Entry information : CroPrx39(CRO_T006500)
Entry ID 11304
Creation 2012-09-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx39(CRO_T006500)
Name CroPrx39(CRO_T006500)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx046]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx39
start..stop
S start..stop
PpePrx23 448 1e-159 5..337 1..333
VvPrx15 446 9e-159 2..336 1..331
PtPrx83 445 3e-158 26..337 30..338
CsaPrx88 428 1e-151 1..336 3..331
Literature and cross-references CroPrx39(CRO_T006500)
Protein sequence: CroPrx39(CRO_T006500)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337
PWM (Da):   %s   37348.63  
PI (pH):   %s   4.64
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLKFMQMLFL FALILAYYCV RSSGNDSPPL VLGYYQETCP AVEEIVQRIV EIAVLKDPRM AASLLRLHFH DCFVMGCDAS VLLDNFGSML SEKQAGPNAN SLRGFEVMDE IKDIIEDTCP  GVVSCADILA IAARDAVSLR GGPTWDVHLG RRDSLTASFN GANQFIPAPN STLDTLIANF HQQGLDTADL VALSGSHTLG KARCLSFKQG IYADKNAAET FGYLERDEMY IKALRSLCPI 
SGKDNILSPL DLETPARFDN QYFENIIEGR GLLISDNVLV VVDDEDSEIR NLVFDYASDQ KYFFDSFVKS MIKMGNINVL TGYNHGEIRR NCRFINS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic . Two times GSHTLGKARCLSF in intron 3
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGAAAT TCATGCAAAT GTTGTTCTTA TTTGCCTTGA TTTTGGCATA TTATTGCGTA AGAAGTTCTG GGAATGATAG TCCTCCTCTT GTTCTTGGCT ATTACCAAGA AACATGTCCT  GCTGTGGAAG AGATAGTGCA GAGAATTGTC GAAATTGCAG TTCTCAAAGA TCCTCGCATG GCTGCCTCCC TCCTACGTCT GCACTTTCAT GACTGTTTCG TTATGGTTTA ACCCCTCTCT  CTCTCTTGCT CTCTCTGCTA TTCATATTCA TACTGTTTTC GCTATTTTCT AACGGTGTGC TTTGTAGGGA TGTGATGCTT CGGTTTTGCT GGACAACTTT GGAAGCATGT TAAGCGAAAA  ACAAGCAGGG CCTAACGCGA ATTCACTGCG AGGATTTGAA GTCATGGATG AAATAAAGGA CATCATAGAA GACACTTGCC CTGGAGTTGT ATCATGTGCT GATATTTTAG CCATTGCTGC  TAGAGATGCC GTTTCATTGG TAGCTTTTCC AACTCTATTT TTATCATTTC GAGTTAAATT TGGTAGTTGT TTGTAGATTA TAAGGACAAA AAAGTTCGAA ATTATTAAGG TTGTCCTTCG  TTATCATGAA ATTTTTGTAT TGCTAGAGAG GAGGACCAAC ATGGGATGTC CATTTAGGCA GAAGAGACTC TCTTACAGCA AGCTTCAATG GTGCTAATCA ATTCATTCCA GCTCCAAACT  CCACTCTTGA TACTCTTATT GCCAATTTCC ATCAACAAGG CCTTGACACT GCTGACTTAG TTGCTTTATC AGGTTCTCTC TCTCTCTCTC TCACTCTTCA TCTATTCTCG TAATGTCAAC  TTGAACTAAA ATCTTTCATT ATCACGCGAT TAGAATTGCC TAAACACGAC AGAATCCATG GTTTGTTCCA TGCATTTGTT ACACATGTTT AGCCGTTTCC TCACATACTT TTGTTACATT  CCACCGAACA AACAGGCAGC CATACATTAG AAAAAGCACA ATGTTTGAGC TTTATCACGT GCATTACACA TGTTCTCTCG TGTTTGGACA AATTTTAGCC GTTTACTCGC ATACTTTTGT  TACATTCCAC ACAATTTTTA GCCGTTTACT CGCATACTTT TGTTACATTC CACCGAACAT GCGGCCATAC ATTAGGAAAA GCGCGATGTT TGAGCTTTAT CACGTGCACT ACACATGTTC  TCTCTTGTTT GGACAGTTTT TAGCCGTTTA CTCACATACT TTTGTCACAT TCCACCGAAC ATGCGGCCAT ACATTAGGAA