Entry information : CroPrx22(CRO_T010160 / cra_locus_3548_iso_4_len_1433_ver_3)
Entry ID 11280
Creation 2012-08-21 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx22(CRO_T010160 / cra_locus_3548_iso_4_len_1433_ver_3)
Name CroPrx22(CRO_T010160 / cra_locus_3548_iso_4_len_1433_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx22
start..stop
S start..stop
MguPrx86 489 7e-176 11..333 4..327
CsPrx50 473 2e-169 15..333 11..328
CclPrx31 473 2e-169 15..333 11..328
NtPrx30-1A 463 2e-165 14..334 9..331
Literature and cross-references CroPrx22(CRO_T010160 / cra_locus_3548_iso_4_len_1433_ver_3)
Protein sequence: CroPrx22(CRO_T010160 / cra_locus_3548_iso_4_len_1433_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334 (307)
PWM (Da):   %s   36230 (32950.6)  
PI (pH):   %s   7.19 (6.73) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-334
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMRSSSMGTF AYNYYWFFFT LLMMCLGGRC QLSTDFYSTT CPNLFRVVRR EVQNAIKVEM RMAASLLRLH FHDCFVNGCD ASVLLDGSEG EKFALANLNS ARGFEVIDAI KNSVENACPA  IVSCADILTI AARDSVVLSG GPSWKVLLGR RDGLVANQEG ANALPSPFDS LTTIIAKFMA LGLNLTDVVS LSGAHTIGST RCALFSGRLY NFSGSGSPDT TMDAALVTQL RKVCPLTGSD 
GNNTVPLDIN SRDLFDNRYF QNLLTGRGIL QSDQILYSSD EAISTTRSIV QSYSTNPMLF FGDFVNSMIK MGNIGILTGS DGQIRKNCRL VNSN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Incorrect prediction from MPGR (large PS is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGAA GTTCATCAAT GGGTACTTTT GCTTATAATT ATTATTGGTT TTTCTTTACT TTGTTAATGA TGTGTTTAGG TGGAAGATGT CAACTAAGCA CAGATTTCTA TTCAACAACA  TGCCCAAATC TTTTCAGAGT TGTAAGAAGA GAGGTTCAAA ATGCCATCAA AGTTGAAATG AGAATGGCTG CTTCTTTGCT TAGGCTTCAT TTCCATGATT GTTTTGTTAA TGTAAGTATA  TATGATTTTA AATTCCTTTT TCACCTTTTC TTTTCTTTCT TTATTTTTAT CTTTTTTATG AATAAAGAGG TTATCTATTT ATATGAAATT GGCCGAAGTC ATTACAATCA AAGTGACCTC  AAACTTTTTT TATACTAAGG AAAAAAGTTG TGAAACTGAG ATAACCCAAG AACTACAAAA CAAGAAAATA AACATGTTAC ATAAGGTAAC AAATCAAATC TAGACCGTAG GCGGATAGAA  AATACTAATA CTAGTAAAAT AAACAAATAT ACAATAATCT TTTCTGTAGT ATCTTTCTGG CAATCTTCAA ACCATATTAA CACAATAAAC TCAATTTTTT TGTTTTTCTG AGAAGTCAGC  ATTAAAAATA ATGGGAGAAT CAACTATTTT GAAAAATATT TCTAGATAAC ATAGAAACTG GAGGAGGGGC CCAAATCAAG TCCAGGTGAA TAACAAACTC CGAGAATGAG TGAAAGGAGC  CCCGATCTGA AAAGATCGGA CTTAGAATCT TAAATCTTGA AGAAAATCGC ACCGAAAAAA GTTTATTGTG ATTTGGAAAC AAGAAAAAAG CATTAAAAAA GAAAAGGAAA GGAAAATTCG  GCCAAGATCC AAACTCCCAC CAGAACAAAG AGGAAGAAGA ACCGAATCTG TAAGGGCCAT AAGAGAGAGT GAGGAGAGAT AGAAAAGGAT ATCTATTATG ATTAAACTTA TTTTTTATGA  