Entry information : CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Entry ID 11276
Creation 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Name CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx024]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx18
start..stop
S start..stop
MguPrx88 565 0 1..324 17..341
SaPrx46 551 0 7..324 24..340
EglPrx60 531 0 14..324 30..339
EgrPrx60 531 0 14..324 30..339
Literature and cross-references CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Protein sequence: CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (310)
PWM (Da):   %s   35705.96 (34306.2)  
PI (pH):   %s   4.82 (4.82) Peptide Signal:   %s   cut: 15 range:15-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
VILVLCIFNG SLGAFDPPLT LDYYKDTCPT VLEIVRKEME CAVLSDPRNA ALILRLHFHD CFVQGCDGSV LLDDTITLQG EKKAPNNVNA LKGFRMMDRI KNRLESECPG TVSCADILTI  AARDAVLLVG GPYWDVPLGR KDSKTAGYEL STTNLPTADE SLVSIISKFL FQGLSVTDMV ALSGAHTIGM ARCVNFRNRI YGDFSITSAM NPISQTYLDN LKGICPPAVG EDNKESAMDY 
VTPNLFDNSY YQILLRGEGL INSDQELYSS VLAIQTRQLV KKYAENPIAF FEQFSESMVK LGNITNPETY VNGEVRKNCR FVNT 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from EST and genomic . Short PS is missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGATTTTGG TTTTGTGCAT TTTTAATGGG AGTTTGGGGG CTTTTGATCC ACCTTTAACG TTGGATTACT ACAAAGATAC GTGCCCAACT GTGCTTGAAA TTGTTAGAAA GGAAATGGAA  TGTGCTGTTC TATCTGATCC TCGTAATGCA GCCTTGATTT TAAGGTTGCA TTTTCATGAC TGCTTTGTTC AGGTTAGCAC AGCTACATGA TTTTTGCTTC TCCTGTTGTA TATGATAGTG  TGTGGTCAAA TGAATCTCGT CACTTAACTT AAGTACTTCC ACCTGTCATA TCAAGTGAGA GATTCTAGAC ATTCAATGTG TAGTTTAATA CTGTATACCA GTCTTGTATC CCTATTTAAG  ACTTTGTGCA CTATGATCCT TCTCGGGTTA GCTGATGATT CTCGAATACC GAATTATCTA AAAAATGTTG AAATATTAGT CTCAGGTTGT CTAGCTTGTG CGCTTTTGGA CAATCCTCTC  CTAAGGTGTT TTTTAAATAG AGTTAAACAC AAATTTAATT TTATAACACG GTATCAGAGT CGGATATTAT GAGGAACCAT TACCTCGTTT AAAATTATAC TCATTCCGTA TTAAAATTAA  TGTATTTAAT TATTTTGATT CCGAAATCAA TTAAAACTAA GTTATCAAAT ACAAAAAATA ATAATCTAAT GTTATTTTCA TAAAGTTAAA TGACAAATCA AATTTTTCTG TATTTAAATT  AAGGTTATTT TTTTGTTGTT TGGCTCTATG AATGTATTAA AATTAAGTTA TCAAGTATGT AACTACTAAA AATTCAATTT ATTTTGCGAG AGTTAAATAA TATATTAAAT TTTTATATTT  AAGTTTTGAC TATGTAACAT AAACATTCAA CTTTCGTCTT TCTAATTCAT TATTATGTCC AATTCTGAAC TTGGAGGTGA GTCTGTCGAG AATTATTTTA TATGACTAAT TATAATTTGT  GAGAAAATTT ACTCTTTATA ACTACCACTA AGACGTTGGT TGAGAAAGAT TGAAATTGTT AAAATGTTCA TCTTTTATGA TTATGAATGC ATAAATACAT ATATATATAT ATATATATGT  ATGTATAGGG ATGTGATGGA TCAGTGCTGT TGGATGATAC AATCACATTG CAAGGAGAAA AGAAAGCACC CAACAACGTT AATGCACTCA AAGGATTTAG GATGATGGAC AGGATCAAGA  ATAGGCTCGA ATCTGAATGT CCTGGAACTG TTTCTTGTGC TGATATTCTC ACCATTGCCG CTAGAGATGC TGTTCTTCTG GTATTAAACT CAATTTGAAA AAAAAAAAAA AAAAAACTCA  TAACACAATT TTTAGTTTTT GTACAATTTC TATTTTGTTT ATTGATGAGT TTTTTTTGTG TTTTGGTTTT TTGTTGAGGT TGGTGGGCCT TATTGGGATG TTCCTTTGGG CAGAAAAGAC  TCAAAAACAG CAGGTTATGA ACTCTCAACA ACAAATCTTC CAACTGCTGA TGAAAGCCTT GTCTCCATCA TTTCCAAGTT CCTTTTTCAG GGGCTCTCAG TTACTGACAT GGTAGCTCTT  TCTGGTAAGC ATGCAAACAA ATAAATATAA AATTTATAAA GATTTTTTAC