Entry information : PabPrx139(PAB00034505 / MA_257706g0010)
Entry ID 12677
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx139(PAB00034505 / MA_257706g0010)
Name PabPrx139(PAB00034505 / MA_257706g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx019]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx139
start..stop
S start..stop
PgPrx05 592 0 1..308 1..308
PtaPrx21-2 529 0 9..308 1..303
PtaPrx21 525 0 9..308 1..303
PabPrx36 433 4e-154 9..308 1..303
Literature and cross-references PabPrx139(PAB00034505 / MA_257706g0010)
Protein sequence: PabPrx139(PAB00034505 / MA_257706g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   308
PWM (Da):   %s   32755.76  
PI (pH):   %s   8.68
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSKYLTIMA LRIVKSLVLF AFLRPTLALQ VGFYNTKCPQ AESIVRGVVT SFFTSDKSIP AGLLRMHFHD CFVRGCDASI LIDAKGNNVP EKAAFPNQSV RGFNIIDAAK AAVEKKCPSV  VSCADIIALA TRDAVALAGG PQYSLPTGRR DGNISLQNDV DLPGPGSLVS DAATAFSAKG LNVADMVTLL GAHTVGNALC SFFSDRLFSF QGSGKPDPTM DPALVAKLKK VCPSPTSTST 
QDPNVFLDQN TSFIFDNSFY KQLQLKHGIL QIDQELASDS STKNMVTSFA SNGNAFSKSF VAAIIKMG 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction, last 200 AA are missing due to scaffold border
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGTCGA AATATTTGAC TATAATGGCA CTCAGAATCG TGAAATCCCT TGTCCTCTTC GCGTTTCTAC GACCCACATT AGCCCTCCAG GTGGGATTTT ACAACACCAA GTGTCCGCAA  GCAGAATCCA TCGTGCGGGG AGTAGTCACA AGTTTCTTTA CGTCAGACAA GTCTATCCCT GCTGGACTCC TTCGCATGCA TTTTCATGAC TGTTTTGTAA GGGTAAGATT ATAGTTATGA  TCTTCATCTT TCATTTAAAC ATATCAAATT GCTCATTAAA ATAGAAGTCT TACATGGATT CAATGGCTTT GCTTGTGAAT AACGTTGATT TACGCTGTTG AAGGGCTGCG ACGCATCAAT  TCTGATTGAT GCGAAAGGTA ATAACGTACC AGAGAAAGCA GCATTTCCAA ATCAATCGGT GAGAGGATTT AATATAATTG ATGCAGCAAA AGCCGCGGTT GAAAAAAAAT GCCCTAGCGT  TGTGTCTTGT GCTGATATAA TTGCACTTGC TACCAGAGAC GCTGTTGCCC TGGTATACAT TTCCTTCAAT TTTGCCATCT TCAACATTGA TTTCGTTCAA GTAAACGTTT AATATCAGTA  AACTAATCTT ATTAATCATT GATTTATTAA GGACTACCCC TGCTACTAAA CTAGAGTAGC TTCGTATTTA TTTGAAGCAC CATAGATCTA TGCTAATCTC GATCTATTAA GCAGCCCAAC  AGATTAGAAA AGCTAGATAA CTACAAGAAC ACTTGGCTTC ACTGGATGCA ATAATAGAAA CATCCAAACT TGGTTGAAAC TTTGACAGGC AGGTGGGCCA CAATACAGTC TGCCAACGGG  AAGAAGAGAT GGAAATATAT CTTTACAAAA