Entry information : CroPrx45(CRO_T013859)
Entry ID 11310
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx45(CRO_T013859)
Name CroPrx45(CRO_T013859)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx030]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx45
start..stop
S start..stop
CsPrx39 459 1e-163 16..338 18..332
EgrPrx73 457 3e-163 38..338 25..325
EcamPrx73 457 5e-163 38..338 25..325
EguPrx73 453 9e-162 38..338 25..325
Literature and cross-references CroPrx45(CRO_T013859)
Protein sequence: CroPrx45(CRO_T013859)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339 (135)
PWM (Da):   %s   36129.88 (14937.4)  
PI (pH):   %s   5.63 (4.29) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-156
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAIRFLRTTT HLCIALFMVC VCSLFASYCC SSTSGGGSGL LSFDFYRGSC PAAEMIVQNT VRSASSQDPT IPGKLLRLLF HDCFVEGCDA SILLQGDGTE RNDPANKSLG GFSVIDSAKR  VLEIFCPGIV SCADILALAA RDSVQLTGGP SVGIPTGRRD GRSSMGSKVR ENIIDTSFSL EEMIKIFSAK GLSLDDLVTL SGAHTIGSAH CSAFSDRFKL DSNGNLTLMD SSLDRNYAAE 
LTKQCAAGAT SNATVNNDPS TPLLFDNQYY KHLLIHKGLF QSDSVLASDE RTIATVQGFA DNQNLFFQSW GLSFLRLTSI GVKTGDDGEI RVACGAINA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATCA GATTTTTAAG AACAACAACT CATTTATGCA TAGCGTTATT TATGGTTTGT GTTTGTAGTT TGTTTGCATC ATACTGTTGT TCTTCTACTA GCGGCGGCGG CAGCGGCCTC  CTCTCATTTG ACTTCTATCG AGGTTCATGT CCAGCAGCAG AAATGATAGT TCAAAATACT GTGAGATCAG CTTCATCTCA AGACCCAACA ATTCCCGGAA AACTTCTTCG ATTGCTTTTT  CATGATTGTT TTGTAGAGGT ACGCCATTCT TTATGTTTAG AAACATTTCT TAGGGCATTT TCAACCGAAA CTGCATTTCA TCAATTTGGA TGCAAAAAAT GGAGTGTTTA CAGTATCACG  TCAAAACTAG GACTAGCCGA ACCCTATCTT GGGAGGGGAG GGTTCTTGGT TAGTTTTTTT AATTTTTGTT TGGTTAAAAT GAGTGTTGCT CCTTCAACAT TTTCATTAAA TTGATTTACT  TATTTTTATA AATATTAAAA ATATTGAATT TTTACAATTA ATAAAATGTG TAAAAAATCA AATATTGAAT TTTACTTCTA TAAATATTTT TAATTTTTAA CAATTATAAT TTGATTTATT  TATTTTTTAA AAATTAATGT TTATAATTCA AAATACTTGT TTTTTTCAAA CTCCAAGGGT TTTCCTTTTA TTAGCAAATT TTAATTGAAT CAAAATTTAA TTTAATAAAT AAATATATTA  CTTGGATATT GATAATTTTG GGGTAAAAAT AGATTACACA TGAGCTGGAG TGTAGTGAAA GTACTGTAAA TACTACATTC TAATATAATA TGTACAACAT TTATACTTCT TAGAGTCTTA  GGTTAGAGAT GGCCTGATTT TTTTTTTTTT TTTGGGTGCC AAATAGTTTT GAAATATACT TTTAATGGGA TTTTATTTTA AACTAATTAA TATGCATATA GGGATGTGAT