The peroxidases and oxidases database
Entry information : LuPrx120(Lus10021956|PACid:23157995)
Entry ID 12077
Creation 2013-05-28 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-05-30 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-05-28 (Qiang Li)
Peroxidase information: LuPrx120(Lus10021956|PACid:23157995)
Name LuPrx120(Lus10021956|PACid:23157995)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx012]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Linaceae Linum
Organism Linum usitatissimum (flax)    [TaxId: 4006 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LuPrx120
start..stop		 S start..stop
LuPrx207 556 0 1..352 1..346
MePrx105 400 2e-140 27..351 30..341
LuPrx208 387 7e-135 2..351 1..346
RcPrx24 386 1e-134 26..353 23..347
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 742176..742469 294 N° 2 741896..742087 192 N° 3 741639..741804 166 N° 4 740664..741067 404
N° 5 731094..731102 9  
complement(join(731094..731102,740664..741067,741639..741804,741896..742087,7421 76..742469))


exon

Literature and cross-references LuPrx120(Lus10021956|PACid:23157995)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold164 (742469..731094)
Protein sequence: LuPrx120(Lus10021956|PACid:23157995)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   354 (328)
PWM (Da):   %s   38093.25 (35224.7) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   8.4 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-354
Sequence 539
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction. Extra 3' end.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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TGACAGCTAGCAGCTGACTCTGCAGCACGTAGTTTTGCAGCTTCCATTTCCTGCCGAAGTTCAGCATTTTCCACCTCAAGCCTACGAACAGCAGAACTAGCTCTCTCCACCTGTCCACTG
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GCCTTGTCCTTGCTTAGCCTTCTAGCAGCCTGCATAACCTTCTGATTCACCCATTCAGTCCATTCTTGAAGCTGATTTTGCAGTACTCGAACTCTAGGAAGAAGCTTAACAATCATCTCA
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GCAGTTAATAGTCCTGGTATAGCACTGACTGGAGGTTTTGCAGGCAAGCCATTGGTTGGGGGTAATACCCGGGGGATGTTGGATTTAGGACAAGGAGCAGCACTAGGAGCCTCCTGACTA
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TGCCTGAGAATGAATTCTCTCATGGTGCTGCCAGAAACAGCCTTTCTTGTAACTGTAAACTTTTCTTCCATCACATGTGACTGAGATGGTCCTGCAATGTTGAAGAATTTATCTACAGGA
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GAGCAATTTGAATGCGATATTCAAAAGTGCAATTAAAAAAATCGTTGCATGTGGGTTTACTGAAGAAGTTGCTACAAAGGCGATAGATTTACCGAAGAAGTGGCTACGAAGGCGATTTTC
AGGTCTAGTGTTTGTGATGGTTCTAAGGACACAGTATCAAATATAGTTGATAATACTTTAGAGTTTCTCAGAAATGGTCAGGAGATTGACCCTTCTAAAGAGCATTGTTTTGGTGACTTA
CAGCAATTCCAGAAGTATATTTTGGCTGAATTAGTTCTTTTACTGAGGGACGTTAGGCCTTTCTTCAGTACCGGGGATGCAATGTGGTGCCTTCTGGTCTGTGACATGAATCTTTCTCAT
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GTTTCTACCCCTTTGAAGCCAGTGCCCTCAATACCTAGTTCCCGTAATCTTCAATTTGAGACAAGCACAAATATAATCTTGAGACAAGCACCAATATCCCAAAGGTTGTCAAGGTGACAA
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GAGCTTATACCCCTCAAGATGGTGGGAATCAAAGCCTTCCAATCAATTCCGGACTGTCATCCTCAGTCTCGTTTAGTTTGGAGGGTCCTAGTTCTGTTCCTTTTTGTTCTAAAACCAACA
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Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
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ATGGTTTCCACTAAGACAGCCATCGCCTTCTTCTTCCTTTCTCTCTTGCTTTTCGTCCTACCTTATGCCTCTCATGCCAAAGGCCATAACGGCAACAATGGTCGGCGGGGTCGGAGAGAC
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CTTTTCTTCGCCACGTTTGCTCGGTCGATGGTGAAGATGGGCGCCATTGTCGACGGTGATGGCACCGAAGGAGAGATTAGGAGGAACTGTCGCTTTGCTAAGTAA

Retrieve as FASTA