Entry information : PtaPrx80(PTA00020785)
Entry ID 12642
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx80(PTA00020785)
Name PtaPrx80(PTA00020785)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx038]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx80
start..stop
S start..stop
PabPrx156 620 0 1..358 1..358
PabPrx24 578 0 1..358 1..367
AcoPrx73 409 6e-144 60..358 23..318
AtrPrx22 405 2e-142 62..358 30..323
Literature and cross-references PtaPrx80(PTA00020785)
Protein sequence: PtaPrx80(PTA00020785)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (348)
PWM (Da):   %s   39862.52 (38785.9) Transmb domain:   %s   i3-25o
PI (pH):   %s   8.36 (8.37) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-367
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLLHLVTIV LLMYGGALAL ATEEKLNSAK SPSPLVANQV ASKPVNKVTA PVKRKPRAVK EFLSPTYYAQ SCPNAEQIIA NRVKYWVQQD FTLAASLIRL HFHDCVVRGC DASILLNYPG  SERDSTVSRT LRGFNVVDDI KQQLENACPR TVSCADILTT IARDASLLLG GPFWSVPFGR KDGRISLARE TYIVPQGHEN LTALIELFQS RGLNILDLVI LSGAHTIGRS VCSVIQDRLY 
NFNGTRKPDP TMDPTYVTYL QKKCAYGWNW GSNLVNLDPT TPNILDAVYY QNLQNKKGLF VTDQILYSDA RTQFLIDTLA SNPYLFYQQF SVSMVNLGNV QVLTGDEGEV RTNCNWNN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTGC TACATTTAGT GACGATAGTT TTGCTTATGT ATGGAGGAGC CCTTGCATTG GCGACGGAAG AGAAACTGAA CTCTGCAAAG TCTCCATCAC CATTAGTTGC TAACCAGGTA  GCATCCAAGC CTGTAAACAA AGTAACTGCG CCTGTGAAGA GGAAACCGAG GGCAGTGAAA GAGTTTCTGT CGCCCACCTA CTACGCTCAG AGCTGCCCCA ACGCCGAACA AATAATTGCT  AATAGGGTTA AATATTGGGT GCAGCAGGAC TTCACACTTG CTGCCAGCCT TATACGTCTG CATTTCCACG ACTGCGTCGT TCGAGTAAGT TCATCACCAT CTTTTTAAAT AATTTCACTC  GCTTGTTTTT GGAAAAAAAT TGGTTTGGTA TTTTTATCAG GGATGGGCAT CTTTCTTGAT TGCTGATTTG TTGAATATTT GGTAATCAGA AAGATATCTG TTGCTGTTAA ATAATTCACA  GTGCCTATGT CTGTCTGATT GCCGAATATT AGAAAAAACA GCCATTGAAA TAAGGTCAAA GGCGTAGGAT CCATGTCAAA AAGAAAAGCT CAGGACCTAG GGCAAAAGAT GGGTTAGAAA  GGGAAAATAG GTCAGCAGGT ATGTCCCCAG CTGAGAAATT ATCTAGTCCA ATGACTCCTT ACTGTATCTT CACAGGGATG CGATGCGTCG ATTCTGTTGA ATTATCCAGG AAGCGAGAGA  GATTCTACAG TAAGCCGTAC ACTGCGCGGT TTTAATGTCG TGGATGACAT CAAGCAACAG CTGGAGAATG CATGCCCTCG AACAGTTTCC TGCGCCGATA TCCTCACAAC AATTGCACGG  GATGCATCGC TTCTGGTATC CATATTTCTT CTTCAGGCAT TCTCAATTTT TTTTTTCCAT GTGAAATTAA ATTAGTAACT TTACATTAAA AAAATATCCT AACAAAATAC TTTATCACTC  TTTCAAAACA CTTTACTGTA ACTAATTCTC CACGATTAAT TCATTTATTT TGCTCATGTG CTACAGTTGG GAGGGCCATT CTGGAGCGTT CCCTTTGGTA GGAAAGACGG TCGCATCTCC  CTAGCAAGGG AAACATATAT CGTTCCGCAA GGCCATGAAA ATTTGACTGC ACTGATAGAA TTGTTCCAGT CAAGGGGACT CAATATTCTT GATTTAGTTA TTCTTTCAGG TTAGGTGCTC  TCAGCCCACT GTGAACAGAT ATCATTGTGT TCTTCTATTT TATGTAAAAT TTACAATAAC TAAATAAGCT AAAGTTAAAA CGTTGTTACA CAACTATGGA ATGTATTGTA CTTCTTAATT  AATATTATAA AATAACTCAT AACTTATGTT AAAGTTAGAA TGGCAATGTT ACAACTCCAG TTTCTGAAAA TATATTATTA TTATTCAGGG TTGAGGAAGA ACTGAGAACT TTTCCTAAAT  TGGTAATTTG AAAAATTAAT TTTTTTTAAG AGTATATTGA GTTTAGGTTG GAGGACGTTT GTTTATTGGA TAGAAGATGA ATGGTCGACT TAGAATCTGA TGCTTATTAT TAGTATTGTG  TGAAGGTCAA TAGAGCTTGG