Entry information : CroPrx47(CRO_T029396 / cra_locus_31772_iso_1_len_485_ver_3)
Entry ID 11312
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx47(CRO_T029396 / cra_locus_31772_iso_1_len_485_ver_3)
Name CroPrx47(CRO_T029396 / cra_locus_31772_iso_1_len_485_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx033]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx47
start..stop
S start..stop
PpePrx68 399 4e-140 8..326 10..327
MePrx79 394 2e-138 3..324 7..323
HaPrx24 391 3e-137 5..325 6..324
CclPrx109 389 2e-136 5..325 8..324
Literature and cross-references CroPrx47(CRO_T029396 / cra_locus_31772_iso_1_len_485_ver_3)
Protein sequence: CroPrx47(CRO_T029396 / cra_locus_31772_iso_1_len_485_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   35016.12 Transmb domain:   %s   o5-27i
PI (pH):   %s   8.91
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVTAINLAL GLIFFININI IGRSNGALQV GFYKGKCNSA DVENVIFQVV KTQFIKDSTI AAALLRMQFH DCWINGCDAS ILVDGNNSEK TAFANAGVRG YEIIDLAKAA VEAICPSLVS  CADIVAIATR DAVSLSGGGK YAVETGRRDG TVSLSKNVNF ISSAASISTA LTAFASKGFN STDLVFLLGA HSIGSANCFF IQNRLYNFQN TRKPDPTMDS NLQKKLGRTC PQTRPPNGRV 
NLDQNPTSSM ILDNSYYKQI LLHRGILDID QELALDPLTN ATVAALANGK LEFSSKFGEA MVKLGKLQVL TGNQGQIRKS CRIVNKT 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST.(3' end is missing). Incorrect orediction (two Prxs fused)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTCA CAGCCATTAA TCTTGCCTTA GGGTTGATCT TCTTCATTAA TATTAATATT ATTGGTCGAT CTAATGGTGC ATTGCAGGTT GGATTTTACA AAGGCAAATG CAATTCTGCA  GATGTTGAAA ATGTTATTTT CCAAGTTGTT AAGACACAGT TCATTAAGGA TTCTACAATT GCTGCTGCCC TTTTACGTAT GCAATTTCAT GATTGTTGGA TCAACGTAAG AAACTCTCTT  TCCAATATTT CTGGTTGCCC TTTCACATTT TTATGTTTCT TTAAATTGGG ACTTATTATT ATTTTGTTGA CATCACTTAT GATATTAACA TTTTTATATG TAAGTTAAAA ATGTCAAAAA  AATTAAGCTG AATCCGATCA GTTTTTGTGA TGGAAATAAT CTCATGCAAT GTATGAATTT TGTTAAGTAA ATAATTTATT TTGTCATCTT ATAACAGAAT ATTTTATAAC AGAATTCGTG  CATTGCATAT GATTATTTTT GTCAAAACTA ATCAAATTTA ATTGTATTTT GACACTTTTA ACTACATATA AAAATGTTGG TGGCGTAAAT AGTGACAAAA AAAATATGAA GGACATTTTT  TTAAAATATA TTCCCTCTTT TTTATTAATA TAAATTATGT TCTACCTAAA GAGGCACATC TTTTTTTTTT