AAGCGCGATG TTTGAnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnCACAT GTTCTCTCAT GTTTGGACAA TGTTTAGCCG TTTCCTCACA TACTTTTGTT ACATTCCACC AAACAAACAG GCAGCCATAC ATTAGCGCAA  TGTTTGAGCT TTATCACGTG CATTACACAT GTTCTCTTGT GTTTGGACAA TGTTTAGCCG TTTCCTCACA TACTTTTGTT ACATTCCACC GAACAAACAG GCAGCCATAC ATTAGCGCAA  TGTTTGAGCT TTATCACGTG CATTACACAT GTTCTCTCAT GTTTAGATAA TTTTTAGCCG TTTACTCACA TACTTCTGTT ACATTCCGCC AAACAAGCAG CCATACATTA GGAAAAGCGC  GATGTTTGAG CTTTATCATA TGCATTACAC ATGTTCTCTC ATGTTTGGAC AATGTTTAGC CGTTTCCTCA CATACTTTTG TTACATTCCA CCAAACAGGC AGCCATACAT TAGGAAAAGC  GCAATGTTTG AGCTTTATCA CGTGCATTAC ACATGTTCTC TCTTGTTTGG ACAGTTTTTA GCCATTTACT CGCATACTTC TGTTACATTC CACCGAACAA ACAGGCAGCC ATACATTAGG  AAAAGCGCAA TGTTTGAGCT TTATCACGTG CATTACACAT GTCCTCTCAT GTTTGGACAA TGTTTAGCCG TTTCCTCACA TACTTTTGTC ACATTCCACC GAACAAACAG GCAGCCATAC  ATTAGCGCAA TGTTTGAGCT TTATCACGTG TATTACACAT GTTCTCTCAT GTTTGGACAA ATTTTACCCG TTTACTCACC TACTTCTGTT ACATTCCACC GAACAGGGAG CCATACCTTA  GGAAAAGCGC GATGTTTGAG CTTTAAACAA GGCATCTATG CGGATAAGAA TGCTGCAGAA ACATTTGGGT ATCTTGAAAG GGATGAAATG TACATAAAAG CTCTAAGATC ATTGTGTCCT  ATATCAGGTA AAGATAATAT ATTATCACCA CTTGATCTTG AGACACCAGC TAGATTTGAT AATCAATATT TTGAAAACAT AATTGAAGGA AGAGGATTGT TGATTTCTGA TAATGTTCTT  GTTGTTGTTG ATGATGAAGA TTCTGAGATA AGAAATCTTG TTTTTGATTA TGCATCTGAT CAAAAATATT TTTTTGATTC ATTTGTAAAA TCAATGATAA AGATGGGGAA TATTAATGTT 
CTTACTGGAT ATAATCATGG AGAAATTAGG AGAAATTGTA GATTTATTAA TTCATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGAAAT TCATGCAAAT GTTGTTCTTA TTTGCCTTGA TTTTGGCATA TTATTGCGTA AGAAGTTCTG GGAATGATAG TCCTCCTCTT GTTCTTGGCT ATTACCAAGA AACATGTCCT  GCTGTGGAAG AGATAGTGCA GAGAATTGTC GAAATTGCAG TTCTCAAAGA TCCTCGCATG GCTGCCTCCC TCCTACGTCT GCACTTTCAT GACTGTTTCG TTATGGGATG TGATGCTTCG  GTTTTGCTGG ACAACTTTGG AAGCATGTTA AGCGAAAAAC AAGCAGGGCC TAACGCGAAT TCACTGCGAG GATTTGAAGT CATGGATGAA ATAAAGGACA TCATAGAAGA CACTTGCCCT  GGAGTTGTAT CATGTGCTGA TATTTTAGCC ATTGCTGCTA GAGATGCCGT TTCATTGAGA GGAGGACCAA CATGGGATGT CCATTTAGGC AGAAGAGACT CTCTTACAGC AAGCTTCAAT  GGTGCTAATC AATTCATTCC AGCTCCAAAC TCCACTCTTG ATACTCTTAT TGCCAATTTC CATCAACAAG GCCTTGACAC TGCTGACTTA GTTGCTTTAT CAGGGAGCCA TACCTTAGGA  AAAGCGCGAT GTTTGAGCTT TAAACAAGGC ATCTATGCGG ATAAGAATGC TGCAGAAACA TTTGGGTATC TTGAAAGGGA TGAAATGTAC ATAAAAGCTC TAAGATCATT GTGTCCTATA  TCAGGTAAAG ATAATATATT ATCACCACTT GATCTTGAGA CACCAGCTAG ATTTGATAAT CAATATTTTG AAAACATAAT TGAAGGAAGA GGATTGTTGA TTTCTGATAA TGTTCTTGTT  GTTGTTGATG ATGAAGATTC TGAGATAAGA AATCTTGTTT TTGATTATGC ATCTGATCAA AAATATTTTT TTGATTCATT TGTAAAATCA ATGATAAAGA TGGGGAATAT TAATGTTCTT 
ACTGGATATA ATCATGGAGA AATTAGGAGA AATTGTAGAT TTATTAATTC ATAA 

Retrieve as FASTA