Entry information : SAcoKat03
Entry ID 11217
Creation 2012-07-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-07-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-09-06 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: SAcoKat03
Name SAcoKat03
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Saitoella
Organism Saitoella complicata    [TaxId: 5606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SAcoKat03
start..stop
S start..stop
CheKat02_C5 878 0 1..698 41..739
CheKat02_C4 878 0 1..698 41..739
PanKat01 861 0 1..698 40..735
PtritKat01 858 0 1..698 41..739
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 591871..593967 2097  
join(591871..593967)


exon

Literature and cross-references SAcoKat03
DNA ref. JGI genome:   scaffold_2 (591871..593967)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   52174
Protein sequence: SAcoKat03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   700
PWM (Da):   %s   78445.86  
PI (pH):   %s   5.99
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MTTNTGVKVS NTDDWLKVIS DNGTGPHILE DFHAREKIHH FDHERIPERV VHARGAGAHG VFRLFESAAD VTCAKVLTDT SRETPMFVRF STVLGSRGSA DTVRDVRGFA IRFYTDEGNW  DIVGNNIPVF FIQDSIKFPD VIHSGKPEPS TEVPQAQSAH NNFWDFMGLQ PETSHMFMWA MSDRGIPRSY RMMQGFGVNT FALINEQGER TFVKFVWTPE LGVHSLVWDE ALKICGQDPD  FHRKDLYAAI DNGAYPKWKF GIQCIKEADA DNFDFDILDS TKLWPEQLVP VRYIGEFELN RNVTEYFPET EQVAFCTSHI VPGIDFTDDP LLQGRNFSYL DTQLNRFGSF NFNELPINRP  LAPTLNNQRD GFMRHTITEG KVNYWPNRYS SIKPTPASGG SGGFETYRQE VNGFKQRKRG PKFYEHLNQA TQFYNSMRPH EKRHMTNSFV FELSKCDDPQ VYTTMIERLN MVSFELACTV  ATQVGVAPPE KPFKTEYPTA AIQGVSQAEL TGNGSIEGRR VAILIADGFD LGQVTEMRTA LAAQKAVTFI VGERRGPIKA AGQEESSKYE EGLGADFSWE SGRSTLFDAI YVPGGAGHIL 
KMKQSGRVTH WVREAFEHLK PICATGEGVD FIQQAVVLPG VDLALSEQST EVVNSYGVIT SRNVGLTNVG DVAKQFSQEM SQHRNWARED AGLNLKVAA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACAACAA ACACCGGTGT CAAGGTCTCC AACACCGATG ACTGGTTGAA GGTCATTTCC GACAACGGTA CCGGTCCTCA TATCTTGGAG GACTTCCATG CTCGTGAGAA GATCCACCAT  TTCGATCATG AGCGTATTCC GGAGCGCGTG GTCCATGCTC GTGGAGCTGG TGCTCACGGT GTTTTCCGTT TGTTCGAGTC GGCGGCCGAT GTCACCTGCG CCAAGGTCCT CACCGACACT  TCCCGCGAGA CGCCCATGTT CGTCCGTTTC TCTACTGTCT TGGGATCCCG TGGTTCCGCA GACACCGTCC