Entry information : CroPrx37(CRO_T001136 / cra_locus_12952_iso_2_len_1120_ver_3)
Entry ID 11302
Creation 2012-09-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx37(CRO_T001136 / cra_locus_12952_iso_2_len_1120_ver_3)
Name CroPrx37(CRO_T001136 / cra_locus_12952_iso_2_len_1120_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx37
start..stop
S start..stop
CroPrx73 494 2e-178 1..322 1..315
CsPrx44 459 3e-164 1..322 1..325
CclPrx41 457 2e-163 1..322 1..325
RcPrx54 454 3e-162 6..322 5..324
Literature and cross-references CroPrx37(CRO_T001136 / cra_locus_12952_iso_2_len_1120_ver_3)
Protein sequence: CroPrx37(CRO_T001136 / cra_locus_12952_iso_2_len_1120_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (300)
PWM (Da):   %s   34970.75 (32387.5) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.4 (8.40) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEGKMYISLF LWFSMAITMV FGQGTRVGFY STSCPRAEAI VQSAVRARFQ TDRTIAPLLL RMHFHDCFVN GCDGSILIDG ANTEKTSIFN VNIRGYDVIE NAKTQLEQAC PGVVSCADIL  ALAARDSVVL TGGPGWAVPT GRRDGRISLA SDVPNNLLGF RDSVDLQKQR FLSKGLNTQD LVALVGAHTI GTTACGTFTY RLNNFVNGSA DPTINPTFLP QLRSQCPAGG DANRVPLDTG 
SENRFDTSFF SNLQNGRGVL ESDQRLWNDI STRTVVQRFL GIRGLLGLTF SIEFTRSMVK MSNIEVKTGA VGEIRRVCSA VN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Prediction is too short for the PS. Incorrect prediction (2 fused ORF and only one Prx)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAGGCA AAATGTATAT TTCTTTGTTT CTTTGGTTTT CCATGGCTAT AACTATGGTG TTTGGCCAAG GAACACGTGT TGGGTTCTAT TCAACTTCAT GTCCACGAGC AGAAGCCATT  GTGCAATCTG CAGTGAGGGC AAGGTTTCAA ACTGATCGTA CGATTGCACC CCTTCTACTT AGAATGCATT TTCATGATTG TTTCGTGAAT GGATGTGATG GTTCTATTCT TATTGATGGT  GCTAATACGG AGAAAACTAG TATTTTTAAC GTTAATATTA GAGGCTATGA CGTTATCGAA AATGCTAAGA CTCAACTTGA ACAAGCATGC CCCGGTGTTG TTTCTTGTGC GGATATTCTT  GCCTTGGCTG CTCGTGATTC TGTTGTTCTG GTATTTTTTT TTTTTTTTTA TCATTTGAAT TTCTAGCTGG TATTATAAAT ACATAAGAAT TATATTGAAT TTGTAACTTT GTATTAATAT  GACGTTAATA TATATACTCA CAATGTGTAG ACGGGTGGAC CTGGATGGGC AGTTCCCACA GGTCGTAGAG ACGGGCGAAT TTCATTAGCG TCTGATGTTC CGAATAATTT GCTCGGATTC  AGAGATTCTG TTGATCTTCA GAAGCAGAGA TTTTTGTCAA AAGGCCTCAA CACTCAAGAT CTCGTTGCTC TTGTTGGTAA TATTCTTTAA CCAAAATCAC ACATATAATT ATCACAACAA  TTTTGCACCA TTCAGTCATT AATTAATTAG AACATAGTTA TTAATGTCTG ACTTATTTCT CATACATATT AGCATAATAG CTTCTCACAT GTCTTTTCAC TCTCATTTAC TAATGAATTT  TGGAAGAAAA GTTAAAATTT TAATAACTCA AACAAAGTAA TACGTCCAAA ATTTTGACAA AGTATAAGTC CAAAGGAAAT GAAAGCAAAA CATTATTTTT AAAAAACTAT ATAATAACAA  ATTTTGGATA ATTTTCAGAC TAAATTTTTC AATTTCTATA AAATATTCGA AATATTAGAG CCAAACTATG ACTGAAAAAT GTTTGAATAA AATTTAACAC TTGACAAAAT CCCACTACAA  CTCTCGTAAT GTAATAACTA CATAGTAATA GTAAAAAGAT CATTTTGAGT GAGTTTTAAG CATATTACCT ATCAATGCAT TCACTGCACC AATTCATTGG TGATACATAT GTTGCTAATT  GATTTTATGT TAAATATGTA GGAGCACACA CTATCGGAAC TACAGCTTGC GGAACCTTCA CTTATAGACT CAACAATTTT GTCAACGGCA GTGCTGATCC AACAATCAAT CCAACATTTC  TTCCCCAACT CCGATCACAA TGTCCAGCAG GTGGCGACGC TAATCGTGTA CCTCTTGATA CCGGCAGCGA AAACAGATTT GACACATCGT TTTTTTCGAA TCTTCAAAAC GGCCGTGGAG  TTTTAGAATC CGATCAGAGA TTGTGGAACG ATATATCTAC TAGAACCGTG GTTCAACGTT TCTTGGGAAT CAGAGGATTG CTAGGGTTGA CATTTAGCAT TGAATTTACA AGATCTATGG 
