Entry information : GmarCIIBC06
| Entry ID | 11876 |
|---|---|
| Creation | 2013-05-23 (Nizar Fawal) |
| Last sequence changes | 2017-04-27 (Catherine Mathe) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2017-04-27 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: GmarCIIBC06
| Name | GmarCIIBC06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Other class II peroxidase type C [Orthogroup: CIIBC001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Cortinariaceae Galerina | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Galerina marginata [TaxId: 109633 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '11876' 'complement(join(72442..72510,72567..72644,72701..72789,72843..72878,72932..73011,73066..73116,73169..73183,73245..73270,73327..73341,73398..73492,73546..73667,73721..73786,73836..73848,73907..73962,74074..74135,74184..74248,74302..74428))' |
Exons►
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Literature and cross-references GmarCIIBC06
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_65 (74428..72442) |
|---|---|
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 106718 |
Protein sequence: GmarCIIBC06
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | complete sequence from genomics (16 introns). Error in JGI prediction : small exon is missing | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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