GACCATGGCT ATGAGTATTT TGAATAGTCC GTACATATAT AAAAAGGCAC CGTAACAAAA TATATATCAG GATTTGAACT CAAAACTTCT GATTAAGTTA TGAGCCACCT TACAAACGTA  GCAACAACCT GCATTTTATA TTGAATTCTT TTTTCTCATA TAAAATGAGA ATCTGATATA TTGATTTGAA TAAAGTAAAT TAATATATAT ACATATATAT AAACTAAAGA ATCAACACAA  TTTTCTAAGC TTTAATATCA TTCATAACAA CACTAGTTAG TGAATTAATT ATTAACAAAA TTGAGGATTC TAATAATTTT AACCTACAAA AAAAGGGTAA AAAATTTAAA TTTTGTTTTG  ATTATTATTA TTACTATTAT GTTGATTTGC AGGGTTGTGA TGCATCTGTT TTGTTGGATG GAAGTGAGGG TGAGAAATTT GCTTTGGCCA ACTTGAATTC AGCAAGAGGA TTTGAAGTGA  TTGACGCAAT TAAAAACTCA GTGGAGAATG CATGCCCTGC CATTGTTTCT TGTGCTGATA TTTTAACCAT AGCTGCCAGG GATTCTGTCG TCTTGGTACC TCTCTCTCTT TTGATTCAGT  ATCAACCGGT TGTTCACCAT TGTTAGAATT TTTTAAACAG TTAAAAAATA GTTATTTTAA AATTTTAATG TACTGTTTTC ATTTTTAATC ACATCAACAA GTAAAAATGA TTTTAAAAAA  TATCTTTTGA AAAAAACATT TTAATATTTC TTTTATCTAG CAACATATAA TAAATAATTA GAAATATAAA TAAAAAACAA ATTATGAATT AAAAATAAAT AATTTATTTT AATAATATTG  TAATGATATA TTTGCTTTTG CAGAGTGGAG GGCCTTCATG GAAGGTTTTG CTTGGTCGAA GGGATGGATT AGTAGCAAAT CAAGAAGGGG CAAATGCACT TCCTTCTCCC TTCGACTCAC  TAACTACTAT CATAGCTAAA TTCATGGCTT TAGGCCTCAA CCTCACCGAC GTCGTTTCAT TATCCGGTAA TCCCCCTTCC AAAAATAATA ATAATATTAA TAATAATAAT TTGAAGCAGA  AAATGCCTCT AAGAACAACT TACTTCTCAT ACACAAAAAT AAATTTTTAA TTTTAAAGTG AGATAATAAT TTACGTAAAG AAAATTTTTC AAGTTTATAA AATTTTAAAG CTAACATCTA  ATTTTATATT GAATTAGAAT AATTATCGCT AGAGAAAGGG ATTGAATCTT TGACCTTGTG GTTAACAGCC ACACGCTCTA ACAAACTGAG CTACTCTAGC TTCTTAATAA ATAAGTGTAA  TTTCATAAAT AATCTAAAAA ATAAAACATT TAAAAAGAAT TGACGGACGA TAAATTGAAA GGAAATGATA TCTAAAAACT TAAAATATTA GGATGTTATT GTTAAATTAA AACCGGACCA  TGTACCAATC TGATTATATT AAAAAATCTA AATCGAATAA AGCATTAAGG TGATTTTCCG ATCGAATACT GAATTGATTA TCTTAAAAAA ATCTAAAGAG GAGAAATCGA ATAAAAATGT  GATTTTCTGA TCGAAAACTG AATTAATCGA CTAACTTAAT TTTTTATCTC TTAATATTTT TTAAGAAAAA AATGGAAAAG TATTTGATAT TATCCTTAAG TTAGATTTTT AATCATGTTA  AAATGATGTC TGACATATAT ATATTGTAAA TAATATGTAT AGAAATTAAT TATTAATATA TTTATATTTA TTTACAAGAT CCAGTTGTTG TATTATAGGG GCACACACAA TAGGATCAAC  AAGGTGTGCA TTATTCAGTG GAAGATTATA CAACTTCTCC GGGAGTGGTT CGCCGGACAC CACCATGGAC GCCGCTTTAG TTACCCAACT CCGTAAAGTT TGTCCGTTAA CCGGCAGCGA  CGGTAACAAC ACGGTTCCAT TGGACATCAA TTCCAGAGAT TTATTTGATA ATCGCTACTT CCAAAACTTG TTAACCGGTA GAGGTATTCT TCAGTCTGAT CAAATTTTAT ACTCAAGTGA  TGAAGCTATT TCAACTACTA GAAGTATTGT TCAAAGTTAC AGCACAAATC CAATGCTTTT CTTTGGGGAT TTTGTTAATT CAATGATTAA GATGGGAAAT ATTGGAATTT TAACTGGATC 
