Entry information : PabPrx156(PAB00042269 / MA_44564g0010)
Entry ID 12690
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx156(PAB00042269 / MA_44564g0010)
Name PabPrx156(PAB00042269 / MA_44564g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx156
start..stop
S start..stop
PtaPrx80 642 0 1..358 1..358
PabPrx24 602 0 1..358 1..367
AcoPrx73 402 4e-141 62..358 25..318
AtrPrx22 400 1e-140 58..358 26..323
Literature and cross-references PabPrx156(PAB00042269 / MA_44564g0010)
Protein sequence: PabPrx156(PAB00042269 / MA_44564g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (339)
PWM (Da):   %s   39650.19 (37701.0)  
PI (pH):   %s   6.39 (6.39) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-358
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLLQLVPIV LLLFGGALAL AANENLSPVK IPSSLVANHV TSMPKNKPTA PAKRIPRPAI VFLSPSYYAQ SCPNAEQIIH NRVQYWVEQD FTLAASLIRM HFHDCIVRGC DASILLNYPG  SERDSTESST LRGFNVIDDI KRELETACPR TVSCADILTT IARDASLLLG GPFWSVPFGR KDGRISLARE TYIVPQGHEN VTTLIELFQS KGLSILDLVI LSGAHTIGRS LCSVIQDRLY 
NFNGTHKPDP SMDPIYVTYL QKKCTYGWNW GSNLVNLDST TPNVLDAAYY QNLQNKKGPF VTDQLLYSDD RTQFLIDTLA SNPDLFYQQF SVSMLNLGNV QVLTGDEGEV RTNCNWNN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTGC TACAACTAGT GCCGATAGTA TTGCTTCTGT TTGGAGGAGC CCTTGCATTG GCGGCGAATG AGAATCTCAG CCCTGTAAAG ATTCCATCAT CTTTAGTTGC CAACCATGTA  ACATCCATGC CTAAAAACAA ACCAACCGCG CCAGCGAAGA GGATACCGAG GCCAGCGATA GTGTTTCTAT CGCCCAGCTA CTACGCTCAG AGCTGCCCGA ACGCTGAACA AATAATTCAT  AACAGGGTTC AATATTGGGT AGAGCAGGAC TTCACACTTG CTGCCAGCCT TATACGTATG CACTTCCACG ACTGCATCGT TCGAGTAAGT TCCCCGTCTC CATCTCTGTA AATAATTTCA  CTCCTTTGGT TTGGGAAAAA TTGGTTTGGT CTTTTCGTTT GGGATCCATA TCCAGATGCT TCGAGTTTTG GCTTGGGACC TGTTTTATAT GTTTCTCGAG GCCATAGATC GGCCATGTAT  TGTTATAGGA TATAAGAGGA ATTCCAGATG CATCTTGGAC TAATGATCGA AGGAATCGAC TAAAACTACT TTTCATTTTT CAAGATAGTA TTGAAATAAA CAATGGGGAC TAAGAATTAT  CTTCAAAACC TAGAAATGCA GGTTTTGGAA GTTTTTTTAA GCATATGTTA TTTTTTAATA GATTCACATT ATGGTTGTAA CAAAATATTA AGTTAGGTCC CCGAAGTGTA GGACAGTCTG  TGACAGAGTG TGTTGTTAAG CAACTCCGTG ATGTTAAAGT CATCGGTTCG AAACCTGCGG GGACAAAAAA GGACAAAAAA ATCCAACCAT GTTAAGGGTT GGTGTGGCTC AGGCCGGGTC  GAGTACCCAA CAGGTCCTGC ACAAATTAAC AAACAAAAAA ACCAAAATAT TAAGTTAGTA ATGTGTTGTT ATTCATATGT TAATTTGATA TGAAGTTTTC TAGGATAGTA AATGATGGAG  TGTGCTGTTA AGGTACTCTG TCATGTTAAA GTTACTGGTT AAAAAGCTGT GAAGACAAAG AATTCAGTCA TGTTAAAAGT TGATGTGGTT CAGACCGAAT GTGATCCCTG TTAATTTTGA  TCGCTTAGAT ATCCAAAAAA AAGTTAATAA GAAAGAATCT GTGTCACTGA ACTAAAACAG CTTTAGTTTA ATGGCTTCTC TACTTTATCT TCACAGGGAT GCGATGCGTC