GCTTCAATAT  TATTACAAGG AGATGGAACA GAACGAAATG ACCCAGCAAA CAAGTCTCTT GGAGGATTTT CGGTAATTGA TTCAGCCAAA AGAGTGTTAG AAATATTTTG CCCTGGAATT GTTTCTTGTG  CTGATATTCT GGCTTTGGCT GCTAGAGATT CTGTTCAATT GGTAATTTCA ATTTACTCAA TTTCATGCCT TATATTTGCA TTTAAAAAAG AAAAATACTA ACAAAAATTT AGCCGTCAAA  TCTATTTTTT TAATACACTT TTTTTAATAT GTAATGGCGC AGACAGGAGG TCCAAGTGTA GGGATTCCAA CAGGAAGGAG AGACGGAAGG AGTTCAATGG GTTCAAAAGT GAGAGAAAAT  ATAATAGATA CAAGTTTTAG TTTGGAAGAA ATGATCAAAA TTTTCTCAGC TAAGGGTCTA TCCCTGGATG ACCTTGTTAC CCTCTCAGGT AAGGCAATTA ACTAATTTTA TTTTTTGCCC  ATATCTTTTT TTGTTGTTTT TCTTTTTCAG TATTTATTTT GCAGAGTTTA TATCTCAAGT AATATGCAAC TACTTTAAAT GCAAACATTA TCATATAATA TGGACACAGT GCTGTGACTC  AAATTTCAAG AGAGAAAAAC TAGTGAAAAA TTAAAGGAAA GACTAAATGG AGTTGAACTA AAAAGAAATG TAAGAAATAA TGAAGAAAAG GGCTGGAATT GTATGTATGA GATTGAGACA  CAGTTGTTTC TTGCTTCATC ATTTCTCTTA ATATATATAT ATATATATAT ATTGTGTCCA CCATACACTT CACTTCCTAA ACGAAAAGAG TGTAATTCAG CTGGACGAGC AACTATGGGA  TCAATTATTC TTCTGTCTCA TCTCTTACGG CTGGACGAGT GTATTTTATA AGTGTCAACA TTAATCAATA ATTAAATTGG TATCACATTG AAAATTGAGG TGGAAACTTC CAATCCTTTG  CCATTCCTAA TATGATGATT GTTGGACTGC AAAATTAATT TATTTATGGG GTTAGTAAAA TTAACTCAGT AATCTAAAAA TTAAATATAA AAAAATTTAA AAAATTTCAT TTTTACAAAA  AGTTTTTCTC TCTACCTCCT ATTCTCTCTA ACACCAATTT ATTCAATCTC AGATCTATGC AAATTTGACC ATTGAAAATT AAAAnAAAAA AAAAAAAAAA AAAGAGAGTA GTACATTGAT  CTATACTCAT TTATTTATAA TTTTATCGGT TTAAAATTTA AAAAAAATGC ACCAAATTGA AAATAAAATT TGACCGAAAT TCAACAAAGA TAAATGCAAC CGGTCACATT TCGGTGCAAA  AAATTTGTTC CGTAAAGTTC AAAAACTTTG ACGGGACATA ACTTTTGTGC TTAGATGTCC GATCGAGGAG ATTATTGTGG GCATTTTGCG TATTTTTTGA AGATTCTACG TGTATACTTG  TGACCACACA TGGTTTCCAT CAACCGTTTC TACAAAAAAG TCATATTTTC ATTTTAATTT ATATTTTTAG AATTTTTTAA TAATTTTTCT TTCATTGACT AAAAACGTAC GGTACAAATT  TTAAATTTAA ACTGAATATC AGTTTTTTTT TATTAAAAAT TTAAATGATT GAAGTTGGTA AATATTGAAA TACATAAATA TATTATTATT AAATAAAATC TCATGAAATT ATTAGTATGA  AATTTCATGT TGGTGTTATG GTATGTTTTT TATGTTGCTT TTTGTTAGGT CAATGGTTCA AATCTCACAA AGTTATTATT GTTATTATTA TTATTATTAT TATTATTATT ATTATTATTA  TTATTATTTT GATAAATCAC AAGTAGCTTC TTAACTAACA AAAAAACTAA ATAACGTAAA CAAATACACA TAAATTTAAA CATAATTAAC ATAATTTTTT TTTAAAAAAA AACCAAACTG  TTTAATTTCA TCCAGACTGG CGAAATTCTT TGTTGAATTT CGGTCAATAT TTTTTTTCAA TCCGGTGTTT TTTTGAATTT TAAACCGATA