Entry information : CroPrx20(CRO_T006302 / cra_locus_6131_iso_4_len_2454_ver_3)
Entry ID 11278
Creation 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-05 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx20(CRO_T006302 / cra_locus_6131_iso_4_len_2454_ver_3)
Name CroPrx20(CRO_T006302 / cra_locus_6131_iso_4_len_2454_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx20
start..stop
S start..stop
LePrx58 419 1e-147 16..347 19..345
StPrx300 416 2e-146 16..347 19..345
MguPrx89 410 4e-144 3..340 1..338
MguPrx300 410 4e-144 3..340 1..338
Literature and cross-references CroPrx20(CRO_T006302 / cra_locus_6131_iso_4_len_2454_ver_3)
Protein sequence: CroPrx20(CRO_T006302 / cra_locus_6131_iso_4_len_2454_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347 (328)
PWM (Da):   %s   38670.78 (36649.7) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.97 (8.97) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-347
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAMEKSGIVL FSILVLAMSL QIVHLRAAVT LPPEDLPGLT RKFYKKLNTC ENVEAFVKHQ VNLFWNQEKN LTAKLLKLLY ADCMVNGCDG SILLEDPNAE KHAPQNSGLG ERVFVIIDKI  KTVLESRCPA AVSCSDIIML AARDAAHLAG APSYPVFLGR RDGVESNAAW IDYPSPSSSF EAGVSYFNSK GLDQQDYVTL LGAHTMGRTH CKFIRDRLYN FQNTGKADPS MDKSLLKTLR 
QQCPLNLYTG QEDPSVYLNP KNVPPQYKFT NSYYSNVLSH QSVLGVDQQL LKGNYTLVDE YGNYLEQFRR MFALSINRMG GLKVLTGKKG EIRRNCRLAN KNNPSIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from EST and genomic (3 independent scaffold and one partial prediction (exons 2 and 3)).
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATGG AGAAAAGTGG GATTGTTCTC TTCTCCATTT TGGTTCTTGC AATGAGCTTG CAGATCGTTC ATCTCCGGGC GGCGGTGACG CTGCCACCAG AGGACCTCCC GGGCTTAACA  AGGAAGTTTT ACAAGAAGTT AAATACTTGT GAAAATGTGG AGGCATTTGT AAAGCATCAA GTGAATTTGT TTTGGAATCA AGAGAAGAAT CTCACTGCTA AACTCCTCAA GTTGCTCTAT  GCAGATTGCA TGGTCAATGG GTGCGATGGA TCAATTCTGT TGGAGGATCC AAATGCAGAA AAACATGCAC CACAAAATTC AGGCCTTGGA GAAAGAGTAT TTGTAATCAT TGACAAAATT  AAGACTGTGC TTGAAAGTAG ATGTCCTGCT GCTGTCTCTT GTTCTGACAT TATTATGCTT GCTGCTAGAG ATGCTGCTCA TCTGGCTGGT GCACCGTCAT ATCCAGTGTT CTTAGGGAGA  AGAGATGGAG TTGAATCAAA TGCAGCATGG ATTGATTATC CCTCACCATC ATCATCCTTT GAAGCAGGAG TCTCTTACTT CAATTCTAAA GGCTTAGATC AACAGGATTA TGTTACTCTC  TTAGGAGCAC ATACAATGGG AAGAACTCAT TGCAAATTCA TTCGTGATCG ACTCTACAAT TTTCAGAACA CAGGAAAAGC AGATCCCAGC ATGGATAAAT CTTTGTTAAA AACACTAAGA  CAGCAATGTC CACTCAATTT ATACACAGGC CAAGAAGATC CATCGGTCTA TTTAAACCCC AAAAATGTCC CCCCTCAGTA CAAGTTCACC AATTCCTACT ACTCCAATGT GCTATCACAT  CAATCTGTTC TTGGTGTTGA TCAGCAGCTA TTAAAGGGTA ATTACACATT GGTTGATGAG TATGGCAATT ACTTGGAACA GTTTCGCAGG ATGTTTGCTC TATCAATAAA CAGGATGGGA 
