Entry information : CroPrx59(CRO_T000492 / cra_locus_27841_iso_1_len_941_ver_3)
Entry ID 11325
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx59(CRO_T000492 / cra_locus_27841_iso_1_len_941_ver_3)
Name CroPrx59(CRO_T000492 / cra_locus_27841_iso_1_len_941_ver_3)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx005]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx59
start..stop
S start..stop
NtPrx62-1A 450 1e-160 4..323 7..324
EgrPrx163 444 4e-158 1..323 1..326
NtPrx62-1B 443 5e-158 1..323 1..324
EcamPrx163 440 1e-156 1..323 1..326
Literature and cross-references CroPrx59(CRO_T000492 / cra_locus_27841_iso_1_len_941_ver_3)
Protein sequence: CroPrx59(CRO_T000492 / cra_locus_27841_iso_1_len_941_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326
PWM (Da):   %s   35442.18  
PI (pH):   %s   9.79
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSKLNLSILF LIQLAVVAYG QGLSPYFYQK SCPDLEKIVR QTMGDFINRA PSLAGPLLRM HFHDCFVRGC DGSVLLNSTK GKAAEKDAPP NLTLRAFHVI DAVKLAVEKR CPNLVSCADI  LALVARDAVS MMNGPSWKVP LGRRDGRISR SNDALNNLPA PTFNFAQLKA AFASKGLNVK DLVVLSGGHT IGVSHCSSFE QRLYNFTGKG DTDPSMDQNY IAALKKKCKA GDTTTIVEMD 
PGSSKAFDIS YFSVVSKRRG LFQSDSALLT NTQTKNYLTQ HLSNPAGTSS FFSDFVESMI KMSKIGVLTG KQGEIRKQCA FVNFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (mismatch with DNA). Incorrect prediction (two ORF fused encoding for two PrxS)..
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGAAAC TTAATCTCTC CATTTTGTTT CTAATTCAAC TAGCTGTTGT TGCCTATGGA CAAGGGTTGA GTCCCTATTT TTACCAGAAG AGCTGTCCAG ACTTGGAGAA AATTGTGAGG  CAGACAATGG GGGATTTTAT CAATAGGGCT CCTAGTCTTG CTGGTCCATT GTTGAGAATG CATTTTCATG ACTGTTTTGT TAGGGTAAGT TTTAATTTGA TTTATCTTTT CCAACTTCTC  CCATAAAATC TATGTTTCAA CTCAATTAGG TTATCTTCTC AATTATTCAA AACAAGCAAC TTTTCATTTA TTTTACGTTA GGAAAAATGG CTATATATAG CCTTAAAACT ATTTATCTTT  TCATGCAAAA ACTATTTCAA CACTATAAAT ATATATAGCA ATTTAAATAT TTTGCAATAG AATTCGGTGC ATTTTGATAC ATACGTGGAT TCAATAGAAT AGTAAAAAAT AACTAAATCC  TTTAAGTTAT GTTGTAAAAA TATACCAAAA AAAAAAAAAA AACACTCGAT AATGCTATGA AATCATGAAT TGTTATGAAC TTGTAATGTT AAAAATAGTT CATGGATAAA AAAAAATTCT  TGGCTATAAA TAACTAAAAT AAAAGTTCAT AATTACAAAG AGAAAAGTAA AAATAGTTTA AGCTTATATA GCTAATTTCT TCTTTACATT TAAGTTATTT TTAAATTGTT TAATACATAT  CCTTTTACTT TAAGGTTTTA TTTTTGAAAA GTTAGCCAAA AAATTCAAGA TAAATTTATA AAATTTAATT TGTTACAAAT TTTCATGAAG TAAATCATTC TTTAGTGAAA TTAACGAGGT  GAATTTCATG CATTTCTTAA AGGGTTGCGA TGGTTCAGTA TTACTAAACT CTACAAAGGG AAAAGCCGCA GAAAAAGATG CACCTCCAAA CCTAACTCTC AGAGCATTTC ATGTCATTGA  TGCTGTGAAA TTAGCAGTGG AGAAAAGATG TCCTAATCTC GTCTCTTGTG CTGATATTCT