Entry information : PabPrx158(PAB00042569 / MA_45356g0010 / prx16)
Entry ID 12692
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx158(PAB00042569 / MA_45356g0010 / prx16)
Name PabPrx158(PAB00042569 / MA_45356g0010 / prx16)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx099]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx158
start..stop
S start..stop
PtaPrx83 642 0 1..338 1..338
PabPrx01 556 0 1..338 1..340
PsiPrx06 548 0 6..338 9..341
PabPrx17 509 0 6..317 9..320
Literature and cross-references PabPrx158(PAB00042569 / MA_45356g0010 / prx16)
mRNA ref. GenBank:   AJ250121
Protein sequence: PabPrx158(PAB00042569 / MA_45356g0010 / prx16)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338 (308)
PWM (Da):   %s   36655.95 (33382.1) Transmb domain:   %s   i13-30o
PI (pH):   %s   9.86 (9.57) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-338
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARASGLRLQ FRSVLIAGVA LMIWIQALHA QSSNGLSPHY YHKSCPEALS IIKSGIEDAV KKEARIAASL LRLHFHDCFV KGCDASVLLD DTANFTGEKT AAPNKNSVRG FGVVDKIKSE  LEKKCPGVVS CADLLAVAAR DSVVISGGPV WDVPLGRRDS RSASKSGANY NIPAPTSTHQ TLETKFKLKG LNSLDLVVLS GGHSIGLSRC TSFKARLYNQ TGNGKPDPTL DTTYLKQLRI 
VCPQNGTDDN QTVPLDPVTP FKFDVNYYKN IVASKGLLNS DEILYSTNGS KTAAYVKFYT THTQAFFQQF AVSMIKMSNL SPLTGTRGEI RKNCRKMN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and cDNA (mismatches).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGGG CTTCTGGCCT TAGACTCCAG TTTCGATCTG TGCTGATCGC GGGGGTGGCA TTGATGATAT GGATCCAGGC ATTACATGCT CAGAGCTCTA ATGGTTTGAG TCCCCATTAT  TATCACAAAT CCTGTCCCGA GGCCCTGTCT ATCATTAAAT CTGGAATAGA AGATGCTGTG AAAAAGGAAG CAAGAATTGC TGCTTCCTTG CTTCGTCTGC ATTTTCATGA CTGCTTTGTT  AAGGTGAGCA TACATTGATG TTCATGAATG TTCACATTTC TGGGCAATCT AGCTACTACC ATTCTCTGAA TTACTCTTCT CCTGAATACT CCTATCATCA ATGTTACATT TCTTATTCTC  TGAATTGCTC TTCTCCTGAA TACTCCTACC ATCGATATTA CATTTCTTGA AGAGTGATTG AATACTTCAA GCTATTATTA TGATAGAATG ATGGTATATT AGTGTTATGT TTATTACAAT  ATTTGTCTGC GTTGCTTCAT CTCAATTTGG AGCTGGACAA ATGTTTTCTG CAGCATCTGG ACGGCTTTGT TCCCTACTTC CTTGCAGCGG CCGGGAAGTA CTAATACTTT ATCAAATCCC  TATAACGCTG AGAGATACTA AAATTTCCTT GTGAGACTGT AACCAATACG AAATTGTGCA GTCTCACTGT TTTAATAGCT CTGGGGTTGA GGGTTATCAT ACGATTTATA ACATTAAGTG  AATATGTCTC AGCTTTCAGA GATATGTCAA AGTGCAATGT CTTTATTTAT GCTGATTATC TGTTATGTCA GAAATGTATC TCCTTTGTAA TGTAGTTATT TTATGGTGTA GAGATATGCT  AACTTGCATT GACAATGTAA GCATTTTTCT AAAACATAAG AAACATACTG TGAAGAGATT TGGATAGTAG AGCATGAGAT AGTTCAGAAG ATAAATTGCT GTAAAATATT GCATTGCATT  GATTCAGGGC TGCGATGCTT CTGTCCTGCT TGATGATACA GCCAACTTCA CCGGGGAAAA GACAGCAGCC CCTAACAAGA ATTCGGTAAG AGGCTTTGGA GTGGTGGATA AGATCAAAAG  CGAACTGGAG AAAAAATGCC CCGGGGTGGT TTCATGTGCT GATCTTCTTG CTGTGGCAGC TCGCGATTCT GTAGTCATTG TGAGTATATG TTTCCAGCCA TGGGAGTATC TTCACTGTTT  GGGGATTTTG GGGGGTTTAA TTTTTCTTTT ATGGTGTAAT CAATGCATAC AGATTGTTTG GTTGTGTCTT AGTGGTTTGG GTTGGGTTCT CATGGATACA CTGGAGGTTT AATTTTGGTG  GCTGTACAGT