Entry information : CroPrx13(CRO_T009970 / cra_locus_15613_iso_3_len_1155_ver_3)
Entry ID 11271
Creation 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx13(CRO_T009970 / cra_locus_15613_iso_3_len_1155_ver_3)
Name CroPrx13(CRO_T009970 / cra_locus_15613_iso_3_len_1155_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx13
start..stop
S start..stop
NtPrx31-1A 514 0 10..321 15..327
CclPrx59 499 7e-180 4..321 12..329
EgrPrx124 492 3e-177 5..321 7..325
CsPrx09 491 3e-177 12..321 1..310
Literature and cross-references CroPrx13(CRO_T009970 / cra_locus_15613_iso_3_len_1155_ver_3)
Protein sequence: CroPrx13(CRO_T009970 / cra_locus_15613_iso_3_len_1155_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (301)
PWM (Da):   %s   34962.13 (32625.2)  
PI (pH):   %s   6.49 (6.12) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-321
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGRSFSWFCC VLFFCSSVFC QLDYRFYDKT CPNLTKIVRY GVWSAIANDT RMAASLLRLH FHDCFVNGCD GSVLLDDSSS FRSEKNAGAN MNSARGFEVI DAIKANVEKA CPSLVSCADI  LALAARESVF LTGGSFWYLP LGRRDGLTAS QSAADLDLPA PFHSLENITA TFVSKGLDLK DVVVLSGAHT LGFAQCFTFK SRLFDFGGSG NPDPSLDSTL LTDLRSMCPN QADSDSKLAP 
LDASANKFDN VYFKNLLNNS GLLQSDQALM SDNRTAAMVL NYSKFPYFFS KDFGISMVKM ANIGVLTGND GEIRKNCRVV N 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTCGCA GTTTTTCTTG GTTTTGTTGT GTCTTGTTTT TTTGTTCTTC TGTATTTTGC CAACTGGATT ACAGATTTTA TGACAAAACT TGTCCTAACC TAACAAAGAT TGTACGATAT  GGAGTATGGT CTGCTATTGC AAATGATACT AGGATGGCCG CCTCTCTTCT TCGCCTTCAC TTCCATGATT GTTTCGTAAA TGTAATCTTA TATATATATA TATATATTCT CCCTCTTTTA  TTTATTTATT TTTATGATTT TAGACATTTC TTTTAAGTTC GTCCTTTTAA TTAATATTTT TTAAAAAAAT TCTTTATATA AATTGTCGCG GCCAACGTTG GAGGTTTGAT TATGTGCCAA  CACTAAGTTG GATGCTTAAT TAACATATAT AAGAGTAATT GATGAATGTG GTATTACAAT TATTTATTCC ATCCAAATTT GATTTTATAT CTTTTTAGTT CAACAATTAA TTTTTTTTTA  TAATTTTTTG GGTCGTCTCC TCTCACAAGG CGGAATACAA ATTTTTTTTC CCGTCCTCCG CCTTGTGGAT AGTGACAAAG ATAAAAAATA AAAATAGTGA TAAAAAAATT AATATTAAAC  TATTTCTTCC GTTCATCGAT TGATTGCGTG AGTACGTTAT ACTGACATAA AAGTTATTTT TGCGTAAAAG TACTTATAAC AAGAGGCAAA ACTATATCTT TTTTACGTTT TTCTAATTTT  ATCTTTTATT GAGCCAACTC AATATTAATC CCTCAAATAT TATTAATAAA AATAAATAGT TATTTAACTA AAATGACTAG AAAAGAATAT AAGACTAAGT