Entry information : CroPrx44(CRO_T018307 / cra_locus_25686_iso_1_len_868_ver_3)
Entry ID 11309
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx44(CRO_T018307 / cra_locus_25686_iso_1_len_868_ver_3)
Name CroPrx44(CRO_T018307 / cra_locus_25686_iso_1_len_868_ver_3)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx074]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx44
start..stop
S start..stop
RcPrx26 417 2e-147 12..334 4..326
EgrPrx129 412 2e-145 14..334 10..323
EglPrx130 407 1e-143 14..334 10..323
EgrPrx130 407 1e-143 14..334 10..323
Literature and cross-references CroPrx44(CRO_T018307 / cra_locus_25686_iso_1_len_868_ver_3)
Protein sequence: CroPrx44(CRO_T018307 / cra_locus_25686_iso_1_len_868_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334
PWM (Da):   %s   36335.15  
PI (pH):   %s   8.4
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSLLINIVI GIVLLLVRCC SSSNELKIGY YEKTCPSAEA IVKNTVRKAY ENNDTGIAPA LIRLHFHDCF VRGCDASVLL DSTPGNPAEK DSPSNFGVQG FDLIDEAKSK IESQCPNKVS  CADILAFAAR DAVFIAGGKN YRVPAGRRDG TISSSTDPPK NLPGSFFNIT QLRSNFANKG LSITEMVTLT GAHSIGDSHC SAFSKRLYSF NSSSNSSSQD PSIDSTYADF LKSKCPNLRF 
VSSSGTDPIV PFDPTTPIKL DNNYYKNLKM NKGLLFSDQI LWTSDLTRKM VKNYADNQNN FWANKFAAAM VHMGSIEVLT GNQGEIRKNC RVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. 5' end is missing.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCAGTT TATTGATTAA TATTGTAATT GGCATAGTTT TATTATTGGT AAGATGTTGT TCATCAAGTA ATGAGTTGAA AATTGGGTAT TATGAGAAAA CATGTCCATC AGCAGAAGCT  ATAGTGAAAA ATACAGTGAG AAAAGCTTAC GAAAATAATG ATACAGGGAT TGCTCCTGCC CTCATTCGAC TCCACTTCCA CGACTGTTTT GTTAGGGGTT GTGATGCATC CGTCCTCCTT  GATTCAACAC CAGGCAATCC AGCGGAAAAA GACAGTCCAT CAAACTTTGG AGTTCAAGGC TTCGATTTAA TCGACGAAGC CAAATCCAAA ATTGAATCAC AATGTCCAAA CAAAGTTTCA  TGTGCAGATA TTCTCGCTTT TGCAGCCAGA GATGCCGTTT TCATCGCCGG AGGTAAAAAT TACAGAGTTC CGGCAGGTCG TCGAGACGGA ACAATTTCAT CATCAACTGA TCCACCAAAG  AATCTCCCAG GTTCATTCTT CAATATCACA CAACTCCGAT CAAATTTTGC TAATAAAGGA TTATCAATTA CAGAAATGGT AACCTTAACT GGTGCTCATT CAATCGGGGA TTCTCATTGC  TCTGCTTTTT CTAAACGTTT ATATTCATTC AATTCGAGTT CTAATTCTTC TTCACAAGAT CCGTCGATTG ATTCGACTTA TGCTGATTTC TTAAAAAGTA AATGTCCAAA TCTGAGATTT  GTTTCGAGTT CGGGAACAGA TCCGATTGTG CCTTTTGATC CTACGACACC GATTAAATTA GATAATAATT ATTATAAGAA CTTGAAGATG AATAAGGGGC TGTTGTTTTC TGATCAGATT  CTTTGGACGA GTGATTTGAC AAGAAAAATG GTGAAGAATT ATGCAGATAA TCAAAATAAT TTTTGGGCTA ATAAATTTGC TGCTGCTATG GTACATATGG GTTCTATTGA GGTTCTTACT 
