Entry information : CroPrx31(CRO_T004754 / cra_locus_18807_iso_1_len_990_ver_3)
Entry ID 11289
Creation 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-05 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx31(CRO_T004754 / cra_locus_18807_iso_1_len_990_ver_3)
Name CroPrx31(CRO_T004754 / cra_locus_18807_iso_1_len_990_ver_3)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx012]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx31
start..stop
S start..stop
VvPrx34 489 4e-176 22..322 25..325
PpePrx22 476 4e-171 19..322 21..324
VvPrx35 476 6e-171 19..322 23..326
EgrPrx23 469 3e-168 24..322 21..319
Literature and cross-references CroPrx31(CRO_T004754 / cra_locus_18807_iso_1_len_990_ver_3)
Protein sequence: CroPrx31(CRO_T004754 / cra_locus_18807_iso_1_len_990_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322
PWM (Da):   %s   34200  
PI (pH):   %s   8.21
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAMSQRPMNI LMATLIISFV LLIGITSAQL SANFYASSCP NALSIIRTAV NSAVSSEARM GASLVRLHFH DCFVNGCDAS VLLDDTANFT GEKTAGPNVN SLRGFEVIDN IKTQLERSCP  GVVSCADILT VAARDSVVAL RGPSWDVALG RRDATTTSLN SVSGNIPGPA LNLNQLISSF SNKGFTGNEM VALSGAHTIG QAKCSSFRNR LYNEANLNST LATSLRPRCP RTGGDNNLSP 
LDSTTPATFD NAYFTNLLSQ NGLLHSDQQL FNGGSTDALV RTYSSNSNAF FTDFANAMVK MSNLSPLTGT NGQIRTNCRR RN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from geneomic and EST.(Short PS is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAATGT CACAGCGGCC CATGAATATT CTTATGGCTA CCTTAATAAT ATCATTTGTT CTTCTTATTG GAATAACATC TGCTCAGTTG TCTGCAAATT TTTATGCAAG TTCATGTCCT  AACGCTCTCT CTATTATAAG AACAGCAGTG AATTCTGCTG TTTCTAGTGA GGCTCGAATG GGAGCATCCT TAGTCCGTCT TCATTTCCAC GATTGTTTCG TTAATGCAAG TCTTCCATTT  TATTTCCCGT CTTAATTTCC TCTTTTCCTC TTCTTCATAA TTCTTTCACC TTTATTCATT AGGATAAATT ATGTTTCCTA AGCCGGGGAA ATATTTATTT CTTGCTCATA TTGATCTAAT  TAAAATTTGG TAGTGTCTAG TTAGCTCTCA AAACCAAGGA CCAAATTAGG GATTAATTAG AGTGATACAC TCCGCTTAAT ATTTTTAAAA ATCATTTATA AAGATTTATT TTTAAAATTT  TTTTAAATAT ATTTTTTTAT TTGTCATTCT CATAATTTAA AATTTATTTT AATCTAAATT TTAGATCCTT CCGAAGATTA AGAGTTAAAG TCATTAATGA TTTAACTAAC TCGCTCCAAG  ATTAAGAATA ATCAAGGTCA GAGTGATGCC CCCTCAGTGC CTCCAATAGT TTTTAAAAAT TCTTGACAGT GACTCTCTTC CTTAAGCTTT CAATATATAT TTTCTTAAAT TGTTCTTCTA  ATTTTTTAAA TTTTTCTTTA AAAATAAATT CTGAAGTTAC ACTTTAATTC CTTTTCATGT