Entry information : CroPrx19(CRO_T022747 / cra_locus_10814_iso_2_len_1020_ver_3)
Entry ID 11277
Creation 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx19(CRO_T022747 / cra_locus_10814_iso_2_len_1020_ver_3)
Name CroPrx19(CRO_T022747 / cra_locus_10814_iso_2_len_1020_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx19
start..stop
S start..stop
IbPrx15 523 0 18..329 16..327
IbPrx05 518 0 1..329 1..327
CcampPrx70 510 0 7..329 26..342
PpePrx07 506 0 9..329 15..331
Literature and cross-references CroPrx19(CRO_T022747 / cra_locus_10814_iso_2_len_1020_ver_3)
Protein sequence: CroPrx19(CRO_T022747 / cra_locus_10814_iso_2_len_1020_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   35251.42  
PI (pH):   %s   5.99
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPHFPSFIVT FILSLSTLLP HNTNGQLNST FYSNTCPNVS AIVKNVMQQA LQSDPRVGAS LIRLHFHDCF VQGCDGSILL DNNGTTIVSE KDAGPNTNST RGFDVVDNIK IALENACPGV  VSCADILALA SQEAVSLAGG PSWNVLLGRR DSRTANRAGA NTSIPTPFEG LSNITSKFSA VGLNINDLVA LSGAHTFGRA QCRLISSRLY NFNNTGNPDP LLNTTYLATL QQACPQNGTG 
FNVVNLDLTT PNAFDNNYFS NLQNNEGLLQ SDQELFSTQG AATLSIVNNF SSNQTAFFQS FVQSMINMGN ISPLVGTNGE IRSNCRRPN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Short PS is missing. Incorrect annotation from MPGR.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCATT TTCCTTCTTT TATTGTAACA TTTATTCTTT CTCTATCAAC TCTTCTACCA CATAACACAA ATGGTCAGCT GAATTCTACC TTTTACTCCA ATACATGTCC AAATGTTTCC  GCCATTGTTA AAAATGTAAT GCAGCAAGCT TTACAATCTG ATCCCCGAGT TGGCGCCAGC CTTATTCGAC TTCATTTTCA CGATTGCTTT GTCCAGGTGA AACTCTTTAC CCTCCTGAAG  GGGATGTAGA GTTAAAAGAG AATCTCATGA TATATTGGAT ATCTCTAATA GAATTAGCAC ATTGTTATAG TTTCAATGGA TTATTAACAT GTCACAATTT GGTTATGAAC AGGGATGTGA  TGGATCAATA TTGTTAGATA ACAATGGAAC AACAATAGTG AGTGAAAAAG ATGCAGGGCC AAATACCAAT TCCACAAGAG GTTTTGATGT TGTGGACAAT ATAAAGATTG CTCTTGAAAA  TGCTTGCCCT GGTGTTGTCT CATGTGCAGA CATTCTGGCA CTTGCTTCCC AAGAAGCTGT GTCTCTGGTA TTACCTTCAA CCAACCTGAT AATACTAAAC TTTTTCCTTA CAGTTTTAAG  TCTTTCAATG ATGAACACTG GGCGTTCGTA TACCTGCATG ACTAGACCAG TCTTGCACAT ATAGTTTCTA GAAAAAAAGA AAAAAAAAAA AAACTTTTGA TGCTTAAGCC AATAGTATTC  TTTAAGAAGT AAATAAGCAT ATTTAAGTAT ATTATCCTAT TAGTTGTAAA AAGAATATAC CTCTTTATAT