TGAGACGGAT AAATAATTAT  GTGAATGAAT TTACGTAACA TTTATTTATT TTGGGTGTTT TAATTGAAGG GTTGTGATGG ATCAGTGTTA CTAGATGATA GCAGCTCATT CAGAAGTGAG AAGAATGCAG GGGCTAATAT  GAATTCCGCA AGGGGATTTG AAGTAATTGA TGCCATAAAA GCTAATGTAG AGAAAGCCTG CCCATCTCTT GTTTCTTGTG CTGATATTTT AGCTCTTGCT GCCAGAGAAT CTGTCTTTCT  TGTAAGAAAT CTTTCTTCTT AATTTCTCAT TAATTAATTA ATTTAATTTA ATTTATTTCA AATATTAATA ATTTTAATTC TTTGATAAAT ATTATTAGAC AGGAGGGTCT TTTTGGTATT  TGCCATTGGG TCGACGAGAT GGGCTCACGG CAAGCCAAAG CGCAGCTGAT TTGGACCTTC CGGCACCCTT TCATTCCCTG GAAAACATAA CTGCAACATT TGTGTCCAAG GGACTTGACT  TAAAAGACGT CGTCGTCCTA TCTGGTACCA ATTTTTTCCA CCCATTTTCA ACTTTTATTT TTTTCCCTCA AAATCCGTTT ATATAAATAT TACCTTCCTA ACCCGTCATT AATAAAAATT  ACCTATTCTA ACTTTTTTTA ATCTAATCGT AAAAACATCA CAATTTAAAA TGTTAAAAGG TAAAGCATTT TTTGTTTGTC AAAGGCTTCG ACTTTGCAAA CGTTAAAATT CTTTTGTCTT  CCAAACTCGG CATAAACAAT TTTTACTATT CAAAAATACT TTTAAATCTT GTGAAAGTTC TTTCAAATAT ATATTTTTTC TTATACAATT TGTCTAATAA GTTCTAAATA ATGCATTTAA  AATTCTATTA TAAAATTATG AAATGTCTCT TTTTCGTCTT ATTGATCCCC GAATTTCTTT TAAACCGCTA AAATGCGATC ATTTAAACAA AATATATTAT TTTTGGTTTA AGCATTTTTT  GTATTTATGT TTTTTCTTAA AGTGGCTATA AATTTTATTT ATTTTTCATA TGTACAAATA ATTTTATGAT TATTAATTTT AACAAATCAT TTGTTATATA ATAAAATTTG ACTAAAATAA  TTATTTTTAA ATTACTATAA CATATGCGTA ATTTAAACAG AATTAGTTTA GTTAGATTTC ATTATATAAA CACATAAATT ATCAAAATCA ATTACCTCAA ATTTATTCGT AAATAGAAAA  AAGGCCAAAT AAAAATTTAT GGAAAATTCT ATTGAAAGTT ATATTTTGGA GGGACATTTT TTTATATATA ATTTACTTTT TTTTTTTTTA ACCTATATCA AGAACAGAAA CAATATTAAG  AAATAATATT CATGTTTTAC ATTATGTAGG TGCACACACC CTTGGTTTTG CTCAATGCTT TACCTTCAAG TCTAGACTCT TTGATTTTGG CGGGTCGGGT AACCCGGATC CAAGTCTTGA  TTCAACCCTT CTAACTGATT TACGTAGTAT GTGCCCAAAT CAAGCGGATT CGGATTCCAA ATTGGCTCCA TTAGATGCCT CCGCCAATAA ATTTGACAAT GTTTACTTCA AAAATCTTCT  CAACAATTCC GGACTTCTTC AATCGGATCA AGCTCTTATG AGTGACAATA GAACTGCTGC TATGGTTTTG AATTACAGCA AGTTCCCTTA CTTTTTCAGT AAGGATTTTG GAATATCAAT 