CGATGTGGAT TTACCCGGTC CCGGTTCACT CGTTTCTGAC GCAGCTACAG CATTCTCGGC CAAGGGTTTG AACGTCGCAG ATATGGTCAC  TCTGCTGGGT AAGTATTCTT AATTATACCA CATATTTGCG CCAATAGGTT ATACCTATTG ATAATTGCTG GGTTTTAATG ATCTTTTTAA TTACAAAGAT GGTTTTATGG ACACTATTTA  CTATTTCTAG AATATTCTAC TGAGATGGTT TTTATGAACA CTATTTACTA GAATATTCTT CATCGTCACC GTCACAAGAA ATTGAGAATT AAGATTTTAT GGATTATCTT CAATAAATTG  AGAATTAAGA TTTTATGAAT TATATTCTTT TTCATGTAAA AACAAAACAT GTAAATTAAT CATTATTGAA ATAAATTTGA TAATAACAAA TTAAAATTTC CACAAAATAT CTCAGATAAT  TATTATTAAA ATTCATTAAT GAAATAAATT TGATAATAAC AAATTAAAAT TAATTTATTA TTGAAATTCA TTAGTAAAAT TTAATTACCT TTTAATCTAA AATTATAATC TGATGGCTAA  AAATTGAAGA TGCTGGCATA TTTTTAGTTG TCCTTCCAAA TCAATAAATG TGATTTACTT TTCATAACTT TATTGTATTT TTTAATGCAT CCATTAACCT ATTTACTTTT TAACATCTAC  CTAATCATAT TAAGAAATTA CTATAGTAGT ATATGATTGT CACGTTTCAT TTTATGGCTG TAGGCACGTT TCATTTTCCG ACTGTCCACG CATTTCATAT TGGATTGCCA AAGGTGGAAG  ACTATAACAG TTATGATTGC CACGTTTAAA TGATTAATCT TTGAGATTAC CACGTTTAGA TTTGTTGGCT TTCTTCCACT GTCTGCACGT TTCATTTTCT GGCTTTCTTC CACTATCCGT  GCATTTCATT TTCTGGTTGT AGGCGTGTTT CATTTTCTAG TTGTCCACGC ATTTCATATT GGATCGCCGA AGGTGGAAGA CTATAACAGT ATGGTGGGGG AAGGCCATTG CTGCGGGCTC  GGGGCAGATC ATCAAGCGTT TAGGGTTTCG ACCATTAACC TGCAAGAGCA AGCTTTGGCA TCGTCTTTCA GGGTTCATCA GCTAATGATA ATAATAATAA TAACAAATCA AAATTTCCAC  AACTTCAGTT ATTTACGTAT TTACTAAGTG GGATTCTTTT ATGTTTTTAA ATGTTCAAGG TTTTTTATTT TTATTTTTTT AAGTGTGCAG GGTTCTTTTA TTTATCTTCT TCAATTAATT  AAAGAGAGCC GATATCTATC GACCTTAACC AGCAGAGTTA GGTGCTGTGC TAGTTATCTA TTATTAAGTG TTTTCCACAT CTTGTGTGTA AAGAAGAGGG TTTTTTGACC TTTCTAAAGT  CGAAAAAAAT TAAAAATAAC ACATATCCCA TTAATTTAGG TACAAGCCCA TTAATTTAGG AACAACCCAA TTTCAATTAG GTACATATTT TTAGACCTAA TTTTATAAGT GAATTTAAAG  GATACATAAT CATTTTTATT TAAATGTAAT CGCATTGTTT ATTTTCCTAT AAGATTAGGA GTGGAGAGAA GCTAATATTT TCTTTTGGGT TCATCTCCAG GCGCGCATAC TGTGGGTAAC  GCGCTCTGCA GTTTCTTTAG CGATCGACTG TTCAGTTTTC AAGGAAGTGG GAAGCCGGAT CCTACTATGG ATCCCGCATT AGTGGCGAAG TTGAAGAAAG TCTGCCCATC TCCGACCTCG  ACTTCAACAC AGGACCCCAA CGTATTTCTG GACCAGAACA CTTCGTTTAT CTTCGACAAC AGCTTCTACA AACAACTGCA ATTAAAGCAT GGAATTCTTC AAATTGATCA GGAGCTTGCC 
TCTGATAGCT CAACCAAGAA CATGGTAACG AGCTTTGCCA GTAATGGAAA TGCGTTTAGT AAGAGCTTCG TCGCCGCCAT AATAAAAATG GGG 

Retrieve as FASTA