Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
|
Length (aa): |
247 |
PWM (Da): |
26343.41 |
|
PI (pH):
| 9.9 |
|
Sequence 288
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MASAPFSAAFSAPSYxFRRAGTNGNSPFPTSLWSPAALRVPSSIRSSLGSCNSAFLVNGLSSSSLQSSSRLSFSSRSSGVYARAATEKTLYDFSVKDIDxNDVSxSKFKGKVLLIVNVASKCGLTTSNYKELSHVYEKYKTQGFEILAFPCNQFGGQEPGSNPEIKQFACTRFKAEFPIFDKVxVNGPGTAPVYQFLKSSAGGFLGELVKWNFEKFLVDKNGKVVERYPPTTSPFQIEKDIQKLLAA |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic. scaffold_3_9764 (14813..11716) |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCCTCGGCCCCTTTCTCGGCCGCTTTCTCCGCCCCTTCGTACNGCTTCCGTCGAGCCGGAACGAATGGGAACTCCCCCTTTCCGACCTCCCTTTGGTCGCCGGCCGCTCTTCGCGTG CCGTCATCGATTCGATCCTCGCTCGGTTCGTGTAATTCGGCTTTTCTCGTTAATGGGTTGTCGTCGTCGTCCCTTCAGAGTTCGTCGCGGCTCAGCTTCAGTTCTCGCTCGTCGGGTGTT TATGCTAGAGCTGCCACTGAGAAGACCCTCTACGATTTCAGCGTGAAGGTATCGAATTTCTCTTCTGGGTGTAGCTGAAATTGGTATTTGGAGAGATCTTCTTTTTTGGGTCGTCAGGGA ACTTTGTAATTCACTTAGATACGGTGTTTTTATGTATTTATTTATCTTCGGTAGAATCAAGCAATTCTGATGGCTTGCCCAAGCTACTTTGGAAATTAGAAAAAANANATATCTTAATTG TCTCAGCCGCCACACTGTTTTTTGCATCTTCTCTGTTTTATTGTTACTTTTGGATGACGAGGAAGCACATTTTANCTACTTAACATTGGTGCTTCCAATTTGGANTAAAAGAAATCAAGC TGGAGTTGAGGTCGCTTATTTGCTCTTTGTTCATGAATTGAACTAATTTGCAAATTCTCCACGGTATGCAAATCCTTAGAATTAAGATTCATGCTGTTGTGGCTAAAAATTCTTCGTTGT TTTGGCACCTGCTATGTTTCGGTAATTTATGTGGACATTATTATACTATTCATTTTTCNGTTTACATACTGAATTTTGGGTAAAGCTGCTTTATTCATGATAATTGCTAATTGCTGCACA CATTTTTCTTCATGGTTCAGGACATTGATAGNAATGATGTTTCANTGAGCAAATTCAAGGGAAAAGTCTTATTAATTGTGAACGTAGCTTCGAAATGGTAATTGCTTTATCTCCTTCAGT TGTCTGATTTAATTTATCAGATGTACAGTCTCATTGAAGAATTTTCTTGTGATTCAGTGGTTTAACGACATCAAACTACAAGGAGCTCTCNCACGTATATGAGAAGTACAAGACTCAAGG TGAGATGAGATTGTGAGGAGAGTTATAGAATTCCTTAAAAGCTTCTCCNGTTTGAAGTTAGACTACTATCTTTGAGCTAGGAGNGATCATTAATTTGTAAATATAGTAGATGAAATCATG ATTCAGCAAAGGATGTGAATCACCTTATTATATCAGTGTCTTTTTCCAATCATNGGAAAATGTACAATATCAATGGAGTTTTGTCTGTCCTACACNCCAAAAGATTCANGTGGAAGTTCT GTTCAAGTTCTCAAGACCATCTAATTAGGAGCTGAATTTCCCTTAACAACAAGTCACATCGATCATTATGCTTCTCACTTATAGTTTTTTTAATGATATGGGCTCCAACCAGAATTTAAT CTTCTCAAGCAAGCTTTGNTTAGTTTGCCCTGTGGTACTGGGTCTTACACAGATTGCTAAAGGGATTGTCCAATGGTCTTTGCTGCGGTTGAGTGTNACAGTGTGCTAGAAATCAGTTGT CCTTTATTTTTCCGTGGGACTTTTATCAGTGTTTTTTCCAGTCCATTTNCAGGTGTTATATTTTGTCAATCATGTTTGTTACATCTTCTTTTTNGTACTCTTGCACATTTACGAAGGGCA