Entry information : CroPrx29(CRO_T032931 / cra_locus_3951_iso_1_len_1197_ver_3)
Entry ID 11287
Creation 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx29(CRO_T032931 / cra_locus_3951_iso_1_len_1197_ver_3)
Name CroPrx29(CRO_T032931 / cra_locus_3951_iso_1_len_1197_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx208]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx29
start..stop
S start..stop
CroPrx[P]11 490 2e-176 4..334 1..330
BvPrx18 417 1e-147 12..334 1..327
VvPrx43 416 5e-147 26..333 18..324
VvPrx86 413 6e-146 26..333 16..321
Literature and cross-references CroPrx29(CRO_T032931 / cra_locus_3951_iso_1_len_1197_ver_3)
Protein sequence: CroPrx29(CRO_T032931 / cra_locus_3951_iso_1_len_1197_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334 (305)
PWM (Da):   %s   37200.67 (33903.0)  
PI (pH):   %s   6.97 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-334
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLLTNNKLT IMFIAMILIL SCYYHQSNAQ LQVGFYKNSC RQAEFIIRDE VQKSSYFNIG ILPALLRLHF HDCFVRGCDA SVLIDSTATN SAEKDGLPNA NSLRGFEVID RAKSRIEAIC  KRVVSCADIV AYAARDAVVL TGGLGWDVPA GRRDGRISIA AETLQMPAPF DNLVRVTQAF AQKGLSQDDM IALSGAHTIG RSHCTSFSNR LYNFSSSNSQ DPTLDRYFAA VLKIQCPRIN 
LQENVDPNSL VQMNLSPYLF ENSYYRDILG NRGLFTSDQT LTTSPEALQE VRDYAFNDRK WQQDFVEAMI KMSQIEVLTG TAGEIRNNCR VINP 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from geneomic and EST. incorrect prediction (2 fused ORF with 1 Prx)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTGC TTACTAATAA TAAGCTTACT ATAATGTTTA TTGCAATGAT ATTAATCCTT AGTTGTTACT ACCATCAAAG TAATGCCCAA CTTCAAGTGG GTTTCTATAA AAATTCATGC  CGCCAAGCTG AATTCATCAT ACGAGATGAA GTCCAAAAGT CCTCCTACTT TAACATAGGA ATTCTTCCTG CTCTCCTCAG ATTGCATTTT CACGATTGCT TCGTTAGGGT AATTCATTAA  TTAATGATCC GGCTCCGGCC CCGGCCCCAT CCATGCGTTT TCTTCTTCCC TCTTTCTTTC TTTTTTACTC ACATTCATGC TTCATTGAAT CACATATTAT ATTATATTAT GAGAAATATA  ATATAATTGA ATGACATGTT AAAGTATGTC ATGCTAAACT CATATTAAAT ATGAATTAAA ATTTTAATTT AATATTTAGA TTTATTAAAC TCAAGTTACT ATATATATTT ATGTTATTTA  TAATATCGTG TTATTGAATT TGTGAGATTT TGTCTAAATA GTAATAACTG AGGCCTTCCG ATTAAAAAAT TGGAGGTTCG ACTCTATACC ATACAGGAAT TATTTTCCTT TTTAATATGG  CACCACTTCT ATTTAACAAA AAAAAAAAAA AAATTAATGT TCTTGTTGGA GATATGATAT ATATCATGCA AATTTTCTTA GTTCTACATT ACATGGATTA AATCACAATT ATATTCATAA  AAAAGTACGA TAAGTAATTT TTTTTTGTTT TTGGGAAGAT AAGTACTATC TTTATTTTAT GCAATTTTGT GAGTAGTTTT TGATTAATTA GGACAATCTC ACTATTTTGA GATTTATAAT  AGTTTAAACT AAAATTGTCT TATACACTTC ATAATATATC CTTCTATTTT TTAAAATGGG TTTAAATGAA TTTTAAAACA AGACGTCTCA TATCTAGATC TCATTATACG GAGGAGTACC  