CTAAAATTGT CCATTACAAG TAACAAAAAA GATTTGTTGC TAACAAAATA TATTCAAGAG  ATGGTGAAAC ATTAACAGCT CTAATAATAT TTACATTGTT ATGATCAACT GATTTTTATG AGATTTAGTG GGATTATATC AGACCAGCAG ATTGATGAAT TTTATTTGAT GATGATACGA  ATGAACACAC AGGGTTGTGA TGCCTCGGTT TTATTGGATG ACACGGCAAA CTTTACAGGG GAGAAGACTG CAGGTCCAAA TGTCAATTCT TTGAGAGGAT TTGAAGTTAT AGACAATATT  AAAACACAAC TAGAAAGGTC ATGCCCTGGT GTTGTTTCTT GTGCTGATAT TTTAACTGTA GCTGCTCGTG ACTCCGTTGT TGCGGTAAGG AAAAAAAAAA AATTAAGCTT TCTTTTTCCC  ATTATCTCTC CTGAAATGCT AACTTATTCA ATGAATAATT TAAATTATTC AACCAAAAAA AAAAAAAGGA AAAAGAATAA TTTACATCCA TTTTTTCCGA ATTGAAATTC TTTTGGCTCT  TTAATTTTTT TGTATTTTTC AAATATTAGT AACATTAATG TTAAAAATGA AATTATTTTT TTCTTGATTT TGTCAGTTGC GTGGTCCTAG TTGGGATGTT GCATTAGGTA GGAGGGACGC  AACCACCACA AGTTTAAATT CCGTGAGCGG TAATATCCCT GGACCAGCTC TTAATCTTAA TCAACTCATT TCCTCCTTCT CAAACAAAGG ATTCACTGGC AATGAAATGG TGGCTCTTTC  TGGTAACTTT TTCACCAATT TCCTTTTGTT TTCTTTTATT AGTTTTTTTT TATTTCGTTC AAGATGGATA AACATATTAG AATTTTCTCA TGAAATATTA TCATAGTTGA ATTAATTTCT  GGTCAAATCT ATACCAAATA TGTTTTTTTA CGGTAATTTT TATTTTTTTT TAACAATTTA ACATTGTTGT GTCTTGTCAA TTTCAGCTGA AAGGTTGATC AATTAGAAAA AAAAACAAAT  CCAATATCTT TCACTTAGGG TTTTTTATTA TTATTATTAT TATTATTATT ATTATTTTAT TTTTTTTATT TTTTATTTTT TGGGAATCGA AAGTTGAGTA TCTTTAAAAA AAATAGAATA  AAAAATAAAA AAGAGCGGAA ATTACACGTG TGATTGGGGA AGACCAATAA GTGTCATTAA TCCAAGAGCT AAGCTGAATT AGGAGATGAG CAGAGATATT TACTGTCCAT AATTAATCCA  AAATACACTA TTTTCTCTAG ATGAATTTGG TACCTTAAGA ATCGCATGGT CAATCTAAAA ATTTTGCATA AATTTATTGT ATTTTTCTTA AGTACAAATG TCACACTAAT AATGAAAATT  ATATCAATAT TAATTAAATT AAGTACAATT TTAATAAAAA AAATAAAAAT TTTATAAAAG ACAACAACTT ACATAATGCA AGAGTTAAAC TCATAATTTT TTATTGGGTT GTCTTAGTTA  TCATCTCATT GAAAGGGTTC AACTCTTACT ACTCATAACA ACAAGACTTG ATTGGCAAAT TTGTTGTATT GTACTTAGTT AAAAATGGTT GTTATGTTAA TTAATCCTCT TTCAATTAAC  AGGAGCTCAC ACCATAGGAC AAGCTAAATG TAGCAGTTTC CGGAACAGGC TTTACAACGA GGCAAACCTA AACTCAACAT TGGCAACCTC GTTAAGGCCA AGATGTCCTA GAACTGGAGG  AGATAATAAC CTTTCTCCCT TAGATTCAAC AACTCCAGCG ACATTTGATA ATGCGTATTT CACAAATTTA CTTAGCCAAA ACGGACTACT TCATTCGGAC CAACAGCTTT TCAACGGAGG  ATCAACTGAT GCTTTAGTCA GAACTTACAG CTCAAATTCT AATGCGTTCT TCACTGACTT CGCAAATGCT ATGGTGAAGA TGAGCAACCT TAGCCCTCTC ACTGGTACGA ATGGACAGAT 