TGAAGATGAG CAACATTGAA GTTAAGACAG GAGCCGTTGG TGAAATTCGC AGGGTCTGCT CCGCTGTTAA TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAGGCA AAATGTATAT TTCTTTGTTT CTTTGGTTTT CCATGGCTAT AACTATGGTG TTTGGCCAAG GAACACGTGT TGGGTTCTAT TCAACTTCAT GTCCACGAGC AGAAGCCATT  GTGCAATCTG CAGTGAGGGC AAGGTTTCAA ACTGATCGTA CGATTGCACC CCTTCTACTT AGAATGCATT TTCATGATTG TTTCGTGAAT GGATGTGATG GTTCTATTCT TATTGATGGT  GCTAATACGG AGAAAACTAG TATTTTTAAC GTTAATATTA GAGGCTATGA CGTTATCGAA AATGCTAAGA CTCAACTTGA ACAAGCATGC CCCGGTGTTG TTTCTTGTGC GGATATTCTT  GCCTTGGCTG CTCGTGATTC TGTTGTTCTG ACGGGTGGAC CTGGATGGGC AGTTCCCACA GGTCGTAGAG ACGGGCGAAT TTCATTAGCG TCTGATGTTC CGAATAATTT GCTCGGATTC  AGAGATTCTG TTGATCTTCA GAAGCAGAGA TTTTTGTCAA AAGGCCTCAA CACTCAAGAT CTCGTTGCTC TTGTTGGAGC ACACACTATC GGAACTACAG CTTGCGGAAC CTTCACTTAT  AGACTCAACA ATTTTGTCAA CGGCAGTGCT GATCCAACAA TCAATCCAAC ATTTCTTCCC CAACTCCGAT CACAATGTCC AGCAGGTGGC GACGCTAATC GTGTACCTCT TGATACCGGC  AGCGAAAACA GATTTGACAC ATCGTTTTTT TCGAATCTTC AAAACGGCCG TGGAGTTTTA GAATCCGATC AGAGATTGTG GAACGATATA TCTACTAGAA CCGTGGTTCA ACGTTTCTTG  GGAATCAGAG GATTGCTAGG GTTGACATTT AGCATTGAAT TTACAAGATC TATGGTGAAG ATGAGCAACA TTGAAGTTAA GACAGGAGCC GTTGGTGAAA TTCGCAGGGT CTGCTCCGCT 
GTTAATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACTGCAAAT TACAAACCCA AAGTCACTTA AGCAAAATAC CACACACTTG GTGAGCATTA TTATATAATG GAAGGCAAAA TGTATATTTC TTTGTTTCTT TGGTTTTCCA TGGCTATAAC  TATGGTGTTT GGCCAAGGAA CACGTGTTGG GTTCTATTCA ACTTCATGTC CACGAGCAGA AGCCATTGTG CAATCTGCAG TGAGGGCAAG GTTTCAAACT GATCGTACGA TTGCACCCCT  TCTACTTAGA ATGCATTTTC ATGATTGTTT CGTGAATGGA TGTGATGGTT CTATTCTTAT TGATGGTGCT AATACGGAGA AAACTAGTAT TTTTAACGTT AATATTAGAG GCTATGACGT  TATCGAAAAT GCTAAGACTC AACTTGAACA AGCATGCCCC GGTGTTGTTT CTTGTGCGGA TATTCTTGCC TTGGCTGCTC GTGATTCTGT TGTTCTGACG GGTGGACCTG GATGGGCAGT  TCCCACAGGT CGTAGAGACG GGCGAATTTC ATTAGCGTCT GATGTTCCGA ATAATTTGCT CGGATTCAGA GATTCTGTTG ATCTTCAGAA GCAGAGATTT TTGTCAAAAG GCCTCAACAC  TCAAGATCTC GTTGCTCTTG TTGGAGCACA CACTATCGGA ACTACAGCTT GCGGAACCTT CACTTATAGA CTCAACAATT TTGTCAACGG CAGTGCTGAT CCAACAATCA ATCCAACATT  TCTTCCCCAA CTCCGATCAC AATGTCCAGC AGGTGGCGAC GCTAATCGTG TACCTCTTGA TACCGGCAGC GAAAACAGAT TTGACACATC GTTTTTTTCG AATCTTCAAA ACGGCCGTGG  AGTTTTAGAA TCCGATCAGA GATTGTGGAA CGATATATCT ACTAGAACCG TGGTTCAACG TTTCTTGGGA ATCAGAGGAT TGCTAGGGTT GACATTTAGC ATTGAATTTA CAAGATCTAT  GGTGAAGATG AGCAACATTG AAGTTAAGAC AGGAGCCGTT GGTGAAATTC GCAGGGTCTG CTCCGCTGTT AATTAATTTC CTCTTTTGAA TTCTAGATAT TGTCCTTTTT TTTCATTTAA 
AGGAGTAGTT GTATGTTTTG TTTTCTTGTT GAACAGCGTA 

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