAAGCTCA AAATCTTCCT CCTCTTGCAA GAGGACTTTC CATGAGCTTT  TATGAACAGA GTTGTCCTAA ATTGGAATCC ATCATCAGAA AACAGCTCCA AAAGGAGTTC AAAAAAGATA TTGGCCAAGC TGCTGGTTTA CTTCGTATTC ACTTCCATGA TTGCTTCGTT  CAGGTACAAT TTTTTTCAAA ATTTTTCTCA AGAAATAGTT TTCCAATACC CACTTATAAA CCCTTTTTTT ATTATTATTT TTAAATCTCA TTGTATTTAA TTAATTATGT ATATGCAGGG  TTGTGATGGT TCGGTCCTAC TGAACGGATC AGCAAGCGGA CCGAGTGAAC AGGACGCGCC ACCTAACTTG AGTCTTCGGG CCAAGGGTTT TCAGATTATT GATGACCTCC GGAGGCGCGT  GCACAAGGAA TGTGGTAGAA TTGTTTCTTG TTCCGATATT GTCGCCCTGG CTGCCCGTGA TTCTGTTTAC CTGGTAATAA AATTACTCCT CTTCTTTTTT TGTTTAATTT CTTTTTTCAC  GAAAAAAAAA AAAAAAGAAC TCTTCTTCGT TTGGGGAGGG GGAAGGGGAG GGGGGACAGA CAAGACTGAT TTTAATAATT TGTGCTTTAG AAGTAAAAAA GTAGATCGAT AATATATATT  TTGCAGAAAA CAATCCAATC TTTTATTAAA GTTACTTATT TTATTGTTAA ATATGGAGAG AGAAAGTAAT GAATAAGACA TAATAAATAA ACTTTAAATA AGTTAGAATT AAAAATTATA  TAATAAATAT ATATTAAAAT AAATAAAAAA TTATAATTTT AATTAATTTT AATTAAAAAA TTAATATTAT TAATCGAAAC TAATATGTAT TATTAATATA AATAGCAGTT TCCATTTGGA  GTGTTCTATC TCATTCTATA CTATCGTAAT TAAATTAAAT TGCGGCATAA CTTTTATTTT TTTCAAAAAA AACCCTACAA AGATATTTTG ACTATCAATT TTGCTACTTT GATTAAAACA  AAAAAAGAGA CTATCAATTT TGGTACTTGA TCTTTGTCCA CCTACTCTCT TTTTCTTTTT CATTACAAAA TTAGTGAGAA TTGATGACAA GTAGGCCATT TGTAGGTTGT CACTCCTCTA  TACATATTCC ATTACAATTA ACAAGTAGCT CATATACACT ATCTTATTCT TTTTTCCTTT AAAAAAAAAA AAAGAAAATA GAGTATCCTA TTCTTATCAA TACCTCTCAA TACCTCTCTT  AATTTCAATA CAAATTTTAG GTTTGGTTTT TTCTCTATTA CTACATAATT TATACAAATT TCAAGATTAT AAATGTGTTC AAATATATCC AACTAGATAA TTATATGAAT TTCAAGATAA  TAAATCTTTC CAATATAAGT GTTTGCAAGT ATTCCTTAAA GAAAAAAATT TGTTTACACG TAGTTAAGGA TACAAGTATA TGAGTTATTT GTCCAATCAT TTATGAAAAA AATAATTAAA  ATTAACAATT CTGCTCTTAA GTTATTTATA CAGTGTGTCA CATTTAGAAA TTTATCAAAA TTTGTCACAA ATGAATAATA AAAATCATTT TTTTTAGAAA ACCAATTTAA AATATCAAAA  ATAAAATTTA AAACTAAATA AATAATTTAA CACTAATTTT GTCGATTTCT CAATAAATAA TATTCTCTGT TTTTTTTACT TGGCATATTG TAGGAATTAT CATATTTTTT TTACTTGTCA  TATTGTAGTT TCAAGATAAT GAGCTATTTC TTATAATATT CTCCTACTAA TAATAAATTT TAATTTTTTT TATTTTTTAA TATTGAAACT AGTAAAACAA TAATGAAGAA AGAGAACTAG  GAAGGGCATT TTAGTTTGTT TAAAAAAAAT CTAAAAATTT ATATTTTATT AACGGAGGGA GCAAGTTTCT AACTTTGAAA TTGTTGCAGT CTGGTGGCCC TGATTATCAA GTACCATTAG  GAAGAAGAGA TGGACTAAAC TTTGCAACAC AAGAAGCAAC ATTAAACAAC CTAGTCCCAC CCTCCGCCAA CACAACCACC CTCCTGTCTA TGCTAGCGGC CAAAAACCTC GACGCCACGG  ACGCCGTCGC ACTTTCAGGC GGCCACACAA TCGGAATCAG CCACTGCAGA TCATTTACCG ACAGACTTTA CCCAAATGTA GATCCAACAA TGGAGAAAAC CTTCGCAAAC AATCTTAAAA  AAACATGTCC GACTGAGAAT TCAAATAACA CCGTATTTCA AGACATTAGA AGTCCGAATA AATTCGATAA TAAATATTTC GTTGATCTTA TGAACAGACA GGGGCTTTTT ACATCGGATC  AAGATATGTA TACCGATCGA AGAACGAGGG GCATTGTTAC TAATTTTGCT GTTAATGAAA CTCTATTTTT TGAGAAGTTT GTGATTGGCA TGATTAAGAT GGGGCAAATG AGTGTTTTGA 
