Entry information : CroPrx33(CRO_T027228 / cra_locus_10747_iso_1_len_1244_ver_3)
Entry ID 11291
Creation 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx33(CRO_T027228 / cra_locus_10747_iso_1_len_1244_ver_3)
Name CroPrx33(CRO_T027228 / cra_locus_10747_iso_1_len_1244_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx33
start..stop
S start..stop
PtPrx40 469 1e-167 13..323 50..360
StPrx25 456 4e-163 9..323 2..314
CclPrx113 454 2e-162 12..323 12..318
RcPrx52 451 2e-161 6..323 3..317
Literature and cross-references CroPrx33(CRO_T027228 / cra_locus_10747_iso_1_len_1244_ver_3)
Protein sequence: CroPrx33(CRO_T027228 / cra_locus_10747_iso_1_len_1244_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (298)
PWM (Da):   %s   34915.56 (31931.0) Transmb domain:   %s   i5-23o
PI (pH):   %s   6.65 (6.34) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFCFFNSSF FFIFFFLLFI IGIKGSSSAQ LSPTFYITTC PQALFTIKSV VTKAVVKEHR MGASLLRLHF HDCFVNGCDG SVLLDDTSSF TGEKNARPNK GSLRGFEVID TIKSQLETIC  PGVVSCADIL AVAARDSVVA LGGPAWIVEL GRRDSTTASL SDAEANIPFP RMDLTDILTA FSNKGFSAKE MVALLGGHTI GQAQCFTFRE RLYNETLIDT TFATSIKLNC PISLGDDNLT 
SLDAITPLSF DNGYYKSLVN NKGLLHSDQQ LFSGGSTDSQ VNTYKSSSLN FFIDFANAMV KMANLSVLTG TNGQIRTNCA KVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Incorrect prediction from MPGR (fusion of 3 ORFs)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTT GCTTCTTCAA CTCTATCTTC TTCTTCATCT TCTTGTTTTT GCTTTTCATA ATTGGCATCA ATGGGAGCTC ATCGGCACAA TTATCCCCAA CATTCTATAT AACAACATGC  CCTCAAACCC TTTTCACCAT AAAATCAGTA GTGACTAAAG CTGTGGCCAA AGAGCACCGA ATGGGAGCTT CCTTGCTTCG TCTTCACTTC CACGATTGCT TTGTTAATGT ATGCATCTCT  CTCTTCTTCC TAATTCTCTC TCTCTCTTAA TTGCATGCAT GTTTTCTTTT ATCAACTTAA TTTCTACATA ATTAGTGACC ATGCATGCAT AGATTAAGAA CACCAAATCG TATTATAACA  TTTAATTATA TTTTTCAGGG ATGTGATGGA TCTGTTCTGC TTGATGATAC TTCAAGCTTC ACAGGAGAAA AGAATGCAAG ACCTAATAAA GGTTCTCTTA GGGGTTTTGA AGTGATAGAT  ACCATCAAAT CTCAGCTAGA GACCATATGT CCTGGTGTTG TTTCTTGTGC TGATATTTTA GCTGTTGCAG CCAGGGATTC CGTTGTTGCC GTAAGAATTT TTACTCATTT TTCATTTCAA  AATATTTCTC ACTTCTATGA ATATTCAATA AATTTTTTTC ACATGTATAT ACTTATTTAT TATTGCGATT