GTGATGTCCG TGGTTTCGCC ATCCGTTTCT ACACCGATGA GGGTAACTGG  GATATCGTCG GAAACAACAT CCCTGTTTTC TTCATCCAGG ACTCGATCAA GTTCCCGGAT GTCATTCACT CCGGTAAGCC CGAGCCTTCG ACTGAGGTTC CCCAGGCTCA GTCCGCCCAC  AACAACTTCT GGGACTTCAT GGGTCTCCAG CCTGAGACTT CTCATATGTT CATGTGGGCC ATGTCTGACC GTGGCATTCC CCGCTCTTAC CGTATGATGC AGGGTTTCGG TGTCAACACC  TTTGCGTTGA TCAACGAGCA GGGTGAGCGC ACCTTCGTCA AGTTCGTCTG GACCCCCGAG TTGGGTGTCC ACTCTCTCGT CTGGGACGAG GCCTTGAAGA TCTGTGGTCA GGACCCCGAT  TTCCACCGCA AGGACTTGTA CGCCGCCATC GACAACGGCG CCTACCCCAA GTGGAAGTTC GGTATCCAGT GCATCAAGGA AGCCGACGCC GACAACTTCG ACTTCGACAT CCTCGACTCT  ACCAAGCTCT GGCCCGAGCA GCTCGTCCCC GTCCGCTATA TCGGTGAGTT CGAGTTGAAC CGTAACGTCA CCGAGTACTT CCCCGAGACT GAGCAAGTCG CTTTCTGCAC TTCTCACATC  GTCCCCGGTA TCGACTTTAC CGACGACCCG CTTTTGCAGG GCCGCAACTT CTCGTACTTG GATACGCAGT TGAACAGGTT CGGCTCGTTC AACTTCAACG AGTTGCCGAT CAACAGGCCC  CTCGCTCCCA CCCTCAACAA CCAGCGTGAT GGCTTCATGC GTCACACCAT CACCGAGGGC AAGGTCAACT ACTGGCCCAA CCGCTACTCC TCCATTAAGC CTACCCCTGC CTCCGGCGGC  TCCGGTGGTT TCGAGACCTA CCGCCAGGAA GTCAACGGCT TCAAGCAGCG CAAGCGTGGT CCCAAGTTCT ACGAGCACTT GAACCAGGCT ACCCAGTTCT ACAACTCTAT GCGTCCCCAC  GAGAAGAGAC ACATGACCAA CTCCTTTGTG TTTGAGTTGT CAAAGTGTGA TGACCCTCAG GTCTACACCA CCATGATTGA GCGTTTGAAC ATGGTTTCGT TCGAGCTTGC TTGTACGGTT  GCTACTCAGG TCGGTGTCGC GCCCCCTGAG AAGCCGTTCA AGACCGAATA TCCTACTGCC GCTATTCAGG GTGTTTCTCA GGCCGAGTTG ACTGGAAATG GCTCGATTGA GGGACGCCGT  GTTGCCATCC TCATCGCCGA TGGTTTCGAT TTGGGACAGG TCACTGAGAT GAGGACGGCG CTTGCTGCGC AGAAGGCTGT TACGTTCATC GTTGGTGAGC GTCGTGGTCC TATCAAGGCC  GCTGGACAGG AGGAATCCTC CAAGTACGAG GAAGGGTTGG GCGCGGACTT CTCTTGGGAG TCGGGCCGTT CTACGCTCTT TGACGCTATC TACGTCCCCG GCGGCGCAGG CCACATCTTG  AAGATGAAGC AATCCGGCCG TGTCACCCAC TGGGTCCGTG AGGCCTTCGA GCACCTCAAG CCCATCTGTG CTACCGGTGA GGGTGTCGAT TTCATCCAGC AGGCTGTTGT TTTGCCTGGT  GTTGACCTTG CGTTGAGTGA GCAGAGCACG GAGGTTGTTA ACTCTTACGG TGTCATTACC AGCAGGAACG TTGGGTTGAC GAACGTTGGC GATGTTGCGA AGCAGTTCAG TCAGGAGATG 
