Entry information : EguPrx[P]47
Entry ID 11508
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-01-22 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-21 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EguPrx[P]47
Name EguPrx[P]47
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx297]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguPrx[P]47
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]47 590 0 1..323 1..323
EglPrx[P]47 589 0 1..323 1..322
EcamPrx[P]47 425 5.64e-151 1..323 1..316
EglPrx48 400 8.1e-141 20..313 22..318
Literature and cross-references EguPrx[P]47
Protein sequence: EguPrx[P]47
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (304)
PWM (Da):   %s   32477.71 (30386.5)  
PI (pH):   %s   9.27 (9.07) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKMITIFLGF VFLLPLGLGN LKVGFYNSTC PRAESIVHQV VQxRFQADRS ITAALLCMHF HECFVRGCDA SILIDSTDSN PLKKxAAPNL TVRGFEIIDE AKKNIEASCP SMxSxADIIT  LATRYAVFxA GGPSYDVATG RRDGxISARD EVNLPGPTFS VSxAQRAFAA KGFTLTEMVx LLxGHTIGIA HYxRPYxRFM GTGAPDRSMD PSLIMKLKVT CGASSSSDPT VSLDQSTPSx 
VDNxFYSEIL xKRGILQIDQ ELTVxKSSxA IVAKFGLDAN xxRxxFxNAM VKMSNVGVLT GNAGxIRKNC RVFQLARxLR QLG 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from genomic.

scaffold_1_2076 (2002..4522)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGATGA TAACTATCTT TCTCGGGTTC GTTTTTCTTC TTCCTCTGGG TTTGGGCAAT CTGAAGGTCG GCTTCTACAA CTCTACTTGC CCGCGAGCTG AGTCCATTGT CCATCAGGTC  GTGCAGAnTC GATTCCAAGC CGACCGATCC ATCACGGCnG CCTTGCTCTG CATGCATTTC CACGAATGTT TCGTTAGAGT AAGTTTCGTG CATGTGTGTT TGGACACnTG CTCTCnATGC  TAGGATGTAA ACGTATAAAC ATCATATCAT AAAATTGATT TATCTATCAT TnTAACGAAA TGTGAATAAA TTCTTAAATA GGTCAGTCnT TTTTAAATGT TTAGTGAAAG TCTCTACATC  AATCATTTTT GTGTCTTCAA GCATACGTTA nTCAAAGATG ATTAGAATCC ATGTGCAATT TATAGATAGT TTATGGGTTC TATAGAGTAT ATGTCTCCGT TTGGATAATA AAAAAAAATT  GGCATGAAAG GACACTTAAG TGCCAAAAGT TAGGAAAGTG ACACTTAAGT ACCAAAATTG AATCAATTAA GTGCCAACGG CGAGAAAATT CGACTAAAAT GTTGACATGG CGATTTTTCG  ACAAGACAAG TGCAAAACGA CGATGTTTTG CACGCTGATG TGATTAGGCA AATGTAAAAA CAACTTCGTT TTGTTACTGA CGTGGCTAAA TAAATAATAT AAAAATTTAT TAAATTAAAT  TTAAAACTAA TTTTCTTTAA AAAAAAAAAA AAGGGGAAGA AGATGATAGC TGCTGAGGGC TTAACCCTCT TTGTTGTCAC CTCCCCATCG TTGATGGGAA GGGCCGATAA CAGTGGGGGG  AGGGTCTGTC GGGGTCATTA GCCCTGGCCA GGGGTCGACG ACCTTGATCA ATTGGCAATG AGGGCCTACG AGCCCTCGCC TAGATCCGAC GAGGGTCGCT AGCCCTTGCT CAGCTGGGTC  AAGAGCCGTC GCTTGCTGGG GGGCCAAGAC CAGCGACCTC GGCTGACCAT CCCCCAATCG TCGTCGACCC TTCTCCACAA CAACAGGGAG GGGGCGGCGA CAAGGGTTGT GCCTTAGCCG  TTGTTCATCT TCTTCTTCTT CTTCTTCTTC TCTCTCTCTC TCTnnnnnnn TCTCTCTCTC TCTCTTTAAT TTAATATAAT TTAATTAATT TTTAAAATCA AATTCAAATC