GGTCTTAAAG TATTGACTGG AAAGAAGGGG GAAATTCGTC GGAATTGCCG TTTGGCCAAT AAGAACAATC CCAGCATCAA TTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGCCGGGGG AAGGACATCT ACAAGCTCAT ATATTGTTCA AATTGAGAGA TTCATTCATT AATTATATCA AACACTTAAA ATTAGATATA TGGCGATGGA GAAAAGTGGG ATTGTTCTCT  TCTCCATTTT GGTTCTTGCA ATGAGCTTGC AGATCGTTCA TCTCCGGGCG GCGGTGACGC TGCCACCAGA GGACCTCCCG GGCTTAACAA GGAAGTTTTA CAAGAAGTTA AATACTTGTG  AAAATGTGGA GGCATTTGTA AAGCATCAAG TGAATTTGTT TTGGAATCAA GAGAAGAATC TCACTGCTAA ACTCCTCAAG TTGCTCTATG CAGATTGCAT GGTCAATGGG TGCGATGGAT  CAATTCTGTT GGAGGATCCA AATGCAGAAA AACATGCACC ACAAAATTCA GGCCTTGGAG AAAGAGTATT TGTAATCATT GACAAAATTA AGACTGTGCT TGAAAGTAGA TGTCCTGCTG  CTGTCTCTTG TTCTGACATT ATTATGCTTG CTGCTAGAGA TGCTGCTCAT CTGGCTGGTG CACCGTCATA TCCAGTGTTC TTAGGGAGAA GAGATGGAGT TGAATCAAAT GCAGCATGGA  TTGATTATCC CTCACCATCA TCATCCTTTG AAGCAGGAGT CTCTTACTTC AATTCTAAAG GCTTAGATCA ACAGGATTAT GTTACTCTCT TAGGAGCACA TACAATGGGA AGAACTCATT  GCAAATTCAT TCGTGATCGA CTCTACAATT TTCAGAACAC AGGAAAAGCA GATCCCAGCA TGGATAAATC TTTGTTAAAA ACACTAAGAC AGCAATGTCC ACTCAATTTA TACACAGGCC  AAGAAGATCC ATCGGTCTAT TTAAACCCCA AAAATGTCCC CCCTCAGTAC AAGTTCACCA ATTCCTACTA CTCCAATGTG CTATCACATC AATCTGTTCT TGGTGTTGAT CAGCAGCTAT  TAAAGGGTAA TTACACATTG GTTGATGAGT ATGGCAATTA CTTGGAACAG TTTCGCAGGA TGTTTGCTCT ATCAATAAAC AGGATGGGAG GTCTTAAAGT ATTGACTGGA AAGAAGGGGG  AAATTCGTCG GAATTGCCGT TTGGCCAATA AGAACAATCC CAGCATCAAT TAGGCCATAC TCATCATCAT TCAACTGATA AAAATAAAAG ATTAATGTGG TTCAAAGTTT GCATACTGCA  CTGGCTATAT AGTAAGGAGA TTAAATGTTG TCATTTTTGT ATCAAGTACT TTACATAAGG TGAACAACAA TGATTAATTA ATAAGAGATA ATTGATTTAG CAAATATTCC TTGTGATTTA  TATCTCAGTA AGTCATTAGC AAGGGAGGAA GACTCTATGA TTAAATTTGA CGACTTCAAA TAATCCCTTC CCTGAGATAA CAAGTATATA TCTGATCGAT AAATTTTCTC GATATAAAAT  TAAGACTCTC CACATAAGGG GTAATCAATA TGGATTTCCT TCGGCCTAAC CTGCAAGAAG TGCCCATGAA CAGCCCGGAG TTGAGCTTTC TGCTCCTTTG AACAGATTGG ACCAATTCTA  GGAATAAGGT AGGCAGATTA GTCTTCAAAT TCCACAAGCA CTTTCGTCAA AACTTCCTCA ACAGATAGAA ATGTCTGTAA AAGCAGCTGC CAAATCTACA AACTGAGAAA TAGTTCCTAA  TGCATGCTCA TCAATCTATC TCATAAGAGA AAAAATCTAC TCCTGAATCC GAACTGCTGG GCTCCTACTC TTGACAATCT TATAGAAGTA TTTCTTCCGC AGTTTGATAG CTGTGCGTAT  GCATCTCCTC ACTCTTATCT TTAACATGTT ATCATTAAAT ATCTTTATCA GATCATCTAT TGAACGCGTT TCTTTAATAA TTTTCTGACG ATTCATGATT AGAACTGCTG CAACACAAAA  CACAGGTAGT TCATCGTCAC CATTTCCAGT TGTTGATATT GCACTGCCAA TGTGCAAATG ATCATTTTTT GACCAAAAAC TCTTCGCCAA CCCACAAAAT GGATGAGCTG ATTCTGATTT  CATTAGAGTG TTGTCAGAGA CAGAGTGAAC CAGGTTTCCC TTCCTGGAGA AAGAACCACT CTTCGAATCA TTATCATTGT TCTCAACAGT TTCCTGTTCA ATTTCCGCTC CAGAGTCTCT  TGGAATCTGT ATGGCTAACA GATCCGGGCA GTTCGCCTCC AGATGAGAAG CCAGACTTTC ATCAAAATCA GCAGCCCACA TCATCTTCAA TATCAACAAA CAAGTGAACC AAATATTCAT  GTTACAGAAA GTTTGTAGAT GAAAGAATCT CTTGCTCGTG TGAATTAAAA AAAACACTGA GCTAAAGGGG GAAATAAATG ATAAAAACTG AAGGCAATCT ATAGTGTATA TTTATACATT 
TTAATCACAA GTTCTGAAAG ATTTCAGAAC TGAATGAGGA TTATTATTCG TTAA 

Retrieve as FASTA