GGTGAAGATG GCAAATATTG GTGTATTAAC TGGAAATGAT GGAGAGATTA GAAAGAATTG TAGAGTGGTC AATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTCGCA GTTTTTCTTG GTTTTGTTGT GTCTTGTTTT TTTGTTCTTC TGTATTTTGC CAACTGGATT ACAGATTTTA TGACAAAACT TGTCCTAACC TAACAAAGAT TGTACGATAT  GGAGTATGGT CTGCTATTGC AAATGATACT AGGATGGCCG CCTCTCTTCT TCGCCTTCAC TTCCATGATT GTTTCGTAAA TGGTTGTGAT GGATCAGTGT TACTAGATGA TAGCAGCTCA  TTCAGAAGTG AGAAGAATGC AGGGGCTAAT ATGAATTCCG CAAGGGGATT TGAAGTAATT GATGCCATAA AAGCTAATGT AGAGAAAGCC TGCCCATCTC TTGTTTCTTG TGCTGATATT  TTAGCTCTTG CTGCCAGAGA ATCTGTCTTT CTTACAGGAG GGTCTTTTTG GTATTTGCCA TTGGGTCGAC GAGATGGGCT CACGGCAAGC CAAAGCGCAG CTGATTTGGA CCTTCCGGCA  CCCTTTCATT CCCTGGAAAA CATAACTGCA ACATTTGTGT CCAAGGGACT TGACTTAAAA GACGTCGTCG TCCTATCTGG TGCACACACC CTTGGTTTTG CTCAATGCTT TACCTTCAAG  TCTAGACTCT TTGATTTTGG CGGGTCGGGT AACCCGGATC CAAGTCTTGA TTCAACCCTT CTAACTGATT TACGTAGTAT GTGCCCAAAT CAAGCGGATT CGGATTCCAA ATTGGCTCCA  TTAGATGCCT CCGCCAATAA ATTTGACAAT GTTTACTTCA AAAATCTTCT CAACAATTCC GGACTTCTTC AATCGGATCA AGCTCTTATG AGTGACAATA GAACTGCTGC TATGGTTTTG  AATTACAGCA AGTTCCCTTA CTTTTTCAGT AAGGATTTTG GAATATCAAT GGTGAAGATG GCAAATATTG GTGTATTAAC TGGAAATGAT GGAGAGATTA GAAAGAATTG TAGAGTGGTC 
AATTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCGTGATCTT AAAGATATAT AATTAATTAC ATATATATAA ATGGGTCGCA GTTTTTCTTG GTTTTGTTGT GTCTTGTTTT TTTGTTCTTC TGTATTTTGC  CAACTGGATT ACAGATTTTA TGACAAAACT TGTCCTAACC TAACAAAGAT TGTACGATAT GGAGTATGGT CTGCTATTGC AAATGATACT AGGATGGCCG CCTCTCTTCT TCGCCTTCAC  TTCCATGATT GTTTCGTAAA TGGTTGTGAT GGATCAGTGT TACTAGATGA TAGCAGCTCA TTCAGAAGTG AGAAGAATGC AGGGGCTAAT ATGAATTCCG CAAGGGGATT TGAAGTAATT  GATGCCATAA AAGCTAATGT AGAGAAAGCC TGCCCATCTC TTGTTTCTTG TGCTGATATT TTAGCTCTTG CTGCCAGAGA ATCTGTCTTT CTTACAGGAG GGTCTTTTTG GTATTTGCCA  TTGGGTCGAC GAGATGGGCT CACGGCAAGC CAAAGCGCAG CTGATTTGGA CCTTCCGGCA CCCTTTCATT CCCTGGAAAA CATAACTGCA ACATTTGTGT CCAAGGGACT TGACTTAAAA  GACGTCGTCG TCCTATCTGG TGCACACACC CTTGGTTTTG CTCAATGCTT TACCTTCAAG TCTAGACTCT TTGATTTTGG CGGGTCGGGT AACCCGGATC CAAGTCTTGA TTCAACCCTT  CTAACTGATT TACGTAGTAT GTGCCCAAAT CAAGCGGATT CGGATTCCAA ATTGGCTCCA TTAGATGCCT CCGCCAATAA ATTTGACAAT GTTTACTTCA AAAATCTTCT CAACAATTCC  GGACTTCTTC AATCGGATCA AGCTCTTATG AGTGACAATA GAACTGCTGC TATGGTTTTG AATTACAGCA AGTTCCCTTA CTTTTTCAGT AAGGATTTTG GAATATCAAT GGTGAAGATG  GCAAATATTG GTGTATTAAC TGGAAATGAT GGAGAGATTA GAAAGAATTG TAGAGTGGTC AATTAGAGAT TCTCCTTCTT AATTAATTGT ATTGTATGGA CAAAATCTCA GTTTTATGTT 
TTTCAAATGA AGAAGCTTCT GTAACATATA AGGCTCTGTT TTTTATTACT TTGGCTCCTT CTAAGTAATC GGAA 

Retrieve as FASTA