CGATGGACAA ATTAGAAAGA ATTGTAGGCT TGTTAATTCT AATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGAA GTTCATCAAT GGGTACTTTT GCTTATAATT ATTATTGGTT TTTCTTTACT TTGTTAATGA TGTGTTTAGG TGGAAGATGT CAACTAAGCA CAGATTTCTA TTCAACAACA  TGCCCAAATC TTTTCAGAGT TGTAAGAAGA GAGGTTCAAA ATGCCATCAA AGTTGAAATG AGAATGGCTG CTTCTTTGCT TAGGCTTCAT TTCCATGATT GTTTTGTTAA TGGTTGTGAT  GCATCTGTTT TGTTGGATGG AAGTGAGGGT GAGAAATTTG CTTTGGCCAA CTTGAATTCA GCAAGAGGAT TTGAAGTGAT TGACGCAATT AAAAACTCAG TGGAGAATGC ATGCCCTGCC  ATTGTTTCTT GTGCTGATAT TTTAACCATA GCTGCCAGGG ATTCTGTCGT CTTGAGTGGA GGGCCTTCAT GGAAGGTTTT GCTTGGTCGA AGGGATGGAT TAGTAGCAAA TCAAGAAGGG  GCAAATGCAC TTCCTTCTCC CTTCGACTCA CTAACTACTA TCATAGCTAA ATTCATGGCT TTAGGCCTCA ACCTCACCGA CGTCGTTTCA TTATCCGGGG CACACACAAT AGGATCAACA  AGGTGTGCAT TATTCAGTGG AAGATTATAC AACTTCTCCG GGAGTGGTTC GCCGGACACC ACCATGGACG CCGCTTTAGT TACCCAACTC CGTAAAGTTT GTCCGTTAAC CGGCAGCGAC  GGTAACAACA CGGTTCCATT GGACATCAAT TCCAGAGATT TATTTGATAA TCGCTACTTC CAAAACTTGT TAACCGGTAG AGGTATTCTT CAGTCTGATC AAATTTTATA CTCAAGTGAT  GAAGCTATTT CAACTACTAG AAGTATTGTT CAAAGTTACA GCACAAATCC AATGCTTTTC TTTGGGGATT TTGTTAATTC AATGATTAAG ATGGGAAATA TTGGAATTTT AACTGGATCC 
GATGGACAAA TTAGAAAGAA TTGTAGGCTT GTTAATTCTA ATTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATAAGTTG AATTACTAGA GTAATTATTA TTAAGAAAAT TAAGCATGAT GAGAAGTTCA TCAATGGGTA CTTTTGCTTA TAATTATTAT TGGTTTTTCT TTACTTTGTT AATGATGTGT  TTAGGTGGAA GATGTCAACT AAGCACAGAT TTCTATTCAA CAACATGCCC AAATCTTTTC AGAGTTGTAA GAAGAGAGGT TCAAAATGCC ATCAAAGTTG AAATGAGAAT GGCTGCTTCT  TTGCTTAGGC TTCATTTCCA TGATTGTTTT GTTAATGGTT GTGATGCATC TGTTTTGTTG GATGGAAGTG AGGGTGAGAA ATTTGCTTTG GCCAACTTGA ATTCAGCAAG AGGATTTGAA  GTGATTGACG CAATTAAAAA CTCAGTGGAG AATGCATGCC CTGCCATTGT TTCTTGTGCT GATATTTTAA CCATAGCTGC CAGGGATTCT GTCGTCTTGA GTGGAGGGCC TTCATGGAAG  GTTTTGCTTG GTCGAAGGGA TGGATTAGTA GCAAATCAAG AAGGGGCAAA TGCACTTCCT TCTCCCTTCG ACTCACTAAC TACTATCATA GCTAAATTCA TGGCTTTAGG CCTCAACCTC  ACCGACGTCG TTTCATTATC CGGGGCACAC ACAATAGGAT CAACAAGGTG TGCATTATTC AGTGGAAGAT TATACAACTT CTCCGGGAGT GGTTCGCCGG ACACCACCAT GGACGCCGCT  TTAGTTACCC AACTCCGTAA AGTTTGTCCG TTAACCGGCA GCGACGGTAA CAACACGGTT CCATTGGACA TCAATTCCAG AGATTTATTT GATAATCGCT ACTTCCAAAA CTTGTTAACC  GGTAGAGGTA TTCTTCAGTC TGATCAAATT TTATACTCAA GTGATGAAGC TATTTCAACT ACTAGAAGTA TTGTTCAAAG TTACAGCACA AATCCAATGC TTTTCTTTGG GGATTTTGTT  AATTCAATGA TTAAGATGGG AAATATTGGA ATTTTAACTG GATCCGATGG ACAAATTAGA AAGAATTGTA GGCTTGTTAA TTCTAATTAG TTTAGTTTGT ATATAAAGTT TGTAATTTAA 
TATCTATGTA TGTAACCGAC ATGTACTTCC TTTAAATGTG ACGTGGTAAT AAACAAGTTT TGCATATACA GATATGAGTG AAATTTTAAG ACCC 

Retrieve as FASTA