AAGCAAACGT TTAAAATTTG ACAAACAAAA AAGGACTAAA TAGCTTGTAT  AAACTCAAAT AATAATTAGG TTCATTAATT AAAGAATCTA ATTATTTTCT TAATTCTTGT ATATTATTTT GTCAAATAAA TTTGGTTAAT TAAATTATGG TTATTTACTT GGATTATCTA  TCAGTTGGGA GGGCCAGCTT GGATAGTGGA GTTAGGAAGA AGAGACTCAA CCACAGCAAG TTTAAGTGAT GCAGAAGCCA ATATTCCATC CCCTAGAATG GATCTCACTG ATATTTTGAC  TGCTTTCTCA AACAAGGGCT TCTCTGCTAA AGAAATGGTG GCACTTTTAG GTACATATTC ACCACCATCA AATCCTCCTC CTGCTATATG CAAATATAAC AAGTTATCGA TCCCCGTCTC  ACATGAAATA TGTCTAAGAA ACTTGATAAT ATAAAGTACA CGAGTAATAT ATATGTTTAA CTCAAGATAT CTATTTTAAA TATATAAGGC GAATTCAGAT AAGTTTTACT AATTGAAAAG  TATAAAGGTT GCTAATAGTT GTTGTCACGC ATGGAGTTTT CGAATATTCA CAAGTATAGG TATAAACAAG TCAAAGAGTT TAAAAGGTTT ATATAGTTAG CTAGTTATTT CTGCTTGCTT  GTCAAATAGT TAGTCATGAG TACTGTTACA ATGCACAAAG TTTTTGAACT TACGAATACA AGACATGACA AGTTATTTAA TATACTGATT AACTCATTAT TGCTAAATAG TTAATCATAT  GTGCTCTTTG GCACGTAGAG TTCTCATGTG AAGTCAAAGA TTTCAAGATT TCTATTCGTT AACCCTCAAT ATTTGCCAAA TAATTAGGCC TTAATAGTTT GCTAGCAAGC ACGAGGCGTG  ACAAGTCAAA GAATCTAAAA ATTTCTACTA AAAGGCTTCA ACTGTTTGAA AAAAAGTTGT GAGTTTTAAA CTAAAAGTGA CGTAACCTCT TTATAACTAC ACATGCAATT CCATACTTAT  GAACCTGATC TATATCTGAA TTTTTCCATG TCCGTGTTAA AGAAATGATC ATCTTAAATT TATAATAATG AATTAATGAA CATATTTTTC TTGATCATGA ACAGGAGGTC ATACAATAGG  ACAAGCCCAA TGCTTCACAT TCAGGGAACG TCTCTACAAT GAAACCCTAA TTGATACAAC ATTTGCAACT TCAATTAAAT TAAATTGTCC AATTTCACTT GGTGATGATA ACCTCACATC  ACTTGATGCT ACTACTCCTC TTTCTTTTGA TAATGGTTAT TACAAGTCAC TTGTTAACAA CAAAGGACTT CTTCACTCTG ATCAACAGCT ATTTAGCGGC GGTTCTACTG ATTCTCAAGT  CAATACTTAT AAATCCAACT CTCTTAACTT CTTTATCGAT TTTGCAAATG CCATGGTTAA AATGGCTAAT CTTAGTGTTC TTACGGGAAC AAATGGACAA ATTCGAACTA ATTGTGCCAA 
AGTTAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTT GCTTCTTCAA CTCTATCTTC TTCTTCATCT TCTTGTTTTT GCTTTTCATA ATTGGCATCA ATGGGAGCTC ATCGGCACAA TTATCCCCAA CATTCTATAT AACAACATGC  CCTCAAACCC TTTTCACCAT AAAATCAGTA GTGACTAAAG CTGTGGCCAA AGAGCACCGA ATGGGAGCTT CCTTGCTTCG TCTTCACTTC CACGATTGCT TTGTTAATGG ATGTGATGGA  TCTGTTCTGC TTGATGATAC TTCAAGCTTC ACAGGAGAAA AGAATGCAAG ACCTAATAAA GGTTCTCTTA GGGGTTTTGA AGTGATAGAT ACCATCAAAT CTCAGCTAGA GACCATATGT  CCTGGTGTTG