Entry information : PabPrx185(PAB00050394 / MA_66200g0010)
Entry ID 12715
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx185(PAB00050394 / MA_66200g0010)
Name PabPrx185(PAB00050394 / MA_66200g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx063]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx185
start..stop
S start..stop
PabPrx166 670 0 1..366 6..371
PtaPrx08 589 0 4..366 10..372
PtaPrx117 588 0 4..366 10..372
PtaPrx94 562 0 4..366 10..372
Literature and cross-references PabPrx185(PAB00050394 / MA_66200g0010)
Protein sequence: PabPrx185(PAB00050394 / MA_66200g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   39229.94 Transmb domain:   %s   i21-43o
PI (pH):   %s   3.72
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLYTIMCVF LFVSVAIISI SGYDIDADDL PTPVDGLSWT FYNETCPNLE SIVNATLEQA LDDDITQAAG LLRVHFHDCF VQGCDGSLLL TGTTTDPGEQ DAPPNLTLRA RAFQLINEIK  TAVEANCSGV VSCADIVTLA ARDSVAKAGG PDYPVPLGRR DSLDYANQST VLSNLPGPTS NLSQLTVGFD NKGLNLTDLV ALSGAHTIGI GHCSSFDNRL YNLSTGQTIV DPTLDVSFAS  SLYSICAVVN DTVNSTNEDL ITPNVFDNNY YLDLQNNQTL FTSDQSLYSN SANTEDIVDS FASNQTVFFE NFILGMLKMG QLDVLTGSEG EIRTNCSIAN TDSSYYQQII ESIVGPEEQS 
QSSQST 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction (two extra exons in 5').
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTAT ACACCATTAT GTGCGTCTTT TTATTTGTTT CTGTGGCGAT AATCTCTATT AGCGGATATG ATATAGATGC AGACGATCTG CCAACGCCTG TGGATGGGCT CTCCTGGACA  TTTTACAACG AGACTTGTCC CAACTTGGAG TCCATAGTTA ACGCAACACT TGAACAGGCA CTGGACGACG ATATCACTCA AGCTGCAGGC TTGTTGAGAG TTCATTTTCA CGACTGTTTT  GTGCAGGTAT GCATCTATAT TTAGCTTTGT GCGAGAAAAG CTGCGTGCTG ATGGATCAGG AGATTGTTGT TACTTCGTGT ATCATTTGTT TTAGGTTGAG AGGTTTGCAT TTGTTAGATG  GGATTCACTT AGCATAATAA ATATGTGGTA TAGTGCTGGC ATTCTTATTT ATGAGTTTCA CTTCAATTCT AACAACTTAC ATGTTAAACG GTTAATGAGT ATAATAGTGT AACCGTTTTG  AACCTTGTTA TTTACCAACT TTATCTCCTG GAGGTAAAAA TTCTAGGGTT ACCCTCCATA CCATCTTCCC AAATAAAAGA AAGAACTATA TCATTGCTTT TAAATGAATT ATGAATTACA  AAGGTAGAAT ATTGCATATT GCACCCAGAT ACCTGTGACT GTTTTCAAAT TCTATGAATC TAACTCTCTT CCTCCTATCT GGAAAAAGGG TTGCGATGGA TCGCTGCTGC TGACAGGAAC  GACAACCGAT CCCGGTGAGC AGGATGCTCC TCCAAACCTA ACACTCAGAG CCCGCGCCTT CCAGCTGATC AACGAAATCA AAACTGCTGT AGAAGCCAAC TGCAGTGGCG TTGTATCGTG  CGCGGACATT GTGACTTTGG CTGCTCGTGA TTCCGTCGCC AAGGTTGGTA GTACCTTACT TTTGTGCTAT TAGAATTTAT GGATCTGTTG TCTCTGATGG AAAATTGCAA TTGGATTAAC  GCAAATGGTC