Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
|
Length (aa): |
195 |
PWM (Da): |
21994.36 |
|
PI (pH):
| 9.3 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MLRSTLLTTSNTLLKQNLLKSSIYKLNLRTMTNDTQVNSFYELKGTDINGNTFTFDRFKNKVVLIVNTACACGFTPQLKGLQELHDKYNTKGLEVVGFPSNSFNQDQAEGQELIDSYVNKHGVKFLLMQKSDVNGDNTNEVFKYLKSQKSGLLGTTFIKWNFEKFLVDRNGEVVKRYSSKGTPEEIAKDIEPLL* |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
complete sequence from genomic (3 introns) |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTTAAGAAGTACATTACTTACAACAAGCAATACTTTACTAAAGCAAAATTTACTAAAAAGCTCAATTTATAAGTTAAATTTAAGAACTATGACTAACGACACTCAAGTAAACTCTTTT TACGAATTAAAAGGAACCGATATTAACGGAAATACCTTTACTTTTGACAGGTTTAAGAATAAGGTAAGTCAGCAAACATAGCTAATTATAAATATTAACACTTATTGGTTTAGGTTGTAC TTATTGTTAACACCGCCTGTGCATGTGGGTTCACTCCTCAACTAAAAGGACTTCAAGAACTCCACGACAAGTACAACACTAAAGGCTTAGAGGTTGTAGGGTTCCCTAGTAACTCTTTTA ACCAAGACCAAGCAGAAGGTCAAGAACTTATTGACAGCTACGTCAACAAGCATGGTGTTAAGTTTTTGTTAATGCAAAAGAGGTAAATTATTAATTTGAAATTGTTATTTTGTAATATTA ATATTTGATAGTGACGTAAATGGAGATAATACCAATGAAGTATTCAAATATTTAAAGAGTCAAAAATCAGGATTATTGGGTACTACTTTTATTAAGTGGAACTTTGAAGTAAATTAATAT CATTCACTCTCACTTTCAATTATTAATTAATTTTATTTTTAGAAATTCTTAGTTGATCGTAATGGTGAAGTAGTTAAGAGATACTCTTCCAAGGGCACTCCTGAAGAAATTGCAAAGGAT ATTGAGCCCTTGTTGTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTTAAGAAGTACATTACTTACAACAAGCAATACTTTACTAAAGCAAAATTTACTAAAAAGCTCAATTTATAAGTTAAATTTAAGAACTATGACTAACGACACTCAAGTAAACTCTTTT TACGAATTAAAAGGAACCGATATTAACGGAAATACCTTTACTTTTGACAGGTTTAAGAATAAGGTTGTACTTATTGTTAACACCGCCTGTGCATGTGGGTTCACTCCTCAACTAAAAGGA CTTCAAGAACTCCACGACAAGTACAACACTAAAGGCTTAGAGGTTGTAGGGTTCCCTAGTAACTCTTTTAACCAAGACCAAGCAGAAGGTCAAGAACTTATTGACAGCTACGTCAACAAG CATGGTGTTAAGTTTTTGTTAATGCAAAAGAGTGACGTAAATGGAGATAATACCAATGAAGTATTCAAATATTTAAAGAGTCAAAAATCAGGATTATTGGGTACTACTTTTATTAAGTGG AACTTTGAAAAATTCTTAGTTGATCGTAATGGTGAAGTAGTTAAGAGATACTCTTCCAAGGGCACTCCTGAAGAAATTGCAAAGGATATTGAGCCCTTGTTGTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
cDNA►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
AAAATCTATA AAATTTAAAC TTATTGATGA TTAAACAAGG GTCTTTTCCA TTAGTATAAA AACTCTACCT ACGTCAGATA AGAAAAATTT AATATGTTAA GAAGTACATT ACTTACAACA
AGCAATACTT TACTAAAGCA AAATTTACTA AAAAGCTCAA TTTATAAGTT AAATTTAAGA ACTATGACTA ACGACACTCA AGTAAACTCT TTTTACGAAT TAAAAGGAAC CGATATTAAC
GGAAATACCT TTACTTTTGA CAGGTTTAAG AATAAGGTTG TACTTATTGT TAACACCGCC TGTGCATGTG GGTTCACTCC TCAACTAAAA GGACTTCAAG AACTCCACGA CAAGTACAAC
ACTAAAGGCT TAGAGGTTGT AGGGTTCCCT AGTAACTCTT TTAACCAAGA CCAAGCAGAA GGTCAAGAAC TTATTGACAG CTACGTCAAC AAGCATGGTG TTAAGTTTTT GTTAATGCAA
AAGAGTGACG TAAATGGAGA TAATACCAAT GAAGTATTCA AATATTTAAA GAGTCAAAAA TCAGGATTAT TGGGTACTAC TTTTATTAAG TGGAACTTTG AAAAATTCTT AGTTGATCGT
AATGGTGAAG TAGTTAAGAG ATACTCTTCC AAGGGCACTC CTGAAGAAAT TGCAAAGGAT ATTGAGCCCT TGTTGTAATC AATTCTTTCT CTAATTGTAA TAATAAATTT TATTAGCTC
|
Retrieve as FASTA
|
|