TTTTGCGTTT GTTGAAAAAA TTGTTTGGCT GAGTCAGTCC AAGGAATTAA ATTGGTGCAA GTGAACAGTG ACAGGTTTTG GCTTTCAGTG GATATCAGTG GTTGGACAGG  GATGTGAATA TGATATTTTA TCTATGACTT TAAGTGAAGA GTGATAAGGA TCCCATGCAA ATAACTTAGG GTGTTTGTTG GACATGAATG CTAGTGTGAT ATTTTATCTT TCATGATTAA  TGATATTGGT TGACCTGCAA ATAGTTGATA AAGATTCCAG GAATGATCTT AATACGGTAT TTCATTTTGT ATTATTAGTG TTTTTAAGAA AAAAAATACT TTGTCTGGTA AGTTAGATGT  ACATATAAAT TCACATAAAT CCGTTTTAAA CCAACGTTTA TGGAAAATCC CAAGTATAAA GACTGGACTG GATTGAGAAA AATAAAATTC CATCGCTATA TATTAGTATA CAACGATGGA  AACTGAATTG ATAATTGATT TTGTTTTCGC TTAATTGCGC AGAGTGGAGG GCCGGTTTGG GATGTTCCAT TGGGCAGAAG GGACTCCAGA AGTGCAAGCA AGAGCGGTGC AAACTACAAT  ATTCCTGCTC CCACCTCAAC CCATCAGACA TTGGAAACCA AATTCAAACT CAAAGGGCTC AATTCGCTTG ACCTGGTTGT TCTCTCAGGT AACTTAATTA CTTCACTTGT GATACTTATT  TTGATTAATT TAACACGAGG ATAGATTAAT TAATTTAACA TGAGGATAGA TTAAGAAAGA AAATGATTTT AACGTACAAG ATGTTAATCA TAGTTAATGA GACAAACGAT TTGACACAGA  TCGCCTCACA CACTGATTTC TGCATTTTAA TCTTACTTCA CACAGACAGC GTTACACACT GATTTCTGCA TTTCAATCCT ACTTCACACA GACACCGTCA CACACTGATT TCTGCATTTC  AATCCTACTT CACACAGACC GGTCACACAC TGATTTCTAC ATTTCAATCC TTTTCTTGTT AAACTTATGT TAATCTTATT TGAAAGGAAA CAAAAGAACA TGCAGACCAC ATTATAACAT  ATCATTTTTT CCAATCTCTA TGAAACTAAT GATTTCAAAT TTCTACAGGC GGCCATTCAA TAGGCTTATC GCGATGTACA AGCTTCAAGG CAAGGCTTTA CAATCAGACT GGTAATGGGA  AGCCTGACCC AACACTTGAC ACAACGTACT TGAAGCAGCT GAGAATCGTG TGTCCTCAAA ATGGTACCGA CGACAATCAA ACTGTGCCAT TGGATCCGGT CACTCCTTTT AAATTCGACG  TAAACTACTA CAAGAACATT GTGGCTAGCA AGGGGCTGCT CAATTCAGAT GAGATTCTTT ACTCTACCAA TGGAAGTAAA ACAGCGGCTT ATGTAAAGTT CTACACAACA CACACCCAAG 
CTTTCTTCCA GCAGTTTGCA GTTTCAATGA TAAAGATGAG TAACCTCAGT CCTCTCACAG GGACCCGCGG GGAAATTAGG AAGAACTGTC GTAAGATGAA TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGGG CTTCTGGCCT TAGACTCCAG TTTCGATCTG TGCTGATCGC GGGGGTGGCA TTGATGATAT GGATCCAGGC ATTACATGCT CAGAGCTCTA ATGGTTTGAG TCCCCATTAT  TATCACAAAT CCTGTCCCGA GGCCCTGTCT ATCATTAAAT CTGGAATAGA AGATGCTGTG AAAAAGGAAG CAAGAATTGC TGCTTCCTTG CTTCGTCTGC ATTTTCATGA CTGCTTTGTT  AAGGGCTGCG ATGCTTCTGT CCTGCTTGAT GATACAGCCA ACTTCACCGG GGAAAAGACA GCAGCCCCTA ACAAGAATTC GGTAAGAGGC TTTGGAGTGG TGGATAAGAT CAAAAGCGAA  CTGGAGAAAA AATGCCCCGG GGTGGTTTCA TGTGCTGATC TTCTTGCTGT GGCAGCTCGC GATTCTGTAG TCATTAGTGG AGGGCCGGTT TGGGATGTTC CATTGGGCAG AAGGGACTCC  AGAAGTGCAA GCAAGAGCGG TGCAAACTAC AATATTCCTG CTCCCACCTC AACCCATCAG ACATTGGAAA CCAAATTCAA ACTCAAAGGG CTCAATTCGC TTGACCTGGT TGTTCTCTCA  GGCGGCCATT CAATAGGCTT ATCGCGATGT ACAAGCTTCA AGGCAAGGCT TTACAATCAG ACTGGTAATG GGAAGCCTGA CCCAACACTT GACACAACGT ACTTGAAGCA GCTGAGAATC  GTGTGTCCTC AAAATGGTAC CGACGACAAT CAAACTGTGC CATTGGATCC GGTCACTCCT TTTAAATTCG ACGTAAACTA CTACAAGAAC ATTGTGGCTA GCAAGGGGCT GCTCAATTCA  GATGAGATTC TTTACTCTAC CAATGGAAGT AAAACAGCGG CTTATGTAAA GTTCTACACA ACACACACCC AAGCTTTCTT CCAGCAGTTT GCAGTTTCAA TGATAAAGAT GAGTAACCTC 
AGTCCTCTCA CAGGGACCCG CGGGGAAATT AGGAAGAACT GTCGTAAGAT GAATTGA 

Retrieve as FASTA