TTTCTTGTGC TGATATTTTA GCTGTTGCAG CCAGGGATTC CGTTGTTGCC TTGGGAGGGC CAGCTTGGAT AGTGGAGTTA GGAAGAAGAG ACTCAACCAC AGCAAGTTTA  AGTGATGCAG AAGCCAATAT TCCATCCCCT AGAATGGATC TCACTGATAT TTTGACTGCT TTCTCAAACA AGGGCTTCTC TGCTAAAGAA ATGGTGGCAC TTTTAGGAGG TCATACAATA  GGACAAGCCC AATGCTTCAC ATTCAGGGAA CGTCTCTACA ATGAAACCCT AATTGATACA ACATTTGCAA CTTCAATTAA ATTAAATTGT CCAATTTCAC TTGGTGATGA TAACCTCACA  TCACTTGATG CTACTACTCC TCTTTCTTTT GATAATGGTT ATTACAAGTC ACTTGTTAAC AACAAAGGAC TTCTTCACTC TGATCAACAG CTATTTAGCG GCGGTTCTAC TGATTCTCAA  GTCAATACTT ATAAATCCAA CTCTCTTAAC TTCTTTATCG ATTTTGCAAA TGCCATGGTT AAAATGGCTA ATCTTAGTGT TCTTACGGGA ACAAATGGAC AAATTCGAAC TAATTGTGCC 
AAAGTTAACT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGGAGGG GATGGATTGT CAAGGGGGAA GAGGCTTATA AATTAGCAGC CAACGATTCT CAATTCCTTG CCATTTACTT GTTCTTGGAA AAACACAATT AATCTTCTCT CTTGTCCATT  AATTAATTAA TAATGGCATT TTGCTTCTTC AACTCTATCT TCTTCTTCAT CTTCTTGTTT TTGCTTTTCA TAATTGGCAT CAATGGGAGC TCATCGGCAC AATTATCCCC AACATTCTAT  ATAACAACAT GCCCTCAAAC CCTTTTCACC ATAAAATCAG TAGTGACTAA AGCTGTGGCC AAAGAGCACC GAATGGGAGC TTCCTTGCTT CGTCTTCACT TCCACGATTG CTTTGTTAAT  GGATGTGATG GATCTGTTCT GCTTGATGAT ACTTCAAGCT TCACAGGAGA AAAGAATGCA AGACCTAATA AAGGTTCTCT TAGGGGTTTT GAAGTGATAG ATACCATCAA ATCTCAGCTA  GAGACCATAT GTCCTGGTGT TGTTTCTTGT GCTGATATTT TAGCTGTTGC AGCCAGGGAT TCCGTTGTTG CCTTGGGAGG GCCAGCTTGG ATAGTGGAGT TAGGAAGAAG AGACTCAACC  ACAGCAAGTT TAAGTGATGC AGAAGCCAAT ATTCCATCCC CTAGAATGGA TCTCACTGAT ATTTTGACTG CTTTCTCAAA CAAGGGCTTC TCTGCTAAAG AAATGGTGGC ACTTTTAGGA  GGTCATACAA TAGGACAAGC CCAATGCTTC ACATTCAGGG AACGTCTCTA CAATGAAACC CTAATTGATA CAACATTTGC AACTTCAATT AAATTAAATT GTCCAATTTC ACTTGGTGAT  GATAACCTCA CATCACTTGA TGCTACTACT CCTCTTTCTT TTGATAATGG TTATTACAAG TCACTTGTTA ACAACAAAGG ACTTCTTCAC TCTGATCAAC AGCTATTTAG CGGCGGTTCT  ACTGATTCTC AAGTCAATAC TTATAAATCC AACTCTCTTA ACTTCTTTAT CGATTTTGCA AATGCCATGG TTAAAATGGC TAATCTTAGT GTTCTTACGG GAACAAATGG ACAAATTCGA  ACTAATTGTG CCAAAGTTAA CTGATTAATT ATTATTCAAA ATCTGTTTTT CTTTTAGCTT TGTAACATGT GTTGAATAAA CTGGCTTATG TGTTCATGTA ATGGAAAATT CTGTTATGAA 
TCGAGTCTTT GTGTACTAAT CACTTTAAGA TGTTATTCAG CGTT 

Retrieve as FASTA