Entry information : UhorKat01
Entry ID 11752
Creation 2013-04-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2013-04-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-04-16 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: UhorKat01
Name UhorKat01
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Basidiomycota Ustilaginomycetes Ustilaginaceae Ustilago
Organism Ustilago hordei    [TaxId: 120017 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value UhorKat01
start..stop
S start..stop
CfulKat01 661 0 5..529 14..542
FoKat01 653 0 2..517 4..530
CnKat02_grubiiH99 655 0 8..524 157..677
CnKat02_JEC21 654 0 8..524 157..677
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 197442..199187 1746  
complement(join(197442..199187))


exon

Literature and cross-references UhorKat01
DNA ref. GenBank:   CAGI01000167.1 (199187..197442)
Protein sequence: UhorKat01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   581
PWM (Da):   %s   65225.24  
PI (pH):   %s   6.74
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSSTTTGLAV RSFQEDSNSE PGTYSTSNGV AVPHAYEAQR AGREGPLLLQ DFHLIDLISH FDRERIPERV VHAKGGGAHG IYRTTHPIPD ICLAPLFGEK TECPITVRFS TVGGESGSPD  CARDPRGFSI KMRTAQGNMD WVFNNTPIFF LRDPAKFPHF IHTQKRDPQT HLTHADDSIH FWDYMGDNPE SVHQFLYLMG PRGIPFSWRH MQGYSGHTIK FINKEGKWKY CQIHLLSQQG  TKNLTNDEAA QQSPDAHQKD LFEAIEKGDF PKWDVKYQIM DPADAPNSGV NVNDLTKVWP RDKFPLHPLG EIELNRNVAN YFAEIEQVAF NPAHLIPGLE PSNDPVLQSR LFSYPDTHRH  RIGVNYQQLP VNQAHPDHKP VNFQRDGAMA FYNQGPRPNY IHSLAPPEFR ARQVDVDNIH ADYEGNAIAF LSGVQEEDFL QPRAMWKKVF SEQDRKQTIE NISGHMSTCQ NKDVLAKAIS 
VWHQVDPEMA EKIAEPLGLK GKYKTDLRDA VFNGSHNFLG RNLGDQAGSA GGWSRADHKH EKVEKVYGLS SNKHALVDGN QTNGTKLVDL CLSVNVASES A 