CAGGACAAAT TGCAGGAGAC GGAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAATGT CACAGCGGCC CATGAATATT CTTATGGCTA CCTTAATAAT ATCATTTGTT CTTCTTATTG GAATAACATC TGCTCAGTTG TCTGCAAATT TTTATGCAAG TTCATGTCCT  AACGCTCTCT CTATTATAAG AACAGCAGTG AATTCTGCTG TTTCTAGTGA GGCTCGAATG GGAGCATCCT TAGTCCGTCT TCATTTCCAC GATTGTTTCG TTAATGGTTG TGATGCCTCG  GTTTTATTGG ATGACACGGC AAACTTTACA GGGGAGAAGA CTGCAGGTCC AAATGTCAAT TCTTTGAGAG GATTTGAAGT TATAGACAAT ATTAAAACAC AACTAGAAAG GTCATGCCCT  GGTGTTGTTT CTTGTGCTGA TATTTTAACT GTAGCTGCTC GTGACTCCGT TGTTGCGTTG CGTGGTCCTA GTTGGGATGT TGCATTAGGT AGGAGGGACG CAACCACCAC AAGTTTAAAT  TCCGTGAGCG GTAATATCCC TGGACCAGCT CTTAATCTTA ATCAACTCAT TTCCTCCTTC TCAAACAAAG GATTCACTGG CAATGAAATG GTGGCTCTTT CTGGAGCTCA CACCATAGGA  CAAGCTAAAT GTAGCAGTTT CCGGAACAGG CTTTACAACG AGGCAAACCT AAACTCAACA TTGGCAACCT CGTTAAGGCC AAGATGTCCT AGAACTGGAG GAGATAATAA CCTTTCTCCC  TTAGATTCAA CAACTCCAGC GACATTTGAT AATGCGTATT TCACAAATTT ACTTAGCCAA AACGGACTAC TTCATTCGGA CCAACAGCTT TTCAACGGAG GATCAACTGA TGCTTTAGTC  AGAACTTACA GCTCAAATTC TAATGCGTTC TTCACTGACT TCGCAAATGC TATGGTGAAG ATGAGCAACC TTAGCCCTCT CACTGGTACG AATGGACAGA TCAGGACAAA TTGCAGGAGA 
CGGAATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAATGT CACAGCGGCC CATGAATATT CTTATGGCTA CCTTAATAAT ATCATTTGTT CTTCTTATTG GAATAACATC TGCTCAGTTG TCTGCAAATT TTTATGCAAG TTCATGTCCT  AACGCTCTCT CTATTATAAG AACAGCAGTG AATTCTGCTG TTTCTAGTGA GGCTCGAATG GGAGCATCCT TAGTCCGTCT TCATTTCCAC GATTGTTTCG TTAATGGTTG TGATGCCTCG  GTTTTATTGG ATGACACGGC AAACTTTACA GGGGAGAAGA CTGCAGGTCC AAATGTCAAT TCTTTGAGAG GATTTGAAGT TATAGACAAT ATTAAAACAC AACTAGAAAG GTCATGCCCT  GGTGTTGTTT CTTGTGCTGA TATTTTAACT GTAGCTGCTC GTGACTCCGT TGTTGCGTTG CGTGGTCCTA GTTGGGATGT TGCATTAGGT AGGAGGGACG CAACCACCAC AAGTTTAAAT  TCCGTGAGCG GTAATATCCC TGGACCAGCT CTTAATCTTA ATCAACTCAT TTCCTCCTTC TCAAACAAAG GATTCACTGG CAATGAAATG GTGGCTCTTT CTGGAGCTCA CACCATAGGA  CAAGCTAAAT GTAGCAGTTT CCGGAACAGG CTTTACAACG AGGCAAACCT AAACTCAACA TTGGCAACCT CGTTAAGGCC AAGATGTCCT AGAACTGGAG GAGATAATAA CCTTTCTCCC  TTAGATTCAA CAACTCCAGC GACATTTGAT AATGCGTATT TCACAAATTT ACTTAGCCAA AACGGACTAC TTCATTCGGA CCAACAGCTT TTCAACGGAG GATCAACTGA TGCTTTAGTC  AGAACTTACA GCTCAAATTC TAATGCGTTC TTCACTGACT TCGCAAATGC TATGGTGAAG ATGAGCAACC TTAGCCCTCT CACTGGTACG AATGGACAGA TCAGGACAAA TTGCAGGAGA 
CGGAATTGAT TATTTCGTAG TACTATACAT ACGGCGTCGT TGTAATCTCG GGTCTTCTTT TTTAGTCTTC TTTTTTTTTT CGTTCAATGG ATTACAA 

Retrieve as FASTA