CTGGTACTCA AGGTGAAATT AGGGCTAAAT GCTCTGTTAG GAATAGGGAT AATTCCATGA TTTCGACTGT GGTGGATGAA ATCGAAGATA TTGGGTTGTC CATGTTTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCTT CTTCTGTGCT TCTTCTAATC TCTTTGGTTT TTTTTAGTGC GCATTATTTT GATGTAAGTG AAGCTCAAAA TCTTCCTCCT CTTGCAAGAG GACTTTCCAT GAGCTTTTAT  GAACAGAGTT GTCCTAAATT GGAATCCATC ATTAGAAAAC AGCTCCAAAA GGAGTTCAAA AAAGATATTG GCCAAGCTGC TGGTTTACTT CGTATTCACT TCCATGATTG CTTCGTTCAG  GGTTGTGATG GTTCGGTCCT ACTGAACGGA TCAGCAAGCG GACCGAGTGA ACGGGACGCG CCACCTAACT TCAGTCTTCG GGCCAAGGGT TTTCAGATTA TTGATGACCT CCGGAGGCGC  GTGCACAAGG AATGTGGTAG AATTGTTTCT TGTTCCGATA TTGTCGCCTT GGCTGCCCGT GATTCTGTTT ACCTGTCTGG TGGCCCTGAT TATCAAGTAC CATTAGGAAG AAGAGATGGA  CTAAACTTTG CAACACAAGA AGCAACATTA AACAACCTAG TCCCACCCTC CGCCAACACA ACCACCCTCC TCTCTATGTT AGCGGCCAAA AACCTCGACG CCACGGACGC CGTCGCACTT  TCAGGCGGCC ACACAATCGG AATCAGCCAC TGCGGATCAT TTACCGACAG ACTTTACCCA AATGTAGATC CAACAATGGA CAAAACCTTC GCAAACAATC TTAAAAAAAC ATGTCCGACT  GAGAATTCAA ATAACACCGT ATTTCAAGAC ATTAGAAGTC CGAATAAATT CGATAATAAA TATTTCGTTG ATCTTATGAA CAGACAGGGG CTTTTTACAT CGGATCAAGA TATGTATACC  GATCGAAGAA CGAGGGGCAT TGTTACTAAT TTTGCTGTTA ATGAAACTCT TTTTTTTGAG AAGTTTGTGA TTGGGATGAT TAAGATGGGG CAAATGAATG TTTTGACTGG TACTCAAGGT 
GAAATTAGGG CTAAATGCTC TGTTAGGAAT AGGGATAATT CCATGATTTC GACTGTGGTG GATGAAATCG AAGATATTGG GTTGTCCATG TTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCTT CTTCTGTGCT TCTTCTAATC TCTTTGGTTT TTTTTAGTGC GCATTATTTT GATGTAAGTG AAGCTCAAAA TCTTCCTCCT CTTGCAAGAG GACTTTCCAT GAGCTTTTAT  GAACAGAGTT GTCCTAAATT GGAATCCATC ATTAGAAAAC AGCTCCAAAA GGAGTTCAAA AAAGATATTG GCCAAGCTGC TGGTTTACTT CGTATTCACT TCCATGATTG CTTCGTTCAG  GGTTGTGATG GTTCGGTCCT ACTGAACGGA TCAGCAAGCG GACCGAGTGA ACGGGACGCG CCACCTAACT TCAGTCTTCG GGCCAAGGGT TTTCAGATTA TTGATGACCT CCGGAGGCGC  GTGCACAAGG AATGTGGTAG AATTGTTTCT TGTTCCGATA TTGTCGCCTT GGCTGCCCGT GATTCTGTTT ACCTGTCTGG TGGCCCTGAT TATCAAGTAC CATTAGGAAG AAGAGATGGA  CTAAACTTTG CAACACAAGA AGCAACATTA AACAACCTAG TCCCACCCTC CGCCAACACA ACCACCCTCC TCTCTATGTT AGCGGCCAAA AACCTCGACG CCACGGACGC CGTCGCACTT  TCAGGCGGCC ACACAATCGG AATCAGCCAC TGCGGATCAT TTACCGACAG ACTTTACCCA AATGTAGATC CAACAATGGA CAAAACCTTC GCAAACAATC TTAAAAAAAC ATGTCCGACT  GAGAATTCAA ATAACACCGT ATTTCAAGAC ATTAGAAGTC CGAATAAATT CGATAATAAA TATTTCGTTG ATCTTATGAA CAGACAGGGG CTTTTTACAT CGGATCAAGA TATGTATACC  GATCGAAGAA CGAGGGGCAT TGTTACTAAT TTTGCTGTTA ATGAAACTCT TTTTTTTGAG AAGTTTGTGA TTGGGATGAT TAAGATGGGG CAAATGAATG TTTTGACTGG TACTCAAGGT  GAAATTAGGG CTAAATGCTC TGTTAGGAAT AGGGATAATT CCATGATTTC GACTGTGGTG GATGAAATCG AAGATATTGG GTTGTCCATG TTTTAATTTT AATTTGATTG TGAGGGTCTT 
TTTTTTCTTT TTCTTTTTTT TTTTTTGTGT AGTTTTTTAT GTAACATTAC CTTTTGTCAT CTTTTGTGCA TTTAGGTGTT AACTACAGTG TTAACTACTG CAA 

Retrieve as FASTA