Entry information : PabAPx01(PAB00028349 / MA_177059g0010)
Entry ID 12627
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabAPx01(PAB00028349 / MA_177059g0010)
Name PabAPx01(PAB00028349 / MA_177059g0010)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabAPx01
start..stop
S start..stop
PtaAPx01 458 2e-166 1..245 1..245
GbAPx06 425 5e-153 1..245 6..250
PtriAPx02 402 3e-144 1..245 1..245
CclAPx05 401 6e-144 1..245 1..245
Literature and cross-references PabAPx01(PAB00028349 / MA_177059g0010)
Protein sequence: PabAPx01(PAB00028349 / MA_177059g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   245
PWM (Da):   %s   27123.81  
PI (pH):   %s   6.24
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALIYPQVSE EYRLAVEGCR RKLRGFIQEK HCAPLVLRLA WHSAGTYDTN SKTGGPFGTI RNKDELSHSA NAGLESAVKL LEPIKEQFPI LSYADFYQLA GVVAVEVTGG PSIPFHPGRT  DLSDSPEEGR LPDATGGSDH LRSVFYRMGL GDKDIVALSG GHTLGRCHKE RSGYEGPWTR TPLLFDNSYF RELLVGEREG LIQLPSDKAL LQDPIFSKYV HLYAKDENAF FIDYAEAHLK 
LSELG 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTAA TATATCCTCA AGTAAGTGAG GAGTACAGAT TGGCTGTTGA AGGCTGTCGC AGAAAGCTTC GAGGATTCAT CCAAGGTACG CTTCATTAAA CGTTCCTCTG GACCTTATTT  GCAGGTATGA ACATTTTTGC ATTATTAGTA ACTTCTACTG TATCGTTTTG TGGCGACAGA AAAACACTGT GCTCCCCTCG TTTTGCGATT AGCGTGAGTC TGAATCTCTC GGTATCTCAG  TTTACTTTCT TGCTATGGCG ATATTAGGAT ATGGGAGAGA AATTATGCAT TAATGTTTGA CAATTGATTA ATCAGATGGC ACTCCGCGGG GACATATGAC ACAAATAGTA AAACTGGAGG  ACCTTTTGGA ACCATTAGGA ACAAGGACGA ACTCTCTCAT TCTGCGAATG CAGGACTTGA AAGTGCGGTG AAGCTCCTGG AACCCATCAA AGAACAGTTC CCCATTCTTA GCTATGCAGA  CTTTTATCAG GTATGGAAAC CATTCGTTAC AACTTTGTTA TGGGGCTACC AGTTGTTACA ACTTTGTTAT GAGGTTAAGT ATGGGATTTA AGAAAAGTTT GTAGGAATTC AAAGAGTTAT  ATATATTGGT TAAGAATATT CCCTGCCTCA CTCCCGAGTA GCTCTCTGCC TTGCCTTACT CTCTATCCTG AGCTTTGGGA CAACTTAGAT AGGGAAAGTT TGCATTTCTT CCTAAGATGC  TAAAGGTTTA AATCTAAATC TAAATTTAGA GGGATAGGGT ATTTACTTTA ACAGTTTAAA TTGTTTAAAT TTAAATCCAG AAGAATAGGG TATTTACTCC TTAAACTTTA ACAGTTCAAA  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TCTAACTCCA GTTACATGAA TTTTGCAGGA CGAGAATGCA TTCTTTATTG ATTATGCAGA GGCTCATCTG AAGCTTTCGG AGCTTGGGTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTAA TATATCCTCA AGTAAGTGAG GAGTACAGAT TGGCTGTTGA AGGCTGTCGC AGAAAGCTTC GAGGATTCAT CCAAGAAAAA CACTGTGCTC CCCTCGTTTT GCGATTAGCA  TGGCACTCCG CGGGGACATA TGACACAAAT AGTAAAACTG GAGGACCTTT TGGAACCATT AGGAACAAGG ACGAACTCTC TCATTCTGCG AATGCAGGAC TTGAAAGTGC GGTGAAGCTC  CTGGAACCCA TCAAAGAACA GTTCCCCATT CTTAGCTATG CAGACTTTTA TCAGCTTGCA GGGGTTGTAG CCGTTGAAGT TACAGGAGGG CCCTCAATAC CTTTCCATCC AGGAAGGACA  GATCTCTCTG ACAGCCCTGA AGAAGGGAGG CTACCTGATG CCACTGGAGG GTCCGACCAT CTTCGATCAG TTTTCTACAG AATGGGATTG GGAGATAAAG ATATAGTAGC ACTCTCCGGA  GGCCACACTC TGGGAAGATG TCACAAGGAG AGATCTGGAT ACGAAGGTCC ATGGACGAGA ACTCCGCTAC TATTTGATAA TTCCTACTTC AGGGAACTAT TGGTTGGTGA ACGTGAAGGC  TTGATACAGC TCCCTTCCGA CAAGGCTCTT TTGCAGGATC CTATATTTAG TAAATATGTC CATTTATATG CTAAGGACGA GAATGCATTC TTTATTGATT ATGCAGAGGC TCATCTGAAG 
CTTTCGGAGC TTGGGTAA 

Retrieve as FASTA