CAGTTAGAGATGCTTCCTTTGTGTGTGTGTGTACGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGTAGTATATCCTGGATGGATGGATGAATGGATGGGGTGATAGGGGTAGAGAAAGAGAGATGTACCT CCACTGATGAAAAGGAAGGGTTCTTTGTTTTGATGCAAGGAGAGAGACATAGAGAGGGAGAGGCCTATTGCCTCTACCGCAAGGGTGGGATGGCTGTTTCTTTGCTGGGATGGAAACAGT GGGAGACCTCCACTGATGAAAGGAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGNNNNGGGGGTGGGGGGGAGCTATATATTTTGCTATATCCGAGAGACAGGAAGAGATCCACTTCTTAG AGAGTGAAATAAGTTCTTTGCTTTGATTCAAGGAGAGAGCTATAGAGAGGGAGAGACCTATTGCCTCTACTGGAAGGGTGGGATGGCTGTTTCTTTGCTGGGATGGAAAGAGTGGGAGAC CTTTTTCCTCTGATCTAATGTATAGCTTGAATCTTCTATGCGGATTTGGATTTGGTTAGTCCTCTTTCTATATCTTTAAAATTGATAAGAAACACCTNGGGCTGTCCATGTTACAGGTTT TGAAATTCTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTGGTGGCCAGGAGCCTGGTTCAAATCCTGAGATTAAACAATTCGCTTGTACAAGGTTTAAAGCAGAGTTTCCGATTTTTGATAAGGTTTG ACTTCCACACATACATTCTTTCCTCTATTTTAAGTGATGGCTGGAATGAACAACCAAGCTCAAGTCTGTTGGAAACAGGTTGANGTTAATGGACCAGGTACAGCTCCTGTGTATCAGTTT CTGAAATCGAGTGCAGGAGGTTTTTTGGGTGAACTGGTCAAGTGGAACTTTGAGAAGTTTCTGGTTGACAAAAATGGCAAAGTTGTGGAGAGATATCCTCCAACAACGTCTCCTTTTCAA ATAGAGGTACGTTTTTTAAGCTAACTTGTGAAGTTCGGAGATATNCCTAAGTAATCGATGTTCTGAAGTATGGCAATTGCTTGCTATCATGACTGCATGGAGATGGTTACNGTCTTGTAT GTTGTGTGACTGTATATCCGGTGTGCTTTTGTAATCGTTCACCATGCCGTTCCCATAGAAAAAGCTGGTCCCTATTCTTTCCCTTTCTGAGGCAGAGTTTTGTATGTTCATTGTAACTTC AGTGNGTTCTCAATNCACTAATTCNCCTGGGTCACCGACNATGATAAGTTTTTACACCTCCCATTCANCAGAAAGGNGGTCTATATGTCANGTTCAATAATTCTAGAAGAAAAGACCAAC AAAAGACTATCTTCAAGCCTCAGAATGATTTGAGNAGTTCTTTCGATTAACNTTCNCGAGTCTTCTTGCAGAAGGACATTCAGAAGCTTCTTGCTGCT |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCCTCGGCCCCTTTCTCGGCCGCTTTCTCCGCCCCTTCGTACNGCTTCCGTCGAGCCGGAACGAATGGGAACTCCCCCTTTCCGACCTCCCTTTGGTCGCCGGCCGCTCTTCGCGTG CCGTCATCGATTCGATCCTCGCTCGGTTCGTGTAATTCGGCTTTTCTCGTTAATGGGTTGTCGTCGTCGTCCCTTCAGAGTTCGTCGCGGCTCAGCTTCAGTTCTCGCTCGTCGGGTGTT TATGCTAGAGCTGCCACTGAGAAGACCCTCTACGATTTCAGCGTGAAGGACATTGATAGNAATGATGTTTCANTGAGCAAATTCAAGGGAAAAGTCTTATTAATTGTGAACGTAGCTTCG AAATGTGGTTTAACGACATCAAACTACAAGGAGCTCTCNCACGTATATGAGAAGTACAAGACTCAAGGTTTTGAAATTCTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTGGTGGCCAGGAGCCTGGT TCAAATCCTGAGATTAAACAATTCGCTTGTACAAGGTTTAAAGCAGAGTTTCCGATTTTTGATAAGGTTGANGTTAATGGACCAGGTACAGCTCCTGTGTATCAGTTTCTGAAATCGAGT GCAGGAGGTTTTTTGGGTGAACTGGTCAAGTGGAACTTTGAGAAGTTTCTGGTTGACAAAAATGGCAAAGTTGTGGAGAGATATCCTCCAACAACGTCTCCTTTTCAAATAGAGAAGGAC ATTCAGAAGCTTCTTGCTGCT |
Retrieve as FASTA
|
|