Entry information : CroPrx48(CRO_T023568)
Entry ID 11313
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx48(CRO_T023568)
Name CroPrx48(CRO_T023568)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx48
start..stop
S start..stop
CroPrx68 477 3e-171 12..315 38..341
VvPrx27 469 2e-168 6..315 25..332
VvPrx28 465 1e-166 6..315 26..333
VvPrx39 464 2e-166 6..315 15..322
Literature and cross-references CroPrx48(CRO_T023568)
Protein sequence: CroPrx48(CRO_T023568)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   315
PWM (Da):   %s   34510.46  
PI (pH):   %s   9.19
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANYYSSSST SLSVGFYYKS CPAAESIVRR VVNKAVQRNP GIGAGLIRMH FHDCFVRGCD GSILLDTVLG RSEVSEKDHP ANNPSLRGFE VIDEAKTQIE SICPNTVSCS DILAFAARDS  SLKLGGITYS VPSGRRDGHI SSFSEVTENL PPPFFNAKQL EENFKRKGLS LDEMVTLSGA HSIGVSHCSS FSNRLYNFNS THKQDPELNR VYATFLKKKC PPPRENGPDP TVDIEVITPN 
RLDNKFYVNL KSHRGLLTSD HTLLSSASTA KLVLNNAKYG KLWASKYAAA MVKMGSIDVL TGKNGEIRKN CRFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAATT ATTATTCATC ATCATCAACA TCACTTAGTG TTGGGTTTTA CTACAAATCA TGTCCAGCTG CTGAGTCAAT TGTTAGAAGA GTTGTGAACA AAGCCGTCCA AAGAAACCCT  GGCATTGGTG CCGGACTAAT CAGGATGCAT TTTCATGACT GCTTTGTTAG GGTAAGTTCA ATTATATTTT ATTTATTCCT AACTAATTAG TTTAAAAATT ACCCGCCATT CTTTTTTTGA  CAGAATCTAA CAATATTCTT GCATGTATTA CTTATATAGT TTACACCGAC TATGAGTATA ATAGTCAATC TCTAACATTT TCTTCTAAGT GTTGGGACAT AAGTCACTTA CATATCCCTT  CCGTATTCAC TTAATAGGAA ATATATATAT ATATATATAT AAAGCAAAAT TTTAAGAGAT ACATTATTTT AACCCCAAAT CAATTTATAT ATACAAGTGT ACTTACATCT ATGATTTCCC  ATATACTATC TTAAAAATAG TGGTTAAAAC TAAAATATTT TACGAAAAAA TAATTTTAGA ACTAAAATGA CTGTAAAAAT AGTTTTCCAA TTAAGTTAAG ATTGAATAAT AATTTTAAGA  TTAATTTTAC TGAATTTTCA AGTAAACATT ACGAAAAATT TTTAAAAAAT TTGAAAGCGG CTACATTAGT ATAACTCTCT GTCCTTTTAG TTCCTTCCTT GAAACTGATC ATTTCAATAT  AATCCAGGGA TGTGATGGTT CTATACTACT AGACACGGTA CTCGGAAGAT CAGAAGTGAG TGAGAAAGAC CATCCGGCTA ACAATCCAAG TCTACGAGGA TTCGAGGTTA TTGATGAAGC  AAAAACTCAA ATAGAATCCA TATGTCCAAA CACCGTCTCA TGTTCAGACA TTCTTGCCTT TGCTGCCCGC GATAGCTCCC TTAAACTCGG AGGAATAACA TACTCAGTCC CTTCCGGACG  CCGAGATGGA CATATTTCTT CGTTTTCCGA AGTTACCGAA AATCTCCCTC CTCCTTTCTT TAATGCCAAA CAACTTGAAG AAAATTTCAA AAGAAAAGGA TTATCACTTG ATGAAATGGT  TACCCTTTCT GGGGCACATT CAATTGGGGT CTCACATTGT TCTTCTTTCT CGAATCGGCT TTATAATTTT AATTCTACAC ATAAACAAGA TCCGGAGTTG AACCGGGTTT ATGCTACTTT  CTTGAAAAAG AAGTGCCCTC CACCAAGGGA AAATGGTCCT GATCCAACGG TAGATATTGA AGTGATTACA CCAAATCGAT TGGATAATAA ATTTTATGTG AATTTGAAGA GTCATAGGGG  ATTATTAACT TCAGATCATA CGTTGTTGAG TAGTGCTTCC ACTGCTAAGT TGGTTTTGAA TAATGCTAAA TATGGTAAAT TATGGGCTTC TAAATATGCT GCTGCCATGG TAAAAATGGG 
TTCTATTGAT GTCCTCACTG GTAAGAATGG GGAGATCCGG AAAAATTGCC GTTTTGTGAA TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAATT ATTATTCATC ATCATCAACA TCACTTAGTG TTGGGTTTTA CTACAAATCA TGTCCAGCTG CTGAGTCAAT TGTTAGAAGA GTTGTGAACA AAGCCGTCCA AAGAAACCCT  GGCATTGGTG CCGGACTAAT CAGGATGCAT TTTCATGACT GCTTTGTTAG GGGATGTGAT GGTTCTATAC TACTAGACAC GGTACTCGGA AGATCAGAAG TGAGTGAGAA AGACCATCCG  GCTAACAATC CAAGTCTACG AGGATTCGAG GTTATTGATG AAGCAAAAAC TCAAATAGAA TCCATATGTC CAAACACCGT CTCATGTTCA GACATTCTTG CCTTTGCTGC CCGCGATAGC  TCCCTTAAAC TCGGAGGAAT AACATACTCA GTCCCTTCCG GACGCCGAGA TGGACATATT TCTTCGTTTT CCGAAGTTAC CGAAAATCTC CCTCCTCCTT TCTTTAATGC CAAACAACTT  GAAGAAAATT TCAAAAGAAA AGGATTATCA CTTGATGAAA TGGTTACCCT TTCTGGGGCA CATTCAATTG GGGTCTCACA TTGTTCTTCT TTCTCGAATC GGCTTTATAA TTTTAATTCT  ACACATAAAC AAGATCCGGA GTTGAACCGG GTTTATGCTA CTTTCTTGAA AAAGAAGTGC CCTCCACCAA GGGAAAATGG TCCTGATCCA ACGGTAGATA TTGAAGTGAT TACACCAAAT  CGATTGGATA ATAAATTTTA TGTGAATTTG AAGAGTCATA GGGGATTATT AACTTCAGAT CATACGTTGT TGAGTAGTGC TTCCACTGCT AAGTTGGTTT TGAATAATGC TAAATATGGT 
AAATTATGGG CTTCTAAATA TGCTGCTGCC ATGGTAAAAA TGGGTTCTAT TGATGTCCTC ACTGGTAAGA ATGGGGAGAT CCGGAAAAAT TGCCGTTTTG TGAATTGA 

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