ATATTCATAT AGGTAGTATT TTAATAGACT TGTGTTTATT CCCAATAAAT TTGAGATTTT TTTTATTAAG TCACGTCATT TTGAGGCAAA CAGTATATAT ATATATATAT AATTGGTGGA  ATCTGCATCA TTTAGTTCGA GTTTCGAATA ATACTATCCC ATTTTCCATT TTCAGCCCTA CTCTCCTGCT ATACTCCCTA ATTTTATAGC GTGTTTATTG GCAAAATTTA TAGATAAATA  TTAAATCTAT AAAATAAAAG ATAAACTCTA AATTAATTAT ATTAAAAGAT AATGTATTAG AAGATGTGTT AAATAATACT TTTTAATATT ACTTACTATA TATATTCTCC TAAATTTAGG  ATAAAGAATT TTGTGTAGAA TTCTTCTTCA AACTTTATTA GTTTAATAAT AATTGTGTTG CGATATAAGT CAGGGTTGTG ATGCATCGGT TCTGATAGAT TCAACGGCAA CGAATTCAGC  AGAGAAAGAC GGACTACCAA ATGCGAACAG TCTAAGAGGG TTTGAAGTTA TTGACAGAGC CAAATCCAGA ATTGAAGCAA TATGCAAAAG AGTTGTTTCT TGTGCTGATA TTGTAGCCTA  TGCAGCAAGA GATGCCGTGG TATTGGTGAG TTACATTAAT ATACATATAT AAATTAACCT CCAAATTGCC CTGCCCTGCC CTCCTTAATT TGGGAGGCAT AACTAATACT TATTAATGAA  TATTGTTTTG GTGGTGGTGG GCTGCTGCAG ACGGGAGGCC TCGGGTGGGA TGTTCCTGCA GGAAGACGAG ACGGACGAAT TTCAATAGCA GCAGAGACCT TACAGATGCC AGCTCCATTT  GATAACCTTG TTCGAGTTAC TCAAGCTTTT GCTCAGAAGG GCCTTTCTCA GGATGATATG ATTGCACTCT CGGGTAATGC AATACTTCGA TCACAATCAC CCCATTATTA ATCGGAAACT  TCTTTTATTA ACTAACTTCA TATTTCTACT CATAAACTTT TTTGGCCTTT GGAGTTCCAA TTATCTCTAT AATTTGAGAA ATATTAACTA GAGTAATGAC GTGACTTAAT ACAAACAAAA  TGATCCATAA ATAAGATATG AATCTGATCT GATCTATAAT AGAATACAAA TCAAATGATC CATAAATAAG ATATGGAATT GATCTATGAT ATATGATACA AACTGGCCAT GATAATAATC  GAATTAATAC AATTTCTTAT AATAGTCGAT TTATTAACAA ATATTATAGA ATAAAAAATA AGTTCTAGAC CTTAAGACAT AAATATTAAA AGAAAAATAA TGACTAAAGC AAGTGTTTAA  AAGATGTATT AGAAGTCATT CTCTAATACA CTATTTCTTC TACAGCAATA TTCTTGTTAG AAATTCTATT TTATTTTATA AGATTTATTA ATAAAATTAC TTTAAAAAGT GATGTTTTTT  AGCAGAAGTG TATTAGGAGT ATTAAAAGGT GCAACTCAGT CTTTTTAGTT CTTGAGAATG TCACCACCTC TTCTAGGATC GAAATAATTA TCCTGTCCAA TGAGTTTAAT GAAACGAATG  ACCGAAGTAA GTTACATTAT CCACCATAAG AAGAGATTAT TAGTCTCCTA GCAAGATCTA GCTAGTTGTC TCCATAAACA GGAATTATAA TATACTTACA TGAGTAATAT GATTTAATAT  AATTTAAAAG GTGTTTATAC AACAAAATCT TTTAATATGA TACAAATATA TCCGACTTAT CTCTATGAAA AAGGACATAA TTTGCTTACA TACATAATAT GATCACTTGA TATATATATA  TATATATATA TATATGTGGT TGTGTCCATA ACAGAATAAT TTTTCTGGTG AACTTAATAT TAATGGCAGG AGCACATACA ATTGGTCGGT CTCATTGCAC CTCTTTCAGC AACAGATTGT  ATAATTTCAG TTCAAGTAAT AGTCAAGATC CGACCCTTGA TCGCTACTTT GCTGCTGTAC TCAAGATTCA ATGTCCAAGA ATTAATCTTC AAGAAAATGT TGATCCTAAC TCATTAGTCC  AAATGAACTT GAGCCCATAT CTTTTTGAGA ACAGCTATTA CAGAGACATT CTTGGAAACA GGGGGCTTTT TACGTCTGAC CAAACGTTGA CAACTAGTCC AGAAGCTCTT CAAGAAGTCA  GAGATTATGC TTTCAACGAT AGAAAATGGC AGCAAGATTT TGTTGAAGCA ATGATAAAGA TGAGTCAGAT TGAAGTTCTA ACTGGAACTG CTGGTGAAAT TCGAAACAAT TGCAGGGTCA 