TTTTTTTCTT TTATGGAAAA CGCCACACAA ATACAAGTTG TGAATAAAAT  GTTGAAACTA AAATTTACTT TTTTTAAACT ATTTACATTT AATCAGTCAT TCCTTTTTTT AAGACATATT TTACTATAAA ATTATTTATA GAATGTTATT TATATGTCAT TTGCTTTCAA  AATCAGGTTA TTTTGACACA ATAATTGACT AATGTACGTG ATTATATAAG AAATAAATGA ATAATTTTAT TACTTAATAG TATGACATCA TGTCAATTAA TTGACAAACA TAACCAAATT  TTGAAGGTAA ATAAAATAAA CGCGATACCT TATAAATATT TCAAAAGTAA AACATATTTT AAAAAGGATT TACGATTTAA TGGGTTAAAT ATAAATAGTT CGAGAATAGT TTTAGTCATT  TTCTCTAAAA AAAAAATTAT GTATACTATA AACACACAAT TAAAAAATTG TTGTGGGTTG GAATATTAGA AGAATTGTTT AATGTGAAAT CTAACAATTT GTTTAAAATT GAATTTTGTT  GTTGATGATG ATAAAAAGGG GTGTGATGCA TCCATTCTAG TAGATGGAAA CAACAGTGAG AAAACTGCAT TCGCGAATGC AGGAGTTAGA GGTTATGAAA TTATTGATTT AGCGAAAGCT  GCTGTTGAAG CAATCTGTCC ATCTTTGGTT TCTTGTGCTG ATATCGTTGC TATAGCCACA AGAGATGCTG TTTCCCTGGT ATAATTACAA TAAAAGCCCA CCTGGCAGTA AATTAAATTA  AATTTGTTTA TGTTGTGATA ATATTGTGTG TATTATTTTA GAAAGTGAAT TTGATTATAT GCATATGCAG AGTGGAGGAG GAAAATACGC AGTAGAAACG GGAAGAAGAG ATGGGACAGT  TTCCCTCTCT AAAAATGTTA ATTTCATATC TTCTGCAGCT TCAATATCTA CAGCTCTCAC TGCATTTGCC AGCAAAGGAT TTAACTCCAC TGACTTGGTT TTTCTTCTTG GTAATAATTT  CATTTCCATG CAATCAGCAT CATCCATTTT CCTTGTTACT TCTTTCAAAC TCATAATTAT TTTTCCAATA ATTATTATAC TTATATGCTA ATTACAGTTA GAATGAGATA TTTAATTTAT  TTGAATGGCT AAGATTTATA TAATTTTTTT TTTAATAGGT TGAAGGAACG AATTTGAAAA ATTACATCTC TAAAACGAAA AAATATATAT ATATATATAT CTAGAAATAA GTGAAAAGCT  AAGTCCTATA TATATATATA TATTCATGTA ATCTTAATAT TCTGTCTAAA CTCTATAATT TTAGTTTGAA AACTATATAT ATATATATTT TTTAAATATT AATCGTCACT ATCCTTTTAG  GCTTTTAAGG ACAGAATCCA ACAAATTCAT GTACATGATG TTTTTATGAG TTACTTGACT CCCCGACCAA ATAGAATAAT GTTAATAATT AACTAGAATT CAAACTTTCT CTCTAAAAAT  CATACATACA TCCTCCCACT CTTATACATA TATATTTTTT GAATTCTAAT TCTATAATTT TTTTGAACGT TCAAACAAAT GAATTAGAAT TAGAAAATAA ATTACATAGC AATTCTATAA  TTTTATCAAA CAAAAAAATA GGAATTATAA TTTTTAAAAT TATATATAAT GCCAATCCAA TTTTAAGAAT TAAACACATT AAATATCTAT AAAAACAACT CAAATATATT TTTTTTTTAT  GTTCACTTAA TTGGATGTAA AAAAAATTAT AAATAAATTA TTCAACTTTT CTCATAACTC GTATAAGTGA CATGTGCAGA AATTTGGACA AATTTGCCAA AAAGTAATGG TCCAGGCTAA  TATCTTTTTT AAAAAAATTA GCTTCAGGAT TAAATTATAA AAAATAGTCT TCGAACTATT ATAAGACAAA