GTATTTCTAA CTCTTCTAAC TTACTCAACC TATAATGTGA AAATCTTATA  TGTATTTCTA ACTCTTCTAA CTTGCTCAAC CTATAATGTG AAAATCTTAG CATTCTGACC TACCAGACTG ACTGATCCCA TCCACTTTCC TTGGATAGGC TCTTGACACA GCCTAGTGTT  ATGTTTTAGA TTTGGACTTG TATTTTCTCA TTTGTAAGGT GGCCCGAGCA GACAGGCTAA GTCCCATCAT CAAGTTTTTC AAACTCTTCG TCTACTCAAT TTTCAGATGA TCATGTACTA  ATATCTAGTT AACGATATAG AAACATACCT GGATTGATGA ACTTCATCTC AAAGTGTTCA TTTGGCCTCT GTAGGCAGGT GGTCCTTCAT GGAATGTACT ACTGGGGAGA AGGGACAGCA  GAACGGCTAA CCGGGCAGGG GCAAATACGT CCATTCCTAC TCCCTTTGAA GGCTTGAGCA ATATCACCTC CAAGTTTTCT GCTGTTGGAC TAAACATAAA TGATTTAGTA GCATTATCTG  GTATTACATG TTTTGATTTA CTACTATATA AATCTCAGTA GAGTTTAGAC TAGAAAATGT AGTTCATTTG CTATTGTTTT CGTCCGACCT AAAATAAATA AACAAGATGG CTAACAAAGA  GAAGACATAA ATTTGTATAG TTCGGTCAAT TAACCTACAT TCACATATGA AGGAGAAACA AAACCACATA GTTTATAAAG CACCTACAAC TATCTTGGAA AAATCTAACA AGAATGACTT  ATGCCCTTAA CTACGGAATT AGCACATAAC TAGAAAAATG TCTTAAATTC TACATGTTTC TGGCCTCTAA AAGCTCATAC GCAAAGGTTT TATAAGCAAT CCTGTTTCCT ACCTTTCGCT  TTTTGTCAAT TGTGTCTCAA TTCTAAAAGT CATAACATAA GAGCTTATTT AGCAACACGT AGTACCTATA ATTGGGGACT TAACTTTAAC TAGACAAATA TCTCAAATCT TACATATTTC  TCGCTTCTAA AAGTTCAAAC ACAAGAGTCT AATATAGCTT GTACAAGAAT AATTTCCCTA ACATAACAAT GTGAGACTTA AATATTTTCG TTTTTAGAAG AAGTTTAATC ATAATCAAAC  TGAGATTAGA AATACAAGAC AAAATCCTAA GAGTTTTCTT CTATCTTTAT TGCAGGGGCT CACACATTTG GAAGGGCACA ATGTCGATTA ATAAGCAGCC GCCTTTACAA TTTTAACAAC  ACTGGAAATC CAGATCCCTT GTTGAACACA ACATACTTAG CTACACTACA ACAAGCATGT CCACAGAATG GAACTGGATT CAATGTGGTC AATCTTGATC TCACCACACC TAATGCATTT  GACAATAACT ATTTTTCCAA CCTTCAGAAC AATGAAGGCC TTCTTCAATC AGATCAAGAA CTGTTTTCCA CTCAAGGTGC TGCTACTCTA TCCATTGTGA ATAACTTTAG TAGCAACCAA  ACTGCTTTTT TCCAAAGCTT TGTACAGTCA ATGATAAATA TGGGAAATAT TAGTCCTTTA GTAGGTACTA ATGGAGAGAT CAGATCAAAT TGCAGAAGGC CTAACTGATG TGAGAAGCTG 
CTGTTATTGT AAGATTAATT TTTTCAGTAT TACAAACATT ATCTTTGTAT TTAAGTATGG CTTTAATAAA ATCGGAGATG ACTTTAGTCC GGATTCTCTT AAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCATT TTCCTTCTTT TATTGTAACA TTTATTCTTT CTCTATCAAC TCTTCTACCA CATAACACAA ATGGTCAGCT GAATTCTACC TTTTACTCCA ATACATGTCC AAATGTTTCC  GCCATTGTTA AAAATGTAAT GCAGCAAGCT TTACAATCTG ATCCCCGAGT TGGCGCCAGC CTTATTCGAC TTCATTTTCA