Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
247 |
PWM (Da): |
26343.41 |
Transmb domain: |
o322-341i368-390o405-422i453-475o503-525i692-709o |
PI (pH): |
9.9 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MASAPFSAAFSAPSYxFRRAGTNGNSPFPTSLWSPAALRVPSSIRSSLGSCNSAFLVNGLSSSSLQSSSRLSFSSRSSGVYARAATEKTLYDFSVKDIDxNDVSxSKFKGKVLLIVNVAS KCGLTTSNYKELSHVYEKYKTQGFEILAFPCNQFGGQEPGSNPEIKQFACTRFKAEFPIFDKVxVNGPGTAPVYQFLKSSAGGFLGELVKWNFEKFLVDKNGKVVERYPPTTSPFQIEKD IQKLLAA |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic.
scaffold_3_9764 (14813..11716) |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCCTCGGCCCCTTTCTCGGCCGCTTTCTCCGCCCCTTCGTACNGCTTCCGTCGAGCCGGAACGAATGGGAACTCCCCCTTTCCGACCTCCCTTTGGTCGCCGGCCGCTCTTCGCGTG CCGTCATCGATTCGATCCTCGCTCGGTTCGTGTAATTCGGCTTTTCTCGTTAATGGGTTGTCGTCGTCGTCCCTTCAGAGTTCGTCGCGGCTCAGCTTCAGTTCTCGCTCGTCGGGTGTT TATGCTAGAGCTGCCACTGAGAAGACCCTCTACGATTTCAGCGTGAAGGTATCGAATTTCTCTTCTGGGTGTAGCTGAAATTGGTATTTGGAGAGATCTTCTTTTTTGGGTCGTCAGGGA ACTTTGTAATTCACTTAGATACGGTGTTTTTATGTATTTATTTATCTTCGGTAGAATCAAGCAATTCTGATGGCTTGCCCAAGCTACTTTGGAAATTAGAAAAAANANATATCTTAATTG TCTCAGCCGCCACACTGTTTTTTGCATCTTCTCTGTTTTATTGTTACTTTTGGATGACGAGGAAGCACATTTTANCTACTTAACATTGGTGCTTCCAATTTGGANTAAAAGAAATCAAGC TGGAGTTGAGGTCGCTTATTTGCTCTTTGTTCATGAATTGAACTAATTTGCAAATTCTCCACGGTATGCAAATCCTTAGAATTAAGATTCATGCTGTTGTGGCTAAAAATTCTTCGTTGT TTTGGCACCTGCTATGTTTCGGTAATTTATGTGGACATTATTATACTATTCATTTTTCNGTTTACATACTGAATTTTGGGTAAAGCTGCTTTATTCATGATAATTGCTAATTGCTGCACA CATTTTTCTTCATGGTTCAGGAGACATTGATAGNAATGATGTTTCANTGAGCAAATTCAAGGGAAAAGTCTTATTAATTGTGAACGTAGCTTCGAAATGGTAATTGCTTTATCTCCTTCA GTTGTCTGATTTAATTTATCAGATGTACAGTCTCATTGAAGAATTTTCTTGTGATTCAGTGTGGTTTAACGACATCAAACTACAAGGAGCTCTCNCACGTATATGAGAAGTACAAGACTC AAGGTGAGATGAGATTGTGAGGAGAGTTATAGAATTCCTTAAAAGCTTCTCCNGTTTGAAGTTAGACTACTATCTTTGAGCTAGGAGNGATCATTAATTTGTAAATATAGTAGATGAAAT CATGATTCAGCAAAGGATGTGAATCACCTTATTATATCAGTGTCTTTTTCCAATCATNGGAAAATGTACAATATCAATGGAGTTTTGTCTGTCCTACACNCCAAAAGATTCANGTGGAAG TTCTGTTCAAGTTCTCAAGACCATCTAATTAGGAGCTGAATTTCCCTTAACAACAAGTCACATCGATCATTATGCTTCTCACTTATAGTTTTTTTAATGATATGGGCTCCAACCAGAATT TAATCTTCTCAAGCAAGCTTTGNTTAGTTTGCCCTGTGGTACTGGGTCTTACACAGATTGCTAAAGGGATTGTCCAATGGTCTTTGCTGCGGTTGAGTGTNACAGTGTGCTAGAAATCAG TTGTCCTTTATTTTTCCGTGGGACTTTTATCAGTGTTTTTTCCAGTCCATTTNCAGGTGTTATATTTTGTCAATCATGTTTGTTACATCTTCTTTTTNGTACTCTTGCACATTTACGAAG