TTCAATACTA AGGACTTATT TTCTATTTTT TTAAGAAAAT AATTTTAAAA  TGTGGACCCA GCACATGATT CCATCTATAT AATTTTACCA AGACGATTGG GAAAATATAT TTTTATCCCA ACATATATAT TAATTTGTTT GTTGGATGTT ATTCGTAACA ATTAATTTTA  TTATTTTTTA TTCTTAACAA TATATGCAAT TTTTTTTTTT AATTCTTCTT GACATCTTTG ATTGATTCGT TTCTAAATGT GTTAATTCCA TTCAATTTTA AACTTTGTTA ATCTTAAGTA  GTTGAATTCA TTAATCTAGA ATTGATCATG TAAATTTATT AAAGATAAAA AGGAAAATAA AATTATTCGC TAACGAACTA ACAAACAAAG AAAAATATGT TGGAGAAAAA AAAATATTTT  TCCCATATTG TAATTTGTCC TAATGCGATA TATATGTACA TTTTTATCAC TTCAGGTGCA CATTCAATTG GAAGCGCTAA TTGTTTCTTC ATCCAAAACC GGCTCTACAA CTTCCAAAAC  ACGAGAAAAC CCGACCCAAC AATGGATTCA AATCTTCAGA AGAAACTGGG AAGAACTTGT CCTCAAACCA GACCACCTAA CGGTCGGGTT AATCTGGATC AAAACCCGAC CAGTTCAATG  ATACTCGATA ATTCTTATTA CAAACAAATT TTATTACATA GAGGAATTTT GGATATCGAT CAAGAATTAG CATTGGACCC ATTGACAAAT GCCACCGTAG CAGCCTTAGC TAATGGGAAA 
CTAGAATTTT CAAGTAAATT TGGTGAAGCA ATGGTTAAAC TTGGGAAACT CCAAGTTCTT ACTGGAAACC AAGGACAGAT TAGGAAATCA TGTCGGATAG TAAACAAGAC TTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTCA CAGCCATTAA TCTTGCCTTA GGGTTGATCT TCTTCATTAA TATTAATATT ATTGGTCGAT CTAATGGTGC ATTGCAGGTT GGATTTTACA AAGGCAAATG CAATTCTGCA  GATGTTGAAA ATGTTATTTT CCAAGTTGTT AAGACACAGT TCATTAAGGA TTCTACAATT GCTGCTGCCC TTTTACGTAT GCAATTTCAT GATTGTTGGA TCAACGGGTG TGATGCATCC  ATTCTAGTAG ATGGAAACAA CAGTGAGAAA ACTGCATTCG CGAATGCAGG AGTTAGAGGT TATGAAATTA TTGATTTAGC GAAAGCTGCT GTTGAAGCAA TCTGTCCATC TTTGGTTTCT  TGTGCTGATA TCGTTGCTAT AGCCACAAGA GATGCTGTTT CCCTGAGTGG AGGAGGAAAA TACGCAGTAG AAACGGGAAG AAGAGATGGG ACAGTTTCCC TCTCTAAAAA TGTTAATTTC  ATATCTTCTG CAGCTTCAAT ATCTACAGCT CTCACTGCAT TTGCCAGCAA AGGATTTAAC TCCACTGACT TGGTTTTTCT TCTTGGTGCA CATTCAATTG GAAGCGCTAA TTGTTTCTTC  ATCCAAAACC GGCTCTACAA CTTCCAAAAC ACGAGAAAAC CCGACCCAAC AATGGATTCA AATCTTCAGA AGAAACTGGG AAGAACTTGT CCTCAAACCA GACCACCTAA CGGTCGGGTT  AATCTGGATC AAAACCCGAC CAGTTCAATG ATACTCGATA ATTCTTATTA CAAACAAATT TTATTACATA GAGGAATTTT GGATATCGAT CAAGAATTAG CATTGGACCC ATTGACAAAT  GCCACCGTAG CAGCCTTAGC TAATGGGAAA CTAGAATTTT CAAGTAAATT TGGTGAAGCA ATGGTTAAAC TTGGGAAACT CCAAGTTCTT ACTGGAAACC AAGGACAGAT TAGGAAATCA 
TGTCGGATAG TAAACAAGAC TTAG 

Retrieve as FASTA