GGTAATCAAG GAGAGATTAG GAAGAATTGC AGGGTTGTGA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCAGTT TATTGATTAA TATTGTAATT GGCATAGTTT TATTATTGGT AAGATGTTGT TCATCAAGTA ATGAGTTGAA AATTGGGTAT TATGAGAAAA CATGTCCATC AGCAGAAGCT  ATAGTGAAAA ATACAGTGAG AAAAGCTTAC GAAAATAATG ATACAGGGAT TGCTCCTGCC CTCATTCGAC TCCACTTCCA CGACTGTTTT GTTAGGGTAT TATTCTATTC ATTCTTCTTC  TTCTTCTTAT TATTAATCTA TTTCTATTGC CTGCACACTC CATTGACGAT TTATGATTTA CAGTGAATCA GGACAAAATG TTGGAGACTG AACACCAATA AAAATTTTGT TAGAATTTCA  TCTACAAAAT AAATTATTCC AAACACAAAA TTATTCAAAC AATTCTGAAA GGATTTGAAT GTAAAAAATA GATAATTTTT AAAGTTTTTA AAATTTTTCG GAGAAAAATT CGAGCCCACC  CGAACTCTTA GTTCTGCCCA TGATGATTTA CAATGACTTA TAAATAGTTT TGTTTATTGT TAGGGTTAAA AATATGCTTT TGGAATATTT TTCAAATTTA TTTTTTATTT ATTGTTAATG  TTAAAAATAA AAATGTTATA TTTTCTCACA TTTTTTATAT TGCGTCTTTT AAAAAATACG AAAATTTTTG AAACATTTTT CTTGTAGTAG TAGGATGAAT TAGAATGCTA TCTAAGACAA  TCCCTCTCTT TCTTTCTTTT TTTTAATAGT GTTCAAAACA ATCTTTCGCC TCATTATTAA TTATTAATTG TATACATTTT TTCTTTTGAA TAAATAATAC AAGAATTAAA AGAAATTAAA  ATTTACTTTT TATGCAAATA CATAATGAAA AAGGTTTATT AAATCATACT GTTTTTACAA AGTGACAAAT AAAAATATGA AAAAGATAAA ATATATTGAG TGAAAACAAA ATGAAGTATT  AATTTTTTTG GGGAAAAAAA CTTTTAAACA TCAATTAATT CAAATGCTCA AAACAAGCAC AAGCACTCGA ATTGCAAAAA AATAGTTTTA ATTACAAAAG TTTTCCATGA GAAAATCATC  TAAGAACATA GTATTAATTC AATTAAGCTT GAATTTAAAA TCTCTCTCCC TGCCGTTTTC AGGGTTGTGA TGCATCCGTC CTCCTTGATT CAACACCAGG CAATCCAGCG GAAAAAGACA  GTCCATCAAA CTTTGGAGTT CAAGGCTTCG ATTTAATCGA CGAAGCCAAA TCCAAAATTG AATCACAATG TCCAAACAAA GTTTCATGTG CAGATATTCT CGCTTTTGCA GCCAGAGATG  CCGTTTTCAT CGCCGGAGGT AAAAATTACA GAGTTCCGGC AGGTCGTCGA GACGGAACAA TTTCATCATC AACTGATCCA CCAAAGAATC TCCCAGGTTC ATTCTTCAAT ATCACACAAC  TCCGATCAAA TTTTGCTAAT AAAGGATTAT CAATTACAGA AATGGTAACC TTAACTGGTG CTCATTCAAT CGGGGATTCT CATTGCTCTG CTTTTTCTAA ACGTTTATAT TCATTCAATT  CGAGTTCTAA TTCTTCTTCA CAAGATCCGT CGATTGATTC GACTTATGCT GATTTCTTAA AAAGTAAATG TCCAAATCTG AGATTTGTTT CGAGTTCGGG AACAGATCCG ATTGTGCCTT  TTGATCCTAC GACACCGATT AAATTAGATA ATAATTATTA TAAGAACTTG AAGATGAATA AGGGGCTGTT GTTTTCTGAT CAGATTCTTT GGACGAGTGA TTTGACAAGA AAAATGGTGA  AGAATTATGC AGATAATCAA AATAATTTTT GGGCTAATAA ATTTGCTGCT GCTATGGTAC ATATGGGTTC TATTGAGGTT CTTACTGGTA ATCAAGGAGA GATTAGGAAG AATTGCAGGG 
TTGTGAATTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCAGTT TATTGATTAA TATTGTAATT GGCATAGTTT TATTATTGGT AAGATGTTGT TCATCAAGTA ATGAGTTGAA AATTGGGTAT TATGAGAAAA CATGTCCATC AGCAGAAGCT  ATAGTGAAAA ATACAGTGAG AAAAGCTTAC GAAAATAATG ATACAGGGAT TGCTCCTGCC CTCATTCGAC TCCACTTCCA CGACTGTTTT GTTAGGGGTT GTGATGCATC CGTCCTCCTT  GATTCAACAC CAGGCAATCC AGCGGAAAAA GACAGTCCAT CAAACTTTGG AGTTCAAGGC TTCGATTTAA TCGACGAAGC CAAATCCAAA ATTGAATCAC AATGTCCAAA CAAAGTTTCA  TGTGCAGATA TTCTCGCTTT TGCAGCCAGA GATGCCGTTT TCATCGCCGG AGGTAAAAAT TACAGAGTTC CGGCAGGTCG TCGAGACGGA ACAATTTCAT CATCAACTGA TCCACCAAAG  AATCTCCCAG GTTCATTCTT CAATATCACA CAACTCCGAT CAAATTTTGC TAATAAAGGA TTATCAATTA CAGAAATGGT AACCTTAACT GGTGCTCATT CAATCGGGGA TTCTCATTGC  TCTGCTTTTT CTAAACGTTT ATATTCATTC AATTCGAGTT CTAATTCTTC TTCACAAGAT CCGTCGATTG ATTCGACTTA TGCTGATTTC TTAAAAAGTA AATGTCCAAA TCTGAGATTT  GTTTCGAGTT CGGGAACAGA TCCGATTGTG CCTTTTGATC CTACGACACC GATTAAATTA GATAATAATT ATTATAAGAA CTTGAAGATG AATAAGGGGC TGTTGTTTTC TGATCAGATT  CTTTGGACGA GTGATTTGAC AAGAAAAATG GTGAAGAATT ATGCAGATAA TCAAAATAAT TTTTGGGCTA ATAAATTTGC TGCTGCTATG GTACATATGG GTTCTATTGA GGTTCTTACT 
GGTAATCAAG GAGAGATTAG GAAGAATTGC AGGGTTGTGA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCAGTT TATTGATTAA TATTGTAATT GGCATAGTTT TATTATTGGT AAGATGTTGT TCATCAAGTA ATGAGTTGAA AATTGGGTAT TATGAGAAAA CATGTCCATC AGCAGAAGCT  ATAGTGAAAA ATACAGTGAG AAAAGCTTAC GAAAATAATG ATACAGGGAT TGCTCCTGCC CTCATTCGAC TCCACTTCCA CGACTGTTTT GTTAGGGGTT GTGATGCATC CGTCCTCCTT  GATTCAACAC CAGGCAATCC AGCGGAAAAA GACAGTCCAT CAAACTTTGG AGTTCAAGGC TTCGATTTAA TCGACGAAGC CAAATCCAAA ATTGAATCAC AATGTCCAAA CAAAGTTTCA  TGTGCAGATA TTCTCGCTTT TGCAGCCAGA GATGCCGTTT TCATCGCCGG AGGTAAAAAT TACAGAGTTC CGGCAGGTCG TCGAGACGGA ACAATTTCAT CATCAACTGA TCCACCAAAG  AATCTCCCAG GTTCATTCTT CAATATCACA CAACTCCGAT CAAATTTTGC TAATAAAGGA TTATCAATTA CAGAAATGGT AACCTTAACT GGTGCTCATT CAATCGGGGA TTCTCATTGC  TCTGCTTTTT CTAAACGTTT ATATTCATTC AATTCGAGTT CTAATTCTTC TTCACAAGAT CCGTCGATTG ATTCGACTTA TGCTGATTTC TTAAAAAGTA AATGTCCAAA TCTGAGATTT  GTTTCGAGTT CGGGAACAGA TCCGATTGTG CCTTTTGATC CTACGACACC GATTAAATTA GATAATAATT ATTATAAGAA CTTGAAGATG AATAAGGGGC TGTTGTTTTC TGATCAGATT  CTTTGGACGA GTGATTTGAC AAGAAAAATG GTGAAGAATT ATGCAGATAA TCAAAATAAT TTTTGGGCTA ATAAATTTGC TGCTGCTATG GTACATATGG GTTCTATTGA GGTTCTTACT  GGTAATCAAG GAGAGATTAG GAAGAATTGC AGGGTTGTGA ATTAAGAAAT TTGGACATTG TATGGTTTTA TTGCTAGATT TTGAATTTTT GTGTTGCTTT ATATTTCTGT TTGATTTATT 
TTTCTTGTTT GTGTTTAATA ATATATAGTA TGAACTAAAT AAAAGAGGGT GTATGTACT 

Retrieve as FASTA