AAATTGTAAA TAAATGAGTA TAGATTGATG  TATTACTTAT TTTTTAAAAA TAATTTTCAA CGGTTAGATT TGCATGAGTT GGTGTTAGAG AGAATAGGAG GTAGAAATTT TTTTTTTGGA AAATGAAAAT TTTTGAATTT TTCCGTGCTA  AACTTTTTGA TTCTCGAGTT AGTTTTATCG TTTCCTTATG TGTCATCTCT ATCTAGTACT TCTCATTTTT TTACTCTGTC ACATTTTAGA TATTATAATT TTTAAGAAAA TACAGAATTT  TAAATATATT TTTTTCTTAC ATAAACTAGA ATATCTTTAA AACTTTTCTC TTTTTTTATT ATTATTTTTA CAAGTTTCAC GTTAGAAGAA CAAAAAGATG TTATAATAAG AAAAAAATGA  TTAAATATAA CCTTTAAACT ACAATATGAT AAGTAAAAAA ACATGAAAAA TAACGCAATA TAACATGTAA AAAAAAATCG GAGGAATTAC TATGGAAAGT TGTAAGGTGC ACTAAGCAAA  AATGTATTTA ATTTGTAGGA GCTCACACGA TAGGATCAGC TCATTGTAGT GCATTCAGCG ACCGCTTCAA GCTTGACTCA AACGGAAACC TTACACTGAT GGATTCCTCC TTAGATCGTA  ATTATGCAGC TGAGCTAACA AAACAGTGTG CAGCAGGTGC AACTTCAAAT GCAACAGTGA ACAATGATCC ATCTACTCCA CTACTATTTG ACAATCAATA TTACAAACAT CTTTTGATCC  ATAAGGGCCT CTTTCAATCT GATTCTGTGC TTGCATCTGA TGAAAGAACA ATTGCTACAG TTCAAGGCTT TGCTGATAAT CAAAACTTGT TTTTTCAGAG TTGGGGGTTG TCTTTCTTGA 
GACTTACTAG TATTGGAGTC AAGACTGGTG ATGATGGTGA GATTAGGGTT GCTTGTGGAG CTATTAATGC TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATCA GATTTTTAAG AACAACAACT CATTTATGCA TAGCGTTATT TATGGTTTGT GTTTGTAGTT TGTTTGCATC ATACTGTTGT TCTTCTACTA GCGGCGGCGG CAGCGGCCTC  CTCTCATTTG ACTTCTATCG AGGTTCATGT CCAGCAGCAG AAATGATAGT TCAAAATACT GTGAGATCAG CTTCATCTCA AGACCCAACA ATTCCCGGAA AACTTCTTCG ATTGCTTTTT  CATGATTGTT TTGTAGAGGG ATGTGATGCT TCAATATTAT TACAAGGAGA TGGAACAGAA CGAAATGACC CAGCAAACAA GTCTCTTGGA GGATTTTCGG TAATTGATTC AGCCAAAAGA  GTGTTAGAAA TATTTTGCCC TGGAATTGTT TCTTGTGCTG ATATTCTGGC TTTGGCTGCT AGAGATTCTG TTCAATTGAC AGGAGGTCCA AGTGTAGGGA TTCCAACAGG AAGGAGAGAC  GGAAGGAGTT CAATGGGTTC AAAAGTGAGA GAAAATATAA TAGATACAAG TTTTAGTTTG GAAGAAATGA TCAAAATTTT CTCAGCTAAG GGTCTATCCC TGGATGACCT TGTTACCCTC  TCAGGAGCTC ACACGATAGG ATCAGCTCAT TGTAGTGCAT TCAGCGACCG CTTCAAGCTT GACTCAAACG GAAACCTTAC ACTGATGGAT TCCTCCTTAG ATCGTAATTA TGCAGCTGAG  CTAACAAAAC AGTGTGCAGC AGGTGCAACT TCAAATGCAA CAGTGAACAA TGATCCATCT ACTCCACTAC TATTTGACAA TCAATATTAC AAACATCTTT TGATCCATAA GGGCCTCTTT  CAATCTGATT CTGTGCTTGC ATCTGATGAA AGAACAATTG CTACAGTTCA AGGCTTTGCT GATAATCAAA ACTTGTTTTT TCAGAGTTGG GGGTTGTCTT TCTTGAGACT TACTAGTATT 
GGAGTCAAGA CTGGTGATGA TGGTGAGATT AGGGTTGCTT GTGGAGCTAT TAATGCTTGA 

Retrieve as FASTA