ATGCCCCTTG GATAGTTTTA ATTCCCCAAA GTGATTTCCA TTCTCAATTT CTTCTGATGT CTATCACGAG GATTGTGTGA AGGTCAATAG AGCTTAGATG  CCCCTTGGAT AGTTTTAATT CCTTCAAAGT GACTTTCATC CTCAACCTCT CCCTCTCAAG TGGCACAGAC TAAACTAGAC ATGGTAAAGA CTAAACCACA TACAACCTAA TTAGTCTACA  CCTCATAGGT TATAATCCAT CAACCAATTT GTCTACACCT CATGACATAT TATTCATCAT TATCAATATC AAGTAAAAAG AAGTTTATTT GTCTCATGAG ATATTATTCA TCATCCAATT  AGTCTACCCT CATGACATAT TAGTCATCAT TATCAATATC AAGTAAAAAG AAGTTTATTT ATTTTTCTTA AAATGAAATA TAATTATTGA AGAGATTGTA ATTTTGCTTA TTTAAAATAT  TTTTCAATAT ATAAATATAG ATTTAGGGTC TTGTAAAACT TTGTATTCTC TTAATAAAAT TTAATTTTTA GATTTTTTTT TGGCAGATAG CATAGTATTC TGATACATCT ACATTGAAAT  TAAATTGATT AAAACATCTA AAAGAGTATT TTATCTAAAT TATAGAATCT AGAATATCTT CAAAATCTGA TATACTAAGA TAGTCTAAAA TATCCTAAAA TCTGATGTAC AAACATAAAA  TTAATTGTTT GACTTTACTT TTATCCATCA CATTTAAAAA ATATTTCAAA TCTTCAATAC ACTATTGAAA AACACAAGCA ACAAAATCTG AAAAACACAA GCAACAAAAT CAGAAGTTGC  TGGTTGTGCT TCTGATTACC CCTAAGTCAG AATCATGTTA AGGATGCCTC TCTAGAGTCT AATGAGTTGA AATCCACCCT GGTAGCTAAG GGTTCTACTG TATTTTGGTA ATTGATCTGG  TCCCATTTAT CTTATCTGAG GGTGTAAAAA TATGGATTTT TGTACCTTTG GTTTTTAATA TTCTGCCTAA ATTAAAATGA ATAATGAATG CAAAAATATA TTGTTGCCAG CAGAATCACT  TACAAAATAT GAGAATTTAT GGGCATGTTT GGTTTCTTTG TGTTTTCAGG TGCCCACACA ATTGGGAGAA GCGTTTGCAG CGTGATACAG GACAGGCTTT ACAACTTCAA TGGCACCCGC  AAGCCTGATC CAACCATGGA TCCCACATAT GTTACATACC TGCAAAAGAA GTGCGCTTAT GGATGGAATT GGGGATCAAA CTTAGTGAAC TTAGACCCAA CAACACCCAA TATTTTGGAT  GCTGTGTACT ACCAAAATCT GCAGAATAAA AAAGGACTAT TTGTGACAGA TCAAATTCTT TACAGCGATG CTAGAACACA ATTTCTAATT GACACGCTCG CATCAAATCC ATATTTGTTC 
TACCAGCAAT TCAGTGTGTC AATGGTGAAC TTAGGAAACG TGCAAGTTCT CACTGGAGAT GAAGGAGAAG TTCGCACTAA CTGCAATTGG AACAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTGC TACATTTAGT GACGATAGTT TTGCTTATGT ATGGAGGAGC CCTTGCATTG GCGACGGAAG AGAAACTGAA CTCTGCAAAG TCTCCATCAC CATTAGTTGC TAACCAGGTA  GCATCCAAGC CTGTAAACAA AGTAACTGCG CCTGTGAAGA GGAAACCGAG GGCAGTGAAA GAGTTTCTGT CGCCCACCTA CTACGCTCAG AGCTGCCCCA ACGCCGAACA AATAATTGCT  AATAGGGTTA AATATTGGGT GCAGCAGGAC TTCACACTTG CTGCCAGCCT TATACGTCTG CATTTCCACG ACTGCGTCGT TCGAGGATGC GATGCGTCGA TTCTGTTGAA TTATCCAGGA  AGCGAGAGAG ATTCTACAGT AAGCCGTACA CTGCGCGGTT TTAATGTCGT GGATGACATC AAGCAACAGC TGGAGAATGC ATGCCCTCGA ACAGTTTCCT GCGCCGATAT CCTCACAACA  ATTGCACGGG ATGCATCGCT TCTGTTGGGA GGGCCATTCT GGAGCGTTCC CTTTGGTAGG AAAGACGGTC GCATCTCCCT AGCAAGGGAA ACATATATCG TTCCGCAAGG CCATGAAAAT  TTGACTGCAC TGATAGAATT GTTCCAGTCA AGGGGACTCA ATATTCTTGA TTTAGTTATT CTTTCAGGTG CCCACACAAT TGGGAGAAGC GTTTGCAGCG TGATACAGGA CAGGCTTTAC  AACTTCAATG GCACCCGCAA GCCTGATCCA ACCATGGATC CCACATATGT TACATACCTG CAAAAGAAGT GCGCTTATGG ATGGAATTGG GGATCAAACT TAGTGAACTT AGACCCAACA  ACACCCAATA TTTTGGATGC TGTGTACTAC CAAAATCTGC AGAATAAAAA AGGACTATTT GTGACAGATC AAATTCTTTA CAGCGATGCT AGAACACAAT TTCTAATTGA CACGCTCGCA 
TCAAATCCAT ATTTGTTCTA CCAGCAATTC AGTGTGTCAA TGGTGAACTT AGGAAACGTG CAAGTTCTCA CTGGAGATGA AGGAGAAGTT CGCACTAACT GCAATTGGAA CAATTAA 

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