TGCTTTGGTA GCCCGTGATG CTGTTTCAAT GGTATGATTC ATTTGGGATA TGTAATTTCA  AAGAGTAATA AATTAAAATT AATATATATA TATATATATG ATTTTCTTTA TTTATATTTT GTAGATGAAT GGACCATCAT GGAAAGTTCC CTTAGGAAGG AGAGATGGAA GAATCTCAAG  ATCTAATGAT GCCCTAAATA ATCTTCCTGC ACCAACTTTC AACTTTGCTC AATTAAAAGC AGCATTTGCC TCCAAGGGTT TGAATGTTAA AGACCTCGTT GTTCTCTCAG GTAGTTTCCA  ATTATATATA TATATATATA TTTTTTCCCT TCCGTTAATA AAATGTAACA TGTAAAAAAA TAAGCGGCAT ATATATAATT GTTCGTCTAC TTTTAGATAA TAAGTTTTCA TGTAGAAAGG  AAGGAAAAAT TAACAAAAAC GAATTATATC TAAATTTTTT TATTTATTTT AGCCCGACAA CTATTTATTC TATCCAAGTT TGGCCTAAAT CTTTTATTTA TTCATTTTAG TCCAAATGTT  ATTTATCTAA AAATATGAAA ATATGACATT GAGGACCTTC ACAAAAACCA TATTAATCAA CGATTTATTT CTGTGAGAAT TTAAAATAGT CAATTTCTAA ATGGTAAATC TCATTTGAAT  CACTTGTAGC TAAAATATAA ATCTAAATTT TATAAAATAA AATTACAAAT TTATTAACTT CAACCTTTTA AGTTTAGGAA TAGCAGCATT ATATGTATCG ATTTTTTACC CTTTTTTGGC  TATAAATATA ACTAAAAAGT TCTTAAAAAA AATTCTTGTT TTTCTAGGTT CTAAAATAAC TATTTCTTTG CAGGAGGTCA TACAATTGGA GTCTCTCATT GCAGTTCCTT CGAACAAAGA  CTATATAATT TCACAGGAAA AGGGGATACA GATCCAAGTA TGGATCAAAA CTACATTGCC GCTTTAAAGA AAAAATGCAA GGCAGGAGAC ACAACAACAA TTGTGGAAAT GGATCCTGGA  AGTTCTAAAG CCTTTGATAT TTCTTACTTT AGTGTTGTGA GCAAAAGAAG AGGTCTTTTT CAATCAGATT CTGCTCTTTT AACTAACACT CAAACCAAGA ATTATTTGAC GCAACATTTG  AGTAATCCTG CTGGAACATC AAGTTTCTTC AGTGATTTTG TTGAATCAAT GATAAAGATG AGTAAGATTG GAGTTCTTAC TGGGAAGCAA GGAGAAATTA GGAAGCAATG TGCCTTTGTT 
AATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGAAAC TTAATCTCTC CATTTTGTTT CTAATTCAAC TAGCTGTTGT TGCCTATGGA CAAGGGTTGA GTCCCTATTT TTACCAGAAG AGCTGTCCAG ACTTGGAGAA AATTGTGAGG  CAGACAATGG GGGATTTTAT CAATAGGGCT CCTAGTCTTG CTGGTCCATT GTTGAGAATG CATTTTCATG ACTGTTTTGT TAGGGGTTGC GATGGTTCAG TATTACTAAA CTCTACAAAG  GGAAAAGCCG CAGAAAAAGA TGCACCTCCA AACCTAACTC TCAGAGCATT TCATGTCATT GATGCTGTGA AATTAGCAGT GGAGAAAAGA TGTCCTAATC TCGTCTCTTG TGCTGATATT  CTTGCTTTGG TAGCCCGTGA TGCTGTTTCA ATGATGAATG GACCATCATG GAAAGTTCCC TTAGGAAGGA GAGATGGAAG AATCTCAAGA TCTAATGATG CCCTAAATAA TCTTCCTGCA  CCAACTTTCA ACTTTGCTCA ATTAAAAGCA GCATTTGCCT CCAAGGGTTT GAATGTTAAA GACCTCGTTG TTCTCTCAGG AGGTCATACA ATTGGAGTCT CTCATTGCAG TTCCTTCGAA  CAAAGACTAT ATAATTTCAC AGGAAAAGGG GATACAGATC CAAGTATGGA TCAAAACTAC ATTGCCGCTT TAAAGAAAAA ATGCAAGGCA GGAGACACAA CAACAATTGT GGAAATGGAT  CCTGGAAGTT CTAAAGCCTT TGATATTTCT TACTTTAGTG TTGTGAGCAA AAGAAGAGGT CTTTTTCAAT CAGATTCTGC TCTTTTAACT AACACTCAAA CCAAGAATTA TTTGACGCAA  CATTTGAGTA ATCCTGCTGG AACATCAAGT TTCTTCAGTG ATTTTGTTGA ATCAATGATA AAGATGAGTA AGATTGGAGT TCTTACTGGG AAGCAAGGAG AAATTAGGAA GCAATGTGCC 
TTTGTTAATT AA 

Retrieve as FASTA