TGTGCCAAAA  CGACGTCTTT TTTGCATTTT TTTTGCTGAG TTAGCTCTTT GATTTGCATT TTTTTTGCTG AGTTAGCTCT TTGATGAGTC ACATAAATGA GCAAAATTAA TTAAAAATTG CCATGTATGA  TTTTCAGCGA GGTGTTTCGG AAGTGACATT CGAGTGTCCC ATTTTTATAA AAAAAGTAGT ACTTAAGTGT CACTTTCCTA ATTTTTTGTA CTTAAGTGTC TCATAGTGCC AAATTTTGGC  GCTCGCGGTG TTCTTTTGTT TTGTATAGAG TATTTGTCTC CATTTGAATA CATATTTGTG GAAATTAGAG ATTGCATGGA TACTGTGATA TATGTGTAAT ATATGTGCAA TTTCnAGAGA  TATGGATAAT CAAnAGAATT ATTATnATTA ACTCTAATAT AGGAAATTCT CCAAAGAAAT CCCTAATTAT CTCTAACAAn TAGTAAATGT AGTCTAGCCA ATCATTTGAT GAAAGAGCAC  GGTATTAACn nGCCATGATT CTTCCTATCA CGATGTCCAC TAATTTACTC CTACTTCCTT CnTCTCATTT AGGGTTGTGA CGCATCCATA CTCATAGACT CTACCGACAG CAATCCATTG  AAGAAAnCCG CCGCCCCGAA CCTAACTGTn CGAGGCTTCG AAATCATTGA CGAAGCCAAG AAGAACATCG AAGCCTCATG CCCTTCGATG nTCTCCTGnG CCGACATCAT AACTTTGGCA  ACACGGTACG CGGTCTTCTT nGCAGGAGGG CCTAGCTATG ATGTCGCGAC GGGAAGGCGA GATGGCATnA TCTCGGCCCG CGACGAAGTT AACTTGCCnG GACCGACATT CTCGGTGTCT  nAGGCTCAAC GAGCCTTCGC AGCAAAAGGA TTCACTCTTA CCGAAATGGT CAnTCTCTTG GnTGGACACA CCATTGGAAT CGCTCACTAC TnnAGACCAT ATCnCAGATT TATGGGTACC  GGCGCTCCGG ACCGATCCAT GGACCCAAGC TTGATCATGA AGCTCAAGGT CACCTGTGGT GCTTCATCAA GTAGCGACCC GACCGTGTCC TTGGACCAGA GCACACCGTC CATnGTCGAT  AACAnGTTCT ATAGCGAGAT TCTTGnGAAG AGAGGGATAT TGCAAATTGA TCAGGAGCTC ACTGTTGAnA AATCGAGCAn GGCAATCGTC GCTAAGTTCG GGTTGGACGC AAATnGAnTT  AGGCnGAnTT TTGnAAACGC GATGGTGAAG ATGAGCAATG TCGGAGTTCT AACAGGAAAT GCTGGAnAGA TTAGGAAAAA CTGTAGGGTT TTCCAACTAG CTAGAnTGCT CCGCCAGTTA 
GGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGATGA TAACTATCTT TCTCGGGTTC GTTTTTCTTC TTCCTCTGGG TTTGGGCAAT CTGAAGGTCG GCTTCTACAA CTCTACTTGC CCGCGAGCTG AGTCCATTGT CCATCAGGTC  GTGCAGAnTC GATTCCAAGC CGACCGATCC ATCACGGCnG CCTTGCTCTG CATGCATTTC CACGAATGTT TCGTTAGAGG TTGTGACGCA TCCATACTCA TAGACTCTAC CGACAGCAAT  CCATTGAAGA AAnCCGCCGC CCCGAACCTA ACTGTnCGAG GCTTCGAAAT CATTGACGAA GCCAAGAAGA ACATCGAAGC CTCATGCCCT TCGATGnTCT CCTGnGCCGA CATCATAACT  TTGGCAACAC GGTACGCGGT CTTCTTnGCA GGAGGGCCTA GCTATGATGT CGCGACGGGA AGGCGAGATG GCATnATCTC GGCCCGCGAC GAAGTTAACT TGCCnGGACC GACATTCTCG  GTGTCTnAGG CTCAACGAGC CTTCGCAGCA AAAGGATTCA CTCTTACCGA AATGGTCAnT CTCTTGGnTG GACACACCAT TGGAATCGCT CACTACTnnA GACCATATCn CAGATTTATG  GGTACCGGCG CTCCGGACCG ATCCATGGAC CCAAGCTTGA TCATGAAGCT CAAGGTCACC TGTGGTGCTT CATCAAGTAG CGACCCGACC GTGTCCTTGG ACCAGAGCAC ACCGTCCATn  GTCGATAACA nGTTCTATAG CGAGATTCTT GnGAAGAGAG GGATATTGCA AATTGATCAG GAGCTCACTG TTGAnAAATC GAGCAnGGCA ATCGTCGCTA AGTTCGGGTT GGACGCAAAT  nGAnTTAGGC nGAnTTTTGn AAACGCGATG GTGAAGATGA GCAATGTCGG AGTTCTAACA GGAAATGCTG GAnAGATTAG GAAAAACTGT AGGGTTTTCC AACTAGCTAG AnTGCTCCGC 
CAGTTAGGA 

Retrieve as FASTA