Entry information : SAcoKat02
Entry ID 11216
Creation 2012-07-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-07-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-09-06 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: SAcoKat02
Name SAcoKat02
Class Catalase    [Orthogroup: Kat002]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Saitoella
Organism Saitoella complicata    [TaxId: 5606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SAcoKat02
start..stop
S start..stop
CcinKat03 814 0 10..574 2..568
CcinKat04 806 0 10..574 2..570
PnoKat01 745 0 35..582 4..543
CheKat01_C5 737 0 33..573 2..537
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 428164..429939 1776  
complement(join(428164..429939))


exon

Literature and cross-references SAcoKat02
DNA ref. JGI genome:   scaffold_9 (429939..428164)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   55828
Protein sequence: SAcoKat02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   592
PWM (Da):   %s   67327.02  
PI (pH):   %s   6.33
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MASLLHNIAQ DAAEVAGKLG LDPRPVQKAT LFQGANKGPA ETAACITGVQ ETHVKEDNAP YLTNNYGIPW PTTNHSLNVG GIPVASDTFL FEKQQTFNRS KTLERMVHPC GSGAFGYFEV  TQDVSDLCKA DFLSEVGKKT PVFVRFSTVT FGREFPDSGR NPRGFAIKFY TGEGNYDIVG LNWPIFFCRD PMQGPDVIRS QQRNPQNFLL DFDSLFDFLA MVPESNHAGL MFFSDHGTPN  GWRFEHGYGA HTFKWVNKDG GAVYVKYHFI AKHGQKQFTW EEAVRMSGED PDYSKRDLWA AIERGEEIEW KAMYQVMTLD EAAQQDFDPF DVTKVWPRGL FPMKEFGKLV LNRNPEDYHR  DVEQSAFSPG SMVPGIEPSP DMLLQFRTFF YRDAQFHRLG VNLHQIPVNC PFMSQSYSSI NNAGPMRVDA NTGQKPHYWP NSYNTPKFRQ DVDYKPVKVA DNILSRQSHS MHEGKFSEYT 
QATELYRRVM DDGARANTHK NTVAYLKWVE PRIQKLYLSQ CYCIAPEYAR GIYDLLPEKK FEFGDVEELA KTAPMRGKEE EYMPKEDWHR LIGVDVDSKV VPTLTATSIS K* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCATCTC TGCTCCATAA CATTGCTCAA GACGCTGCCG AGGTCGCCGG CAAGCTGGGT CTCGACCCTC GTCCCGTGCA GAAGGCTACT CTCTTCCAGG GTGCCAACAA AGGCCCTGCT  GAGACTGCTG CTTGTATCAC TGGTGTTCAG GAAACTCACG TGAAGGAGGA CAATGCTCCT TACTTGACCA ACAACTACGG TATTCCCTGG CCTACCACCA ACCATTCCCT TAATGTCGGT  GGAATCCCCG TCGCTTCCGA CACCTTCCTC TTCGAGAAGC AGCAGACCTT CAACCGTTCC AAGACTTTGG AGCGTATGGT CCACCCCTGT GGATCCGGTG CTTTCGGATA CTTTGAGGTC  ACCCAGGACG TCTCAGACCT CTGCAAAGCC GACTTTTTGA GTGAGGTCGG TAAGAAGACT CCTGTGTTCG TTCGTTTCTC TACCGTCACG TTCGGTCGTG AGTTCCCCGA CTCTGGTCGT  AACCCCCGTG GATTCGCGAT CAAGTTCTAC ACCGGCGAAG GAAACTACGA CATCGTGGGT CTCAACTGGC CTATCTTCTT CTGCCGTGAT CCTATGCAGG GTCCGGATGT GATCCGCTCT  CAGCAGCGTA ACCCGCAGAA CTTCCTCCTC GACTTTGACT CCCTCTTCGA CTTCCTCGCC ATGGTTCCCG AGTCTAACCA CGCTGGACTC ATGTTCTTCT CCGACCACGG TACGCCCAAT  GGATGGAGGT TTGAACATGG CTACGGTGCG CACACGTTCA AGTGGGTTAA CAAGGATGGG GGTGCTGTGT ACGTCAAGTA CCACTTCATC GCGAAGCACG GACAAAAGCA GTTCACCTGG  GAGGAAGCCG TCCGCATGAG TGGTGAAGAC CCCGATTACT CCAAGCGTGA CCTCTGGGCT GCTATCGAGC GTGGCGAGGA GATCGAGTGG AAGGCGATGT ACCAAGTCAT GACCCTCGAC  GAAGCCGCCC AGCAGGACTT CGACCCCTTC GACGTCACCA AGGTCTGGCC TCGTGGTCTC