ATTTTGAAGG CCGGAGGCCC AGACTATCCA GTTCCTCTTG GGCGCAGAGA TAGCCTCGAC TATGCTAATC AATCAACCGT TCTTAGCAAT TTACCAGGTC CAACCTCAAA  TTTATCACAG CTGACGGTCG GTTTTGATAA CAAGGGATTA AATTTGACAG ATTTGGTAGC GCTATCAGGT CTGATGCCTG TACTTTCTAC TCCACTCACA CACATGACAA AATAGAATAC  ACCTCTTAGC GTCTAAATCA TCGAAAATGC ATATGCTATT TCATCGAAAA TGAAGGACTG TGAAACAATT TCATACAAGT AAGAGTTAGT CTAAGATTGA TTTATGTTTT ATAATTCTTG  TAGTGATTAT AATGGTTAAT AGTATGTAGT TTTTTTTTCA AACTTATAAA TTTATTTTCG TATTCAGAAA TTGAAAAAAT CTTCTTATCA TCATTGTTTA ACAAAATGTC ATGAAATGTT  TCAGGCGCGC ACACAATTGG TATTGGTCAC TGCAGCTCCT TTGATAACCG ATTATATAAC CTCAGCACAG GACAAACAAT TGTGGATCCA ACTCTAGACG TGAGTTTTGC AAGCAGTCTT  TATTCAATAT GCGCCGTGGT TAACGACACC GTCAATTCAA CCAACGAGGA TCTCATCACT CCAAACGTTT TCGACAACAA TTACTACCTG GACCTGCAGA ACAACCAAAC GCTCTTCACC  TCCGACCAGA GTCTGTACTC TAATTCCGCC AATACTGAAG ACATTGTGGA CAGCTTTGCC TCCAACCAGA CTGTGTTCTT CGAAAACTTC ATTCTGGGAA TGCTTAAAAT GGGGCAGCTG  GACGTTCTAA CGGGAAGCGA GGGAGAGATC CGCACCAACT GCTCCATTGC CAATACAGAT TCTTCATACT ATCAACAAAT TATCGAGTCC ATTGTTGGTC CAGAGGAGCA GTCTCAGTCT 
TCACAGTCCA CATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTAT ACACCATTAT GTGCGTCTTT TTATTTGTTT CTGTGGCGAT AATCTCTATT AGCGGATATG ATATAGATGC AGACGATCTG CCAACGCCTG TGGATGGGCT CTCCTGGACA  TTTTACAACG AGACTTGTCC CAACTTGGAG TCCATAGTTA ACGCAACACT TGAACAGGCA CTGGACGACG ATATCACTCA AGCTGCAGGC TTGTTGAGAG TTCATTTTCA CGACTGTTTT  GTGCAGGGTT GCGATGGATC GCTGCTGCTG ACAGGAACGA CAACCGATCC CGGTGAGCAG GATGCTCCTC CAAACCTAAC ACTCAGAGCC CGCGCCTTCC AGCTGATCAA CGAAATCAAA  ACTGCTGTAG AAGCCAACTG CAGTGGCGTT GTATCGTGCG CGGACATTGT GACTTTGGCT GCTCGTGATT CCGTCGCCAA GGCCGGAGGC CCAGACTATC CAGTTCCTCT TGGGCGCAGA  GATAGCCTCG ACTATGCTAA TCAATCAACC GTTCTTAGCA ATTTACCAGG TCCAACCTCA AATTTATCAC AGCTGACGGT CGGTTTTGAT AACAAGGGAT TAAATTTGAC AGATTTGGTA  GCGCTATCAG GCGCGCACAC AATTGGTATT GGTCACTGCA GCTCCTTTGA TAACCGATTA TATAACCTCA GCACAGGACA AACAATTGTG GATCCAACTC TAGACGTGAG TTTTGCAAGC  AGTCTTTATT CAATATGCGC CGTGGTTAAC GACACCGTCA ATTCAACCAA CGAGGATCTC ATCACTCCAA ACGTTTTCGA CAACAATTAC TACCTGGACC TGCAGAACAA CCAAACGCTC  TTCACCTCCG ACCAGAGTCT GTACTCTAAT TCCGCCAATA CTGAAGACAT TGTGGACAGC TTTGCCTCCA ACCAGACTGT GTTCTTCGAA AACTTCATTC TGGGAATGCT TAAAATGGGG  CAGCTGGACG TTCTAACGGG AAGCGAGGGA GAGATCCGCA CCAACTGCTC CATTGCCAAT ACAGATTCTT CATACTATCA ACAAATTATC GAGTCCATTG TTGGTCCAGA GGAGCAGTCT 
CAGTCTTCAC AGTCCACATA A 

Retrieve as FASTA