Entry information : PabPrx148(PAB00039140 / MA_37159g0010)
Entry ID 12682
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-05-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx148(PAB00039140 / MA_37159g0010)
Name PabPrx148(PAB00039140 / MA_37159g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx029]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx148
start..stop
S start..stop
PtaPrx129 550 0 1..272 62..333
GbPrx04 471 8e-170 1..270 56..329
PabPrx75 446 6e-160 1..273 56..330
PabPrx107 445 2e-159 1..271 62..335
Literature and cross-references PabPrx148(PAB00039140 / MA_37159g0010)
Protein sequence: PabPrx148(PAB00039140 / MA_37159g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   273
PWM (Da):   %s   29609.55  
PI (pH):   %s   4.61
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ARMAASLLRL HFHDCFVNGC DASVLLDDTV TFVGEKTAAP NLNSLRGFEV IDAIKKELEF ACPGTVSCAD ILAMAARDSV VLTGGASWEV QLGRRDSLTA SKEAANNNIP APTSNVATLN  SNFQNVGLTE QDMVTLSGAH TIGKARCATF NSRLTGQPDP TLQREFLTSL QQLCFEGFAS NNNTVTALDV ETPVIFDNQY YQNLPSGEGL LNSDQVLYST GGTTRELVEF YMQNQEAFFE 
NFKTSMIKMG NIQPLTGTNG EIRRNCRFVN SLA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic and RNA seq. Incorrect prediction (large part of exon 1 is missing due to NN in the scaffold).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACGCATGGC TGCCTCTCTT CTTCGTCTGC ATTTTCATGA CTGCTTTGTT AATGTTAGTA ACTCAAGCTA TATCATTGTC ATTGCTTCTT CTGTTAAGAG TTGAATTGAT TTTCTTACAA  ATATTTCCCT TATTGTTTTG TTTATCTAAA GTTGTTGGTA ACCATCACTT TGGGCTTTGG GTTGAATTTT TATTTAACGG GAGAGTCTAA AATATTAAAA TAAGGTTTGC ATTTGATAAT  TTTTCTTTTA CTTAACTGTT AAAGTGTATC TAGTTATACA CCCTACCCTT CTGGATTTAA GGATTTGAAC TTGTAATTTT ATAAGAGGAC ATGTAATTTT ATAAGAGGAC ACCTGTTCTT  ACTCATTAAA CCTCCTTGAA TTTCCTTATT AAAAGATTGG CCATATATAC TTAAAGATTG GTAATATATA CTAAGTTTGG TATTTTTGAA AAGTTCTTCT CCATCATGGA ATTCAATTTA  TTTCCTTCAT ATATGGTGTT CCACACTTGC ATTTATATCC CATTAGTTTC ATCAGGATAG AGTTTGCTGG TTCTCTATTT CTCAGTTAAA GTTCTCGGTC ACATCATATT GGATTTGCTG  CTTCATCATT TTCGTGAGTG ATTCTGTTTT ATTTGATGTA GCATAAGCTC TTACGAGCCA TCAAAGTTAA CCATTGACTT CCGTTAACAT TACTTCATAT CTCTTGGATG GACTGAATCT  GCAACAGGCC AAGTAGATAA CTTTGTACAT TTTGATGTCA CTTAGAGGTC TATGACTTCC GTTAACATTA CTTCATATCT CTTGGATGGA CTGAATCTGC AATCCAAAGA TTGCTGAATC  TGCAATCTAA GGATTGTAGA ATAATGTTGT TTACCTCGAA CTTGATTGTA GATTGGATAT CCATCCAATC TACATGGAGC AAAGTCAATC ATTGACTTTC GTTAACATTA CTTCATATCT  TTTGCATAGA CTGAATCTGC AATCCTTGGA TTGCAGAATG ATGCTGTTTA CCTGCATTTG ATTTCTTATA ATTTGCGTTA ATTTCACTGG CTTAGTGTTT ATTGGGTTTG GATATTAAAG  TCTCATTTGA AGAATAGGAC TTACAGGCCA AGTAGATAAC TTTGTACATT TTGATGTCAC TTAGAGGTCT ATGCAGGCCA AGTAGATAAC TTTGTACATT TTGATGTCAC TTAGAGGTCT  ATGTAGACCA TCATTCTAGA GAAGTTTGAT ATTTAAGAAA TTATACTTCT TAAAGTTGTA ATGGATATTT AATCAAGAAA TGGAAGTTAT ATGCAGGGCT GTGATGCTTC GGTGCTGCTG  GATGACACTG TGACTTTTGT GGGAGAGAAG ACAGCAGCTC CTAACCTCAA CTCTCTCCGT GGTTTTGAAG TTATAGATGC CATAAAAAAA GAACTTGAAT TTGCATGCCC TGGAACTGTT  TCCTGTGCTG ACATCCTTGC CATGGCAGCC AGGGACTCGG TCGTTCTGGT AAAATATTAT TGTTATTTTT CTATTGTCTT TATGATTTAA AATACCTTTA TCCAATTCAT AGTTTTATGA  AGATACTATA TAGTAACATC GGAGATTGTT TTTTTTTTTT TTTTTTCGGT TTATGACCAG ACAGGAGGAG CATCATGGGA AGTGCAGTTG GGGAGAAGAG ACAGCCTAAC AGCAAGCAAA  GAAGCAGCAA ATAACAACAT TCCAGCCCCC ACATCAAATG TTGCAACACT CAACTCCAAT TTTCAGAATG TAGGCCTCAC TGAACAAGAT ATGGTCACAC TCTCAGGTCC ATCATCCATT  CACTGTTTCA TCTGTGTATC TATAACAATA CATAGGACAG AATATATAAT AATATATCAG TACTTAAAAG CATAAAAAAT AAATCTAAGC ATGAATTTAT TAGGGTTAAA AAGATTCAAA  TTAAGATGAT ATATCTTGAC TTATATATTT CATTCTAAAA TATATTTTTA TGTTTATTAT TTTTACCTGA GCTGGTCACA CTCTCAGGTC CCTGACCTGT AAATACACCT CATAATTTTT  GATATGAAGT GATTGATATG TTTTGCAGGA GCCCATACAA TAGGAAAGGC GCGATGTGCA ACATTCAACT CTAGGCTCAC GGGACAACCA GATCCCACTC TGCAGAGAGA GTTCCTGACA  TCGCTCCAAC AACTCTGCTT TGAAGGTTTC GCCAGTAATA ACAACACCGT AACTGCACTA GACGTGGAGA CTCCTGTCAT TTTTGACAAC CAATATTATC AAAACCTGCC TTCTGGTGAA  GGCCTACTGA ATTCGGACCA GGTGCTCTAT TCCACTGGAG GAACTACAAG GGAGTTGGTG GAATTTTACA TGCAGAACCA AGAGGCATTC TTCGAGAACT TCAAAACCTC CATGATCAAA 
ATGGGAAACA TCCAACCTCT CACTGGCACA AATGGGGAGA TTCGTCGCAA TTGTCGATTT GTTAATTCAT TAGCATGA 

Retrieve as FASTA