CGATTGCTTT GTCCAGGGAT GTGATGGATC AATATTGTTA  GATAACAATG GAACAACAAT AGTGAGTGAA AAAGATGCAG GGCCAAATAC CAATTCCACA AGAGGTTTTG ATGTTGTGGA CAATATAAAG ATTGCTCTTG AAAATGCTTG CCCTGGTGTT  GTCTCATGTG CAGACATTCT GGCACTTGCT TCCCAAGAAG CTGTGTCTCT GGCAGGTGGT CCTTCATGGA ATGTACTACT GGGGAGAAGG GACAGCAGAA CGGCTAACCG GGCAGGGGCA  AATACGTCCA TTCCTACTCC CTTTGAAGGC TTGAGCAATA TCACCTCCAA GTTTTCTGCT GTTGGACTAA ACATAAATGA TTTAGTAGCA TTATCTGGGG CTCACACATT TGGAAGGGCA  CAATGTCGAT TAATAAGCAG CCGCCTTTAC AATTTTAACA ACACTGGAAA TCCAGATCCC TTGTTGAACA CAACATACTT AGCTACACTA CAACAAGCAT GTCCACAGAA TGGAACTGGA  TTCAATGTGG TCAATCTTGA TCTCACCACA CCTAATGCAT TTGACAATAA CTATTTTTCC AACCTTCAGA ACAATGAAGG CCTTCTTCAA TCAGATCAAG AACTGTTTTC CACTCAAGGT  GCTGCTACTC TATCCATTGT GAATAACTTT AGTAGCAACC AAACTGCTTT TTTCCAAAGC TTTGTACAGT CAATGATAAA TATGGGAAAT ATTAGTCCTT TAGTAGGTAC TAATGGAGAG 
ATCAGATCAA ATTGCAGAAG GCCTAACTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCATT TTCCTTCTTT TATTGTAACA TTTATTCTTT CTCTATCAAC TCTTCTACCA CATAACACAA ATGGTCAGCT GAATTCTACC TTTTACTCCA ATACATGTCC AAATGTTTCC  GCCATTGTTA AAAATGTAAT GCAGCAAGCT TTACAATCTG ATCCCCGAGT TGGCGCCAGC CTTATTCGAC TTCATTTTCA CGATTGCTTT GTCCAGGGAT GTGATGGATC AATATTGTTA  GATAACAATG GAACAACAAT AGTGAGTGAA AAAGATGCAG GGCCAAATAC CAATTCCACA AGAGGTTTTG ATGTTGTGGA CAATATAAAG ATTGCTCTTG AAAATGCTTG CCCTGGTGTT  GTCTCATGTG CAGACATTCT GGCACTTGCT TCCCAAGAAG CTGTGTCTCT GGCAGGTGGT CCTTCATGGA ATGTACTACT GGGGAGAAGG GACAGCAGAA CGGCTAACCG GGCAGGGGCA  AATACGTCCA TTCCTACTCC CTTTGAAGGC TTGAGCAATA TCACCTCCAA GTTTTCTGCT GTTGGACTAA ACATAAATGA TTTAGTAGCA TTATCTGGGG CTCACACATT TGGAAGGGCA  CAATGTCGAT TAATAAGCAG CCGCCTTTAC AATTTTAACA ACACTGGAAA TCCAGATCCC TTGTTGAACA CAACATACTT AGCTACACTA CAACAAGCAT GTCCACAGAA TGGAACTGGA  TTCAATGTGG TCAATCTTGA TCTCACCACA CCTAATGCAT TTGACAATAA CTATTTTTCC AACCTTCAGA ACAATGAAGG CCTTCTTCAA TCAGATCAAG AACTGTTTTC CACTCAAGGT  GCTGCTACTC TATCCATTGT GAATAACTTT AGTAGCAACC AAACTGCTTT TTTCCAAAGC TTTGTACAGT CAATGATAAA TATGGGAAAT ATTAGTCCTT TAGTAGGTAC TAATGGAGAG  ATCAGATCAA ATTGCAGAAG GCCTAACTGA TGTGAGAAGC TGCTGTTATT GTAAGATTAA TTTTTTCAGT ATTACAAACA TTATCTTTGT ATTTAAGTAT GGCTTTAATA AAATCGGAGA 
TGACTTTAGT CCGGATTCTC TTAAAA 

Retrieve as FASTA