GGCACAGTTAGAGATGCTTCCTTTGTGTGTGTGTGTACGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGTAGTATATCCTGGATGGATGGATGAATGGATGGGGTGATAGGGGTAGAGAAAGAGAGATGT ACCTCCACTGATGAAAAGGAAGGGTTCTTTGTTTTGATGCAAGGAGAGAGACATAGAGAGGGAGAGGCCTATTGCCTCTACCGCAAGGGTGGGATGGCTGTTTCTTTGCTGGGATGGAAA CAGTGGGAGACCTCCACTGATGAAAGGAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGNNNNGGGGGTGGGGGGGAGCTATATATTTTGCTATATCCGAGAGACAGGAAGAGATCCACTTC TTAGAGAGTGAAATAAGTTCTTTGCTTTGATTCAAGGAGAGAGCTATAGAGAGGGAGAGACCTATTGCCTCTACTGGAAGGGTGGGATGGCTGTTTCTTTGCTGGGATGGAAAGAGTGGG AGACCTTTTTCCTCTGATCTAATGTATAGCTTGAATCTTCTATGCGGATTTGGATTTGGTTAGTCCTCTTTCTATATCTTTAAAATTGATAAGAAACACCTNGGGCTGTCCATGTTACAG GTGTTTTGAAATTCTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTGGTGGCCAGGAGCCTGGTTCAAATCCTGAGATTAAACAATTCGCTTGTACAAGGTTTAAAGCAGAGTTTCCGATTTTTGATAA GGTTTGACTTCCACACATACATTCTTTCCTCTATTTTAAGTGATGGCTGGAATGAACAACCAAGCTCAAGTCTGTTGGAAACAGGTGTTGANGTTAATGGACCAGGTACAGCTCCTGTGT ATCAGTTTCTGAAATCGAGTGCAGGAGGTTTTTTGGGTGAACTGGTCAAGTGGAACTTTGAGAAGTTTCTGGTTGACAAAAATGGCAAAGTTGTGGAGAGATATCCTCCAACAACGTCTC CTTTTCAAATAGAGGTACGTTTTTTAAGCTAACTTGTGAAGTTCGGAGATATNCCTAAGTAATCGATGTTCTGAAGTATGGCAATTGCTTGCTATCATGACTGCATGGAGATGGTTACNG TCTTGTATGTTGTGTGACTGTATATCCGGTGTGCTTTTGTAATCGTTCACCATGCCGTTCCCATAGAAAAAGCTGGTCCCTATTCTTTCCCTTTCTGAGGCAGAGTTTTGTATGTTCATT GTAACTTCAGTGNGTTCTCAATNCACTAATTCNCCTGGGTCACCGACNATGATAAGTTTTTACACCTCCCATTCANCAGAAAGGNGGTCTATATGTCANGTTCAATAATTCTAGAAGAAA AGACCAACAAAAGACTATCTTCAAGCCTCAGAATGATTTGAGNAGTTCTTTCGATTAACNTTCNCGAGTCTTCTTGCAGAAAAGGACATTCAGAAGCTTCTTGCTGCT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCCTCGGCCCCTTTCTCGGCCGCTTTCTCCGCCCCTTCGTACNGCTTCCGTCGAGCCGGAACGAATGGGAACTCCCCCTTTCCGACCTCCCTTTGGTCGCCGGCCGCTCTTCGCGTG CCGTCATCGATTCGATCCTCGCTCGGTTCGTGTAATTCGGCTTTTCTCGTTAATGGGTTGTCGTCGTCGTCCCTTCAGAGTTCGTCGCGGCTCAGCTTCAGTTCTCGCTCGTCGGGTGTT TATGCTAGAGCTGCCACTGAGAAGACCCTCTACGATTTCAGCGTGAAGGACATTGATAGNAATGATGTTTCANTGAGCAAATTCAAGGGAAAAGTCTTATTAATTGTGAACGTAGCTTCG AAATGTGGTTTAACGACATCAAACTACAAGGAGCTCTCNCACGTATATGAGAAGTACAAGACTCAAGGTTTTGAAATTCTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTGGTGGCCAGGAGCCTGGT TCAAATCCTGAGATTAAACAATTCGCTTGTACAAGGTTTAAAGCAGAGTTTCCGATTTTTGATAAGGTTGANGTTAATGGACCAGGTACAGCTCCTGTGTATCAGTTTCTGAAATCGAGT GCAGGAGGTTTTTTGGGTGAACTGGTCAAGTGGAACTTTGAGAAGTTTCTGGTTGACAAAAATGGCAAAGTTGTGGAGAGATATCCTCCAACAACGTCTCCTTTTCAAATAGAGAAGGAC ATTCAGAAGCTTCTTGCTGCT |
Retrieve as FASTA
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