Entry information : CroPrx12(CRO_T03208/ cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Entry ID 11270
Creation 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx12(CRO_T03208/ cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Name CroPrx12(CRO_T03208/ cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx12
start..stop
S start..stop
NtPrx36-1A 510 0 1..330 1..327
NtPrx36-1B 498 1e-179 1..330 1..328
LePrx37 490 6e-176 9..330 10..328
RcPrx31 486 2e-174 1..330 1..335
Literature and cross-references CroPrx12(CRO_T03208/ cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Protein sequence: CroPrx12(CRO_T03208/ cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (311)
PWM (Da):   %s   36292.17 (33806.8)  
PI (pH):   %s   5.72 (5.14) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVHKTFLFFA IFFCIILFVA PDPFPYNAQL DYHFYDTSCP NLALIVRWGV WAAVKSDSRM GASLLRLYFH DCFVNGCDGS VLLDDTVNFK GEKNAFPNRN SARGYEVIDS IKADVEKACP  SVVSCVDILA LAAREAVIIA GGPYYPVYLG RRDGLTASEK AANEQLPSPI EPLDNITTKF VSKGLDLKDV VVLSGAHTIG FAQCFTFKRR LYNFKGSGNP DPTLDSSLVS NLQSTCPNVD 
GSNNKLAPLD VQSTLIFDNA YYVNLMNNSG LLESDQALMG DPRTADLVKS YSMYPYLYFR DFAASMVKLG NVGILTGDSG EIRKKCGSVN SY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (Short PS is missing). Incorrect prediction (2 ORFs fused)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTCATA AAACTTTCTT GTTCTTCGCG ATTTTCTTCT GCATTATCCT CTTCGTAGCG CCTGACCCCT TTCCTTATAA TGCCCAATTA GATTACCATT TCTATGATAC ATCATGCCCT  AATTTGGCTC TAATAGTTAG ATGGGGTGTT TGGGCAGCTG TTAAAAGTGA TAGCAGAATG GGTGCATCCC TTCTCCGTTT ATACTTTCAT GATTGCTTCG TAAATGTAAT TTTTTCTTCT  TTTTCTGATT CCTTCATGAT CAGTTATTTC TGTGCCTTTA GTATTTCACT TCTGCATAAG ATATATAAGA ATACTTTACT ATTTGTCACA CCCCATAGTT TCGATGTTGT CTAAACATTG  TGACCGCAAA TTCAATGGTG ATTAAGCGAT TCCATTAACA TAACAATTGT TGATTTGTTG TACTAACTTT TAAATCAATT ATTTGAATCC CTTAAATAAG TGAAAGGGGC TTTGAAAGAT  ACCAAATTGG AGAAAACTTT AATACAAGGA TTTCATAATG AAGTGAAAGT TAATAAAGTT CAATTCTTGA TGCTTTGGCA CAGGGTTGTG ATGGTTCTGT GCTTCTTGAT GACACAGTAA  ACTTCAAGGG CGAGAAGAAT GCTTTTCCAA ACCGCAATTC AGCCAGAGGA TATGAGGTGA TTGATAGCAT AAAAGCCGAT GTTGAAAAAG CTTGCCCATC CGTAGTATCA TGTGTGGACA  TCTTAGCTCT TGCAGCTAGA GAAGCAGTGA TTATAGTAAG TATTGCTGTC ACCACTTGTT CCATTTGATT CCGTCCTTGC CTTAAGAGAT ATAAATGAAG TACTGATGTT TATGTATTGT  GTATTCAATA CTTTAGGCAG GAGGGCCTTA TTATCCTGTT TATTTAGGCC GGCGAGATGG ATTAACTGCA AGTGAGAAAG CAGCAAATGA GCAACTACCA TCACCTATTG AGCCTTTGGA  TAACATTACT ACCAAGTTTG TATCAAAAGG TCTTGACTTG AAGGATGTGG TAGTCCTCTC AGGTACTTCT GCCATACCCC CGTCCTACAT GGAATATATC TCATATAAAA AGTCGTATAA  GAGTGTATAT TTAATGGTTT AAGCATCTAT TGTCATATTG AGGGATTTAT TTTGGAACAA TAAAGATGAT TTTCAAGAAA TTAGTTGTCC CTACTACAGA CTTATGAGTC ATACTCTCAG  ACTTCTTGAG ACCACAAGAA GTGATATTAG TCAACTTCAA ATTCAAGAGA AAGGAAAATT TTGCTGTTCC TCTTTTCACT CCAAGGATGC GGTCCATTTT TATGCATGTT ACATAAAACT  GAATCATATA AGAACATGTA CCTATACTCA TTTTCACTTT AGAAATATCT ATTTTGACAT AGTAGAAAAT GATGGTAAGT AATTGTTGTC GCGCTGTTTT