Entry information : ParcCIIBB11
| Entry ID | 12296 |
|---|---|
| Creation | 2013-05-30 (Nizar Fawal) |
| Last sequence changes | 2017-03-02 (Catherine Mathe) |
| Sequence status | partial |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2017-03-02 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: ParcCIIBB11
| Name | ParcCIIBB11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Other class II peroxidase type B [Orthogroup: CIIBB001]* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Polyporaceae Polyporus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Polyporus arcularius [TaxId: 5639 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '12296' 'complement(join(2100..2112,2172..2409,2480..2721,2770..2970,3026..3160,3221..3425,3494..3554))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references ParcCIIBB11
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_604 (3554..2100) |
|---|---|
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 327880 |
Protein sequence: ParcCIIBB11
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | incorrect prediction from genomics (6 introns). 5'end too long | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