AATTCTCTTG  AATTATCCAG GAAGCGAGAG AGATTCTACA GAAAGCAGTA CACTGCGCGG TTTTAATGTC ATCGATGACA TCAAGCGAGA GCTGGAGACT GCATGCCCTC GAACAGTTTC GTGTGCCGAT  ATCCTGACAA CAATTGCACG GGATGCATCG CTTCTGGTAT CCATATTTGC TGCTACTCTT TCACTTTCAC CCCTTTAAAA ATAATCAGGG GAAATACTTT CATGTACCGA GCTCTCCAGC  ATGAATGGAA GGATCATTTA ATTTATTTAA TGTGTTACAG TTGGGAGGGC CATTCTGGAG CGTTCCATTT GGTAGGAAAG ACGGTCGCAT ATCCCTAGCC AGGGAAACAT ATATCGTTCC  ACAAGGCCAT GAAAATGTGA CTACACTGAT AGAACTGTTC CAGTCAAAGG GACTCAGTAT CCTTGATTTA GTTATTCTTT CAGGTTATGT GCTCTACAGT CTTTGTGAGG AGATCTCCTT  GTGTTTTTCT ATCTGTTTTG TTTTTGTTTT TTTAATTGAT CTGGTACAAT TTAAGTAATA TGGGAGGGTG TCAGTCCTTT AGGTGTAGGA CAGTGACGGA GTGTGTTGTT AAGGCACTCC  ATGATGTTAA AATCATTTGT TCGAAACTTG TTGGGACAAA AAATCAATCA TGTTAAGGGT TGATGTGGTG TGGTTCTCAA TCCTAAATAT TATGGTGATT TCATGCTTAT ATTTAGTTTC  TTTGTGTTCT CAGGCGCCCA CACAATCGGG AGAAGCCTTT GCAGTGTGAT ACAGGACAGG CTTTACAACT TCAACGGCAC CCACAAGCCT GATCCAAGCA TGGATCCTAT ATACGTTACG  TACCTGCAAA AAAAGTGCAC ATATGGATGG AATTGGGGAT CAAACTTAGT GAACTTAGAT TCCACAACTC CCAACGTTTT GGATGCTGCC TACTACCAAA ATCTGCAGAA TAAAAAAGGA  CCATTTGTTA CAGACCAACT TCTTTATAGT GACGATAGGA CACAATTCCT AATTGACACG CTTGCATCTA ATCCAGATCT ATTCTACCAG CAATTCAGTG TGTCAATGTT GAACTTAGGA 
AACGTCCAAG TTCTGACTGG AGATGAAGGA GAAGTTCGTA CTAACTGCAA TTGGAACAAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTGC TACAACTAGT GCCGATAGTA TTGCTTCTGT TTGGAGGAGC CCTTGCATTG GCGGCGAATG AGAATCTCAG CCCTGTAAAG ATTCCATCAT CTTTAGTTGC CAACCATGTA  ACATCCATGC CTAAAAACAA ACCAACCGCG CCAGCGAAGA GGATACCGAG GCCAGCGATA GTGTTTCTAT CGCCCAGCTA CTACGCTCAG AGCTGCCCGA ACGCTGAACA AATAATTCAT  AACAGGGTTC AATATTGGGT AGAGCAGGAC TTCACACTTG CTGCCAGCCT TATACGTATG CACTTCCACG ACTGCATCGT TCGAGGATGC GATGCGTCAA TTCTCTTGAA TTATCCAGGA  AGCGAGAGAG ATTCTACAGA AAGCAGTACA CTGCGCGGTT TTAATGTCAT CGATGACATC AAGCGAGAGC TGGAGACTGC ATGCCCTCGA ACAGTTTCGT GTGCCGATAT CCTGACAACA  ATTGCACGGG ATGCATCGCT TCTGTTGGGA GGGCCATTCT GGAGCGTTCC ATTTGGTAGG AAAGACGGTC GCATATCCCT AGCCAGGGAA ACATATATCG TTCCACAAGG CCATGAAAAT  GTGACTACAC TGATAGAACT GTTCCAGTCA AAGGGACTCA GTATCCTTGA TTTAGTTATT CTTTCAGGCG CCCACACAAT CGGGAGAAGC CTTTGCAGTG TGATACAGGA CAGGCTTTAC  AACTTCAACG GCACCCACAA GCCTGATCCA AGCATGGATC CTATATACGT TACGTACCTG CAAAAAAAGT GCACATATGG ATGGAATTGG GGATCAAACT TAGTGAACTT AGATTCCACA  ACTCCCAACG TTTTGGATGC TGCCTACTAC CAAAATCTGC AGAATAAAAA AGGACCATTT GTTACAGACC AACTTCTTTA TAGTGACGAT AGGACACAAT TCCTAATTGA CACGCTTGCA 
TCTAATCCAG ATCTATTCTA CCAGCAATTC AGTGTGTCAA TGTTGAACTT AGGAAACGTC CAAGTTCTGA CTGGAGATGA AGGAGAAGTT CGTACTAACT GCAATTGGAA CAATTAA 

Retrieve as FASTA