GAGCCTGTTA GGCACGAGTC  GTGACATTAG ACATACCTAG TTTAGTCTAA GTCCTCTTCC TACTCCAAGC ATGCCTTCCA TTGTAACATT TCCATTGTGT TTTCTGGTGA TTTTAGGAGC TCATACCATT GGTTTTGCTC  AGTGTTTTAC ATTCAAGAGG AGACTCTATA ATTTCAAAGG ATCAGGAAAT CCAGACCCTA CTCTTGATTC ATCTCTAGTT TCGAACTTGC AAAGTACTTG TCCAAATGTA GATGGATCAA  ACAACAAATT AGCTCCTCTT GATGTTCAAT CTACTCTTAT ATTCGACAAT GCATATTATG TTAACTTGAT GAACAATTCG GGCTTGCTTG AATCTGATCA AGCATTGATG GGGGATCCAA  GAACAGCAGA TTTGGTGAAG TCTTATAGTA TGTATCCATA TCTGTATTTC AGAGATTTTG CAGCATCAAT GGTGAAGCTT GGAAATGTTG GGATTTTGAC TGGTGATTCT GGCGAAATTC 
GCAAGAAATG TGGCTCTGTA AACTCTTACT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTCATA AAACTTTCTT GTTCTTCGCG ATTTTCTTCT GCATTATCCT CTTCGTAGCG CCTGACCCCT TTCCTTATAA TGCCCAATTA GATTACCATT TCTATGATAC ATCATGCCCT  AATTTGGCTC TAATAGTTAG ATGGGGTGTT TGGGCAGCTG TTAAAAGTGA TAGCAGAATG GGTGCATCCC TTCTCCGTTT ATACTTTCAT GATTGCTTCG TAAATGGTTG TGATGGTTCT  GTGCTTCTTG ATGACACAGT AAACTTCAAG GGCGAGAAGA ATGCTTTTCC AAACCGCAAT TCAGCCAGAG GATATGAGGT GATTGATAGC ATAAAAGCCG ATGTTGAAAA AGCTTGCCCA  TCCGTAGTAT CATGTGTGGA CATCTTAGCT CTTGCAGCTA GAGAAGCAGT GATTATAGCA GGAGGGCCTT ATTATCCTGT TTATTTAGGC CGGCGAGATG GATTAACTGC AAGTGAGAAA  GCAGCAAATG AGCAACTACC ATCACCTATT GAGCCTTTGG ATAACATTAC TACCAAGTTT GTATCAAAAG GTCTTGACTT GAAGGATGTG GTAGTCCTCT CAGGAGCTCA TACCATTGGT  TTTGCTCAGT GTTTTACATT CAAGAGGAGA CTCTATAATT TCAAAGGATC AGGAAATCCA GACCCTACTC TTGATTCATC TCTAGTTTCG AACTTGCAAA GTACTTGTCC AAATGTAGAT  GGATCAAACA ACAAATTAGC TCCTCTTGAT GTTCAATCTA CTCTTATATT CGACAATGCA TATTATGTTA ACTTGATGAA CAATTCGGGC TTGCTTGAAT CTGATCAAGC ATTGATGGGG  GATCCAAGAA CAGCAGATTT GGTGAAGTCT TATAGTATGT ATCCATATCT GTATTTCAGA GATTTTGCAG CATCAATGGT GAAGCTTGGA AATGTTGGGA TTTTGACTGG TGATTCTGGC 
GAAATTCGCA AGAAATGTGG CTCTGTAAAC TCTTACTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTCATA AAACTTTCTT GTTCTTCGCG ATTTTCTTCT GCATTATCCT CTTCGTAGCG CCTGACCCCT TTCCTTATAA TGCCCAATTA GATTACCATT TCTATGATAC ATCATGCCCT  AATTTGGCTC TAATAGTTAG ATGGGGTGTT TGGGCAGCTG TTAAAAGTGA TAGCAGAATG GGTGCATCCC TTCTCCGTTT ATACTTTCAT GATTGCTTCG TAAATGGTTG TGATGGTTCT  GTGCTTCTTG ATGACACAGT AAACTTCAAG GGCGAGAAGA ATGCTTTTCC AAACCGCAAT TCAGCCAGAG GATATGAGGT GATTGATAGC ATAAAAGCCG ATGTTGAAAA AGCTTGCCCA  TCCGTAGTAT CATGTGTGGA CATCTTAGCT CTTGCAGCTA GAGAAGCAGT GATTATAGCA GGAGGGCCTT ATTATCCTGT TTATTTAGGC CGGCGAGATG GATTAACTGC AAGTGAGAAA  GCAGCAAATG AGCAACTACC ATCACCTATT GAGCCTTTGG ATAACATTAC TACCAAGTTT GTATCAAAAG GTCTTGACTT GAAGGATGTG GTAGTCCTCT CAGGAGCTCA TACCATTGGT  TTTGCTCAGT GTTTTACATT CAAGAGGAGA CTCTATAATT TCAAAGGATC AGGAAATCCA GACCCTACTC TTGATTCATC TCTAGTTTCG AACTTGCAAA GTACTTGTCC AAATGTAGAT  GGATCAAACA ACAAATTAGC TCCTCTTGAT GTTCAATCTA CTCTTATATT CGACAATGCA TATTATGTTA ACTTGATGAA CAATTCGGGC TTGCTTGAAT CTGATCAAGC ATTGATGGGG  GATCCAAGAA CAGCAGATTT GGTGAAGTCT TATAGTATGT ATCCATATCT GTATTTCAGA GATTTTGCAG CATCAATGGT GAAGCTTGGA AATGTTGGGA TTTTGACTGG TGATTCTGGC 
GAAATTCGCA AGAAATGTGG CTCTGTAAAC TCTTACTGA 

Retrieve as FASTA