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Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGTCTA CTACTACTGG ACTCGCCGTC CGATCGTTCC AGGAGGACAG CAACTCTGAA CCCGGAACTT ACTCCACTTC CAATGGTGTC GCTGTCCCTC ATGCCTATGA AGCCCAGCGA  GCCGGTCGCG AAGGCCCCCT TTTGCTTCAG GACTTTCACC TTATCGACCT GATCTCTCAC TTCGATCGAG AACGTATCCC TGAGCGAGTC GTTCACGCTA AGGGTGGTGG AGCTCACGGT  ATCTATCGAA CCACCCACCC AATTCCGGAC ATCTGTCTTG CGCCACTCTT TGGTGAAAAG ACTGAATGTC CTATCACTGT TCGCTTCTCT ACTGTTGGTG GCGAATCGGG TTCTCCTGAT  TGCGCTCGTG ATCCTCGTGG ATTTTCCATC AAGATGAGGA CGGCACAAGG AAACATGGAC TGGGTGTTCA ACAACACTCC TATCTTCTTC CTTCGTGATC CGGCCAAGTT CCCTCACTTT  ATCCACACGC AGAAGCGAGA CCCTCAAACG CACTTGACGC ATGCCGACGA CTCGATCCAC TTCTGGGACT ACATGGGTGA CAACCCCGAG TCCGTCCACC AGTTCCTCTA CCTCATGGGT  CCTCGTGGTA TTCCTTTCTC TTGGAGACAC ATGCAGGGCT ACTCTGGGCA CACGATCAAG TTCATCAACA AGGAGGGCAA GTGGAAATAC TGTCAGATCC ACCTTCTCTC CCAACAGGGC  ACCAAGAACC TCACCAACGA CGAGGCAGCT CAGCAATCGC CCGATGCTCA CCAGAAGGAT CTCTTCGAAG CCATCGAAAA GGGAGACTTC CCCAAGTGGG ACGTCAAGTA TCAGATCATG  GACCCCGCAG ATGCTCCCAA CTCCGGTGTC AACGTCAATG ACCTCACCAA GGTCTGGCCT CGTGACAAGT TCCCTCTCCA CCCTCTCGGC GAGATTGAAC TCAACCGCAA CGTCGCCAAC  TACTTTGCCG AGATCGAACA AGTCGCATTC AACCCAGCAC ATTTGATCCC TGGTCTCGAA CCAAGCAACG ACCCCGTTCT TCAATCGCGC CTATTCTCCT ACCCTGACAC ACACCGTCAT  CGTATTGGCG TCAACTATCA ACAGTTGCCA GTAAATCAAG CTCACCCAGA CCACAAACCC GTCAACTTCC AAAGAGACGG TGCTATGGCC TTTTACAACC AAGGTCCTCG ACCGAACTAC  ATCCATTCCC TTGCTCCACC CGAGTTTAGA GCTCGTCAGG TTGACGTCGA CAACATCCAC GCAGACTATG AGGGTAATGC TATTGCTTTC CTCTCTGGTG TTCAGGAGGA AGATTTCCTC  CAGCCTAGGG CTATGTGGAA GAAGGTCTTC TCCGAACAAG ATAGGAAGCA AACAATTGAG AATATCTCAG GTCACATGTC CACTTGTCAG AATAAAGACG TTCTCGCTAA GGCGATTAGT  GTTTGGCATC AGGTCGACCC GGAGATGGCA GAGAAGATCG CTGAACCTTT AGGTTTGAAG GGCAAATACA AGACCGACTT GAGGGATGCA GTTTTCAACG GCAGTCACAA CTTCCTTGGT  AGGAACCTGG GCGACCAGGC TGGCTCAGCT GGTGGCTGGT CCAGGGCAGA TCACAAACAC GAGAAGGTCG AGAAGGTTTA TGGTCTCAGC AGCAACAAGC ATGCTTTGGT TGATGGAAAC 
CAGACCAATG GAACCAAGCT CGTTGATTTG TGCCTTTCCG TTAATGTAGC ATCTGAATCA GCTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGTCTA CTACTACTGG ACTCGCCGTC CGATCGTTCC AGGAGGACAG CAACTCTGAA CCCGGAACTT ACTCCACTTC CAATGGTGTC GCTGTCCCTC ATGCCTATGA AGCCCAGCGA  GCCGGTCGCG AAGGCCCCCT TTTGCTTCAG GACTTTCACC TTATCGACCT GATCTCTCAC TTCGATCGAG AACGTATCCC TGAGCGAGTC GTTCACGCTA AGGGTGGTGG AGCTCACGGT  ATCTATCGAA CCACCCACCC AATTCCGGAC ATCTGTCTTG CGCCACTCTT TGGTGAAAAG ACTGAATGTC CTATCACTGT TCGCTTCTCT ACTGTTGGTG GCGAATCGGG TTCTCCTGAT  TGCGCTCGTG ATCCTCGTGG ATTTTCCATC AAGATGAGGA CGGCACAAGG AAACATGGAC TGGGTGTTCA ACAACACTCC TATCTTCTTC CTTCGTGATC CGGCCAAGTT CCCTCACTTT  ATCCACACGC AGAAGCGAGA CCCTCAAACG CACTTGACGC ATGCCGACGA CTCGATCCAC TTCTGGGACT ACATGGGTGA CAACCCCGAG TCCGTCCACC AGTTCCTCTA CCTCATGGGT  CCTCGTGGTA TTCCTTTCTC TTGGAGACAC ATGCAGGGCT ACTCTGGGCA CACGATCAAG TTCATCAACA AGGAGGGCAA GTGGAAATAC TGTCAGATCC ACCTTCTCTC CCAACAGGGC  ACCAAGAACC TCACCAACGA CGAGGCAGCT CAGCAATCGC CCGATGCTCA CCAGAAGGAT CTCTTCGAAG CCATCGAAAA GGGAGACTTC CCCAAGTGGG ACGTCAAGTA TCAGATCATG  GACCCCGCAG ATGCTCCCAA CTCCGGTGTC AACGTCAATG ACCTCACCAA GGTCTGGCCT CGTGACAAGT TCCCTCTCCA CCCTCTCGGC GAGATTGAAC TCAACCGCAA CGTCGCCAAC  TACTTTGCCG AGATCGAACA AGTCGCATTC AACCCAGCAC ATTTGATCCC TGGTCTCGAA CCAAGCAACG ACCCCGTTCT TCAATCGCGC CTATTCTCCT ACCCTGACAC ACACCGTCAT  CGTATTGGCG TCAACTATCA ACAGTTGCCA GTAAATCAAG CTCACCCAGA CCACAAACCC GTCAACTTCC AAAGAGACGG TGCTATGGCC TTTTACAACC AAGGTCCTCG ACCGAACTAC  ATCCATTCCC TTGCTCCACC CGAGTTTAGA GCTCGTCAGG TTGACGTCGA CAACATCCAC GCAGACTATG AGGGTAATGC TATTGCTTTC CTCTCTGGTG TTCAGGAGGA AGATTTCCTC  CAGCCTAGGG CTATGTGGAA GAAGGTCTTC TCCGAACAAG ATAGGAAGCA AACAATTGAG AATATCTCAG GTCACATGTC CACTTGTCAG AATAAAGACG TTCTCGCTAA GGCGATTAGT  GTTTGGCATC AGGTCGACCC GGAGATGGCA GAGAAGATCG CTGAACCTTT AGGTTTGAAG GGCAAATACA AGACCGACTT GAGGGATGCA GTTTTCAACG GCAGTCACAA CTTCCTTGGT  AGGAACCTGG GCGACCAGGC TGGCTCAGCT GGTGGCTGGT CCAGGGCAGA TCACAAACAC GAGAAGGTCG AGAAGGTTTA TGGTCTCAGC AGCAACAAGC ATGCTTTGGT TGATGGAAAC 
CAGACCAATG GAACCAAGCT CGTTGATTTG TGCCTTTCCG TTAATGTAGC ATCTGAATCA GCTTGA 

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