AAATATTAAA GAACGACACT ATCTTCACTT TGCCGCTTGT CCCTTTCATT CCATCCTTGA TTTTCATGCA  AGCTATATTT CTACTTTAGT AAAATTATAA CAACAGAGGT GATATAAAAC TTGACCTTTC ATCCTCAGGT TTCTGATTAT GCCATTGACT GCAGGTGCCC ACACAATTGG CATGGCAAGG  TGTGTAAACT TCAGGAACAG AATCTATGGA GACTTTTCAA TAACTTCAGC AATGAATCCA ATTTCTCAAA CATATTTGGA CAATTTGAAA GGTATATGCC CTCCTGCTGT TGGAGAAGAC  AACAAAGAAT CAGCAATGGA TTATGTAACA CCAAATTTAT TTGATAATTC TTATTACCAA ATACTATTGA GAGGAGAAGG ACTCATCAAT TCAGATCAAG AATTATATTC AAGTGTTCTT  GCAATTCAAA CAAGACAACT TGTCAAGAAA TATGCTGAAA ATCCAATTGC TTTCTTTGAG CAATTCTCAG AATCAATGGT GAAATTGGGG AACATTACAA ATCCAGAAAC TTATGTCAAT 
GGAGAAGTCA GGAAGAATTG CAGATTTGTG AATACATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGATTTTGG TTTTGTGCAT TTTTAATGGG AGTTTGGGGG CTTTTGATCC ACCTTTAACG TTGGATTACT ACAAAGATAC GTGCCCAACT GTGCTTGAAA TTGTTAGAAA GGAAATGGAA  TGTGCTGTTC TATCTGATCC TCGTAATGCA GCCTTGATTT TAAGGTTGCA TTTTCATGAC TGCTTTGTTC AGGGATGTGA TGGATCAGTG CTGTTGGATG ATACAATCAC ATTGCAAGGA  GAAAAGAAAG CACCCAACAA CGTTAATGCA CTCAAAGGAT TTAGGATGAT GGACAGGATC AAGAATAGGC TCGAATCTGA ATGTCCTGGA ACTGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCACCATT  GCCGCTAGAG ATGCTGTTCT TCTGGTTGGT GGGCCTTATT GGGATGTTCC TTTGGGCAGA AAAGACTCAA AAACAGCAGG TTATGAACTC TCAACAACAA ATCTTCCAAC TGCTGATGAA  AGCCTTGTCT CCATCATTTC CAAGTTCCTT TTTCAGGGGC TCTCAGTTAC TGACATGGTA GCTCTTTCTG GTGCCCACAC AATTGGCATG GCAAGGTGTG TAAACTTCAG GAACAGAATC  TATGGAGACT TTTCAATAAC TTCAGCAATG AATCCAATTT CTCAAACATA TTTGGACAAT TTGAAAGGTA TATGCCCTCC TGCTGTTGGA GAAGACAACA AAGAATCAGC AATGGATTAT  GTAACACCAA ATTTATTTGA TAATTCTTAT TACCAAATAC TATTGAGAGG AGAAGGACTC ATCAATTCAG ATCAAGAATT ATATTCAAGT GTTCTTGCAA TTCAAACAAG ACAACTTGTC  AAGAAATATG CTGAAAATCC AATTGCTTTC TTTGAGCAAT TCTCAGAATC AATGGTGAAA TTGGGGAACA TTACAAATCC AGAAACTTAT GTCAATGGAG AAGTCAGGAA GAATTGCAGA 
TTTGTGAATA CATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGATTTTGG TTTTGTGCAT TTTTAATGGG AGTTTGGGGG CTTTTGATCC ACCTTTAACG TTGGATTACT ACAAAGATAC GTGCCCAACT GTGCTTGAAA TTGTTAGAAA GGAAATGGAA  TGTGCTGTTC TATCTGATCC TCGTAATGCA GCCTTGATTT TAAGGTTGCA TTTTCATGAC TGCTTTGTTC AGGGATGTGA TGGATCAGTG CTGTTGGATG ATACAATCAC ATTGCAAGGA  GAAAAGAAAG CACCCAACAA CGTTAATGCA CTCAAAGGAT TTAGGATGAT GGACAGGATC AAGAATAGGC TCGAATCTGA ATGTCCTGGA ACTGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCACCATT  GCCGCTAGAG ATGCTGTTCT TCTGGTTGGT GGGCCTTATT GGGATGTTCC TTTGGGCAGA AAAGACTCAA AAACAGCAGG TTATGAACTC TCAACAACAA ATCTTCCAAC TGCTGATGAA  AGCCTTGTCT CCATCATTTC CAAGTTCCTT TTTCAGGGGC TCTCAGTTAC TGACATGGTA GCTCTTTCTG GTGCCCACAC AATTGGCATG GCAAGGTGTG TAAACTTCAG GAACAGAATC  TATGGAGACT TTTCAATAAC TTCAGCAATG AATCCAATTT CTCAAACATA TTTGGACAAT TTGAAAGGTA TATGCCCTCC TGCTGTTGGA GAAGACAACA AAGAATCAGC AATGGATTAT  GTAACACCAA ATTTATTTGA TAATTCTTAT TACCAAATAC TATTGAGAGG AGAAGGACTC ATCAATTCAG ATCAAGAATT ATATTCAAGT GTTCTTGCAA TTCAAACAAG ACAACTTGTC  AAGAAATATG CTGAAAATCC AATTGCTTTC TTTGAGCAAT TCTCAGAATC AATGGTGAAA TTGGGGAACA TTACAAATCC AGAAACTTAT GTCAATGGAG AAGTCAGGAA GAATTGCAGA 
TTTGTGAATA CATAAAAAAG CTTTATTAAT TATATGAAAG TTGTT 

Retrieve as FASTA