AGTCAGCACA GGAACTGGGC TCGTGAGGAT GCTGGGCTTA ACTTGAAGGT TGCTGCT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACAACAA ACACCGGTGT CAAGGTCTCC AACACCGATG ACTGGTTGAA GGTCATTTCC GACAACGGTA CCGGTCCTCA TATCTTGGAG GACTTCCATG CTCGTGAGAA GATCCACCAT  TTCGATCATG AGCGTATTCC GGAGCGCGTG GTCCATGCTC GTGGAGCTGG TGCTCACGGT GTTTTCCGTT TGTTCGAGTC GGCGGCCGAT GTCACCTGCG CCAAGGTCCT CACCGACACT  TCCCGCGAGA CGCCCATGTT CGTCCGTTTC TCTACTGTCT TGGGATCCCG TGGTTCCGCA GACACCGTCC GTGATGTCCG TGGTTTCGCC ATCCGTTTCT ACACCGATGA GGGTAACTGG  GATATCGTCG GAAACAACAT CCCTGTTTTC TTCATCCAGG ACTCGATCAA GTTCCCGGAT GTCATTCACT CCGGTAAGCC CGAGCCTTCG ACTGAGGTTC CCCAGGCTCA GTCCGCCCAC  AACAACTTCT GGGACTTCAT GGGTCTCCAG CCTGAGACTT CTCATATGTT CATGTGGGCC ATGTCTGACC GTGGCATTCC CCGCTCTTAC CGTATGATGC AGGGTTTCGG TGTCAACACC  TTTGCGTTGA TCAACGAGCA GGGTGAGCGC ACCTTCGTCA AGTTCGTCTG GACCCCCGAG TTGGGTGTCC ACTCTCTCGT CTGGGACGAG GCCTTGAAGA TCTGTGGTCA GGACCCCGAT  TTCCACCGCA AGGACTTGTA CGCCGCCATC GACAACGGCG CCTACCCCAA GTGGAAGTTC GGTATCCAGT GCATCAAGGA AGCCGACGCC GACAACTTCG ACTTCGACAT CCTCGACTCT  ACCAAGCTCT GGCCCGAGCA GCTCGTCCCC GTCCGCTATA TCGGTGAGTT CGAGTTGAAC CGTAACGTCA CCGAGTACTT CCCCGAGACT GAGCAAGTCG CTTTCTGCAC TTCTCACATC  GTCCCCGGTA TCGACTTTAC CGACGACCCG CTTTTGCAGG GCCGCAACTT CTCGTACTTG GATACGCAGT TGAACAGGTT CGGCTCGTTC AACTTCAACG AGTTGCCGAT CAACAGGCCC  CTCGCTCCCA CCCTCAACAA CCAGCGTGAT GGCTTCATGC GTCACACCAT CACCGAGGGC AAGGTCAACT ACTGGCCCAA CCGCTACTCC TCCATTAAGC CTACCCCTGC CTCCGGCGGC  TCCGGTGGTT TCGAGACCTA CCGCCAGGAA GTCAACGGCT TCAAGCAGCG CAAGCGTGGT CCCAAGTTCT ACGAGCACTT GAACCAGGCT ACCCAGTTCT ACAACTCTAT GCGTCCCCAC  GAGAAGAGAC ACATGACCAA CTCCTTTGTG TTTGAGTTGT CAAAGTGTGA TGACCCTCAG GTCTACACCA CCATGATTGA GCGTTTGAAC ATGGTTTCGT TCGAGCTTGC TTGTACGGTT  GCTACTCAGG TCGGTGTCGC GCCCCCTGAG AAGCCGTTCA AGACCGAATA TCCTACTGCC GCTATTCAGG GTGTTTCTCA GGCCGAGTTG ACTGGAAATG GCTCGATTGA GGGACGCCGT  GTTGCCATCC TCATCGCCGA TGGTTTCGAT TTGGGACAGG TCACTGAGAT GAGGACGGCG CTTGCTGCGC AGAAGGCTGT TACGTTCATC GTTGGTGAGC GTCGTGGTCC TATCAAGGCC  GCTGGACAGG AGGAATCCTC CAAGTACGAG GAAGGGTTGG GCGCGGACTT CTCTTGGGAG TCGGGCCGTT CTACGCTCTT TGACGCTATC TACGTCCCCG GCGGCGCAGG CCACATCTTG  AAGATGAAGC AATCCGGCCG TGTCACCCAC TGGGTCCGTG AGGCCTTCGA GCACCTCAAG CCCATCTGTG CTACCGGTGA GGGTGTCGAT TTCATCCAGC AGGCTGTTGT TTTGCCTGGT  GTTGACCTTG CGTTGAGTGA GCAGAGCACG GAGGTTGTTA ACTCTTACGG TGTCATTACC AGCAGGAACG TTGGGTTGAC GAACGTTGGC GATGTTGCGA AGCAGTTCAG TCAGGAGATG 
AGTCAGCACA GGAACTGGGC TCGTGAGGAT GCTGGGCTTA ACTTGAAGGT TGCTGCT 

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