TAAATCCCTA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTGC TTACTAATAA TAAGCTTACT ATAATGTTTA TTGCAATGAT ATTAATCCTT AGTTGTTACT ACCATCAAAG TAATGCCCAA CTTCAAGTGG GTTTCTATAA AAATTCATGC  CGCCAAGCTG AATTCATCAT ACGAGATGAA GTCCAAAAGT CCTCCTACTT TAACATAGGA ATTCTTCCTG CTCTCCTCAG ATTGCATTTT CACGATTGCT TCGTTAGGGG TTGTGATGCA  TCGGTTCTGA TAGATTCAAC GGCAACGAAT TCAGCAGAGA AAGACGGACT ACCAAATGCG AACAGTCTAA GAGGGTTTGA AGTTATTGAC AGAGCCAAAT CCAGAATTGA AGCAATATGC  AAAAGAGTTG TTTCTTGTGC TGATATTGTA GCCTATGCAG CAAGAGATGC CGTGGTATTG ACGGGAGGCC TCGGGTGGGA TGTTCCTGCA GGAAGACGAG ACGGACGAAT TTCAATAGCA  GCAGAGACCT TACAGATGCC AGCTCCATTT GATAACCTTG TTCGAGTTAC TCAAGCTTTT GCTCAGAAGG GCCTTTCTCA GGATGATATG ATTGCACTCT CGGGAGCACA TACAATTGGT  CGGTCTCATT GCACCTCTTT CAGCAACAGA TTGTATAATT TCAGTTCAAG TAATAGTCAA GATCCGACCC TTGATCGCTA CTTTGCTGCT GTACTCAAGA TTCAATGTCC AAGAATTAAT  CTTCAAGAAA ATGTTGATCC TAACTCATTA GTCCAAATGA ACTTGAGCCC ATATCTTTTT GAGAACAGCT ATTACAGAGA CATTCTTGGA AACAGGGGGC TTTTTACGTC TGACCAAACG  TTGACAACTA GTCCAGAAGC TCTTCAAGAA GTCAGAGATT ATGCTTTCAA CGATAGAAAA TGGCAGCAAG ATTTTGTTGA AGCAATGATA AAGATGAGTC AGATTGAAGT TCTAACTGGA 
ACTGCTGGTG AAATTCGAAA CAATTGCAGG GTCATAAATC CCTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGCCGGGGG AATATTAATA CAATACAATA GAAATGGGTT TGCTTACTAA TAATAAGCTT ACTATAATGT TTATTGCAAT GATATTAATC CTTAGTTGTT ACTACCATCA AAGTAATGCC  CAACTTCAAG TGGGTTTCTA TAAAAATTCA TGCCGCCAAG CTGAATTCAT CATACGAGAT GAAGTCCAAA AGTCCTCCTA CTTTAACATA GGAATTCTTC CTGCTCTCCT CAGATTGCAT  TTTCACGATT GCTTCGTTAG GGGTTGTGAT GCATCGGTTC TGATAGATTC AACGGCAACG AATTCAGCAG AGAAAGACGG ACTACCAAAT GCGAACAGTC TAAGAGGGTT TGAAGTTATT  GACAGAGCCA AATCCAGAAT TGAAGCAATA TGCAAAAGAG TTGTTTCTTG TGCTGATATT GTAGCCTATG CAGCAAGAGA TGCCGTGGTA TTGACGGGAG GCCTCGGGTG GGATGTTCCT  GCAGGAAGAC GAGACGGACG AATTTCAATA GCAGCAGAGA CCTTACAGAT GCCAGCTCCA TTTGATAACC TTGTTCGAGT TACTCAAGCT TTTGCTCAGA AGGGCCTTTC TCAGGATGAT  ATGATTGCAC TCTCGGGAGC ACATACAATT GGTCGGTCTC ATTGCACCTC TTTCAGCAAC AGATTGTATA ATTTCAGTTC AAGTAATAGT CAAGATCCGA CCCTTGATCG CTACTTTGCT  GCTGTACTCA AGATTCAATG TCCAAGAATT AATCTTCAAG AAAATGTTGA TCCTAACTCA TTAGTCCAAA TGAACTTGAG CCCATATCTT TTTGAGAACA GCTATTACAG AGACATTCTT  GGAAACAGGG GGCTTTTTAC GTCTGACCAA ACGTTGACAA CTAGTCCAGA AGCTCTTCAA GAAGTCAGAG ATTATGCTTT CAACGATAGA AAATGGCAGC AAGATTTTGT TGAAGCAATG  ATAAAGATGA GTCAGATTGA AGTTCTAACT GGAACTGCTG GTGAAATTCG AAACAATTGC AGGGTCATAA ATCCCTAGGA TTAACATTAA TGATCTGATT CATATTAGGA GTGAGTTTTT 
ACAATAAGTG CAGCAATTCC AGTTGCCCGT GAAAATAAAG ATCAAAATAA TAATTGAGTG ATCGAAGCAC TTAAAAATAT AGAAATATTG GAGTTCCATA TTCTTTTTTC TCGACGG 

Retrieve as FASTA