TTCCCCATGA AGGAGTTTGG AAAGTTGGTG TTGAACCGCA ACCCCGAAGA CTACCACCGC  GACGTCGAAC AATCCGCATT CTCCCCCGGC TCCATGGTTC CTGGAATCGA GCCCTCTCCC GACATGTTGT TGCAGTTCCG CACCTTCTTC TACCGCGACG CGCAATTCCA CCGTCTCGGC  GTGAATCTCC ACCAAATCCC CGTCAACTGC CCTTTCATGT CCCAATCCTA CTCATCCATC AACAACGCGG GTCCCATGCG CGTGGATGCC AACACCGGAC AGAAGCCCCA CTACTGGCCC  AACTCCTACA ACACCCCCAA GTTCCGCCAG GATGTCGACT ACAAGCCCGT CAAGGTCGCT GACAATATCC TCTCCCGCCA GTCGCACAGC ATGCACGAAG GCAAATTCTC CGAATACACC  CAAGCAACCG AACTCTACCG CCGCGTAATG GACGACGGCG CACGCGCCAA CACCCACAAA AACACCGTCG CATACCTCAA ATGGGTCGAA CCCCGTATCC AGAAACTCTA TTTGAGTCAA  TGCTACTGCA TCGCGCCGGA GTATGCTAGG GGCATCTACG ATTTGTTGCC GGAGAAGAAG TTTGAGTTTG GGGATGTGGA GGAGTTGGCG AAGACGGCGC CGATGAGGGG GAAGGAGGAG 
GAGTATATGC CGAAGGAGGA CTGGCACAGG CTGATTGGGG TTGATGTTGA TAGTAAGGTT GTGCCGACTT TGACGGCGAC GAGTATTAGC AAGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCATCTC TGCTCCATAA CATTGCTCAA GACGCTGCCG AGGTCGCCGG CAAGCTGGGT CTCGACCCTC GTCCCGTGCA GAAGGCTACT CTCTTCCAGG GTGCCAACAA AGGCCCTGCT  GAGACTGCTG CTTGTATCAC TGGTGTTCAG GAAACTCACG TGAAGGAGGA CAATGCTCCT TACTTGACCA ACAACTACGG TATTCCCTGG CCTACCACCA ACCATTCCCT TAATGTCGGT  GGAATCCCCG TCGCTTCCGA CACCTTCCTC TTCGAGAAGC AGCAGACCTT CAACCGTTCC AAGACTTTGG AGCGTATGGT CCACCCCTGT GGATCCGGTG CTTTCGGATA CTTTGAGGTC  ACCCAGGACG TCTCAGACCT CTGCAAAGCC GACTTTTTGA GTGAGGTCGG TAAGAAGACT CCTGTGTTCG TTCGTTTCTC TACCGTCACG TTCGGTCGTG AGTTCCCCGA CTCTGGTCGT  AACCCCCGTG GATTCGCGAT CAAGTTCTAC ACCGGCGAAG GAAACTACGA CATCGTGGGT CTCAACTGGC CTATCTTCTT CTGCCGTGAT CCTATGCAGG GTCCGGATGT GATCCGCTCT  CAGCAGCGTA ACCCGCAGAA CTTCCTCCTC GACTTTGACT CCCTCTTCGA CTTCCTCGCC ATGGTTCCCG AGTCTAACCA CGCTGGACTC ATGTTCTTCT CCGACCACGG TACGCCCAAT  GGATGGAGGT TTGAACATGG CTACGGTGCG CACACGTTCA AGTGGGTTAA CAAGGATGGG GGTGCTGTGT ACGTCAAGTA CCACTTCATC GCGAAGCACG GACAAAAGCA GTTCACCTGG  GAGGAAGCCG TCCGCATGAG TGGTGAAGAC CCCGATTACT CCAAGCGTGA CCTCTGGGCT GCTATCGAGC GTGGCGAGGA GATCGAGTGG AAGGCGATGT ACCAAGTCAT GACCCTCGAC  GAAGCCGCCC AGCAGGACTT CGACCCCTTC GACGTCACCA AGGTCTGGCC TCGTGGTCTC TTCCCCATGA AGGAGTTTGG AAAGTTGGTG TTGAACCGCA ACCCCGAAGA CTACCACCGC  GACGTCGAAC AATCCGCATT CTCCCCCGGC TCCATGGTTC CTGGAATCGA GCCCTCTCCC GACATGTTGT TGCAGTTCCG CACCTTCTTC TACCGCGACG CGCAATTCCA CCGTCTCGGC  GTGAATCTCC ACCAAATCCC CGTCAACTGC CCTTTCATGT CCCAATCCTA CTCATCCATC AACAACGCGG GTCCCATGCG CGTGGATGCC AACACCGGAC AGAAGCCCCA CTACTGGCCC  AACTCCTACA ACACCCCCAA GTTCCGCCAG GATGTCGACT ACAAGCCCGT CAAGGTCGCT GACAATATCC TCTCCCGCCA GTCGCACAGC ATGCACGAAG GCAAATTCTC CGAATACACC  CAAGCAACCG AACTCTACCG CCGCGTAATG GACGACGGCG CACGCGCCAA CACCCACAAA AACACCGTCG CATACCTCAA ATGGGTCGAA CCCCGTATCC AGAAACTCTA TTTGAGTCAA  TGCTACTGCA TCGCGCCGGA GTATGCTAGG GGCATCTACG ATTTGTTGCC GGAGAAGAAG TTTGAGTTTG GGGATGTGGA GGAGTTGGCG AAGACGGCGC CGATGAGGGG GAAGGAGGAG 
GAGTATATGC CGAAGGAGGA CTGGCACAGG CTGATTGGGG TTGATGTTGA TAGTAAGGTT GTGCCGACTT TGACGGCGAC GAGTATTAGC AAGTAG 

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